MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 40714

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015574	TA	3	6	342909	342914	50 %	50 %	0 %	0 %	333986542
5502	NC_015574	TAC	2	6	342939	342944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986542
5503	NC_015574	AAC	2	6	342957	342962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986542
5504	NC_015574	T	6	6	343045	343050	0 %	100 %	0 %	0 %	333986542
5505	NC_015574	ATG	2	6	343059	343064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986542
5506	NC_015574	T	6	6	343074	343079	0 %	100 %	0 %	0 %	333986542
5507	NC_015574	CAA	2	6	343108	343113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986542
5508	NC_015574	T	6	6	343136	343141	0 %	100 %	0 %	0 %	333986542
5509	NC_015574	GTT	2	6	343191	343196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986542
5510	NC_015574	GTT	2	6	343227	343232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986542
5511	NC_015574	TAA	2	6	343252	343257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986542
5512	NC_015574	TAT	2	6	343290	343295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986542
5513	NC_015574	AAT	2	6	343301	343306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986542
5514	NC_015574	TAA	2	6	343325	343330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986542
5515	NC_015574	TAT	2	6	343345	343350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986542
5516	NC_015574	T	6	6	343430	343435	0 %	100 %	0 %	0 %	333986542
5517	NC_015574	AGA	2	6	343467	343472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986542
5518	NC_015574	TAA	2	6	343540	343545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986542
5519	NC_015574	TAA	2	6	343547	343552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986542
5520	NC_015574	CTG	2	6	343576	343581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986542
5521	NC_015574	TTG	2	6	343600	343605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986542
5522	NC_015574	ATT	2	6	343774	343779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986542
5523	NC_015574	TAA	2	6	343798	343803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986542
5524	NC_015574	TAT	2	6	343864	343869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986542
5525	NC_015574	TGC	2	6	343895	343900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986542
5526	NC_015574	TGA	2	6	343909	343914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986542
5527	NC_015574	AG	3	6	343925	343930	50 %	0 %	50 %	0 %	333986542
5528	NC_015574	TTAT	2	8	343942	343949	25 %	75 %	0 %	0 %	333986542
5529	NC_015574	TAAT	2	8	343978	343985	50 %	50 %	0 %	0 %	333986542
5530	NC_015574	T	7	7	344003	344009	0 %	100 %	0 %	0 %	333986542
5531	NC_015574	AGT	2	6	344039	344044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986542
5532	NC_015574	TCAT	2	8	344076	344083	25 %	50 %	0 %	25 %	333986542
5533	NC_015574	CAA	2	6	344147	344152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986542
5534	NC_015574	GAA	2	6	344277	344282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986542
5535	NC_015574	ATTA	2	8	344310	344317	50 %	50 %	0 %	0 %	333986542
5536	NC_015574	ATG	2	6	344365	344370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986542
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5538	NC_015574	TCTT	2	8	344414	344421	0 %	75 %	0 %	25 %	333986542
5539	NC_015574	TTAA	2	8	344465	344472	50 %	50 %	0 %	0 %	333986543
5540	NC_015574	CAT	2	6	344492	344497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986543
5541	NC_015574	GTG	2	6	344532	344537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986543
5542	NC_015574	TCA	2	6	344713	344718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986543
5543	NC_015574	CGC	2	6	344771	344776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333986543
5544	NC_015574	TGG	2	6	344797	344802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986543
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5547	NC_015574	CTG	2	6	344900	344905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986543
5548	NC_015574	T	7	7	344908	344914	0 %	100 %	0 %	0 %	333986543
5549	NC_015574	AGT	2	6	344969	344974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986543
5550	NC_015574	GTT	2	6	345012	345017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986543
5551	NC_015574	ACA	2	6	345019	345024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986543
5552	NC_015574	ATATT	2	10	345179	345188	40 %	60 %	0 %	0 %	333986544
5553	NC_015574	TAG	3	9	345191	345199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986544
5554	NC_015574	AT	5	10	345280	345289	50 %	50 %	0 %	0 %	333986544
5555	NC_015574	A	6	6	345490	345495	100 %	0 %	0 %	0 %	333986545
5556	NC_015574	ATG	2	6	345565	345570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986545
5557	NC_015574	TTAC	2	8	345629	345636	25 %	50 %	0 %	25 %	333986545
