MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosalsum zhilinae DSM 4017 chromosome

Total Repeats: 37647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_015676	TCA	2	6	175607	175612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476106
3003	NC_015676	CTT	2	6	175641	175646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336476106
3004	NC_015676	T	7	7	175793	175799	0 %	100 %	0 %	0 %	336476106
3005	NC_015676	CAT	2	6	175810	175815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476106
3006	NC_015676	CTC	2	6	175844	175849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336476106
3007	NC_015676	AAAT	2	8	176007	176014	75 %	25 %	0 %	0 %	336476107
3008	NC_015676	ATC	2	6	176045	176050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476107
3009	NC_015676	GCA	2	6	176134	176139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336476107
3010	NC_015676	TGTAT	2	10	176170	176179	20 %	60 %	20 %	0 %	336476107
3011	NC_015676	GGA	2	6	176247	176252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336476108
3012	NC_015676	ATG	2	6	176272	176277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476108
3013	NC_015676	A	6	6	176279	176284	100 %	0 %	0 %	0 %	336476108
3014	NC_015676	A	8	8	176355	176362	100 %	0 %	0 %	0 %	336476108
3015	NC_015676	TTG	2	6	176363	176368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336476108
3016	NC_015676	ATC	2	6	176377	176382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476108
3017	NC_015676	AAAG	2	8	176414	176421	75 %	0 %	25 %	0 %	336476108
3018	NC_015676	TTCC	2	8	176489	176496	0 %	50 %	0 %	50 %	336476109
3019	NC_015676	ATT	2	6	176743	176748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336476109
3020	NC_015676	ATG	2	6	176771	176776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476109
3021	NC_015676	GTA	2	6	176779	176784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476109
3022	NC_015676	TGC	2	6	176799	176804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476109
3023	NC_015676	AAT	2	6	176901	176906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336476109
3024	NC_015676	CCA	2	6	176937	176942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336476109
3025	NC_015676	TCC	2	6	176946	176951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336476109
3026	NC_015676	GTT	2	6	176967	176972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336476109
3027	NC_015676	CAG	2	6	176973	176978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336476109
3028	NC_015676	CCA	2	6	177047	177052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336476110
3029	NC_015676	AATA	2	8	177076	177083	75 %	25 %	0 %	0 %	336476110
3030	NC_015676	CCA	2	6	177118	177123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336476110
3031	NC_015676	AT	3	6	177126	177131	50 %	50 %	0 %	0 %	336476110
3032	NC_015676	ACC	2	6	177295	177300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336476110
3033	NC_015676	TCA	3	9	177311	177319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476110
3034	NC_015676	CTT	2	6	177333	177338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336476110
3035	NC_015676	T	6	6	177366	177371	0 %	100 %	0 %	0 %	336476110
3036	NC_015676	ATT	2	6	177383	177388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336476110
3037	NC_015676	TA	4	8	177397	177404	50 %	50 %	0 %	0 %	336476110
3038	NC_015676	TAC	2	6	177454	177459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476110
3039	NC_015676	ATC	2	6	177517	177522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476110
3040	NC_015676	T	6	6	177538	177543	0 %	100 %	0 %	0 %	336476110
3041	NC_015676	ATA	2	6	177554	177559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336476110
3042	NC_015676	AT	3	6	177667	177672	50 %	50 %	0 %	0 %	336476111
3043	NC_015676	TGC	2	6	177691	177696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476111
3044	NC_015676	CTTCA	2	10	177706	177715	20 %	40 %	0 %	40 %	336476111
3045	NC_015676	ATA	2	6	177803	177808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336476111
3046	NC_015676	TGC	2	6	177883	177888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476111
3047	NC_015676	AAG	2	6	177907	177912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336476111
3048	NC_015676	GCA	2	6	177923	177928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336476111
3049	NC_015676	CAA	2	6	177945	177950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336476111
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3051	NC_015676	CAC	2	6	178035	178040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336476111
3052	NC_015676	TA	3	6	178075	178080	50 %	50 %	0 %	0 %	336476111
3053	NC_015676	ATT	2	6	178100	178105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336476111
3054	NC_015676	ATA	2	6	178109	178114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336476111
3055	NC_015676	TGC	2	6	178203	178208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476111
3056	NC_015676	AGA	2	6	178316	178321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336476111
3057	NC_015676	CAG	2	6	178393	178398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336476111
3058	NC_015676	A	6	6	178448	178453	100 %	0 %	0 %	0 %	336476111
3059	NC_015676	CTT	2	6	178481	178486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336476111
3060	NC_015676	AG	4	8	178490	178497	50 %	0 %	50 %	0 %	336476111
3061	NC_015676	TGC	2	6	178498	178503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476111
3062	NC_015676	AAC	2	6	178507	178512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336476111
3063	NC_015676	AG	3	6	178524	178529	50 %	0 %	50 %	0 %	336476111
3064	NC_015676	CTGC	2	8	178574	178581	0 %	25 %	25 %	50 %	336476111
3065	NC_015676	GAT	2	6	178583	178588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476111
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3071	NC_015676	CTC	2	6	178750	178755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336476112
3072	NC_015676	CAT	2	6	178782	178787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476112
3073	NC_015676	CTTC	2	8	178828	178835	0 %	50 %	0 %	50 %	336476112
3074	NC_015676	TTC	2	6	178861	178866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336476112
3075	NC_015676	TG	3	6	178880	178885	0 %	50 %	50 %	0 %	336476112
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3079	NC_015676	AT	3	6	179092	179097	50 %	50 %	0 %	0 %	336476112
3080	NC_015676	TTTC	2	8	179127	179134	0 %	75 %	0 %	25 %	336476113
3081	NC_015676	ACA	2	6	179143	179148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336476113
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3087	NC_015676	GTTA	2	8	179502	179509	25 %	50 %	25 %	0 %	336476113
3088	NC_015676	GTT	2	6	179524	179529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336476113
3089	NC_015676	GGTT	2	8	179607	179614	0 %	50 %	50 %	0 %	336476113
3090	NC_015676	AAC	2	6	179656	179661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336476113
