MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylomicrobium alcaliphilum chromosome

Total Repeats: 73443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_016112	GCGAA	2	10	159411	159420	40 %	0 %	40 %	20 %	357403526
2502	NC_016112	ACG	2	6	159435	159440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403526
2503	NC_016112	CCA	2	6	159457	159462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357403526
2504	NC_016112	TTG	2	6	159482	159487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403526
2505	NC_016112	G	6	6	159657	159662	0 %	0 %	100 %	0 %	357403526
2506	NC_016112	TCA	2	6	159703	159708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403526
2507	NC_016112	CGGG	2	8	159841	159848	0 %	0 %	75 %	25 %	357403526
2508	NC_016112	ATC	2	6	159873	159878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403526
2509	NC_016112	GTT	2	6	159880	159885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403526
2510	NC_016112	AAGG	2	8	159899	159906	50 %	0 %	50 %	0 %	357403526
2511	NC_016112	ACG	2	6	159940	159945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403526
2512	NC_016112	GCC	2	6	159958	159963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403526
2513	NC_016112	TTG	2	6	159980	159985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403526
2514	NC_016112	CCG	2	6	160005	160010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403526
2515	NC_016112	CTC	2	6	160011	160016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357403526
2516	NC_016112	GC	3	6	160102	160107	0 %	0 %	50 %	50 %	357403526
2517	NC_016112	CGGT	2	8	160108	160115	0 %	25 %	50 %	25 %	357403526
2518	NC_016112	TTG	2	6	160127	160132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403526
2519	NC_016112	A	7	7	160436	160442	100 %	0 %	0 %	0 %	357403527
2520	NC_016112	ATG	2	6	160533	160538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403527
2521	NC_016112	A	6	6	160579	160584	100 %	0 %	0 %	0 %	357403527
2522	NC_016112	TCG	2	6	160585	160590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403527
2523	NC_016112	TCA	2	6	160645	160650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403527
2524	NC_016112	T	6	6	160652	160657	0 %	100 %	0 %	0 %	357403527
2525	NC_016112	A	6	6	160690	160695	100 %	0 %	0 %	0 %	357403527
2526	NC_016112	ATG	3	9	160699	160707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403527
2527	NC_016112	GGC	2	6	160811	160816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403527
2528	NC_016112	GGT	2	6	160826	160831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403527
2529	NC_016112	GAA	2	6	160941	160946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403527
2530	NC_016112	GCG	2	6	160948	160953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403527
2531	NC_016112	AT	3	6	160991	160996	50 %	50 %	0 %	0 %	357403527
2532	NC_016112	CGA	2	6	161081	161086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403527
2533	NC_016112	AGG	2	6	161104	161109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357403527
2534	NC_016112	CGA	2	6	161288	161293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403527
2535	NC_016112	CAA	2	6	161310	161315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403527
2536	NC_016112	CGT	3	9	161387	161395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403527
2537	NC_016112	G	6	6	161488	161493	0 %	0 %	100 %	0 %	357403527
2538	NC_016112	CGA	2	6	161549	161554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403527
2539	NC_016112	TTG	2	6	161571	161576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403527
2540	NC_016112	GAA	2	6	161604	161609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403527
2541	NC_016112	TGC	2	6	161681	161686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403527
2542	NC_016112	GC	3	6	161685	161690	0 %	0 %	50 %	50 %	357403527
2543	NC_016112	AGC	2	6	161716	161721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403527
2544	NC_016112	TAT	2	6	161775	161780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403527
2545	NC_016112	GT	3	6	161809	161814	0 %	50 %	50 %	0 %	357403527
2546	NC_016112	A	7	7	161830	161836	100 %	0 %	0 %	0 %	357403527
2547	NC_016112	GC	3	6	161841	161846	0 %	0 %	50 %	50 %	357403527
2548	NC_016112	GCT	2	6	161876	161881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403527
2549	NC_016112	GA	3	6	161882	161887	50 %	0 %	50 %	0 %	357403527
2550	NC_016112	TTA	2	6	162014	162019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403527
2551	NC_016112	CG	3	6	162062	162067	0 %	0 %	50 %	50 %	357403527
