MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium sp. JDM601 chromosome

Total Repeats: 117462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015576	TCGT	2	8	209457	209464	0 %	50 %	25 %	25 %	333988842
5502	NC_015576	TGA	2	6	209533	209538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333988842
5503	NC_015576	GAC	2	6	209762	209767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988843
5504	NC_015576	GCT	2	6	209777	209782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988843
5505	NC_015576	GCT	2	6	209795	209800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988843
5506	NC_015576	CGC	2	6	209816	209821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988843
5507	NC_015576	CAC	2	6	209857	209862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988843
5508	NC_015576	GCCA	2	8	209870	209877	25 %	0 %	25 %	50 %	333988843
5509	NC_015576	ACG	2	6	209894	209899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988843
5510	NC_015576	GC	4	8	209905	209912	0 %	0 %	50 %	50 %	333988843
5511	NC_015576	CGG	2	6	209913	209918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988843
5512	NC_015576	GCC	2	6	209935	209940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988843
5513	NC_015576	GCA	2	6	210005	210010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988843
5514	NC_015576	CGA	2	6	210036	210041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988843
5515	NC_015576	ACA	2	6	210090	210095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333988843
5516	NC_015576	CTG	2	6	210100	210105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988843
5517	NC_015576	CCG	2	6	210146	210151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988843
5518	NC_015576	GGT	2	6	210166	210171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988843
5519	NC_015576	GC	3	6	210182	210187	0 %	0 %	50 %	50 %	333988843
5520	NC_015576	CCGGC	2	10	210219	210228	0 %	0 %	40 %	60 %	333988843
5521	NC_015576	CGGC	2	8	210252	210259	0 %	0 %	50 %	50 %	333988843
5522	NC_015576	CGC	2	6	210295	210300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988843
5523	NC_015576	CGGG	2	8	210315	210322	0 %	0 %	75 %	25 %	333988843
5524	NC_015576	GCC	2	6	210343	210348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988843
5525	NC_015576	CCAGG	2	10	210355	210364	20 %	0 %	40 %	40 %	333988843
5526	NC_015576	ACG	2	6	210374	210379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988843
5527	NC_015576	GCA	2	6	210391	210396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988843
5528	NC_015576	TGC	2	6	210403	210408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988843
5529	NC_015576	CGG	3	9	210412	210420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988843
5530	NC_015576	GACC	2	8	210435	210442	25 %	0 %	25 %	50 %	333988843
5531	NC_015576	CGG	3	9	210450	210458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988843
5532	NC_015576	CCAC	2	8	210486	210493	25 %	0 %	0 %	75 %	333988843
5533	NC_015576	GCA	2	6	210507	210512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988843
5534	NC_015576	GCCCA	2	10	210539	210548	20 %	0 %	20 %	60 %	333988843
5535	NC_015576	GCC	2	6	210551	210556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988843
5536	NC_015576	CCAGCA	2	12	210606	210617	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	333988843
5537	NC_015576	CG	3	6	210623	210628	0 %	0 %	50 %	50 %	333988843
5538	NC_015576	CGC	2	6	210638	210643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988843
5539	NC_015576	CCA	2	6	210663	210668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988843
5540	NC_015576	CAG	2	6	210673	210678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988843
5541	NC_015576	CCG	2	6	210681	210686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988843
5542	NC_015576	CGC	2	6	210805	210810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988843
5543	NC_015576	CGGC	2	8	210816	210823	0 %	0 %	50 %	50 %	333988843
5544	NC_015576	CGC	2	6	210825	210830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988843
5545	NC_015576	CAC	2	6	210847	210852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988843
5546	NC_015576	GCG	2	6	210875	210880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988843
5547	NC_015576	GGT	2	6	210886	210891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988843
5548	NC_015576	CAC	3	9	210911	210919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988843
5549	NC_015576	CGG	2	6	210922	210927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988843
5550	NC_015576	CGG	2	6	210966	210971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988843
5551	NC_015576	CAG	3	9	210973	210981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988843
5552	NC_015576	AGAA	2	8	211010	211017	75 %	0 %	25 %	0 %	333988843
5553	NC_015576	CCG	3	9	211034	211042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988843
5554	NC_015576	CGCAGC	2	12	211052	211063	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	333988843
5555	NC_015576	GGCA	2	8	211082	211089	25 %	0 %	50 %	25 %	333988843
5556	NC_015576	CAG	2	6	211102	211107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988843
5557	NC_015576	GCA	2	6	211122	211127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988843
5558	NC_015576	CCA	2	6	211170	211175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988843
5559	NC_015576	GGCCG	2	10	211179	211188	0 %	0 %	60 %	40 %	333988843
5560	NC_015576	GCA	2	6	211200	211205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988843
