MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methanosalsum zhilinae DSM 4017 chromosome

Total Repeats: 1415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015676	CTGTA	2	10	540	549	20 %	40 %	20 %	20 %	336475960
2	NC_015676	CTGAT	2	10	1302	1311	20 %	40 %	20 %	20 %	336475960
3	NC_015676	AAATG	2	10	4653	4662	60 %	20 %	20 %	0 %	336475963
4	NC_015676	GAAAA	2	10	5669	5678	80 %	0 %	20 %	0 %	336475964
5	NC_015676	AAAAG	2	10	6049	6058	80 %	0 %	20 %	0 %	336475964
6	NC_015676	GTACA	2	10	10833	10842	40 %	20 %	20 %	20 %	336475968
7	NC_015676	TCACA	2	10	13257	13266	40 %	20 %	0 %	40 %	336475970
8	NC_015676	CTTTA	2	10	13929	13938	20 %	60 %	0 %	20 %	336475971
9	NC_015676	AATGA	2	10	14659	14668	60 %	20 %	20 %	0 %	336475971
10	NC_015676	ATATC	2	10	17735	17744	40 %	40 %	0 %	20 %	336475975
11	NC_015676	CATTC	2	10	18581	18590	20 %	40 %	0 %	40 %	336475976
12	NC_015676	TTGCT	2	10	19254	19263	0 %	60 %	20 %	20 %	336475976
13	NC_015676	CATCT	2	10	21052	21061	20 %	40 %	0 %	40 %	336475978
14	NC_015676	GAATA	2	10	23678	23687	60 %	20 %	20 %	0 %	336475981
15	NC_015676	ATCCA	2	10	26808	26817	40 %	20 %	0 %	40 %	336475984
16	NC_015676	AGATG	2	10	29716	29725	40 %	20 %	40 %	0 %	336475987
17	NC_015676	GTGAG	2	10	30737	30746	20 %	20 %	60 %	0 %	336475988
18	NC_015676	ATGGT	2	10	31388	31397	20 %	40 %	40 %	0 %	336475988
19	NC_015676	TCTTT	2	10	34539	34548	0 %	80 %	0 %	20 %	336475991
20	NC_015676	CTTTC	2	10	34782	34791	0 %	60 %	0 %	40 %	336475991
21	NC_015676	CCCAT	2	10	35666	35675	20 %	20 %	0 %	60 %	336475991
22	NC_015676	CTGGG	2	10	36005	36014	0 %	20 %	60 %	20 %	336475991
23	NC_015676	GATGG	2	10	36956	36965	20 %	20 %	60 %	0 %	336475993
24	NC_015676	CATCT	2	10	45674	45683	20 %	40 %	0 %	40 %	336475995
25	NC_015676	ATCTG	2	10	49182	49191	20 %	40 %	20 %	20 %	336475999
26	NC_015676	TCTGG	2	10	49215	49224	0 %	40 %	40 %	20 %	336475999
27	NC_015676	TGAAA	2	10	50826	50835	60 %	20 %	20 %	0 %	336476002
28	NC_015676	TTACT	2	10	51252	51261	20 %	60 %	0 %	20 %	336476002
29	NC_015676	GCTCA	2	10	51577	51586	20 %	20 %	20 %	40 %	336476002
30	NC_015676	ACTAT	2	10	51812	51821	40 %	40 %	0 %	20 %	336476002
31	NC_015676	GAAGA	2	10	52390	52399	60 %	0 %	40 %	0 %	336476002
32	NC_015676	GTCTG	2	10	54439	54448	0 %	40 %	40 %	20 %	336476004
33	NC_015676	ATATT	2	10	58286	58295	40 %	60 %	0 %	0 %	336476009
34	NC_015676	AAATG	2	10	61803	61812	60 %	20 %	20 %	0 %	336476011
35	NC_015676	TCCTC	2	10	62720	62729	0 %	40 %	0 %	60 %	336476012
36	NC_015676	GATCC	2	10	63523	63532	20 %	20 %	20 %	40 %	336476014
37	NC_015676	TATGT	2	10	65912	65921	20 %	60 %	20 %	0 %	336476017
38	NC_015676	AGTGT	2	10	66782	66791	20 %	40 %	40 %	0 %	336476018
39	NC_015676	GAAAT	2	10	66927	66936	60 %	20 %	20 %	0 %	336476018
