MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140010059 chromosome

Total Repeats: 3116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015848	TCATC	2	10	902	911	20 %	40 %	0 %	40 %	340625034
2	NC_015848	CGTTT	2	10	2092	2101	0 %	60 %	20 %	20 %	340625035
3	NC_015848	CGGTT	2	10	3241	3250	0 %	40 %	40 %	20 %	340625035
4	NC_015848	GTCGG	2	10	4589	4598	0 %	20 %	60 %	20 %	340625037
5	NC_015848	GCAGC	2	10	7373	7382	20 %	0 %	40 %	40 %	340625039
6	NC_015848	CGGTG	2	10	9281	9290	0 %	20 %	60 %	20 %	340625039
7	NC_015848	CAGAC	2	10	9799	9808	40 %	0 %	20 %	40 %	340625039
8	NC_015848	CCGGC	2	10	10249	10258	0 %	0 %	40 %	60 %	340625040
9	NC_015848	CGCAA	2	10	10270	10279	40 %	0 %	20 %	40 %	340625040
10	NC_015848	CGGCG	2	10	10396	10405	0 %	0 %	60 %	40 %	340625040
11	NC_015848	GGCGT	2	10	14101	14110	0 %	20 %	60 %	20 %	340625045
12	NC_015848	GGGCC	2	10	14384	14393	0 %	0 %	60 %	40 %	340625045
13	NC_015848	GCGTT	2	10	15129	15138	0 %	40 %	40 %	20 %	340625046
14	NC_015848	CCAGC	2	10	15669	15678	20 %	0 %	20 %	60 %	340625047
15	NC_015848	ACCGA	2	10	16432	16441	40 %	0 %	20 %	40 %	340625047
16	NC_015848	ATCGG	2	10	16824	16833	20 %	20 %	40 %	20 %	340625047
17	NC_015848	CGGCC	2	10	17833	17842	0 %	0 %	40 %	60 %	340625048
18	NC_015848	TTAGC	2	10	18984	18993	20 %	40 %	20 %	20 %	340625049
19	NC_015848	GGTCC	2	10	19056	19065	0 %	20 %	40 %	40 %	340625049
20	NC_015848	GTCGT	2	10	21575	21584	0 %	40 %	40 %	20 %	340625050
21	NC_015848	ATCAC	2	10	23848	23857	40 %	20 %	0 %	40 %	340625053
22	NC_015848	GCCGG	2	10	24535	24544	0 %	0 %	60 %	40 %	340625053
23	NC_015848	GGCAA	2	10	29230	29239	40 %	0 %	40 %	20 %	340625058
24	NC_015848	CGATC	2	10	30056	30065	20 %	20 %	20 %	40 %	340625059
25	NC_015848	CGACG	2	10	32243	32252	20 %	0 %	40 %	40 %	340625062
26	NC_015848	GCGTC	2	10	32298	32307	0 %	20 %	40 %	40 %	340625062
27	NC_015848	GACAC	2	10	32395	32404	40 %	0 %	20 %	40 %	340625062
28	NC_015848	TCCTG	2	10	37400	37409	0 %	40 %	20 %	40 %	340625068
29	NC_015848	CTCGG	2	10	37493	37502	0 %	20 %	40 %	40 %	340625068
30	NC_015848	GGCGC	2	10	38036	38045	0 %	0 %	60 %	40 %	340625068
31	NC_015848	TGGCC	2	10	38184	38193	0 %	20 %	40 %	40 %	340625068
32	NC_015848	CGGCG	2	10	38716	38725	0 %	0 %	60 %	40 %	340625068
33	NC_015848	GTCCA	2	10	39441	39450	20 %	20 %	20 %	40 %	340625069
34	NC_015848	GCCAA	2	10	41575	41584	40 %	0 %	20 %	40 %	340625071
35	NC_015848	GCACA	2	10	42374	42383	40 %	0 %	20 %	40 %	340625072
36	NC_015848	GGTAC	2	10	44908	44917	20 %	20 %	40 %	20 %	340625074
37	NC_015848	TCGAA	2	10	45140	45149	40 %	20 %	20 %	20 %	340625074