2552	NC_016112	CCG	2	6	162082	162087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403527
2553	NC_016112	GTT	2	6	162116	162121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403527
2554	NC_016112	CCGAAA	2	12	162193	162204	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	357403528
2555	NC_016112	TGG	2	6	162223	162228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403528
2556	NC_016112	TTGG	2	8	162231	162238	0 %	50 %	50 %	0 %	357403528
2557	NC_016112	ACA	2	6	162321	162326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403528
2558	NC_016112	CCT	2	6	162331	162336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357403528
2559	NC_016112	GTCAA	2	10	162350	162359	40 %	20 %	20 %	20 %	357403528
2560	NC_016112	CAA	2	6	162365	162370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403528
2561	NC_016112	CGA	2	6	162399	162404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403528
2562	NC_016112	GTC	2	6	162445	162450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403528
2563	NC_016112	GAA	2	6	162484	162489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403528
2564	NC_016112	TGC	2	6	162521	162526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403528
2565	NC_016112	AGGC	2	8	162527	162534	25 %	0 %	50 %	25 %	357403528
2566	NC_016112	AG	3	6	162541	162546	50 %	0 %	50 %	0 %	357403528
2567	NC_016112	AGTC	2	8	162732	162739	25 %	25 %	25 %	25 %	357403528
2568	NC_016112	ATTG	2	8	162740	162747	25 %	50 %	25 %	0 %	357403528
2569	NC_016112	T	6	6	164949	164954	0 %	100 %	0 %	0 %	357403529
2570	NC_016112	GC	4	8	164967	164974	0 %	0 %	50 %	50 %	357403529
2571	NC_016112	ATAG	2	8	165001	165008	50 %	25 %	25 %	0 %	357403529
2572	NC_016112	TCA	2	6	165018	165023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403529
2573	NC_016112	CGT	2	6	165103	165108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403529
2574	NC_016112	AG	3	6	165113	165118	50 %	0 %	50 %	0 %	357403529
2575	NC_016112	GTT	2	6	165142	165147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403529
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2577	NC_016112	GC	3	6	165177	165182	0 %	0 %	50 %	50 %	357403529
2578	NC_016112	TCG	2	6	165269	165274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403529
2579	NC_016112	GCG	2	6	165278	165283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403529
2580	NC_016112	GC	4	8	165314	165321	0 %	0 %	50 %	50 %	357403529
2581	NC_016112	GCA	2	6	165360	165365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403529
2582	NC_016112	CAGG	2	8	165445	165452	25 %	0 %	50 %	25 %	357403529
2583	NC_016112	T	6	6	165532	165537	0 %	100 %	0 %	0 %	357403529
2584	NC_016112	GAT	2	6	165547	165552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403529
2585	NC_016112	T	8	8	165558	165565	0 %	100 %	0 %	0 %	357403529
2586	NC_016112	GCG	3	9	165587	165595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403529
2587	NC_016112	CG	3	6	165600	165605	0 %	0 %	50 %	50 %	357403529
2588	NC_016112	CGC	2	6	165615	165620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403529
2589	NC_016112	GCA	2	6	165633	165638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403529
2590	NC_016112	CGT	2	6	165646	165651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403529
2591	NC_016112	GCG	2	6	165661	165666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403529
2592	NC_016112	TCG	2	6	165674	165679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403529
2593	NC_016112	T	8	8	165696	165703	0 %	100 %	0 %	0 %	357403529
2594	NC_016112	ATG	2	6	165725	165730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403529
2595	NC_016112	TGCCA	2	10	165786	165795	20 %	20 %	20 %	40 %	357403530
2596	NC_016112	CGA	2	6	165884	165889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403530
2597	NC_016112	CT	3	6	165943	165948	0 %	50 %	0 %	50 %	357403530
2598	NC_016112	TCT	2	6	166090	166095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403530
2599	NC_016112	GCTG	2	8	166115	166122	0 %	25 %	50 %	25 %	357403530
2600	NC_016112	T	7	7	166128	166134	0 %	100 %	0 %	0 %	357403530
2601	NC_016112	CCGA	2	8	166264	166271	25 %	0 %	25 %	50 %	357403530
2602	NC_016112	A	6	6	166306	166311	100 %	0 %	0 %	0 %	357403530
2603	NC_016112	ACG	2	6	166459	166464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403530
2604	NC_016112	CGC	2	6	166538	166543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403530
2605	NC_016112	CAG	2	6	166583	166588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403530
