MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mesorhizobium opportunistum WSM2075 chromosome

Total Repeats: 105000

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015675	GCG	2	6	682	687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264538
2	NC_015675	ATC	2	6	987	992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337264538
3	NC_015675	GCC	2	6	1083	1088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264538
4	NC_015675	CGC	2	6	1180	1185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264538
5	NC_015675	CGC	3	9	1244	1252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264538
6	NC_015675	CTG	2	6	1338	1343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264538
7	NC_015675	CGC	2	6	1352	1357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264538
8	NC_015675	CGT	2	6	1388	1393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264538
9	NC_015675	ACA	2	6	1444	1449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337264538
10	NC_015675	ATC	2	6	1494	1499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337264538
11	NC_015675	GAC	2	6	1500	1505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264538
12	NC_015675	TGC	2	6	1561	1566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264538
13	NC_015675	GCC	2	6	1604	1609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264538
14	NC_015675	CGG	2	6	1655	1660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264538
15	NC_015675	CGA	2	6	1739	1744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264538
16	NC_015675	GGA	2	6	1763	1768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337264538
17	NC_015675	GCT	2	6	1835	1840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264538
18	NC_015675	CGA	2	6	1883	1888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264538
19	NC_015675	TGA	2	6	2056	2061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337264538
20	NC_015675	CGC	2	6	2062	2067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264538
21	NC_015675	CGG	2	6	2096	2101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264538
22	NC_015675	TGC	2	6	2119	2124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264538
23	NC_015675	ACA	2	6	2161	2166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337264538
24	NC_015675	GCT	2	6	2186	2191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264538
25	NC_015675	GCG	2	6	2192	2197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264538
26	NC_015675	TGC	2	6	2622	2627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264539
27	NC_015675	GCG	2	6	2712	2717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264539
28	NC_015675	CGA	2	6	2721	2726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264539
29	NC_015675	CTA	2	6	2983	2988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337264539
30	NC_015675	CGG	2	6	3022	3027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264539
31	NC_015675	CAT	3	9	3118	3126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337264539
32	NC_015675	CGA	2	6	3163	3168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264539
33	NC_015675	ACC	2	6	3185	3190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337264539
34	NC_015675	CGT	2	6	3229	3234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264539
35	NC_015675	AAG	2	6	3302	3307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337264539
36	NC_015675	GCC	2	6	3332	3337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264539
37	NC_015675	TCC	2	6	3362	3367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337264539
38	NC_015675	CAA	2	6	3424	3429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337264539
39	NC_015675	GAA	2	6	3452	3457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337264539
40	NC_015675	GGC	2	6	3460	3465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264539
41	NC_015675	TCG	2	6	3473	3478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264539
42	NC_015675	CGC	2	6	3523	3528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264539
43	NC_015675	CGA	2	6	3601	3606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264539
44	NC_015675	GCG	2	6	3773	3778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264540
45	NC_015675	GGT	2	6	3805	3810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337264540
46	NC_015675	GGC	2	6	3920	3925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264540
47	NC_015675	CGG	2	6	3928	3933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264540
48	NC_015675	CGG	2	6	3997	4002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264540
49	NC_015675	GGC	2	6	4013	4018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264540
50	NC_015675	CGT	2	6	4081	4086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264540
51	NC_015675	GTT	2	6	4111	4116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337264540
52	NC_015675	CGG	2	6	4139	4144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264540
53	NC_015675	GAC	2	6	4253	4258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264540
54	NC_015675	CGC	2	6	4309	4314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264540
55	NC_015675	CTG	2	6	4337	4342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264540
56	NC_015675	GCC	2	6	4343	4348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264540
57	NC_015675	CGG	2	6	4437	4442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264540
58	NC_015675	GAG	2	6	4451	4456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337264540
59	NC_015675	CGG	2	6	4463	4468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264540
60	NC_015675	GCC	2	6	4499	4504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264540
61	NC_015675	CTG	2	6	4670	4675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264540
62	NC_015675	CGA	2	6	4678	4683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264540
63	NC_015675	GCA	2	6	4688	4693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264540
64	NC_015675	GGA	2	6	4703	4708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337264540
65	NC_015675	CGG	2	6	4709	4714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264540
66	NC_015675	GAG	2	6	4736	4741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337264540
67	NC_015675	GCG	2	6	4775	4780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264540
68	NC_015675	GTC	2	6	4870	4875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264541
69	NC_015675	CCG	2	6	4922	4927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264541
70	NC_015675	TGC	2	6	4958	4963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264541
71	NC_015675	CGG	2	6	4971	4976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264541
72	NC_015675	CAG	2	6	4984	4989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264541
73	NC_015675	TCG	2	6	5087	5092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264541
74	NC_015675	ACG	2	6	5093	5098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264541
75	NC_015675	CTG	2	6	5158	5163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264541
76	NC_015675	GTC	2	6	5281	5286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264541
77	NC_015675	GTG	2	6	5317	5322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337264541
78	NC_015675	GCC	2	6	5362	5367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264541
79	NC_015675	CGC	2	6	5468	5473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264541
80	NC_015675	TGC	2	6	5600	5605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264541
81	NC_015675	CGC	2	6	5619	5624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264541
82	NC_015675	TCA	2	6	5734	5739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337264542
83	NC_015675	CCG	2	6	5775	5780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264542
84	NC_015675	TCG	2	6	5866	5871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264542
85	NC_015675	GAC	2	6	5898	5903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264542
86	NC_015675	GCA	2	6	6006	6011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264542
87	NC_015675	CGC	2	6	6050	6055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264542
88	NC_015675	CAG	2	6	6107	6112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264542
89	NC_015675	GCA	2	6	6184	6189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264543
