MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium sp. JDM601 chromosome

Total Repeats: 3823

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015576	ACCAC	2	10	1358	1367	40 %	0 %	0 %	60 %	333988641
2	NC_015576	GCAGC	2	10	7382	7391	20 %	0 %	40 %	40 %	333988646
3	NC_015576	ACCGG	2	10	9301	9310	20 %	0 %	40 %	40 %	333988646
4	NC_015576	CGCGG	2	10	10928	10937	0 %	0 %	60 %	40 %	333988646
5	NC_015576	GGCCC	2	10	11212	11221	0 %	0 %	40 %	60 %	333988647
6	NC_015576	CCGGC	2	10	11306	11315	0 %	0 %	40 %	60 %	333988647
7	NC_015576	GCCGA	2	10	11336	11345	20 %	0 %	40 %	40 %	333988647
8	NC_015576	CCCGG	2	10	11569	11578	0 %	0 %	40 %	60 %	333988647
9	NC_015576	CGCCA	2	10	12550	12559	20 %	0 %	20 %	60 %	333988648
10	NC_015576	CGGCG	2	10	12734	12743	0 %	0 %	60 %	40 %	333988648
11	NC_015576	ACAGC	2	10	13874	13883	40 %	0 %	20 %	40 %	333988651
12	NC_015576	CGATG	2	10	15373	15382	20 %	20 %	40 %	20 %	333988653
13	NC_015576	CCAGC	2	10	16394	16403	20 %	0 %	20 %	60 %	333988655
14	NC_015576	CGGCG	2	10	19407	19416	0 %	0 %	60 %	40 %	333988657
15	NC_015576	TTAGC	2	10	19649	19658	20 %	40 %	20 %	20 %	333988657
16	NC_015576	GGGCC	2	10	22379	22388	0 %	0 %	60 %	40 %	333988659
17	NC_015576	GCCGG	2	10	22403	22412	0 %	0 %	60 %	40 %	333988659
18	NC_015576	CACCG	2	10	24090	24099	20 %	0 %	20 %	60 %	333988660
19	NC_015576	CGGGG	2	10	25226	25235	0 %	0 %	80 %	20 %	333988661
20	NC_015576	AGCGC	2	10	26450	26459	20 %	0 %	40 %	40 %	333988662
21	NC_015576	TCGCG	2	10	27211	27220	0 %	20 %	40 %	40 %	333988664
22	NC_015576	CGGCC	2	10	28707	28716	0 %	0 %	40 %	60 %	333988666
23	NC_015576	CCCAC	2	10	33946	33955	20 %	0 %	0 %	80 %	333988669
24	NC_015576	GCCCA	2	10	34212	34221	20 %	0 %	20 %	60 %	333988669
25	NC_015576	CCGCG	2	10	34771	34780	0 %	0 %	40 %	60 %	333988670
26	NC_015576	CGCGG	3	15	37245	37259	0 %	0 %	60 %	40 %	333988672
27	NC_015576	GGGCC	2	10	37644	37653	0 %	0 %	60 %	40 %	333988672
28	NC_015576	CCGAT	2	10	38108	38117	20 %	20 %	20 %	40 %	333988673
29	NC_015576	GACCG	2	10	39558	39567	20 %	0 %	40 %	40 %	333988676
30	NC_015576	TTCGC	2	10	39962	39971	0 %	40 %	20 %	40 %	333988677
31	NC_015576	GAACC	2	10	40626	40635	40 %	0 %	20 %	40 %	333988678
32	NC_015576	CCGCG	2	10	42457	42466	0 %	0 %	40 %	60 %	333988680
33	NC_015576	CCGGC	2	10	42628	42637	0 %	0 %	40 %	60 %	333988680
34	NC_015576	CGCGC	2	10	42971	42980	0 %	0 %	40 %	60 %	333988681
35	NC_015576	CGGGC	2	10	44098	44107	0 %	0 %	60 %	40 %	333988681
36	NC_015576	GCTGC	2	10	45013	45022	0 %	20 %	40 %	40 %	333988684
37	NC_015576	CCGCT	2	10	45660	45669	0 %	20 %	20 %	60 %	333988685
38	NC_015576	CCGCT	2	10	45678	45687	0 %	20 %	20 %	60 %	333988685
39	NC_015576	CCGCT	2	10	45696	45705	0 %	20 %	20 %	60 %	333988685
40	NC_015576	CCGCT	2	10	45926	45935	0 %	20 %	20 %	60 %	333988685
41	NC_015576	TGGGC	2	10	46436	46445	0 %	20 %	60 %	20 %	333988685
42	NC_015576	TTCGG	2	10	48220	48229	0 %	40 %	40 %	20 %	333988687
43	NC_015576	CGGTC	2	10	49212	49221	0 %	20 %	40 %	40 %	333988688
44	NC_015576	GCTCA	2	10	49510	49519	20 %	20 %	20 %	40 %	333988688
