MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methanotorris igneus Kol 5 chromosome

Total Repeats: 1332

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015562	AAAAG	2	10	1825	1834	80 %	0 %	20 %	0 %	333909897
2	NC_015562	AAGAG	2	10	4963	4972	60 %	0 %	40 %	0 %	333909900
3	NC_015562	ATTGA	2	10	5219	5228	40 %	40 %	20 %	0 %	333909900
4	NC_015562	TGATA	2	10	6609	6618	40 %	40 %	20 %	0 %	333909902
5	NC_015562	GAAAA	2	10	6710	6719	80 %	0 %	20 %	0 %	333909902
6	NC_015562	AAACA	2	10	7539	7548	80 %	0 %	0 %	20 %	333909903
7	NC_015562	GCATT	2	10	9496	9505	20 %	40 %	20 %	20 %	333909904
8	NC_015562	CCATC	2	10	15369	15378	20 %	20 %	0 %	60 %	333909909
9	NC_015562	GGCAG	2	10	18536	18545	20 %	0 %	60 %	20 %	333909911
10	NC_015562	GAGTT	2	10	18613	18622	20 %	40 %	40 %	0 %	333909911
11	NC_015562	AAGGA	2	10	18756	18765	60 %	0 %	40 %	0 %	333909911
12	NC_015562	GGAAA	2	10	19513	19522	60 %	0 %	40 %	0 %	333909911
13	NC_015562	AAATC	2	10	19698	19707	60 %	20 %	0 %	20 %	333909912
14	NC_015562	TCTTT	2	10	21782	21791	0 %	80 %	0 %	20 %	333909914
15	NC_015562	TCAAC	2	10	22795	22804	40 %	20 %	0 %	40 %	333909915
16	NC_015562	TTTTC	2	10	23047	23056	0 %	80 %	0 %	20 %	333909915
17	NC_015562	CAAAA	2	10	26235	26244	80 %	0 %	0 %	20 %	333909918
18	NC_015562	TCCAA	2	10	27697	27706	40 %	20 %	0 %	40 %	333909918
19	NC_015562	CTTTT	2	10	30032	30041	0 %	80 %	0 %	20 %	333909920
20	NC_015562	TTTTC	2	10	31871	31880	0 %	80 %	0 %	20 %	333909921
21	NC_015562	AGAAT	2	10	32885	32894	60 %	20 %	20 %	0 %	333909922
22	NC_015562	TTTTG	2	10	33796	33805	0 %	80 %	20 %	0 %	333909923
23	NC_015562	AAGAA	2	10	34781	34790	80 %	0 %	20 %	0 %	333909923
24	NC_015562	AAGAA	2	10	35826	35835	80 %	0 %	20 %	0 %	333909924
25	NC_015562	TCCAA	2	10	36153	36162	40 %	20 %	0 %	40 %	333909924
26	NC_015562	AATAA	3	15	37615	37629	80 %	20 %	0 %	0 %	333909926
27	NC_015562	TCATC	2	10	39746	39755	20 %	40 %	0 %	40 %	333909928
28	NC_015562	ATGGA	2	10	42980	42989	40 %	20 %	40 %	0 %	333909931
29	NC_015562	AGATA	2	10	45895	45904	60 %	20 %	20 %	0 %	333909933
30	NC_015562	AATAA	2	10	46199	46208	80 %	20 %	0 %	0 %	333909933
31	NC_015562	TATCT	2	10	47904	47913	20 %	60 %	0 %	20 %	333909934
32	NC_015562	AAATT	2	10	48200	48209	60 %	40 %	0 %	0 %	333909934
33	NC_015562	GTTTT	2	10	48417	48426	0 %	80 %	20 %	0 %	333909934
34	NC_015562	TCTTA	2	10	48915	48924	20 %	60 %	0 %	20 %	333909934
35	NC_015562	CTATG	2	10	53268	53277	20 %	40 %	20 %	20 %	333909937
