MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylomonas methanica MC09 chromosome

Total Repeats: 86528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015572	CAC	2	6	116	121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333981748
2	NC_015572	TTGC	2	8	180	187	0 %	50 %	25 %	25 %	333981748
3	NC_015572	AGC	2	6	217	222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981748
4	NC_015572	T	7	7	224	230	0 %	100 %	0 %	0 %	333981748
5	NC_015572	A	6	6	300	305	100 %	0 %	0 %	0 %	333981748
6	NC_015572	CAA	2	6	374	379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981748
7	NC_015572	GCT	2	6	432	437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981748
8	NC_015572	ATA	2	6	454	459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333981748
9	NC_015572	TTTA	2	8	483	490	25 %	75 %	0 %	0 %	333981748
10	NC_015572	TAC	2	6	651	656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981748
11	NC_015572	CTG	2	6	672	677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981748
12	NC_015572	GAC	2	6	681	686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981748
13	NC_015572	CAA	2	6	740	745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981748
14	NC_015572	A	6	6	900	905	100 %	0 %	0 %	0 %	333981748
15	NC_015572	TTCC	2	8	964	971	0 %	50 %	0 %	50 %	333981748
16	NC_015572	CGG	2	6	999	1004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981748
17	NC_015572	GTG	2	6	1005	1010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981748
18	NC_015572	ATA	2	6	1108	1113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333981748
19	NC_015572	GCAA	2	8	1174	1181	50 %	0 %	25 %	25 %	333981748
20	NC_015572	GGCG	2	8	1266	1273	0 %	0 %	75 %	25 %	333981748
21	NC_015572	CAC	2	6	1280	1285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333981748
22	NC_015572	ACG	2	6	1327	1332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981748
23	NC_015572	TAT	2	6	1579	1584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981749
24	NC_015572	TTA	2	6	1598	1603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981749
25	NC_015572	CAA	2	6	1613	1618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981749
26	NC_015572	GAA	2	6	1682	1687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981749
27	NC_015572	GCC	2	6	1806	1811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981749
28	NC_015572	CCG	2	6	1905	1910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981749
29	NC_015572	ATC	2	6	1944	1949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981749
30	NC_015572	TTG	2	6	1955	1960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981749
31	NC_015572	ACGT	2	8	2019	2026	25 %	25 %	25 %	25 %	333981749
32	NC_015572	TAC	2	6	2027	2032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981749
33	NC_015572	CTG	2	6	2045	2050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981749
34	NC_015572	TGG	2	6	2076	2081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981749
35	NC_015572	GC	3	6	2144	2149	0 %	0 %	50 %	50 %	333981749
36	NC_015572	ATT	2	6	2150	2155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981749
37	NC_015572	GAC	2	6	2195	2200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981749
38	NC_015572	CAA	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981749
39	NC_015572	TTA	2	6	2248	2253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981749
40	NC_015572	GTG	2	6	2261	2266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981749
41	NC_015572	TCAA	2	8	2316	2323	50 %	25 %	0 %	25 %	333981749
42	NC_015572	TGG	2	6	2428	2433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981749
43	NC_015572	GAA	3	9	2480	2488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981749
44	NC_015572	CAG	2	6	2605	2610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981749
45	NC_015572	TTG	2	6	2690	2695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981750
46	NC_015572	TTTTA	2	10	2812	2821	20 %	80 %	0 %	0 %	333981750
47	NC_015572	TTG	2	6	2889	2894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981750
48	NC_015572	CAT	2	6	2912	2917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981750
49	NC_015572	TTAT	2	8	3007	3014	25 %	75 %	0 %	0 %	333981750
50	NC_015572	CCG	2	6	3073	3078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981750
51	NC_015572	ACA	2	6	3154	3159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981750
52	NC_015572	CAAAC	2	10	3185	3194	60 %	0 %	0 %	40 %	333981750
53	NC_015572	TGG	2	6	3219	3224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981750
54	NC_015572	TACA	2	8	3260	3267	50 %	25 %	0 %	25 %	333981750
55	NC_015572	GCT	2	6	3268	3273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981750
56	NC_015572	GCCA	2	8	3296	3303	25 %	0 %	25 %	50 %	333981750
57	NC_015572	T	6	6	3304	3309	0 %	100 %	0 %	0 %	333981750