5558	NC_015574	CA	3	6	345648	345653	50 %	0 %	0 %	50 %	333986545
5559	NC_015574	ATCT	2	8	345736	345743	25 %	50 %	0 %	25 %	333986545
5560	NC_015574	ATT	2	6	345748	345753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986545
5561	NC_015574	GAT	2	6	345768	345773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986545
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5565	NC_015574	GGAT	2	8	345973	345980	25 %	25 %	50 %	0 %	333986545
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5567	NC_015574	A	6	6	346068	346073	100 %	0 %	0 %	0 %	333986545
5568	NC_015574	AGTA	2	8	346101	346108	50 %	25 %	25 %	0 %	333986545
5569	NC_015574	TGA	2	6	346109	346114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986545
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5571	NC_015574	TGACAT	2	12	346380	346391	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333986546
5572	NC_015574	TCAC	2	8	346420	346427	25 %	25 %	0 %	50 %	333986546
5573	NC_015574	CCT	2	6	346543	346548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986546
5574	NC_015574	GCT	2	6	346590	346595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986546
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5577	NC_015574	TAT	2	6	346694	346699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986546
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5579	NC_015574	CAA	2	6	346814	346819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986546
5580	NC_015574	T	6	6	346846	346851	0 %	100 %	0 %	0 %	333986546
5581	NC_015574	T	7	7	346853	346859	0 %	100 %	0 %	0 %	333986546
5582	NC_015574	TCTG	2	8	346874	346881	0 %	50 %	25 %	25 %	333986546
5583	NC_015574	AATA	2	8	346883	346890	75 %	25 %	0 %	0 %	333986546
5584	NC_015574	T	8	8	346905	346912	0 %	100 %	0 %	0 %	333986546
5585	NC_015574	TGA	2	6	346974	346979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986546
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5587	NC_015574	T	6	6	347157	347162	0 %	100 %	0 %	0 %	333986546
5588	NC_015574	GTC	2	6	347208	347213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986546
5589	NC_015574	T	6	6	347306	347311	0 %	100 %	0 %	0 %	333986546
5590	NC_015574	AGG	2	6	347392	347397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986546
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5592	NC_015574	TCA	2	6	347489	347494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986546
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5594	NC_015574	TCT	2	6	347542	347547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986546
5595	NC_015574	ATG	2	6	347594	347599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986546
5596	NC_015574	TGT	2	6	347709	347714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986546
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5600	NC_015574	GAA	2	6	348302	348307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986547
5601	NC_015574	GTT	3	9	348359	348367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986547
5602	NC_015574	CAA	2	6	348390	348395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986547
5603	NC_015574	ATC	2	6	348411	348416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986547
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5605	NC_015574	T	6	6	348536	348541	0 %	100 %	0 %	0 %	333986547
5606	NC_015574	ATT	2	6	348585	348590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986547
5607	NC_015574	TGA	2	6	348598	348603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986547
5608	NC_015574	TGA	2	6	348610	348615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986547
5609	NC_015574	ATT	2	6	348641	348646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986547
5610	NC_015574	A	6	6	348685	348690	100 %	0 %	0 %	0 %	333986547
5611	NC_015574	ATAA	2	8	348695	348702	75 %	25 %	0 %	0 %	333986547
5612	NC_015574	TTAA	2	8	348785	348792	50 %	50 %	0 %	0 %	333986547
5613	NC_015574	AGG	2	6	348838	348843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986547
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5615	NC_015574	CA	3	6	349497	349502	50 %	0 %	0 %	50 %	333986548
5616	NC_015574	TCTCA	2	10	349599	349608	20 %	40 %	0 %	40 %	333986548
5617	NC_015574	CAT	2	6	349652	349657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986548
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5619	NC_015574	ATT	2	6	349711	349716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986548
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5621	NC_015574	GTG	2	6	349791	349796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986548
5622	NC_015574	CAC	2	6	349820	349825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986548
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5624	NC_015574	GAT	2	6	349911	349916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986548
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