38	NC_015848	GCACC	2	10	46070	46079	20 %	0 %	20 %	60 %	340625074
39	NC_015848	CGGTG	2	10	47104	47113	0 %	20 %	60 %	20 %	340625075
40	NC_015848	TCATG	2	10	47250	47259	20 %	40 %	20 %	20 %	340625075
41	NC_015848	GCAGC	2	10	48644	48653	20 %	0 %	40 %	40 %	340625077
42	NC_015848	CCCGA	2	10	48727	48736	20 %	0 %	20 %	60 %	340625077
43	NC_015848	CAGCG	2	10	49852	49861	20 %	0 %	40 %	40 %	340625078
44	NC_015848	CTCCC	2	10	56292	56301	0 %	20 %	0 %	80 %	340625084
45	NC_015848	CGGCG	2	10	56741	56750	0 %	0 %	60 %	40 %	340625084
46	NC_015848	CGACC	2	10	58273	58282	20 %	0 %	20 %	60 %	340625086
47	NC_015848	CTTCG	2	10	58960	58969	0 %	40 %	20 %	40 %	340625087
48	NC_015848	CGGTG	2	10	60016	60025	0 %	20 %	60 %	20 %	340625090
49	NC_015848	TCAGG	2	10	62502	62511	20 %	20 %	40 %	20 %	340625091
50	NC_015848	CGGCG	2	10	66044	66053	0 %	0 %	60 %	40 %	340625095
51	NC_015848	GGCGA	2	10	66465	66474	20 %	0 %	60 %	20 %	340625095
52	NC_015848	CGGCC	2	10	69309	69318	0 %	0 %	40 %	60 %	340625097
53	NC_015848	GGTGT	2	10	71013	71022	0 %	40 %	60 %	0 %	340625098
54	NC_015848	ATCGG	2	10	71650	71659	20 %	20 %	40 %	20 %	340625098
55	NC_015848	CCGCG	2	10	72187	72196	0 %	0 %	40 %	60 %	340625098
56	NC_015848	GGCAA	2	10	72538	72547	40 %	0 %	40 %	20 %	340625098
57	NC_015848	CGACC	2	10	72827	72836	20 %	0 %	20 %	60 %	340625098
58	NC_015848	CGGGT	2	10	73281	73290	0 %	20 %	60 %	20 %	340625098
59	NC_015848	TGCCT	2	10	74082	74091	0 %	40 %	20 %	40 %	340625099
60	NC_015848	GTCCA	2	10	74953	74962	20 %	20 %	20 %	40 %	340625100
61	NC_015848	TGACC	2	10	77577	77586	20 %	20 %	20 %	40 %	340625102
62	NC_015848	GCCAA	2	10	77891	77900	40 %	0 %	20 %	40 %	340625102
63	NC_015848	GTCGC	2	10	77968	77977	0 %	20 %	40 %	40 %	340625102
64	NC_015848	GCGCG	2	10	79056	79065	0 %	0 %	60 %	40 %	340625103
65	NC_015848	CACGA	2	10	81913	81922	40 %	0 %	20 %	40 %	340625105
66	NC_015848	GAGCA	2	10	84451	84460	40 %	0 %	40 %	20 %	340625107
67	NC_015848	GCCGG	2	10	84550	84559	0 %	0 %	60 %	40 %	340625107
68	NC_015848	GCGAC	2	10	84626	84635	20 %	0 %	40 %	40 %	340625107
69	NC_015848	ATCCG	2	10	85396	85405	20 %	20 %	20 %	40 %	340625108
70	NC_015848	CACCG	2	10	86176	86185	20 %	0 %	20 %	60 %	340625109
71	NC_015848	TGGTC	2	10	88311	88320	0 %	40 %	40 %	20 %	340625111
72	NC_015848	GCTGG	2	10	88948	88957	0 %	20 %	60 %	20 %	340625112
73	NC_015848	TGGGT	2	10	91986	91995	0 %	40 %	60 %	0 %	340625117
74	NC_015848	TCGCC	2	10	92193	92202	0 %	20 %	20 %	60 %	340625117
75	NC_015848	GGGTC	2	10	92700	92709	0 %	20 %	60 %	20 %	340625118