58	NC_015572	ATT	2	6	3477	3482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981750
59	NC_015572	CG	3	6	3486	3491	0 %	0 %	50 %	50 %	333981750
60	NC_015572	CAA	2	6	3494	3499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981750
61	NC_015572	TGC	2	6	3519	3524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981750
62	NC_015572	CTG	2	6	3565	3570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981750
63	NC_015572	TGG	2	6	3576	3581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981750
64	NC_015572	TAA	2	6	3706	3711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333981750
65	NC_015572	CGA	2	6	3959	3964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981751
66	NC_015572	TCCGTA	2	12	4071	4082	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	333981751
67	NC_015572	AGA	2	6	4121	4126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981751
68	NC_015572	TGC	2	6	4159	4164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981751
69	NC_015572	CGG	2	6	4169	4174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981751
70	NC_015572	CGA	2	6	4181	4186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981751
71	NC_015572	CGG	2	6	4205	4210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981751
72	NC_015572	CGG	2	6	4318	4323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981751
73	NC_015572	AAG	2	6	4490	4495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981751
74	NC_015572	TTCGAA	2	12	4512	4523	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333981751
75	NC_015572	GGC	2	6	4524	4529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981751
76	NC_015572	AAAAC	2	10	4558	4567	80 %	0 %	0 %	20 %	333981751
77	NC_015572	AAG	2	6	4606	4611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981751
78	NC_015572	CAA	2	6	4676	4681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981751
79	NC_015572	CGG	2	6	4697	4702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981751
80	NC_015572	AGC	2	6	4724	4729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981751
81	NC_015572	A	6	6	4776	4781	100 %	0 %	0 %	0 %	333981751
82	NC_015572	ACC	2	6	4794	4799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333981751
83	NC_015572	CGA	2	6	4802	4807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981751
84	NC_015572	TTC	2	6	4862	4867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333981751
85	NC_015572	TCG	2	6	4890	4895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981751
86	NC_015572	TGG	2	6	4909	4914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981751
87	NC_015572	CCA	2	6	4918	4923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333981751
88	NC_015572	AAC	2	6	4954	4959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981751
89	NC_015572	CAA	2	6	4982	4987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981751
90	NC_015572	GCC	2	6	4998	5003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981751
91	NC_015572	CG	3	6	5018	5023	0 %	0 %	50 %	50 %	333981751
92	NC_015572	CCCTG	2	10	5108	5117	0 %	20 %	20 %	60 %	333981751
93	NC_015572	CGGC	2	8	5146	5153	0 %	0 %	50 %	50 %	333981751
94	NC_015572	CCG	2	6	5177	5182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981751
95	NC_015572	GAA	2	6	5259	5264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981751
96	NC_015572	ACA	2	6	5314	5319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981751
97	NC_015572	CAT	4	12	5342	5353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981751
98	NC_015572	TCT	2	6	5404	5409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333981751
99	NC_015572	GCC	2	6	5459	5464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981751
100	NC_015572	A	6	6	5478	5483	100 %	0 %	0 %	0 %	333981751
101	NC_015572	TAAT	2	8	5644	5651	50 %	50 %	0 %	0 %	333981751
102	NC_015572	GCC	2	6	5702	5707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981751
103	NC_015572	CGA	2	6	5831	5836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981751
104	NC_015572	CAC	2	6	5894	5899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333981751
105	NC_015572	A	6	6	5923	5928	100 %	0 %	0 %	0 %	333981751
106	NC_015572	AGCA	2	8	5998	6005	50 %	0 %	25 %	25 %	333981751
107	NC_015572	AGG	2	6	6019	6024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333981751
108	NC_015572	GAT	2	6	6035	6040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981751
109	NC_015572	A	6	6	6051	6056	100 %	0 %	0 %	0 %	333981751
110	NC_015572	AGC	2	6	6103	6108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981751
111	NC_015572	ACC	2	6	6117	6122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333981751
112	NC_015572	GCC	2	6	6136	6141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981751