40	NC_015676	TCCCA	2	10	68898	68907	20 %	20 %	0 %	60 %	336476020
41	NC_015676	TGCCT	2	10	69634	69643	0 %	40 %	20 %	40 %	336476021
42	NC_015676	TGCTG	2	10	71930	71939	0 %	40 %	40 %	20 %	336476023
43	NC_015676	CACAG	2	10	72110	72119	40 %	0 %	20 %	40 %	336476023
44	NC_015676	AGATC	2	10	72342	72351	40 %	20 %	20 %	20 %	336476024
45	NC_015676	TGGGT	2	10	84918	84927	0 %	40 %	60 %	0 %	336476038
46	NC_015676	TACTG	2	10	85343	85352	20 %	40 %	20 %	20 %	336476038
47	NC_015676	TCTGG	2	10	86590	86599	0 %	40 %	40 %	20 %	336476039
48	NC_015676	TGTAT	2	10	87955	87964	20 %	60 %	20 %	0 %	336476040
49	NC_015676	AAAAC	2	10	98705	98714	80 %	0 %	0 %	20 %	336476051
50	NC_015676	GTTCA	2	10	99490	99499	20 %	40 %	20 %	20 %	336476053
51	NC_015676	CTGTT	2	10	99596	99605	0 %	60 %	20 %	20 %	336476053
52	NC_015676	ATCTG	2	10	104515	104524	20 %	40 %	20 %	20 %	336476058
53	NC_015676	CTATA	2	10	105198	105207	40 %	40 %	0 %	20 %	336476059
54	NC_015676	ATTGC	2	10	107690	107699	20 %	40 %	20 %	20 %	336476062
55	NC_015676	CTCAT	2	10	107884	107893	20 %	40 %	0 %	40 %	336476062
56	NC_015676	ACTGC	2	10	108027	108036	20 %	20 %	20 %	40 %	336476062
57	NC_015676	TTCAG	2	10	111063	111072	20 %	40 %	20 %	20 %	336476065
58	NC_015676	TATGA	2	10	114345	114354	40 %	40 %	20 %	0 %	336476067
59	NC_015676	TACCC	2	10	116069	116078	20 %	20 %	0 %	60 %	336476068
60	NC_015676	ATAAA	2	10	117947	117956	80 %	20 %	0 %	0 %	336476070
61	NC_015676	TTCTT	2	10	119412	119421	0 %	80 %	0 %	20 %	336476070
62	NC_015676	GAATC	2	10	119551	119560	40 %	20 %	20 %	20 %	336476070
63	NC_015676	ATTCA	2	10	119667	119676	40 %	40 %	0 %	20 %	336476070
64	NC_015676	TATAA	2	10	119936	119945	60 %	40 %	0 %	0 %	336476070
65	NC_015676	TGAAA	2	10	120854	120863	60 %	20 %	20 %	0 %	336476070
66	NC_015676	CCAGA	2	10	128463	128472	40 %	0 %	20 %	40 %	336476073
67	NC_015676	ATTTT	2	10	129180	129189	20 %	80 %	0 %	0 %	336476074
68	NC_015676	AAAAT	3	15	129961	129975	80 %	20 %	0 %	0 %	336476074
69	NC_015676	TTTTC	2	10	132177	132186	0 %	80 %	0 %	20 %	336476075
70	NC_015676	CTGAA	2	10	134087	134096	40 %	20 %	20 %	20 %	336476077
71	NC_015676	GATAT	2	10	135219	135228	40 %	40 %	20 %	0 %	336476078
72	NC_015676	TAGAA	2	10	137600	137609	60 %	20 %	20 %	0 %	336476080
73	NC_015676	TGAAT	2	10	137829	137838	40 %	40 %	20 %	0 %	336476080
74	NC_015676	ACTTT	2	10	144664	144673	20 %	60 %	0 %	20 %	336476085
75	NC_015676	TATAG	2	10	146647	146656	40 %	40 %	20 %	0 %	336476087
76	NC_015676	ATTCT	2	10	147092	147101	20 %	60 %	0 %	20 %	336476087
77	NC_015676	ATTCA	2	10	148855	148864	40 %	40 %	0 %	20 %	336476087
78	NC_015676	CATTT	2	10	148894	148903	20 %	60 %	0 %	20 %	336476087
79	NC_015676	AATTC	2	10	151230	151239	40 %	40 %	0 %	20 %	336476088