76	NC_015848	CGGGC	2	10	93165	93174	0 %	0 %	60 %	40 %	340625118
77	NC_015848	GGCCG	2	10	94485	94494	0 %	0 %	60 %	40 %	340625119
78	NC_015848	GCGCC	2	10	95137	95146	0 %	0 %	40 %	60 %	340625119
79	NC_015848	CGCAC	2	10	96462	96471	20 %	0 %	20 %	60 %	340625121
80	NC_015848	GGTTG	2	10	96860	96869	0 %	40 %	60 %	0 %	340625121
81	NC_015848	AGATC	2	10	97680	97689	40 %	20 %	20 %	20 %	340625122
82	NC_015848	TCAGT	2	10	99546	99555	20 %	40 %	20 %	20 %	340625123
83	NC_015848	CGGCG	2	10	102811	102820	0 %	0 %	60 %	40 %	340625127
84	NC_015848	GTCGA	2	10	104270	104279	20 %	20 %	40 %	20 %	340625129
85	NC_015848	GCGCC	2	10	106702	106711	0 %	0 %	40 %	60 %	340625130
86	NC_015848	GTCGA	2	10	107075	107084	20 %	20 %	40 %	20 %	340625130
87	NC_015848	CTGGC	2	10	109094	109103	0 %	20 %	40 %	40 %	340625132
88	NC_015848	GCACA	2	10	110215	110224	40 %	0 %	20 %	40 %	340625132
89	NC_015848	ATCGC	2	10	113040	113049	20 %	20 %	20 %	40 %	340625135
90	NC_015848	TCTGA	2	10	114374	114383	20 %	40 %	20 %	20 %	340625137
91	NC_015848	CGGTC	2	10	114649	114658	0 %	20 %	40 %	40 %	340625137
92	NC_015848	GACCA	2	10	115787	115796	40 %	0 %	20 %	40 %	340625137
93	NC_015848	GGCTG	2	10	118351	118360	0 %	20 %	60 %	20 %	340625137
94	NC_015848	CCGCG	2	10	122271	122280	0 %	0 %	40 %	60 %	340625138
95	NC_015848	TCGTG	2	10	126224	126233	0 %	40 %	40 %	20 %	340625140
96	NC_015848	CCGGA	2	10	128004	128013	20 %	0 %	40 %	40 %	340625142
97	NC_015848	ATCAC	2	10	134958	134967	40 %	20 %	0 %	40 %	340625144
98	NC_015848	ATCGG	2	10	135006	135015	20 %	20 %	40 %	20 %	340625144
99	NC_015848	CGGGC	2	10	136097	136106	0 %	0 %	60 %	40 %	340625144
100	NC_015848	GCGAT	2	10	137902	137911	20 %	20 %	40 %	20 %	340625146
101	NC_015848	GTTCG	2	10	138123	138132	0 %	40 %	40 %	20 %	340625146
102	NC_015848	CCTGG	2	10	138515	138524	0 %	20 %	40 %	40 %	340625146
103	NC_015848	GGCCC	2	10	138621	138630	0 %	0 %	40 %	60 %	340625146
104	NC_015848	CGTTG	2	10	139133	139142	0 %	40 %	40 %	20 %	340625146
105	NC_015848	CGACC	2	10	139205	139214	20 %	0 %	20 %	60 %	340625146
106	NC_015848	GAGAT	2	10	142225	142234	40 %	20 %	40 %	0 %	340625150
107	NC_015848	CGGCG	2	10	144380	144389	0 %	0 %	60 %	40 %	340625151
108	NC_015848	TGCGG	2	10	145013	145022	0 %	20 %	60 %	20 %	340625152
109	NC_015848	CGCTG	2	10	145720	145729	0 %	20 %	40 %	40 %	340625153
110	NC_015848	GTTGC	2	10	146266	146275	0 %	40 %	40 %	20 %	340625153
111	NC_015848	CCGAT	2	10	147014	147023	20 %	20 %	20 %	40 %	340625153
112	NC_015848	ATCGC	2	10	147705	147714	20 %	20 %	20 %	40 %	340625154
113	NC_015848	AACCG	2	10	148444	148453	40 %	0 %	20 %	40 %	340625154
