MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylomonas methanica MC09 chromosome

Total Repeats: 86528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015572	TCT	2	6	214352	214357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333981936
3502	NC_015572	AAC	2	6	214439	214444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981936
3503	NC_015572	CGC	2	6	214453	214458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981936
3504	NC_015572	GACG	2	8	214489	214496	25 %	0 %	50 %	25 %	333981936
3505	NC_015572	T	6	6	214581	214586	0 %	100 %	0 %	0 %	333981936
3506	NC_015572	ATT	2	6	214719	214724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981936
3507	NC_015572	GCC	2	6	214759	214764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981936
3508	NC_015572	GAA	2	6	214916	214921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981937
3509	NC_015572	GAA	2	6	214995	215000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981937
3510	NC_015572	TTGATT	2	12	215187	215198	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	333981937
3511	NC_015572	CAA	2	6	215220	215225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981937
3512	NC_015572	TGC	2	6	215494	215499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981937
3513	NC_015572	CGG	2	6	215766	215771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981938
3514	NC_015572	TGT	2	6	215827	215832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981938
3515	NC_015572	CGG	2	6	215926	215931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981938
3516	NC_015572	CAA	2	6	215944	215949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981938
3517	NC_015572	ATG	2	6	215963	215968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981938
3518	NC_015572	GCG	2	6	215973	215978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981938
3519	NC_015572	ATCA	2	8	216101	216108	50 %	25 %	0 %	25 %	333981938
3520	NC_015572	GGT	2	6	216172	216177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981938
3521	NC_015572	CGG	2	6	216181	216186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981938
3522	NC_015572	ACA	2	6	216208	216213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981938
3523	NC_015572	CAC	2	6	216269	216274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333981938
3524	NC_015572	CAA	2	6	216293	216298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981938
3525	NC_015572	GCA	2	6	216367	216372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981938
3526	NC_015572	CGA	2	6	216382	216387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981938
3527	NC_015572	ACA	2	6	216618	216623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981939
3528	NC_015572	GTC	2	6	216633	216638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981939
3529	NC_015572	ATT	2	6	216679	216684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981939
3530	NC_015572	TTG	2	6	216690	216695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981939
3531	NC_015572	CCG	2	6	216707	216712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981939
3532	NC_015572	AAG	2	6	216918	216923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981939
3533	NC_015572	TAT	2	6	216958	216963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981939
3534	NC_015572	ATT	2	6	216994	216999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981939
3535	NC_015572	CGC	2	6	217081	217086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981939
3536	NC_015572	CCA	2	6	217101	217106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333981939
3537	NC_015572	CGG	2	6	217234	217239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981939
3538	NC_015572	ATT	2	6	217306	217311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981939
3539	NC_015572	A	6	6	217359	217364	100 %	0 %	0 %	0 %	333981939
3540	NC_015572	TA	3	6	217543	217548	50 %	50 %	0 %	0 %	333981939
3541	NC_015572	GGTTT	2	10	217562	217571	0 %	60 %	40 %	0 %	333981939
3542	NC_015572	GGC	2	6	217905	217910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981940
3543	NC_015572	TGA	2	6	217931	217936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981940
3544	NC_015572	CTG	2	6	218085	218090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981940
3545	NC_015572	CGG	2	6	218103	218108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981940
3546	NC_015572	TCG	2	6	218129	218134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981940
3547	NC_015572	GGC	2	6	218136	218141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981940
3548	NC_015572	TGC	2	6	218240	218245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981940
3549	NC_015572	AT	3	6	218341	218346	50 %	50 %	0 %	0 %	333981941
3550	NC_015572	CCG	2	6	218348	218353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981941
3551	NC_015572	GCC	2	6	218457	218462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981941
3552	NC_015572	AGATCG	2	12	218463	218474	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	333981941
3553	NC_015572	CCG	2	6	218529	218534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981941
3554	NC_015572	GCC	2	6	218564	218569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981941
3555	NC_015572	TGATT	2	10	218632	218641	20 %	60 %	20 %	0 %	333981941
3556	NC_015572	A	7	7	218701	218707	100 %	0 %	0 %	0 %	333981941
3557	NC_015572	GTC	2	6	218744	218749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981941
3558	NC_015572	GCC	2	6	218786	218791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981941
3559	NC_015572	CCG	2	6	218907	218912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981941
3560	NC_015572	CAA	2	6	218956	218961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981941
3561	NC_015572	GT	3	6	218971	218976	0 %	50 %	50 %	0 %	333981941
3562	NC_015572	GCC	2	6	218979	218984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981941
3563	NC_015572	A	6	6	219029	219034	100 %	0 %	0 %	0 %	333981941
3564	NC_015572	CGA	2	6	219059	219064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981941
3565	NC_015572	ATTG	2	8	219065	219072	25 %	50 %	25 %	0 %	333981941
3566	NC_015572	CGC	3	9	219110	219118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981941
3567	NC_015572	CGC	2	6	219132	219137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981941