80	NC_015676	CTGAA	2	10	152056	152065	40 %	20 %	20 %	20 %	336476088
81	NC_015676	CCTGC	2	10	155483	155492	0 %	20 %	20 %	60 %	336476089
82	NC_015676	ATATT	2	10	158404	158413	40 %	60 %	0 %	0 %	336476091
83	NC_015676	TGAAC	2	10	158480	158489	40 %	20 %	20 %	20 %	336476091
84	NC_015676	TTCAG	2	10	158522	158531	20 %	40 %	20 %	20 %	336476091
85	NC_015676	CGGAT	2	10	158555	158564	20 %	20 %	40 %	20 %	336476091
86	NC_015676	ATGAA	2	10	160126	160135	60 %	20 %	20 %	0 %	336476091
87	NC_015676	TCCAG	2	10	160213	160222	20 %	20 %	20 %	40 %	336476091
88	NC_015676	TCTTA	2	10	160463	160472	20 %	60 %	0 %	20 %	336476091
89	NC_015676	TGGTC	2	10	161693	161702	0 %	40 %	40 %	20 %	336476092
90	NC_015676	TATAA	2	10	166041	166050	60 %	40 %	0 %	0 %	336476097
91	NC_015676	ATTCA	2	10	166357	166366	40 %	40 %	0 %	20 %	336476098
92	NC_015676	ATGGC	2	10	166886	166895	20 %	20 %	40 %	20 %	336476098
93	NC_015676	GATCA	2	10	170049	170058	40 %	20 %	20 %	20 %	336476100
94	NC_015676	TGGAA	2	10	171024	171033	40 %	20 %	40 %	0 %	336476100
95	NC_015676	GGGCT	2	10	171162	171171	0 %	20 %	60 %	20 %	336476100
96	NC_015676	GAACA	2	10	171418	171427	60 %	0 %	20 %	20 %	336476100
97	NC_015676	AGAAC	2	10	172965	172974	60 %	0 %	20 %	20 %	336476101
98	NC_015676	TGATT	2	10	174169	174178	20 %	60 %	20 %	0 %	336476102
99	NC_015676	TGTAT	2	10	176170	176179	20 %	60 %	20 %	0 %	336476107
100	NC_015676	CTTCA	2	10	177706	177715	20 %	40 %	0 %	40 %	336476111
101	NC_015676	ATTTC	2	10	182409	182418	20 %	60 %	0 %	20 %	336476117
102	NC_015676	ATACC	2	10	185229	185238	40 %	20 %	0 %	40 %	336476119
103	NC_015676	CAGGA	2	10	186447	186456	40 %	0 %	40 %	20 %	336476120
104	NC_015676	CATTT	2	10	187461	187470	20 %	60 %	0 %	20 %	336476122
105	NC_015676	AGAAT	2	10	187798	187807	60 %	20 %	20 %	0 %	336476122
106	NC_015676	ATCTG	2	10	189096	189105	20 %	40 %	20 %	20 %	336476124
107	NC_015676	CAATA	2	10	189152	189161	60 %	20 %	0 %	20 %	336476124
108	NC_015676	AGGAC	2	10	189749	189758	40 %	0 %	40 %	20 %	336476124
109	NC_015676	GGAAA	2	10	191722	191731	60 %	0 %	40 %	0 %	336476126
110	NC_015676	ATGCC	2	10	192996	193005	20 %	20 %	20 %	40 %	336476128
111	NC_015676	ATGGA	2	10	193202	193211	40 %	20 %	40 %	0 %	336476128
112	NC_015676	ATTCT	2	10	194971	194980	20 %	60 %	0 %	20 %	336476130
113	NC_015676	GCCTG	2	10	195907	195916	0 %	20 %	40 %	40 %	336476131
114	NC_015676	GCAGT	2	10	196306	196315	20 %	20 %	40 %	20 %	336476131
115	NC_015676	TGCTC	2	10	197504	197513	0 %	40 %	20 %	40 %	336476133
116	NC_015676	GGATT	2	10	197975	197984	20 %	40 %	40 %	0 %	336476133
117	NC_015676	TCCAT	2	10	198248	198257	20 %	40 %	0 %	40 %	336476133
118	NC_015676	CCCCT	2	10	201453	201462	0 %	20 %	0 %	80 %	336476136
119	NC_015676	GTTTT	2	10	201957	201966	0 %	80 %	20 %	0 %	336476136