114	NC_015848	CCGCC	2	10	149031	149040	0 %	0 %	20 %	80 %	340625154
115	NC_015848	CCGCC	2	10	149674	149683	0 %	0 %	20 %	80 %	340625155
116	NC_015848	ATCGG	2	10	153158	153167	20 %	20 %	40 %	20 %	340625159
117	NC_015848	TCGTC	2	10	158349	158358	0 %	40 %	20 %	40 %	340625162
118	NC_015848	CACGC	2	10	158813	158822	20 %	0 %	20 %	60 %	340625162
119	NC_015848	ATTCT	2	10	159657	159666	20 %	60 %	0 %	20 %	340625163
120	NC_015848	AGGCG	2	10	160185	160194	20 %	0 %	60 %	20 %	340625163
121	NC_015848	GTCTG	2	10	162556	162565	0 %	40 %	40 %	20 %	340625166
122	NC_015848	TGACC	2	10	163189	163198	20 %	20 %	20 %	40 %	340625166
123	NC_015848	CGGCG	2	10	163435	163444	0 %	0 %	60 %	40 %	340625166
124	NC_015848	GCACC	2	10	163605	163614	20 %	0 %	20 %	60 %	340625167
125	NC_015848	CCGCA	2	10	164783	164792	20 %	0 %	20 %	60 %	340625168
126	NC_015848	CGCGG	2	10	164862	164871	0 %	0 %	60 %	40 %	340625168
127	NC_015848	CGGTT	2	10	165189	165198	0 %	40 %	40 %	20 %	340625168
128	NC_015848	GCCGG	2	10	165650	165659	0 %	0 %	60 %	40 %	340625169
129	NC_015848	GCGCG	2	10	165772	165781	0 %	0 %	60 %	40 %	340625169
130	NC_015848	CTGGG	2	10	167986	167995	0 %	20 %	60 %	20 %	340625171
131	NC_015848	GCCGG	2	10	168579	168588	0 %	0 %	60 %	40 %	340625172
132	NC_015848	GTTGG	2	10	170548	170557	0 %	40 %	60 %	0 %	340625174
133	NC_015848	GCGTG	2	10	171714	171723	0 %	20 %	60 %	20 %	340625177
134	NC_015848	GCCGC	2	10	172387	172396	0 %	0 %	40 %	60 %	340625177
135	NC_015848	CCGCC	2	10	173638	173647	0 %	0 %	20 %	80 %	340625178
136	NC_015848	GCGCC	2	10	177768	177777	0 %	0 %	40 %	60 %	340625182
137	NC_015848	ACCAA	2	10	178475	178484	60 %	0 %	0 %	40 %	340625182
138	NC_015848	CCCGA	2	10	178485	178494	20 %	0 %	20 %	60 %	340625182
139	NC_015848	TGGTC	2	10	179142	179151	0 %	40 %	40 %	20 %	340625183
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142	NC_015848	GTGAA	2	10	181441	181450	40 %	20 %	40 %	0 %	340625185
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149	NC_015848	GTCGC	2	10	190380	190389	0 %	20 %	40 %	40 %	340625191
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152	NC_015848	GGCTG	2	10	197631	197640	0 %	20 %	60 %	20 %	340625198
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159	NC_015848	CGGGC	2	10	211280	211289	0 %	0 %	60 %	40 %	340625210
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169	NC_015848	TCGGT	3	15	222589	222603	0 %	40 %	40 %	20 %	340625222
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173	NC_015848	GAATC	2	10	227193	227202	40 %	20 %	20 %	20 %	340625226