2606	NC_016112	CCG	2	6	166663	166668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403530
2607	NC_016112	ATA	2	6	166672	166677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403530
2608	NC_016112	GCA	2	6	166866	166871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403531
2609	NC_016112	TTC	2	6	166957	166962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403531
2610	NC_016112	GTT	2	6	167065	167070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403531
2611	NC_016112	GAT	2	6	167143	167148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403531
2612	NC_016112	AC	3	6	167188	167193	50 %	0 %	0 %	50 %	357403531
2613	NC_016112	TCG	2	6	167327	167332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403531
2614	NC_016112	GCCT	2	8	167454	167461	0 %	25 %	25 %	50 %	357403532
2615	NC_016112	CGGCC	2	10	167486	167495	0 %	0 %	40 %	60 %	357403532
2616	NC_016112	CGG	2	6	167588	167593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403532
2617	NC_016112	ACCG	2	8	167640	167647	25 %	0 %	25 %	50 %	357403532
2618	NC_016112	CGC	2	6	167660	167665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403532
2619	NC_016112	GAT	2	6	167688	167693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403532
2620	NC_016112	CG	3	6	167700	167705	0 %	0 %	50 %	50 %	357403532
2621	NC_016112	GC	3	6	167714	167719	0 %	0 %	50 %	50 %	357403532
2622	NC_016112	GCCG	2	8	167730	167737	0 %	0 %	50 %	50 %	357403532
2623	NC_016112	CTT	2	6	167774	167779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403532
2624	NC_016112	CGA	2	6	167831	167836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403532
2625	NC_016112	CGT	2	6	167885	167890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403532
2626	NC_016112	GATC	2	8	167900	167907	25 %	25 %	25 %	25 %	357403532
2627	NC_016112	CGCGC	2	10	167982	167991	0 %	0 %	40 %	60 %	357403532
2628	NC_016112	AACCGT	2	12	168015	168026	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	357403532
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2630	NC_016112	CGA	2	6	168065	168070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403532
2631	NC_016112	CAACG	2	10	168121	168130	40 %	0 %	20 %	40 %	357403532
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2643	NC_016112	GCG	2	6	168830	168835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403532
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2741	NC_016112	GAAG	2	8	175632	175639	50 %	0 %	50 %	0 %	357403538
2742	NC_016112	GTC	2	6	175831	175836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403538
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2745	NC_016112	ATC	2	6	175944	175949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403538
2746	NC_016112	GCT	2	6	175977	175982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403538
2747	NC_016112	A	6	6	176015	176020	100 %	0 %	0 %	0 %	357403538
2748	NC_016112	CGA	2	6	176052	176057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403538
2749	NC_016112	CGG	2	6	176071	176076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403538
2750	NC_016112	A	6	6	176098	176103	100 %	0 %	0 %	0 %	357403538
2751	NC_016112	T	6	6	176112	176117	0 %	100 %	0 %	0 %	357403538
2752	NC_016112	GGTG	2	8	176118	176125	0 %	25 %	75 %	0 %	357403538
2753	NC_016112	GGA	2	6	176175	176180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357403538
2754	NC_016112	AAG	2	6	176185	176190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403538
2755	NC_016112	ATC	2	6	176356	176361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403538
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2758	NC_016112	CGA	2	6	176433	176438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403538
2759	NC_016112	GAA	2	6	176599	176604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403538
2760	NC_016112	TGC	2	6	176724	176729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403538
2761	NC_016112	ATCAA	2	10	176765	176774	60 %	20 %	0 %	20 %	357403538
2762	NC_016112	A	6	6	176782	176787	100 %	0 %	0 %	0 %	357403538
2763	NC_016112	AGCGA	2	10	176894	176903	40 %	0 %	40 %	20 %	357403538
2764	NC_016112	ATC	2	6	176914	176919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403538
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2766	NC_016112	AAATC	2	10	177259	177268	60 %	20 %	0 %	20 %	357403539
2767	NC_016112	TCC	2	6	177344	177349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357403539
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2770	NC_016112	AATG	2	8	177476	177483	50 %	25 %	25 %	0 %	357403539
