MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Methanothermococcus okinawensis IH1 plasmid pMETOK01

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015632	AT	3	6	260	265	50 %	50 %	0 %	0 %	336120991
2	NC_015632	TA	3	6	377	382	50 %	50 %	0 %	0 %	336120991
3	NC_015632	AT	3	6	513	518	50 %	50 %	0 %	0 %	336120991
4	NC_015632	AT	3	6	2710	2715	50 %	50 %	0 %	0 %	336120992
5	NC_015632	TA	3	6	2716	2721	50 %	50 %	0 %	0 %	336120992
6	NC_015632	AT	4	8	3145	3152	50 %	50 %	0 %	0 %	336120992
7	NC_015632	AT	3	6	3164	3169	50 %	50 %	0 %	0 %	336120992
8	NC_015632	AT	3	6	3721	3726	50 %	50 %	0 %	0 %	336120992
9	NC_015632	AT	4	8	3773	3780	50 %	50 %	0 %	0 %	336120992
10	NC_015632	AT	3	6	3813	3818	50 %	50 %	0 %	0 %	336120992
11	NC_015632	AT	3	6	4306	4311	50 %	50 %	0 %	0 %	336120992
12	NC_015632	TA	3	6	4312	4317	50 %	50 %	0 %	0 %	336120992
13	NC_015632	AT	3	6	4335	4340	50 %	50 %	0 %	0 %	336120992
14	NC_015632	CA	3	6	4442	4447	50 %	0 %	0 %	50 %	336120992
15	NC_015632	TG	3	6	4615	4620	0 %	50 %	50 %	0 %	336120992
16	NC_015632	TA	3	6	5751	5756	50 %	50 %	0 %	0 %	336120993
17	NC_015632	AT	3	6	6179	6184	50 %	50 %	0 %	0 %	336120993
18	NC_015632	GA	4	8	6890	6897	50 %	0 %	50 %	0 %	336120993
19	NC_015632	AT	3	6	6942	6947	50 %	50 %	0 %	0 %	336120993
20	NC_015632	AG	4	8	7268	7275	50 %	0 %	50 %	0 %	336120993
21	NC_015632	AT	3	6	7310	7315	50 %	50 %	0 %	0 %	336120993
22	NC_015632	AT	3	6	7875	7880	50 %	50 %	0 %	0 %	336120993
23	NC_015632	AT	3	6	8122	8127	50 %	50 %	0 %	0 %	336120993
24	NC_015632	AT	3	6	9933	9938	50 %	50 %	0 %	0 %	336120995
25	NC_015632	TA	3	6	11154	11159	50 %	50 %	0 %	0 %	336120995
26	NC_015632	AT	3	6	11206	11211	50 %	50 %	0 %	0 %	336120995
27	NC_015632	AT	3	6	11318	11323	50 %	50 %	0 %	0 %	336120995
28	NC_015632	AT	3	6	12079	12084	50 %	50 %	0 %	0 %	336120995
29	NC_015632	AG	3	6	12106	12111	50 %	0 %	50 %	0 %	336120995
30	NC_015632	TA	3	6	12145	12150	50 %	50 %	0 %	0 %	336120995
31	NC_015632	TA	3	6	12726	12731	50 %	50 %	0 %	0 %	336120996

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.