174	NC_015848	CCCGA	2	10	227493	227502	20 %	0 %	20 %	60 %	340625226
175	NC_015848	GCGTC	2	10	228649	228658	0 %	20 %	40 %	40 %	340625227
176	NC_015848	CCGTG	2	10	228802	228811	0 %	20 %	40 %	40 %	340625227
177	NC_015848	GCCGC	2	10	229262	229271	0 %	0 %	40 %	60 %	340625228
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236	NC_015848	GGCCG	2	10	321694	321703	0 %	0 %	60 %	40 %	340625300
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245	NC_015848	CCGGC	2	10	338657	338666	0 %	0 %	40 %	60 %	340625312
246	NC_015848	CTCGA	2	10	342325	342334	20 %	20 %	20 %	40 %	340625314
247	NC_015848	AGCCC	2	10	347052	347061	20 %	0 %	20 %	60 %	340625316
248	NC_015848	CAACC	2	10	350565	350574	40 %	0 %	0 %	60 %	340625318
249	NC_015848	CGCGG	2	10	351186	351195	0 %	0 %	60 %	40 %	340625318
250	NC_015848	TGCCG	2	10	351631	351640	0 %	20 %	40 %	40 %	340625319
251	NC_015848	CCGGA	2	10	352340	352349	20 %	0 %	40 %	40 %	340625319
252	NC_015848	CCCAT	2	10	356001	356010	20 %	20 %	0 %	60 %	340625321
253	NC_015848	GCCCG	2	10	356033	356042	0 %	0 %	40 %	60 %	340625321
254	NC_015848	GCCCG	2	10	356964	356973	0 %	0 %	40 %	60 %	340625322
255	NC_015848	CGGTT	2	10	359307	359316	0 %	40 %	40 %	20 %	340625322
256	NC_015848	AGCGC	2	10	360211	360220	20 %	0 %	40 %	40 %	340625323
257	NC_015848	GTGGC	2	10	360660	360669	0 %	20 %	60 %	20 %	340625324
258	NC_015848	GGGCT	2	10	361284	361293	0 %	20 %	60 %	20 %	340625324
259	NC_015848	CGGCG	2	10	365648	365657	0 %	0 %	60 %	40 %	340625329
260	NC_015848	ACACC	2	10	366271	366280	40 %	0 %	0 %	60 %	340625329
261	NC_015848	TGACG	2	10	368333	368342	20 %	20 %	40 %	20 %	340625331
262	NC_015848	GCCAA	2	10	376255	376264	40 %	0 %	20 %	40 %	340625336
263	NC_015848	TCCAC	2	10	378210	378219	20 %	20 %	0 %	60 %	340625336
264	NC_015848	ATGGG	2	10	384112	384121	20 %	20 %	60 %	0 %	340625337
265	NC_015848	GCGCC	2	10	388715	388724	0 %	0 %	40 %	60 %	340625343
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380	NC_015848	CGGGG	2	10	536344	536353	0 %	0 %	80 %	20 %	340625462
381	NC_015848	CGGTC	2	10	544668	544677	0 %	20 %	40 %	40 %	340625470
382	NC_015848	AGCTG	2	10	548125	548134	20 %	20 %	40 %	20 %	340625474
383	NC_015848	CGCGG	2	10	548409	548418	0 %	0 %	60 %	40 %	340625474
384	NC_015848	CCGGC	2	10	554802	554811	0 %	0 %	40 %	60 %	340625478
385	NC_015848	GGGTC	2	10	556203	556212	0 %	20 %	60 %	20 %	340625481
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391	NC_015848	CGGGC	2	10	561287	561296	0 %	0 %	60 %	40 %	340625484
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