MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosalsum zhilinae DSM 4017 chromosome

Total Repeats: 37647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015676	GAA	2	6	203150	203155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336476138
3502	NC_015676	AAT	2	6	203206	203211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336476138
3503	NC_015676	AACA	2	8	203212	203219	75 %	0 %	0 %	25 %	336476138
3504	NC_015676	ATT	2	6	203244	203249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336476138
3505	NC_015676	A	7	7	203269	203275	100 %	0 %	0 %	0 %	336476138
3506	NC_015676	TTG	2	6	203317	203322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336476139
3507	NC_015676	ACT	2	6	203431	203436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476139
3508	NC_015676	A	6	6	203444	203449	100 %	0 %	0 %	0 %	336476139
3509	NC_015676	ATG	2	6	203490	203495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476139
3510	NC_015676	GGA	2	6	203579	203584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336476139
3511	NC_015676	GAA	2	6	203588	203593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336476139
3512	NC_015676	TTC	2	6	203627	203632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336476139
3513	NC_015676	ATA	2	6	203697	203702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336476139
3514	NC_015676	CTA	2	6	203764	203769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476139
3515	NC_015676	CAT	2	6	203860	203865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476139
3516	NC_015676	GAT	2	6	203868	203873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476139
3517	NC_015676	GGT	2	6	203958	203963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336476139
3518	NC_015676	AGG	2	6	203985	203990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336476139
3519	NC_015676	AAT	2	6	204901	204906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336476140
3520	NC_015676	A	7	7	204915	204921	100 %	0 %	0 %	0 %	336476140
3521	NC_015676	TA	3	6	204931	204936	50 %	50 %	0 %	0 %	336476140
3522	NC_015676	CTG	2	6	205048	205053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476140
3523	NC_015676	ATT	2	6	205066	205071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336476140
3524	NC_015676	GCCA	2	8	205102	205109	25 %	0 %	25 %	50 %	336476140
3525	NC_015676	AGG	2	6	205127	205132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336476140
3526	NC_015676	CAT	2	6	205143	205148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476140
3527	NC_015676	TATGG	2	10	205171	205180	20 %	40 %	40 %	0 %	336476140
3528	NC_015676	GCT	2	6	205261	205266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476140
3529	NC_015676	TCA	2	6	205307	205312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476140
3530	NC_015676	GAT	2	6	205341	205346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476140
3531	NC_015676	A	6	6	205349	205354	100 %	0 %	0 %	0 %	336476140
3532	NC_015676	AGC	3	9	205362	205370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336476140
3533	NC_015676	GCC	2	6	205409	205414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336476140
3534	NC_015676	AGA	2	6	205417	205422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336476140
3535	NC_015676	CAG	2	6	205431	205436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336476140
3536	NC_015676	A	6	6	205453	205458	100 %	0 %	0 %	0 %	336476140
3537	NC_015676	A	6	6	205491	205496	100 %	0 %	0 %	0 %	336476140
3538	NC_015676	TGT	2	6	205524	205529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336476140
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3540	NC_015676	AATG	2	8	205558	205565	50 %	25 %	25 %	0 %	336476140
3541	NC_015676	AAT	2	6	205638	205643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336476140
3542	NC_015676	ATC	2	6	205658	205663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476140
3543	NC_015676	ACT	2	6	205673	205678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476140
3544	NC_015676	A	6	6	205680	205685	100 %	0 %	0 %	0 %	336476140
3545	NC_015676	TGA	2	6	205702	205707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476141
3546	NC_015676	CAC	2	6	205729	205734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336476141
3547	NC_015676	CAG	2	6	205813	205818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336476141
3548	NC_015676	CAGG	2	8	205940	205947	25 %	0 %	50 %	25 %	336476141
3549	NC_015676	TTG	2	6	205980	205985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336476141
3550	NC_015676	AG	3	6	206016	206021	50 %	0 %	50 %	0 %	336476141
3551	NC_015676	TGCA	2	8	206116	206123	25 %	25 %	25 %	25 %	336476141
3552	NC_015676	AAT	2	6	206143	206148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336476141
3553	NC_015676	TTG	2	6	206220	206225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336476141
3554	NC_015676	GATG	2	8	206281	206288	25 %	25 %	50 %	0 %	336476141
3555	NC_015676	TG	3	6	206303	206308	0 %	50 %	50 %	0 %	336476141
3556	NC_015676	GGA	2	6	206318	206323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336476141
3557	NC_015676	T	7	7	206417	206423	0 %	100 %	0 %	0 %	336476142
3558	NC_015676	A	6	6	206424	206429	100 %	0 %	0 %	0 %	336476142
3559	NC_015676	TCA	2	6	206439	206444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476142
3560	NC_015676	AG	3	6	206579	206584	50 %	0 %	50 %	0 %	336476142
3561	NC_015676	ATA	2	6	206679	206684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336476142
3562	NC_015676	CCT	2	6	206723	206728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336476142
3563	NC_015676	ATG	2	6	206813	206818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476142
3564	NC_015676	ATA	2	6	207062	207067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336476142
3565	NC_015676	GTTA	2	8	207118	207125	25 %	50 %	25 %	0 %	336476143
3566	NC_015676	T	6	6	207138	207143	0 %	100 %	0 %	0 %	336476143
3567	NC_015676	TGAT	2	8	207145	207152	25 %	50 %	25 %	0 %	336476143
3568	NC_015676	CTT	2	6	207211	207216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336476143
3569	NC_015676	AT	4	8	207348	207355	50 %	50 %	0 %	0 %	336476143
3570	NC_015676	ATT	2	6	207540	207545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336476143
