MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosalsum zhilinae DSM 4017 chromosome

Total Repeats: 37647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_015676	TCC	2	6	326519	326524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336476239
5503	NC_015676	CAG	2	6	326542	326547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336476239
5504	NC_015676	TGC	2	6	326701	326706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476239
5505	NC_015676	CAG	2	6	326770	326775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336476239
5506	NC_015676	TGT	2	6	326776	326781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336476239
5507	NC_015676	GAG	2	6	326782	326787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336476239
5508	NC_015676	TCT	2	6	326817	326822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336476239
5509	NC_015676	TGT	2	6	326832	326837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336476239
5510	NC_015676	CTG	2	6	326867	326872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476239
5511	NC_015676	A	6	6	326901	326906	100 %	0 %	0 %	0 %	336476239
5512	NC_015676	CAGA	2	8	326920	326927	50 %	0 %	25 %	25 %	336476239
5513	NC_015676	TGA	2	6	327196	327201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476240
5514	NC_015676	GA	4	8	327231	327238	50 %	0 %	50 %	0 %	336476240
5515	NC_015676	TC	3	6	327251	327256	0 %	50 %	0 %	50 %	336476240
5516	NC_015676	AAC	2	6	327377	327382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336476240
5517	NC_015676	CAG	2	6	327393	327398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336476240
5518	NC_015676	CTG	3	9	327427	327435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476240
5519	NC_015676	TGC	2	6	327452	327457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476240
5520	NC_015676	TGC	2	6	327485	327490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476240
5521	NC_015676	GGA	2	6	327527	327532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336476240
5522	NC_015676	TGCA	2	8	327547	327554	25 %	25 %	25 %	25 %	336476240
5523	NC_015676	ATG	2	6	327604	327609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476240
5524	NC_015676	TGC	2	6	327725	327730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476240
5525	NC_015676	ATA	2	6	327748	327753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336476240
5526	NC_015676	A	6	6	327776	327781	100 %	0 %	0 %	0 %	336476240
5527	NC_015676	TC	4	8	327813	327820	0 %	50 %	0 %	50 %	336476240
5528	NC_015676	ATG	2	6	327849	327854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476240
5529	NC_015676	TC	3	6	327879	327884	0 %	50 %	0 %	50 %	336476240
5530	NC_015676	TAT	2	6	327917	327922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336476240
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5532	NC_015676	CT	3	6	327997	328002	0 %	50 %	0 %	50 %	336476240
5533	NC_015676	AAT	2	6	328082	328087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336476240
5534	NC_015676	TAG	2	6	328154	328159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476240
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5536	NC_015676	A	6	6	328266	328271	100 %	0 %	0 %	0 %	336476241
5537	NC_015676	T	6	6	328277	328282	0 %	100 %	0 %	0 %	336476241
5538	NC_015676	AGC	2	6	328289	328294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336476241
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5540	NC_015676	TAT	2	6	328306	328311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336476241
5541	NC_015676	GCA	2	6	328326	328331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336476241
5542	NC_015676	CTA	2	6	328348	328353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476241
5543	NC_015676	CTTCAA	2	12	328360	328371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476241
5544	NC_015676	TAC	2	6	328406	328411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476241
5545	NC_015676	ATG	2	6	328426	328431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476241
5546	NC_015676	AAT	2	6	328476	328481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336476241
5547	NC_015676	GATGAC	2	12	328500	328511	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	336476241
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5549	NC_015676	TTC	2	6	328601	328606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336476241
5550	NC_015676	CTA	2	6	328645	328650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476241
5551	NC_015676	TAC	2	6	328703	328708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476241
5552	NC_015676	ATG	2	6	328723	328728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476241
5553	NC_015676	AAT	2	6	328773	328778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336476241
5554	NC_015676	GATGAC	2	12	328797	328808	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	336476241
5555	NC_015676	ATTA	2	8	328820	328827	50 %	50 %	0 %	0 %	336476241
5556	NC_015676	CAA	2	6	328945	328950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336476241
5557	NC_015676	CTA	2	6	328957	328962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476241
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5559	NC_015676	TTA	2	6	329005	329010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336476241
5560	NC_015676	ATG	2	6	329017	329022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476241
5561	NC_015676	AAT	2	6	329067	329072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336476241
5562	NC_015676	TCTT	2	8	329264	329271	0 %	75 %	0 %	25 %	336476241
5563	NC_015676	GAT	2	6	329385	329390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476241
5564	NC_015676	AT	3	6	329402	329407	50 %	50 %	0 %	0 %	336476241
5565	NC_015676	TGA	2	6	329419	329424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476241
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5570	NC_015676	GTG	2	6	329662	329667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336476241
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5572	NC_015676	TGA	2	6	329768	329773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476241
5573	NC_015676	TGA	2	6	329861	329866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476241
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5578	NC_015676	TGA	2	6	330163	330168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476241
5579	NC_015676	TAC	2	6	330332	330337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476241
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5590	NC_015676	TTG	2	6	330874	330879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336476241
5591	NC_015676	TGG	2	6	331001	331006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336476241
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5593	NC_015676	AT	3	6	331097	331102	50 %	50 %	0 %	0 %	336476241
5594	NC_015676	TGA	3	9	331136	331144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476241
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5599	NC_015676	TC	3	6	331432	331437	0 %	50 %	0 %	50 %	336476241
5600	NC_015676	CAGGG	2	10	331452	331461	20 %	0 %	60 %	20 %	336476241
5601	NC_015676	CAA	2	6	331582	331587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336476241
5602	NC_015676	GGAA	2	8	331649	331656	50 %	0 %	50 %	0 %	336476241
5603	NC_015676	AGG	2	6	331751	331756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336476241
5604	NC_015676	TGAT	2	8	331816	331823	25 %	50 %	25 %	0 %	336476241
5605	NC_015676	T	6	6	332184	332189	0 %	100 %	0 %	0 %	336476242
5606	NC_015676	GCT	2	6	332193	332198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476242
5607	NC_015676	T	6	6	332209	332214	0 %	100 %	0 %	0 %	336476242
5608	NC_015676	CAGCTG	2	12	332221	332232	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	336476242
5609	NC_015676	TAT	2	6	332358	332363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336476242
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5611	NC_015676	AT	3	6	332409	332414	50 %	50 %	0 %	0 %	336476242
5612	NC_015676	ATG	2	6	332452	332457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476242
5613	NC_015676	GTATG	2	10	332490	332499	20 %	40 %	40 %	0 %	336476242
5614	NC_015676	ATT	2	6	332506	332511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336476242
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5618	NC_015676	TAT	2	6	332679	332684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336476242
5619	NC_015676	AT	3	6	332736	332741	50 %	50 %	0 %	0 %	336476242
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5983	NC_015676	TCCC	2	8	355363	355370	0 %	25 %	0 %	75 %	336476264
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5986	NC_015676	TCA	2	6	355516	355521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476264
5987	NC_015676	TGC	2	6	355548	355553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476264
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5989	NC_015676	TCT	2	6	355684	355689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336476264
5990	NC_015676	ATT	2	6	355690	355695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336476264
5991	NC_015676	CAG	2	6	355860	355865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336476264
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5997	NC_015676	GATC	2	8	356222	356229	25 %	25 %	25 %	25 %	336476264
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5999	NC_015676	TCT	2	6	356485	356490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336476265
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