5561	NC_015576	CCA	2	6	211212	211217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988843
5562	NC_015576	CGC	2	6	211222	211227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988843
5563	NC_015576	GCCA	2	8	211238	211245	25 %	0 %	25 %	50 %	333988843
5564	NC_015576	GCC	2	6	211279	211284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988843
5565	NC_015576	CCGC	2	8	211329	211336	0 %	0 %	25 %	75 %	333988843
5566	NC_015576	GCC	2	6	211340	211345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988843
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5568	NC_015576	GCA	3	9	211404	211412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988843
5569	NC_015576	GCA	2	6	211425	211430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988843
5570	NC_015576	GCG	2	6	211431	211436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988843
5571	NC_015576	CCAGCA	2	12	211437	211448	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	333988843
5572	NC_015576	CAC	2	6	211495	211500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988843
5573	NC_015576	CGG	2	6	211547	211552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988844
5574	NC_015576	TCTCGG	2	12	211609	211620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988844
5575	NC_015576	GGCGAC	2	12	211644	211655	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	333988844
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5579	NC_015576	CGG	2	6	211723	211728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988844
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5581	NC_015576	CGG	3	9	211777	211785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988844
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5583	NC_015576	GAC	2	6	211880	211885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988844
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5586	NC_015576	TCT	2	6	211996	212001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333988844
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5588	NC_015576	TCG	2	6	212034	212039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988844
5589	NC_015576	CCGGG	2	10	212066	212075	0 %	0 %	60 %	40 %	333988844
5590	NC_015576	TCG	2	6	212094	212099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988844
5591	NC_015576	CGT	2	6	212197	212202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988844
5592	NC_015576	CTG	2	6	212231	212236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988844
5593	NC_015576	TGG	2	6	212323	212328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988844
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5601	NC_015576	GGCG	2	8	212519	212526	0 %	0 %	75 %	25 %	333988844
5602	NC_015576	CGA	2	6	212572	212577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988844
5603	NC_015576	GACGTC	2	12	212642	212653	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333988844
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5611	NC_015576	GCC	2	6	212945	212950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988845
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5619	NC_015576	GC	3	6	213095	213100	0 %	0 %	50 %	50 %	333988845
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5855	NC_015576	GAG	2	6	222965	222970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333988855
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5857	NC_015576	GTCG	2	8	222994	223001	0 %	25 %	50 %	25 %	333988855
5858	NC_015576	GCG	2	6	223028	223033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988855
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5860	NC_015576	TAC	2	6	223079	223084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988855
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5862	NC_015576	CGA	3	9	223153	223161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988855
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5983	NC_015576	GCG	2	6	227812	227817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988858
5984	NC_015576	GTG	3	9	227851	227859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988858
5985	NC_015576	CCG	2	6	227883	227888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988858
5986	NC_015576	GC	3	6	227894	227899	0 %	0 %	50 %	50 %	333988858
5987	NC_015576	GGT	2	6	227948	227953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988858
5988	NC_015576	CCG	2	6	227981	227986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988858
5989	NC_015576	GGC	3	9	228033	228041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988858
5990	NC_015576	GCC	2	6	228111	228116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988858
5991	NC_015576	GCC	2	6	228123	228128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988858
5992	NC_015576	GGC	2	6	228138	228143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988858
5993	NC_015576	GGCG	2	8	228182	228189	0 %	0 %	75 %	25 %	333988858
5994	NC_015576	CGG	2	6	228194	228199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988858
5995	NC_015576	GTC	2	6	228219	228224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988858
5996	NC_015576	GCG	2	6	228254	228259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988858
5997	NC_015576	CGGTGA	2	12	228263	228274	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	333988858
5998	NC_015576	CGGCG	2	10	228302	228311	0 %	0 %	60 %	40 %	333988858
5999	NC_015576	CG	3	6	228310	228315	0 %	0 %	50 %	50 %	333988858
6000	NC_015576	TCA	2	6	228323	228328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988858

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