45	NC_015576	CGCAG	2	10	50004	50013	20 %	0 %	40 %	40 %	333988688
46	NC_015576	GGCGC	2	10	50191	50200	0 %	0 %	60 %	40 %	333988688
47	NC_015576	TCGGC	2	10	50421	50430	0 %	20 %	40 %	40 %	333988688
48	NC_015576	GACCG	2	10	51060	51069	20 %	0 %	40 %	40 %	333988689
49	NC_015576	CGGCG	2	10	51105	51114	0 %	0 %	60 %	40 %	333988689
50	NC_015576	CCGGG	2	10	52178	52187	0 %	0 %	60 %	40 %	333988689
51	NC_015576	CCGCG	2	10	52666	52675	0 %	0 %	40 %	60 %	333988690
52	NC_015576	GCGCC	2	10	53206	53215	0 %	0 %	40 %	60 %	333988690
53	NC_015576	TGTGC	2	10	56619	56628	0 %	40 %	40 %	20 %	333988694
54	NC_015576	TTCGC	2	10	57647	57656	0 %	40 %	20 %	40 %	333988695
55	NC_015576	GCGCT	2	10	58573	58582	0 %	20 %	40 %	40 %	333988697
56	NC_015576	GCCGG	2	10	59352	59361	0 %	0 %	60 %	40 %	333988697
57	NC_015576	GCCGG	2	10	59870	59879	0 %	0 %	60 %	40 %	333988697
58	NC_015576	GACTT	2	10	60556	60565	20 %	40 %	20 %	20 %	333988697
59	NC_015576	GCGCT	2	10	62236	62245	0 %	20 %	40 %	40 %	333988697
60	NC_015576	CGAAC	2	10	62826	62835	40 %	0 %	20 %	40 %	333988698
61	NC_015576	CGCGG	2	10	64260	64269	0 %	0 %	60 %	40 %	333988699
62	NC_015576	CGCGG	2	10	65935	65944	0 %	0 %	60 %	40 %	333988701
63	NC_015576	CGAGG	2	10	67440	67449	20 %	0 %	60 %	20 %	333988703
64	NC_015576	TGCGC	2	10	67483	67492	0 %	20 %	40 %	40 %	333988703
65	NC_015576	GGGGC	2	10	69408	69417	0 %	0 %	80 %	20 %	333988704
66	NC_015576	GGGGC	2	10	69424	69433	0 %	0 %	80 %	20 %	333988704
67	NC_015576	GGGGC	2	10	69474	69483	0 %	0 %	80 %	20 %	333988704
68	NC_015576	GGGGC	2	10	69490	69499	0 %	0 %	80 %	20 %	333988704
69	NC_015576	GGATG	2	10	73647	73656	20 %	20 %	60 %	0 %	333988707
70	NC_015576	CCCGA	2	10	77643	77652	20 %	0 %	20 %	60 %	333988712
71	NC_015576	GGTCG	2	10	77954	77963	0 %	20 %	60 %	20 %	333988712
72	NC_015576	GCGAC	2	10	80476	80485	20 %	0 %	40 %	40 %	333988714
73	NC_015576	GCCCG	2	10	81300	81309	0 %	0 %	40 %	60 %	333988715
74	NC_015576	CCGGA	2	10	81613	81622	20 %	0 %	40 %	40 %	333988715
75	NC_015576	GCGCA	2	10	82261	82270	20 %	0 %	40 %	40 %	333988716
76	NC_015576	GCCGC	2	10	83667	83676	0 %	0 %	40 %	60 %	333988718
77	NC_015576	CGCGG	2	10	83817	83826	0 %	0 %	60 %	40 %	333988718
78	NC_015576	GCGCC	2	10	85100	85109	0 %	0 %	40 %	60 %	333988719
79	NC_015576	GGTCG	2	10	86265	86274	0 %	20 %	60 %	20 %	333988721
80	NC_015576	CGGCG	2	10	86578	86587	0 %	0 %	60 %	40 %	333988722
81	NC_015576	CGGCG	2	10	87107	87116	0 %	0 %	60 %	40 %	333988722
82	NC_015576	GCCGA	2	10	88985	88994	20 %	0 %	40 %	40 %	333988724
83	NC_015576	CCCGG	2	10	89464	89473	0 %	0 %	40 %	60 %	333988724
84	NC_015576	CGTCG	2	10	89490	89499	0 %	20 %	40 %	40 %	333988725
85	NC_015576	GCCCC	2	10	89832	89841	0 %	0 %	20 %	80 %	333988725
86	NC_015576	GCTGG	2	10	92410	92419	0 %	20 %	60 %	20 %	333988728
87	NC_015576	ACCGC	2	10	94175	94184	20 %	0 %	20 %	60 %	333988731
88	NC_015576	CGCGG	2	10	94231	94240	0 %	0 %	60 %	40 %	333988731
89	NC_015576	GATCT	2	10	96454	96463	20 %	40 %	20 %	20 %	333988734
90	NC_015576	ACCCG	2	10	98003	98012	20 %	0 %	20 %	60 %	333988735
91	NC_015576	GGCCG	2	10	98310	98319	0 %	0 %	60 %	40 %	333988736
