MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methylomonas methanica MC09 chromosome

Total Repeats: 2775

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015572	TTTTA	2	10	2812	2821	20 %	80 %	0 %	0 %	333981750
2	NC_015572	CAAAC	2	10	3185	3194	60 %	0 %	0 %	40 %	333981750
3	NC_015572	AAAAC	2	10	4558	4567	80 %	0 %	0 %	20 %	333981751
4	NC_015572	CCCTG	2	10	5108	5117	0 %	20 %	20 %	60 %	333981751
5	NC_015572	GTTGC	2	10	10792	10801	0 %	40 %	40 %	20 %	333981756
6	NC_015572	GAATT	2	10	13561	13570	40 %	40 %	20 %	0 %	333981758
7	NC_015572	TTGCG	2	10	13598	13607	0 %	40 %	40 %	20 %	333981758
8	NC_015572	GCCAT	2	10	14540	14549	20 %	20 %	20 %	40 %	333981759
9	NC_015572	TCAGC	2	10	17172	17181	20 %	20 %	20 %	40 %	333981761
10	NC_015572	AATTG	2	10	18974	18983	40 %	40 %	20 %	0 %	333981762
11	NC_015572	GACGG	2	10	19212	19221	20 %	0 %	60 %	20 %	333981762
12	NC_015572	CGAGC	2	10	19710	19719	20 %	0 %	40 %	40 %	333981762
13	NC_015572	TGGAA	2	10	22061	22070	40 %	20 %	40 %	0 %	333981764
14	NC_015572	GCCAT	2	10	22635	22644	20 %	20 %	20 %	40 %	333981764
15	NC_015572	AATCC	2	10	22969	22978	40 %	20 %	0 %	40 %	333981764
16	NC_015572	GCCGG	2	10	25481	25490	0 %	0 %	60 %	40 %	333981767
17	NC_015572	TGGCT	2	10	26852	26861	0 %	40 %	40 %	20 %	333981768
18	NC_015572	TTACC	2	10	27029	27038	20 %	40 %	0 %	40 %	333981768
19	NC_015572	AAAAT	2	10	27398	27407	80 %	20 %	0 %	0 %	333981768
20	NC_015572	GTGTT	2	10	27449	27458	0 %	60 %	40 %	0 %	333981768
21	NC_015572	GATTC	2	10	28349	28358	20 %	40 %	20 %	20 %	333981769
22	NC_015572	TTGTT	2	10	28916	28925	0 %	80 %	20 %	0 %	333981771
23	NC_015572	ATACT	2	10	31540	31549	40 %	40 %	0 %	20 %	333981774
24	NC_015572	TGATT	2	10	32570	32579	20 %	60 %	20 %	0 %	333981775
25	NC_015572	TACAT	2	10	36125	36134	40 %	40 %	0 %	20 %	333981777
26	NC_015572	AACTG	2	10	36146	36155	40 %	20 %	20 %	20 %	333981777
27	NC_015572	GACTC	2	10	36642	36651	20 %	20 %	20 %	40 %	333981777
28	NC_015572	GACAA	2	10	36964	36973	60 %	0 %	20 %	20 %	333981777
29	NC_015572	CCAAA	2	10	40776	40785	60 %	0 %	0 %	40 %	333981783
30	NC_015572	GTTTT	2	10	41531	41540	0 %	80 %	20 %	0 %	333981783
31	NC_015572	TTCGA	2	10	42487	42496	20 %	40 %	20 %	20 %	333981784
32	NC_015572	CAAGC	2	10	44017	44026	40 %	0 %	20 %	40 %	333981785
33	NC_015572	GTCTC	2	10	47292	47301	0 %	40 %	20 %	40 %	333981787
34	NC_015572	GCGTT	2	10	51794	51803	0 %	40 %	40 %	20 %	333981792
35	NC_015572	TTTCA	2	10	57357	57366	20 %	60 %	0 %	20 %	333981799
36	NC_015572	CGACA	2	10	58716	58725	40 %	0 %	20 %	40 %	333981800
37	NC_015572	GCGGA	2	10	61396	61405	20 %	0 %	60 %	20 %	333981801
38	NC_015572	CAAGC	2	10	64554	64563	40 %	0 %	20 %	40 %	333981803
39	NC_015572	TTTGG	2	10	64900	64909	0 %	60 %	40 %	0 %	333981803
40	NC_015572	GCTTG	2	10	67339	67348	0 %	40 %	40 %	20 %	333981804
41	NC_015572	TGAAC	2	10	68374	68383	40 %	20 %	20 %	20 %	333981804
42	NC_015572	CGCCA	2	10	69270	69279	20 %	0 %	20 %	60 %	333981804
43	NC_015572	TGAAG	2	10	71252	71261	40 %	20 %	40 %	0 %	333981806
44	NC_015572	TTTGA	2	10	75652	75661	20 %	60 %	20 %	0 %	333981812
45	NC_015572	ATCAC	2	10	76537	76546	40 %	20 %	0 %	40 %	333981814
46	NC_015572	AATTT	2	10	78872	78881	40 %	60 %	0 %	0 %	333981817
47	NC_015572	TCAAT	2	10	79452	79461	40 %	40 %	0 %	20 %	333981817