2771	NC_016112	A	6	6	177536	177541	100 %	0 %	0 %	0 %	357403539
2772	NC_016112	CAT	2	6	177598	177603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403539
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2774	NC_016112	CG	3	6	177631	177636	0 %	0 %	50 %	50 %	357403539
2775	NC_016112	TGCT	2	8	177848	177855	0 %	50 %	25 %	25 %	357403539
2776	NC_016112	CGC	2	6	177882	177887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403539
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2778	NC_016112	CGA	2	6	178548	178553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403540
2779	NC_016112	CGGC	2	8	178582	178589	0 %	0 %	50 %	50 %	357403540
2780	NC_016112	CAT	2	6	178638	178643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403540
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2788	NC_016112	ACC	2	6	179016	179021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357403540
2789	NC_016112	TCG	2	6	179059	179064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403540
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2833	NC_016112	TCG	2	6	181230	181235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403542
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2845	NC_016112	ATTC	2	8	181915	181922	25 %	50 %	0 %	25 %	357403542
2846	NC_016112	AAC	2	6	181953	181958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403542
2847	NC_016112	CGA	2	6	181987	181992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403542
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2849	NC_016112	TGA	2	6	182118	182123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403542
2850	NC_016112	A	7	7	182136	182142	100 %	0 %	0 %	0 %	357403542
2851	NC_016112	ATGCG	2	10	182229	182238	20 %	20 %	40 %	20 %	357403542
2852	NC_016112	GTG	2	6	182255	182260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403542
2853	NC_016112	TGT	2	6	182309	182314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403542
2854	NC_016112	ATA	2	6	182337	182342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403542
2855	NC_016112	AAGCC	2	10	182386	182395	40 %	0 %	20 %	40 %	357403542
2856	NC_016112	GTT	2	6	182413	182418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403542
2857	NC_016112	CCAT	2	8	182466	182473	25 %	25 %	0 %	50 %	357403542
2858	NC_016112	ATTAAC	2	12	182532	182543	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	357403542
2859	NC_016112	TACAG	2	10	182569	182578	40 %	20 %	20 %	20 %	357403542
2860	NC_016112	GA	3	6	182635	182640	50 %	0 %	50 %	0 %	357403542
2861	NC_016112	TAA	2	6	182695	182700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403543
2862	NC_016112	GCCG	2	8	182828	182835	0 %	0 %	50 %	50 %	357403543
2863	NC_016112	AGC	2	6	182976	182981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403543
2864	NC_016112	GC	3	6	183043	183048	0 %	0 %	50 %	50 %	357403543
2865	NC_016112	ATA	2	6	183082	183087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403543
2866	NC_016112	GTG	2	6	183148	183153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403543
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2868	NC_016112	TTC	2	6	183290	183295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403543
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2870	NC_016112	GGC	2	6	183347	183352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403543
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2989	NC_016112	CGAT	2	8	191492	191499	25 %	25 %	25 %	25 %	357403553
2990	NC_016112	CGA	2	6	191502	191507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403553
2991	NC_016112	CGA	2	6	191517	191522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403553
2992	NC_016112	TTG	2	6	191527	191532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403553
2993	NC_016112	A	6	6	191546	191551	100 %	0 %	0 %	0 %	357403553
2994	NC_016112	ACCG	2	8	191553	191560	25 %	0 %	25 %	50 %	357403553
2995	NC_016112	CGA	2	6	191592	191597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403553
2996	NC_016112	GTC	2	6	191626	191631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403553
2997	NC_016112	GGC	2	6	191656	191661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403553
2998	NC_016112	GCG	2	6	191675	191680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403553
2999	NC_016112	CGGT	2	8	191702	191709	0 %	25 %	50 %	25 %	357403553
3000	NC_016112	TCAGGC	2	12	191748	191759	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	357403553

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