90	NC_015675	CGG	2	6	6197	6202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264543
91	NC_015675	CGA	2	6	6214	6219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264543
92	NC_015675	TGA	3	9	6232	6240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337264543
93	NC_015675	AGC	2	6	6327	6332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264543
94	NC_015675	GAT	2	6	6425	6430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337264543
95	NC_015675	CGC	2	6	6433	6438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264543
96	NC_015675	GCA	2	6	6469	6474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264543
97	NC_015675	GCC	2	6	6481	6486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264543
98	NC_015675	GAT	2	6	6536	6541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337264543
99	NC_015675	CGG	2	6	6841	6846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264543
100	NC_015675	CTT	2	6	6890	6895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337264543
101	NC_015675	GCC	3	9	6900	6908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264543
102	NC_015675	GCG	2	6	6981	6986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264543
103	NC_015675	TGA	2	6	7138	7143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337264543
104	NC_015675	CTT	2	6	7154	7159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337264543
105	NC_015675	GCA	2	6	7356	7361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264544
106	NC_015675	CTC	2	6	7374	7379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337264544
107	NC_015675	CGG	2	6	7393	7398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264544
108	NC_015675	ATC	2	6	7566	7571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337264544
109	NC_015675	GCT	2	6	7637	7642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264544
110	NC_015675	TCG	2	6	7744	7749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264544
111	NC_015675	GTG	2	6	7790	7795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337264544
112	NC_015675	CGG	2	6	7808	7813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264544
113	NC_015675	AGC	2	6	8036	8041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264545
114	NC_015675	CCA	2	6	8158	8163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337264545
115	NC_015675	CGA	2	6	8173	8178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264545
116	NC_015675	AGA	2	6	8184	8189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337264545
117	NC_015675	ACG	2	6	8207	8212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264545
118	NC_015675	ATT	2	6	8272	8277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337264546
119	NC_015675	CAC	2	6	8336	8341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337264546
120	NC_015675	TGG	3	9	8451	8459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337264546
121	NC_015675	GCA	2	6	8512	8517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264546
122	NC_015675	CGG	2	6	8578	8583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264546
123	NC_015675	CCT	2	6	8590	8595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337264546
124	NC_015675	TTC	2	6	9177	9182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337264547
125	NC_015675	GAA	2	6	9344	9349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337264547
126	NC_015675	GCG	2	6	9447	9452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264547
127	NC_015675	CGG	2	6	9484	9489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264547
128	NC_015675	GTC	2	6	9582	9587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264548
129	NC_015675	CCG	2	6	9729	9734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264548
130	NC_015675	GAC	2	6	9817	9822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264548
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133	NC_015675	AAC	2	6	9897	9902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337264548
134	NC_015675	GTC	2	6	9957	9962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264548
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152	NC_015675	GAT	2	6	11238	11243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337264549
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159	NC_015675	CTC	2	6	11526	11531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337264549
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163	NC_015675	ATG	2	6	11909	11914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337264550
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242	NC_015675	GAA	2	6	16383	16388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337264552
243	NC_015675	ACG	2	6	16420	16425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264552
244	NC_015675	GCC	2	6	16515	16520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264552
245	NC_015675	TGG	2	6	16540	16545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337264552
246	NC_015675	GTC	2	6	16876	16881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264553
247	NC_015675	GCG	2	6	16909	16914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264553
248	NC_015675	CGG	2	6	16940	16945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264553
249	NC_015675	CTT	2	6	16957	16962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337264553
250	NC_015675	GCT	2	6	17278	17283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264554
251	NC_015675	TTC	2	6	17292	17297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337264554
252	NC_015675	GAA	2	6	17303	17308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337264554
253	NC_015675	CAG	2	6	17342	17347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264554
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255	NC_015675	TGA	2	6	17482	17487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337264554
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376	NC_015675	GTC	2	6	23621	23626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264559
377	NC_015675	TCT	2	6	23641	23646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337264559
378	NC_015675	TCG	2	6	23790	23795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264559
379	NC_015675	CGA	2	6	23830	23835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264559
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383	NC_015675	TCG	2	6	23955	23960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264559
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389	NC_015675	CGA	2	6	24100	24105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264559
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403	NC_015675	TGT	2	6	25052	25057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337264560
404	NC_015675	GTC	2	6	25083	25088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264560
405	NC_015675	CGT	2	6	25118	25123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264560
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411	NC_015675	GAT	2	6	25560	25565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337264560
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413	NC_015675	TCA	2	6	25595	25600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337264560
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489	NC_015675	CCA	2	6	30594	30599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337264566
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491	NC_015675	ACG	2	6	30624	30629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264566
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493	NC_015675	ATT	2	6	30720	30725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337264566
494	NC_015675	GCC	2	6	30735	30740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264566
495	NC_015675	CGA	2	6	30853	30858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264566
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497	NC_015675	TGC	2	6	30925	30930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264566
498	NC_015675	GTC	2	6	31022	31027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264566
499	NC_015675	CGG	2	6	31084	31089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264567
500	NC_015675	CAC	2	6	31182	31187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337264567

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