113	NC_015572	TGC	2	6	6145	6150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981751
114	NC_015572	CGA	2	6	6179	6184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981751
115	NC_015572	TAC	2	6	6191	6196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981751
116	NC_015572	GTT	2	6	6275	6280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981751
117	NC_015572	AC	5	10	7105	7114	50 %	0 %	0 %	50 %	333981752
118	NC_015572	CTG	2	6	7209	7214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981752
119	NC_015572	A	6	6	7222	7227	100 %	0 %	0 %	0 %	333981752
120	NC_015572	TGG	2	6	7320	7325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981752
121	NC_015572	ATAA	2	8	7463	7470	75 %	25 %	0 %	0 %	333981752
122	NC_015572	ATG	2	6	7562	7567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981752
123	NC_015572	TGC	2	6	7588	7593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981752
124	NC_015572	GAT	2	6	7643	7648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981752
125	NC_015572	AGC	2	6	7649	7654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981752
126	NC_015572	ACTT	2	8	7659	7666	25 %	50 %	0 %	25 %	333981752
127	NC_015572	ATCT	2	8	7706	7713	25 %	50 %	0 %	25 %	333981752
128	NC_015572	CGA	2	6	7755	7760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981752
129	NC_015572	ATT	2	6	7911	7916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981752
130	NC_015572	GAAATT	2	12	7919	7930	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333981752
131	NC_015572	GAT	2	6	7944	7949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981752
132	NC_015572	CTT	2	6	7999	8004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333981753
133	NC_015572	TATT	2	8	8063	8070	25 %	75 %	0 %	0 %	333981753
134	NC_015572	TTGA	2	8	8095	8102	25 %	50 %	25 %	0 %	333981753
135	NC_015572	GAA	2	6	8140	8145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981753
136	NC_015572	GTT	2	6	8164	8169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981753
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138	NC_015572	GAC	2	6	8184	8189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981753
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142	NC_015572	TAT	2	6	8454	8459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981753
143	NC_015572	AATC	2	8	8474	8481	50 %	25 %	0 %	25 %	333981753
144	NC_015572	A	6	6	8492	8497	100 %	0 %	0 %	0 %	333981753
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153	NC_015572	TTC	2	6	8809	8814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333981753
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263	NC_015572	GTT	2	6	16972	16977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981761
264	NC_015572	GAT	2	6	17110	17115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981761
265	NC_015572	TCAGC	2	10	17172	17181	20 %	20 %	20 %	40 %	333981761
266	NC_015572	CAG	2	6	17254	17259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981761
267	NC_015572	TGA	2	6	17295	17300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981761
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276	NC_015572	TTG	2	6	18135	18140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981762
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281	NC_015572	TGGC	2	8	18647	18654	0 %	25 %	50 %	25 %	333981762
282	NC_015572	TGA	2	6	18676	18681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981762
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284	NC_015572	GTG	2	6	18828	18833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981762
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287	NC_015572	AATTG	2	10	18974	18983	40 %	40 %	20 %	0 %	333981762
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381	NC_015572	A	7	7	24143	24149	100 %	0 %	0 %	0 %	333981765
382	NC_015572	TGA	2	6	24177	24182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981765
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391	NC_015572	GAA	2	6	24655	24660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981765
392	NC_015572	TAA	2	6	24765	24770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333981765
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396	NC_015572	TAA	2	6	24917	24922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333981765
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489	NC_015572	CAA	2	6	30679	30684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981773
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498	NC_015572	CAC	2	6	31488	31493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333981774
499	NC_015572	ATACT	2	10	31540	31549	40 %	40 %	0 %	20 %	333981774
500	NC_015572	CCAG	2	8	31598	31605	25 %	0 %	25 %	50 %	333981774

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