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3092	NC_015676	A	6	6	179682	179687	100 %	0 %	0 %	0 %	336476113
3093	NC_015676	ATC	2	6	179689	179694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476113
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3095	NC_015676	GCA	2	6	179797	179802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336476113
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3097	NC_015676	CAT	2	6	179956	179961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476114
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3099	NC_015676	CT	3	6	179995	180000	0 %	50 %	0 %	50 %	336476114
3100	NC_015676	TAA	2	6	180055	180060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336476114
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3103	NC_015676	CCT	2	6	180112	180117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336476114
3104	NC_015676	TGG	2	6	180144	180149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336476114
3105	NC_015676	GTG	2	6	180165	180170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336476114
3106	NC_015676	TCC	2	6	180211	180216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336476114
3107	NC_015676	TCA	2	6	180243	180248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476114
3108	NC_015676	TCT	2	6	180296	180301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336476114
3109	NC_015676	CT	3	6	180382	180387	0 %	50 %	0 %	50 %	336476114
3110	NC_015676	GTT	2	6	180463	180468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336476114
3111	NC_015676	T	8	8	180497	180504	0 %	100 %	0 %	0 %	336476114
3112	NC_015676	CGA	2	6	180615	180620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336476114
3113	NC_015676	TGT	2	6	180693	180698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336476114
3114	NC_015676	ATG	2	6	180817	180822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476115
3115	NC_015676	TCCT	2	8	180852	180859	0 %	50 %	0 %	50 %	336476115
3116	NC_015676	TGG	2	6	180876	180881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336476115
3117	NC_015676	ATT	2	6	180900	180905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336476115
3118	NC_015676	GCT	2	6	180978	180983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476115
3119	NC_015676	TAT	2	6	180989	180994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336476115
3120	NC_015676	TCC	2	6	181020	181025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336476115
3121	NC_015676	GCT	2	6	181096	181101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476115
3122	NC_015676	CT	3	6	181100	181105	0 %	50 %	0 %	50 %	336476115
3123	NC_015676	TCC	2	6	181113	181118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336476115
3124	NC_015676	T	7	7	181188	181194	0 %	100 %	0 %	0 %	336476115
3125	NC_015676	TCT	2	6	181240	181245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336476115
3126	NC_015676	TGT	2	6	181251	181256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336476115
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3155	NC_015676	CTT	2	6	182886	182891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336476117
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3244	NC_015676	AGAAT	2	10	187798	187807	60 %	20 %	20 %	0 %	336476122
3245	NC_015676	ATC	2	6	187889	187894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476122
3246	NC_015676	TA	3	6	188005	188010	50 %	50 %	0 %	0 %	336476123
3247	NC_015676	GCAG	2	8	188063	188070	25 %	0 %	50 %	25 %	336476123
3248	NC_015676	AGA	2	6	188269	188274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336476123
3249	NC_015676	AT	4	8	188329	188336	50 %	50 %	0 %	0 %	336476123
3250	NC_015676	CTG	2	6	188403	188408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476123
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3252	NC_015676	GCT	3	9	188601	188609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476124
3253	NC_015676	AT	3	6	188620	188625	50 %	50 %	0 %	0 %	336476124
3254	NC_015676	A	6	6	188661	188666	100 %	0 %	0 %	0 %	336476124
3255	NC_015676	GTATCT	3	18	188716	188733	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	336476124
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3258	NC_015676	CAT	2	6	189063	189068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476124
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3260	NC_015676	CAT	2	6	189081	189086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476124
3261	NC_015676	ATCTG	2	10	189096	189105	20 %	40 %	20 %	20 %	336476124
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3263	NC_015676	CAATA	2	10	189152	189161	60 %	20 %	0 %	20 %	336476124
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3265	NC_015676	TTG	2	6	189281	189286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336476124
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3269	NC_015676	CTG	2	6	189511	189516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476124
3270	NC_015676	TGC	2	6	189519	189524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476124
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3273	NC_015676	TGA	2	6	189570	189575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476124
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3277	NC_015676	CTG	2	6	189778	189783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476124
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3280	NC_015676	TGCA	2	8	189929	189936	25 %	25 %	25 %	25 %	336476125
3281	NC_015676	CGG	2	6	189950	189955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336476125
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3284	NC_015676	TTG	2	6	190120	190125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336476125
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3354	NC_015676	GT	3	6	194471	194476	0 %	50 %	50 %	0 %	336476130
3355	NC_015676	ATG	2	6	194585	194590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476130
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3358	NC_015676	TTAT	2	8	194717	194724	25 %	75 %	0 %	0 %	336476130
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3361	NC_015676	AC	3	6	194831	194836	50 %	0 %	0 %	50 %	336476130
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3366	NC_015676	TGA	2	6	195075	195080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476130
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3489	NC_015676	TGT	2	6	202489	202494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336476137
3490	NC_015676	TGA	2	6	202531	202536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476137
3491	NC_015676	TA	3	6	202608	202613	50 %	50 %	0 %	0 %	336476137
3492	NC_015676	ATGCTG	2	12	202794	202805	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	336476138
3493	NC_015676	AT	3	6	202851	202856	50 %	50 %	0 %	0 %	336476138
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3495	NC_015676	CAGAT	2	10	202869	202878	40 %	20 %	20 %	20 %	336476138
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