3568	NC_015572	ATT	2	6	219155	219160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981941
3569	NC_015572	GAT	2	6	219188	219193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981941
3570	NC_015572	AGCGTT	2	12	219194	219205	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333981941
3571	NC_015572	CGC	2	6	219227	219232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981941
3572	NC_015572	T	6	6	219247	219252	0 %	100 %	0 %	0 %	333981941
3573	NC_015572	T	6	6	219460	219465	0 %	100 %	0 %	0 %	333981942
3574	NC_015572	T	7	7	219513	219519	0 %	100 %	0 %	0 %	333981942
3575	NC_015572	CCG	2	6	219841	219846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981942
3576	NC_015572	GGCA	2	8	219880	219887	25 %	0 %	50 %	25 %	333981942
3577	NC_015572	ATT	2	6	219888	219893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981942
3578	NC_015572	GGTA	2	8	219946	219953	25 %	25 %	50 %	0 %	333981942
3579	NC_015572	CAG	3	9	220016	220024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981942
3580	NC_015572	CGC	2	6	220045	220050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981942
3581	NC_015572	TCT	2	6	220064	220069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333981942
3582	NC_015572	AATG	2	8	220085	220092	50 %	25 %	25 %	0 %	333981942
3583	NC_015572	CCG	2	6	220305	220310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981943
3584	NC_015572	CGT	2	6	220368	220373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981943
3585	NC_015572	CGC	2	6	220398	220403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981943
3586	NC_015572	CCG	2	6	220440	220445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981943
3587	NC_015572	GC	3	6	220562	220567	0 %	0 %	50 %	50 %	333981943
3588	NC_015572	GATT	2	8	220580	220587	25 %	50 %	25 %	0 %	333981943
3589	NC_015572	TTGC	2	8	220685	220692	0 %	50 %	25 %	25 %	333981943
3590	NC_015572	GC	3	6	220697	220702	0 %	0 %	50 %	50 %	333981943
3591	NC_015572	TCA	2	6	220764	220769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981943
3592	NC_015572	C	6	6	220833	220838	0 %	0 %	0 %	100 %	333981943
3593	NC_015572	CGT	2	6	220895	220900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981943
3594	NC_015572	AGCGG	2	10	220901	220910	20 %	0 %	60 %	20 %	333981943
3595	NC_015572	AAC	2	6	221006	221011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981943
3596	NC_015572	GCC	2	6	221208	221213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981944
3597	NC_015572	GTT	2	6	221246	221251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981944
3598	NC_015572	ATGAAA	2	12	221282	221293	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	333981944
3599	NC_015572	TGC	2	6	221364	221369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981944
3600	NC_015572	CGG	2	6	221416	221421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981944
3601	NC_015572	TCG	3	9	221481	221489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981944
3602	NC_015572	CCA	2	6	221494	221499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333981944
3603	NC_015572	CATA	2	8	221503	221510	50 %	25 %	0 %	25 %	333981944
3604	NC_015572	CAG	2	6	221531	221536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981944
3605	NC_015572	CGC	2	6	221618	221623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981944
3606	NC_015572	GGC	2	6	221675	221680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981944
3607	NC_015572	A	6	6	221682	221687	100 %	0 %	0 %	0 %	333981944
3608	NC_015572	CGG	2	6	221800	221805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981944
3609	NC_015572	CG	3	6	221882	221887	0 %	0 %	50 %	50 %	333981944
3610	NC_015572	AAC	2	6	221916	221921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981944
3611	NC_015572	CCGT	2	8	221936	221943	0 %	25 %	25 %	50 %	333981944
3612	NC_015572	TGG	2	6	222030	222035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981944
3613	NC_015572	CGGT	2	8	222039	222046	0 %	25 %	50 %	25 %	333981944
3614	NC_015572	TTG	2	6	222051	222056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981944
3615	NC_015572	GAT	2	6	222172	222177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981945
3616	NC_015572	TTC	2	6	222199	222204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333981945
3617	NC_015572	T	7	7	222267	222273	0 %	100 %	0 %	0 %	333981945
3618	NC_015572	T	6	6	222345	222350	0 %	100 %	0 %	0 %	333981945
3619	NC_015572	AGCAGG	2	12	222376	222387	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	333981945
3620	NC_015572	T	6	6	222395	222400	0 %	100 %	0 %	0 %	333981945
3621	NC_015572	GGA	2	6	222437	222442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333981945
3622	NC_015572	GTC	2	6	222497	222502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981945
3623	NC_015572	AAT	2	6	222517	222522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333981945
3624	NC_015572	GTC	2	6	222523	222528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981945
3625	NC_015572	TTC	2	6	222582	222587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333981945
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3627	NC_015572	CAT	2	6	222681	222686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981945
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3644	NC_015572	GCT	2	6	223280	223285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981946
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3732	NC_015572	A	8	8	227251	227258	100 %	0 %	0 %	0 %	333981948
3733	NC_015572	GATA	2	8	227290	227297	50 %	25 %	25 %	0 %	333981948
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3741	NC_015572	AAT	2	6	227581	227586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333981948
3742	NC_015572	ATG	2	6	227632	227637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981948
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3744	NC_015572	AGG	2	6	227664	227669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333981948
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3853	NC_015572	T	6	6	233184	233189	0 %	100 %	0 %	0 %	333981957
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3988	NC_015572	GTT	2	6	239687	239692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981960
3989	NC_015572	GGT	2	6	239713	239718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981960
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