3571	NC_015676	ATT	2	6	207621	207626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336476144
3572	NC_015676	ATT	2	6	207665	207670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336476144
3573	NC_015676	CAG	2	6	207672	207677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336476144
3574	NC_015676	CCA	2	6	207749	207754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336476144
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3576	NC_015676	CAA	2	6	207789	207794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336476144
3577	NC_015676	T	7	7	207899	207905	0 %	100 %	0 %	0 %	336476144
3578	NC_015676	GAAG	2	8	207952	207959	50 %	0 %	50 %	0 %	336476144
3579	NC_015676	TAT	2	6	207979	207984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336476144
3580	NC_015676	AT	3	6	208008	208013	50 %	50 %	0 %	0 %	336476144
3581	NC_015676	TTC	2	6	208066	208071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336476144
3582	NC_015676	CT	3	6	208086	208091	0 %	50 %	0 %	50 %	336476144
3583	NC_015676	TTTGA	2	10	208106	208115	20 %	60 %	20 %	0 %	336476144
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3587	NC_015676	TTTGT	2	10	208236	208245	0 %	80 %	20 %	0 %	336476144
3588	NC_015676	TGA	2	6	208278	208283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476144
3589	NC_015676	CTTAT	2	10	208384	208393	20 %	60 %	0 %	20 %	336476145
3590	NC_015676	CAG	2	6	208414	208419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336476145
3591	NC_015676	ATA	2	6	208556	208561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336476145
3592	NC_015676	GTA	2	6	208603	208608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476145
3593	NC_015676	TC	3	6	208622	208627	0 %	50 %	0 %	50 %	336476145
3594	NC_015676	TCA	2	6	208652	208657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476145
3595	NC_015676	CTG	2	6	208662	208667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476145
3596	NC_015676	TAT	2	6	208696	208701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336476145
3597	NC_015676	CAA	2	6	208803	208808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336476145
3598	NC_015676	CAA	2	6	208836	208841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336476145
3599	NC_015676	CAT	2	6	208845	208850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476145
3600	NC_015676	TCTGT	2	10	208866	208875	0 %	60 %	20 %	20 %	336476145
3601	NC_015676	AAG	2	6	208975	208980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336476145
3602	NC_015676	CAA	2	6	208995	209000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336476145
3603	NC_015676	TCA	2	6	209037	209042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476145
3604	NC_015676	CTT	2	6	209058	209063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336476145
3605	NC_015676	AGA	2	6	209075	209080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336476145
3606	NC_015676	AAT	2	6	209224	209229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336476145
3607	NC_015676	T	6	6	209277	209282	0 %	100 %	0 %	0 %	336476146
3608	NC_015676	CAG	2	6	209349	209354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336476146
3609	NC_015676	ATG	2	6	209389	209394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476146
3610	NC_015676	CTCGAC	2	12	209466	209477	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	336476146
3611	NC_015676	CTT	2	6	209525	209530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336476146
3612	NC_015676	CAT	2	6	209547	209552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476146
3613	NC_015676	TGC	2	6	209586	209591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476146
3614	NC_015676	CAAT	2	8	209693	209700	50 %	25 %	0 %	25 %	336476146
3615	NC_015676	TCAT	2	8	210034	210041	25 %	50 %	0 %	25 %	336476147
3616	NC_015676	GAAT	2	8	210120	210127	50 %	25 %	25 %	0 %	336476147
3617	NC_015676	GAT	2	6	210163	210168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476147
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3620	NC_015676	GATG	2	8	210349	210356	25 %	25 %	50 %	0 %	336476147
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3622	NC_015676	ACA	2	6	210374	210379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336476147
3623	NC_015676	TGC	2	6	210382	210387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476147
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3743	NC_015676	CAG	2	6	216221	216226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336476149
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3860	NC_015676	A	7	7	223390	223396	100 %	0 %	0 %	0 %	336476151
3861	NC_015676	TGGC	2	8	223439	223446	0 %	25 %	50 %	25 %	336476151
3862	NC_015676	GAA	2	6	223474	223479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336476151
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3984	NC_015676	CA	3	6	231785	231790	50 %	0 %	0 %	50 %	336476155
3985	NC_015676	TGT	2	6	231896	231901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336476155
3986	NC_015676	TGAA	2	8	232006	232013	50 %	25 %	25 %	0 %	336476155
3987	NC_015676	AGA	3	9	232136	232144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336476155
3988	NC_015676	CTG	2	6	232213	232218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476155
3989	NC_015676	TGA	2	6	232289	232294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476155
3990	NC_015676	CAC	2	6	232309	232314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336476155
3991	NC_015676	TGA	2	6	232376	232381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476155
3992	NC_015676	ACA	2	6	232414	232419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336476155
3993	NC_015676	TGA	2	6	232448	232453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476155
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3997	NC_015676	CA	3	6	232664	232669	50 %	0 %	0 %	50 %	336476155
3998	NC_015676	GA	3	6	232737	232742	50 %	0 %	50 %	0 %	336476155
3999	NC_015676	AATGAA	2	12	233175	233186	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	336476156
4000	NC_015676	TGC	2	6	233211	233216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476156

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