120	NC_015676	CAGAT	2	10	202869	202878	40 %	20 %	20 %	20 %	336476138
121	NC_015676	TATGG	2	10	205171	205180	20 %	40 %	40 %	0 %	336476140
122	NC_015676	TTTGA	2	10	208106	208115	20 %	60 %	20 %	0 %	336476144
123	NC_015676	TTTGT	2	10	208236	208245	0 %	80 %	20 %	0 %	336476144
124	NC_015676	CTTAT	2	10	208384	208393	20 %	60 %	0 %	20 %	336476145
125	NC_015676	TCTGT	2	10	208866	208875	0 %	60 %	20 %	20 %	336476145
126	NC_015676	TCTGC	2	10	210643	210652	0 %	40 %	20 %	40 %	336476148
127	NC_015676	CATTA	2	10	210795	210804	40 %	40 %	0 %	20 %	336476148
128	NC_015676	TGGAG	2	10	212448	212457	20 %	20 %	60 %	0 %	336476149
129	NC_015676	CCAGG	2	10	212951	212960	20 %	0 %	40 %	40 %	336476149
130	NC_015676	GATAT	2	10	213089	213098	40 %	40 %	20 %	0 %	336476149
131	NC_015676	AGAAT	2	10	213163	213172	60 %	20 %	20 %	0 %	336476149
132	NC_015676	CAGGA	2	10	216341	216350	40 %	0 %	40 %	20 %	336476149
133	NC_015676	GAGAA	2	10	218452	218461	60 %	0 %	40 %	0 %	336476149
134	NC_015676	TACAG	2	10	220393	220402	40 %	20 %	20 %	20 %	336476149
135	NC_015676	AGCTC	2	10	221522	221531	20 %	20 %	20 %	40 %	336476149
136	NC_015676	TGATC	2	10	222416	222425	20 %	40 %	20 %	20 %	336476150
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138	NC_015676	ACAGC	2	10	225559	225568	40 %	0 %	20 %	40 %	336476151
139	NC_015676	GCTAT	2	10	231418	231427	20 %	40 %	20 %	20 %	336476155
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141	NC_015676	CCTGG	2	10	236503	236512	0 %	20 %	40 %	40 %	336476161
142	NC_015676	TGGAA	2	10	240229	240238	40 %	20 %	40 %	0 %	336476164
143	NC_015676	GCAGG	2	10	240528	240537	20 %	0 %	60 %	20 %	336476164
144	NC_015676	TGAAG	2	10	242397	242406	40 %	20 %	40 %	0 %	336476165
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147	NC_015676	CGTGA	2	10	245960	245969	20 %	20 %	40 %	20 %	336476169
148	NC_015676	TGAAA	2	10	246703	246712	60 %	20 %	20 %	0 %	336476169
149	NC_015676	GAATC	2	10	249696	249705	40 %	20 %	20 %	20 %	336476173
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152	NC_015676	TATGA	2	10	252948	252957	40 %	40 %	20 %	0 %	336476177
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154	NC_015676	ATGTT	2	10	253627	253636	20 %	60 %	20 %	0 %	336476177
155	NC_015676	ATGGT	2	10	254785	254794	20 %	40 %	40 %	0 %	336476177
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165	NC_015676	CGATC	2	10	271679	271688	20 %	20 %	20 %	40 %	336476188
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167	NC_015676	TCGTT	2	10	276375	276384	0 %	60 %	20 %	20 %	336476192
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258	NC_015676	TTTCA	2	10	410460	410469	20 %	60 %	0 %	20 %	336476315
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