48	NC_015572	GAATC	2	10	80097	80106	40 %	20 %	20 %	20 %	333981817
49	NC_015572	TAGCG	2	10	81042	81051	20 %	20 %	40 %	20 %	333981818
50	NC_015572	CGGGC	2	10	81482	81491	0 %	0 %	60 %	40 %	333981819
51	NC_015572	TTTAA	2	10	82020	82029	40 %	60 %	0 %	0 %	333981819
52	NC_015572	CGCTG	2	10	82622	82631	0 %	20 %	40 %	40 %	333981820
53	NC_015572	TCGTA	2	10	84535	84544	20 %	40 %	20 %	20 %	333981822
54	NC_015572	GATGT	2	10	86981	86990	20 %	40 %	40 %	0 %	333981825
55	NC_015572	CTTGC	2	10	89419	89428	0 %	40 %	20 %	40 %	333981828
56	NC_015572	CATTC	2	10	90504	90513	20 %	40 %	0 %	40 %	333981829
57	NC_015572	TTGCG	2	10	94171	94180	0 %	40 %	40 %	20 %	333981832
58	NC_015572	CCCAG	2	10	97294	97303	20 %	0 %	20 %	60 %	333981836
59	NC_015572	TTTTA	2	10	99802	99811	20 %	80 %	0 %	0 %	333981839
60	NC_015572	ATGCC	2	10	102396	102405	20 %	20 %	20 %	40 %	333981842
61	NC_015572	GCTTT	2	10	104877	104886	0 %	60 %	20 %	20 %	333981844
62	NC_015572	CGCAT	2	10	107985	107994	20 %	20 %	20 %	40 %	333981845
63	NC_015572	AATAG	2	10	108423	108432	60 %	20 %	20 %	0 %	333981845
64	NC_015572	ACGAA	2	10	110455	110464	60 %	0 %	20 %	20 %	333981847
65	NC_015572	ACGGT	2	10	114961	114970	20 %	20 %	40 %	20 %	333981851
66	NC_015572	GGCGT	2	10	115476	115485	0 %	20 %	60 %	20 %	333981851
67	NC_015572	TTGGC	2	10	117610	117619	0 %	40 %	40 %	20 %	333981851
68	NC_015572	GCGCG	2	10	119173	119182	0 %	0 %	60 %	40 %	333981852
69	NC_015572	GTTGG	2	10	119303	119312	0 %	40 %	60 %	0 %	333981853
70	NC_015572	CTTGG	2	10	119591	119600	0 %	40 %	40 %	20 %	333981853
71	NC_015572	ATCCA	2	10	121020	121029	40 %	20 %	0 %	40 %	333981855
72	NC_015572	CGATG	2	10	121954	121963	20 %	20 %	40 %	20 %	333981856
73	NC_015572	GGCGC	2	10	122492	122501	0 %	0 %	60 %	40 %	333981856
74	NC_015572	GCCGC	2	10	123587	123596	0 %	0 %	40 %	60 %	333981857
75	NC_015572	GAGGC	2	10	125007	125016	20 %	0 %	60 %	20 %	333981859
76	NC_015572	AAGGA	2	10	126469	126478	60 %	0 %	40 %	0 %	333981861
77	NC_015572	GGCGT	2	10	127041	127050	0 %	20 %	60 %	20 %	333981862
78	NC_015572	AGGAA	2	10	130179	130188	60 %	0 %	40 %	0 %	333981864
79	NC_015572	ATTTT	2	10	131905	131914	20 %	80 %	0 %	0 %	333981867
80	NC_015572	GCTTT	2	10	132182	132191	0 %	60 %	20 %	20 %	333981867
81	NC_015572	ATGTA	2	10	133298	133307	40 %	40 %	20 %	0 %	333981868
82	NC_015572	AAATT	2	10	133811	133820	60 %	40 %	0 %	0 %	333981870
83	NC_015572	AATGA	2	10	137492	137501	60 %	20 %	20 %	0 %	333981873
84	NC_015572	GCCGC	2	10	138386	138395	0 %	0 %	40 %	60 %	333981873
85	NC_015572	CCCGG	2	10	146250	146259	0 %	0 %	40 %	60 %	333981879
86	NC_015572	TTGAG	2	10	147476	147485	20 %	40 %	40 %	0 %	333981881
87	NC_015572	TAAAA	2	10	148994	149003	80 %	20 %	0 %	0 %	333981882
88	NC_015572	GGTTG	2	10	149628	149637	0 %	40 %	60 %	0 %	333981882
89	NC_015572	CACCG	2	10	150399	150408	20 %	0 %	20 %	60 %	333981882
90	NC_015572	GGCCG	2	10	153126	153135	0 %	0 %	60 %	40 %	333981884
91	NC_015572	GCATA	2	10	154800	154809	40 %	20 %	20 %	20 %	333981885
92	NC_015572	GGTCC	2	10	155506	155515	0 %	20 %	40 %	40 %	333981885
93	NC_015572	CGCTT	2	10	155599	155608	0 %	40 %	20 %	40 %	333981885
94	NC_015572	GCTTG	2	10	157248	157257	0 %	40 %	40 %	20 %	333981887
95	NC_015572	CAAGG	2	10	159618	159627	40 %	0 %	40 %	20 %	333981888