92	NC_015576	CAGGT	2	10	100026	100035	20 %	20 %	40 %	20 %	333988738
93	NC_015576	CCGCG	2	10	102698	102707	0 %	0 %	40 %	60 %	333988741
94	NC_015576	GCCGG	2	10	102791	102800	0 %	0 %	60 %	40 %	333988741
95	NC_015576	CCGGG	2	10	103019	103028	0 %	0 %	60 %	40 %	333988741
96	NC_015576	GGCGC	2	10	103105	103114	0 %	0 %	60 %	40 %	333988741
97	NC_015576	GCCGG	2	10	103490	103499	0 %	0 %	60 %	40 %	333988742
98	NC_015576	GTGCG	2	10	103916	103925	0 %	20 %	60 %	20 %	333988742
99	NC_015576	AGCAC	2	10	107455	107464	40 %	0 %	20 %	40 %	333988746
100	NC_015576	CGTCG	2	10	108229	108238	0 %	20 %	40 %	40 %	333988747
101	NC_015576	CGGTG	2	10	108528	108537	0 %	20 %	60 %	20 %	333988747
102	NC_015576	GCGCC	2	10	109014	109023	0 %	0 %	40 %	60 %	333988748
103	NC_015576	CCCGC	2	10	110440	110449	0 %	0 %	20 %	80 %	333988750
104	NC_015576	CGACG	2	10	110487	110496	20 %	0 %	40 %	40 %	333988750
105	NC_015576	GCACA	2	10	111051	111060	40 %	0 %	20 %	40 %	333988751
106	NC_015576	GACCT	2	10	111252	111261	20 %	20 %	20 %	40 %	333988751
107	NC_015576	GCGCA	2	10	112473	112482	20 %	0 %	40 %	40 %	333988752
108	NC_015576	GCCTG	2	10	114664	114673	0 %	20 %	40 %	40 %	333988755
109	NC_015576	TCCGC	2	10	114823	114832	0 %	20 %	20 %	60 %	333988755
110	NC_015576	CGGCA	2	10	116596	116605	20 %	0 %	40 %	40 %	333988756
111	NC_015576	CGGCG	2	10	116673	116682	0 %	0 %	60 %	40 %	333988756
112	NC_015576	CCGCG	2	10	117066	117075	0 %	0 %	40 %	60 %	333988756
113	NC_015576	TCGCC	2	10	121356	121365	0 %	20 %	20 %	60 %	333988761
114	NC_015576	GCCGA	2	10	124013	124022	20 %	0 %	40 %	40 %	333988764
115	NC_015576	CCGCA	2	10	124989	124998	20 %	0 %	20 %	60 %	333988764
116	NC_015576	GGCGA	2	10	126017	126026	20 %	0 %	60 %	20 %	333988765
117	NC_015576	GCCCG	2	10	126922	126931	0 %	0 %	40 %	60 %	333988765
118	NC_015576	GGCCG	2	10	127615	127624	0 %	0 %	60 %	40 %	333988766
119	NC_015576	CGACG	2	10	128765	128774	20 %	0 %	40 %	40 %	333988767
120	NC_015576	CCCGG	2	10	129628	129637	0 %	0 %	40 %	60 %	333988767
121	NC_015576	GTGCA	2	10	129648	129657	20 %	20 %	40 %	20 %	333988767
122	NC_015576	TGAAC	2	10	132517	132526	40 %	20 %	20 %	20 %	333988771
123	NC_015576	GCCGT	2	10	132530	132539	0 %	20 %	40 %	40 %	333988771
124	NC_015576	CCAGC	2	10	134663	134672	20 %	0 %	20 %	60 %	333988774
125	NC_015576	GTCGG	2	10	134953	134962	0 %	20 %	60 %	20 %	333988775
126	NC_015576	GCGCG	2	10	135018	135027	0 %	0 %	60 %	40 %	333988775
127	NC_015576	CAGAC	2	10	135792	135801	40 %	0 %	20 %	40 %	333988775
128	NC_015576	CGGGC	2	10	141672	141681	0 %	0 %	60 %	40 %	333988780
129	NC_015576	CAGGT	2	10	142615	142624	20 %	20 %	40 %	20 %	333988781
130	NC_015576	CATGC	2	10	148561	148570	20 %	20 %	20 %	40 %	333988787
131	NC_015576	CGCGG	2	10	152420	152429	0 %	0 %	60 %	40 %	333988791
132	NC_015576	CGCGG	2	10	154238	154247	0 %	0 %	60 %	40 %	333988793
133	NC_015576	GCGAC	2	10	155266	155275	20 %	0 %	40 %	40 %	333988794
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135	NC_015576	TGCGC	2	10	158420	158429	0 %	20 %	40 %	40 %	333988798
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