96	NC_015572	AGCGA	2	10	159903	159912	40 %	0 %	40 %	20 %	333981888
97	NC_015572	GGTTT	2	10	160566	160575	0 %	60 %	40 %	0 %	333981889
98	NC_015572	CACGC	2	10	161490	161499	20 %	0 %	20 %	60 %	333981890
99	NC_015572	AAGCC	2	10	162572	162581	40 %	0 %	20 %	40 %	333981891
100	NC_015572	CGCCC	2	10	164792	164801	0 %	0 %	20 %	80 %	333981894
101	NC_015572	ATGCG	2	10	166468	166477	20 %	20 %	40 %	20 %	333981896
102	NC_015572	AACGC	2	10	170263	170272	40 %	0 %	20 %	40 %	333981898
103	NC_015572	CAAAG	2	10	172380	172389	60 %	0 %	20 %	20 %	333981899
104	NC_015572	TGGAA	2	10	172491	172500	40 %	20 %	40 %	0 %	333981899
105	NC_015572	TGATT	2	10	172697	172706	20 %	60 %	20 %	0 %	333981900
106	NC_015572	GCGCT	2	10	173027	173036	0 %	20 %	40 %	40 %	333981900
107	NC_015572	GCGCT	2	10	183204	183213	0 %	20 %	40 %	40 %	333981906
108	NC_015572	TGCGG	2	10	183229	183238	0 %	20 %	60 %	20 %	333981906
109	NC_015572	TTGGT	2	10	183852	183861	0 %	60 %	40 %	0 %	333981906
110	NC_015572	TAGCT	2	10	184923	184932	20 %	40 %	20 %	20 %	333981907
111	NC_015572	ATGCC	2	10	187153	187162	20 %	20 %	20 %	40 %	333981908
112	NC_015572	CCGCA	2	10	187422	187431	20 %	0 %	20 %	60 %	333981909
113	NC_015572	TTACC	2	10	187434	187443	20 %	40 %	0 %	40 %	333981909
114	NC_015572	ACAAA	2	10	187620	187629	80 %	0 %	0 %	20 %	333981909
115	NC_015572	AATTA	2	10	187816	187825	60 %	40 %	0 %	0 %	333981909
116	NC_015572	AAATG	2	10	190363	190372	60 %	20 %	20 %	0 %	333981913
117	NC_015572	GCTGT	2	10	195478	195487	0 %	40 %	40 %	20 %	333981917
118	NC_015572	ACCGT	2	10	198404	198413	20 %	20 %	20 %	40 %	333981922
119	NC_015572	ATGAC	2	10	198749	198758	40 %	20 %	20 %	20 %	333981922
120	NC_015572	TCGAT	2	10	201691	201700	20 %	40 %	20 %	20 %	333981924
121	NC_015572	AATCG	2	10	203066	203075	40 %	20 %	20 %	20 %	333981926
122	NC_015572	ACCAG	2	10	205129	205138	40 %	0 %	20 %	40 %	333981928
123	NC_015572	CCGAT	2	10	207146	207155	20 %	20 %	20 %	40 %	333981929
124	NC_015572	GCAAA	2	10	213204	213213	60 %	0 %	20 %	20 %	333981936
125	NC_015572	GGTTT	2	10	217562	217571	0 %	60 %	40 %	0 %	333981939
126	NC_015572	TGATT	2	10	218632	218641	20 %	60 %	20 %	0 %	333981941
127	NC_015572	AGCGG	2	10	220901	220910	20 %	0 %	60 %	20 %	333981943
128	NC_015572	TGAAC	2	10	227201	227210	40 %	20 %	20 %	20 %	333981948
129	NC_015572	ACTTT	2	10	232153	232162	20 %	60 %	0 %	20 %	333981955
130	NC_015572	AACCA	2	10	233150	233159	60 %	0 %	0 %	40 %	333981957
131	NC_015572	AAAGT	2	10	233542	233551	60 %	20 %	20 %	0 %	333981957
132	NC_015572	TAGGG	2	10	234709	234718	20 %	20 %	60 %	0 %	333981958
133	NC_015572	CGCGA	2	10	235060	235069	20 %	0 %	40 %	40 %	333981959
134	NC_015572	CTTGC	2	10	236592	236601	0 %	40 %	20 %	40 %	333981959
135	NC_015572	GTTGA	2	10	237517	237526	20 %	40 %	40 %	0 %	333981960
136	NC_015572	TGATC	2	10	237927	237936	20 %	40 %	20 %	20 %	333981960
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138	NC_015572	TGATC	2	10	238983	238992	20 %	40 %	20 %	20 %	333981960
139	NC_015572	TTTGG	2	10	239965	239974	0 %	60 %	40 %	0 %	333981960
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264	NC_015572	CGAAG	2	10	467815	467824	40 %	0 %	40 %	20 %	333982173
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