36	NC_015562	TCTTT	2	10	59082	59091	0 %	80 %	0 %	20 %	333909945
37	NC_015562	ATCCA	2	10	63908	63917	40 %	20 %	0 %	40 %	333909949
38	NC_015562	GAAAA	2	10	65329	65338	80 %	0 %	20 %	0 %	333909950
39	NC_015562	ATAAG	2	10	67039	67048	60 %	20 %	20 %	0 %	333909953
40	NC_015562	TTTAA	2	10	68110	68119	40 %	60 %	0 %	0 %	333909954
41	NC_015562	ATTTC	2	10	68572	68581	20 %	60 %	0 %	20 %	333909954
42	NC_015562	ACATA	2	10	68588	68597	60 %	20 %	0 %	20 %	333909954
43	NC_015562	AACGC	2	10	68908	68917	40 %	0 %	20 %	40 %	333909954
44	NC_015562	CCTTC	2	10	69442	69451	0 %	40 %	0 %	60 %	333909955
45	NC_015562	AAGAG	2	10	71471	71480	60 %	0 %	40 %	0 %	333909956
46	NC_015562	AAAGG	2	10	71597	71606	60 %	0 %	40 %	0 %	333909956
47	NC_015562	GTTGA	2	10	71697	71706	20 %	40 %	40 %	0 %	333909956
48	NC_015562	GGTTT	2	10	72571	72580	0 %	60 %	40 %	0 %	333909956
49	NC_015562	ACTTT	2	10	73611	73620	20 %	60 %	0 %	20 %	333909958
50	NC_015562	AAGAA	2	10	74721	74730	80 %	0 %	20 %	0 %	333909958
51	NC_015562	AAATG	2	10	74982	74991	60 %	20 %	20 %	0 %	333909958
52	NC_015562	TGCCT	2	10	77533	77542	0 %	40 %	20 %	40 %	333909961
53	NC_015562	TCCCC	2	10	77913	77922	0 %	20 %	0 %	80 %	333909961
54	NC_015562	ATTAA	2	10	78536	78545	60 %	40 %	0 %	0 %	333909962
55	NC_015562	ATTTA	2	10	78991	79000	40 %	60 %	0 %	0 %	333909962
56	NC_015562	AATAG	2	10	81952	81961	60 %	20 %	20 %	0 %	333909964
57	NC_015562	GTTAA	2	10	82276	82285	40 %	40 %	20 %	0 %	333909964
58	NC_015562	CCCAA	2	10	84616	84625	40 %	0 %	0 %	60 %	333909966
59	NC_015562	GTCTT	2	10	91888	91897	0 %	60 %	20 %	20 %	333909973
60	NC_015562	CTGGA	2	10	92482	92491	20 %	20 %	40 %	20 %	333909973
61	NC_015562	ATGCA	2	10	93759	93768	40 %	20 %	20 %	20 %	333909976
62	NC_015562	AATGT	2	10	97440	97449	40 %	40 %	20 %	0 %	333909980
63	NC_015562	TTTTG	2	10	99068	99077	0 %	80 %	20 %	0 %	333909982
64	NC_015562	CAACT	2	10	100584	100593	40 %	20 %	0 %	40 %	333909984
65	NC_015562	TTTTA	2	10	100734	100743	20 %	80 %	0 %	0 %	333909984
66	NC_015562	TTGCA	2	10	101766	101775	20 %	40 %	20 %	20 %	333909987
67	NC_015562	TCCAA	2	10	102233	102242	40 %	20 %	0 %	40 %	333909988
68	NC_015562	CTCTT	2	10	102706	102715	0 %	60 %	0 %	40 %	333909990
69	NC_015562	TCTTG	2	10	103739	103748	0 %	60 %	20 %	20 %	333909992
70	NC_015562	TTATC	2	10	103813	103822	20 %	60 %	0 %	20 %	333909992
71	NC_015562	TGCAT	2	10	104469	104478	20 %	40 %	20 %	20 %	333909992
72	NC_015562	AAACA	2	10	104931	104940	80 %	0 %	0 %	20 %	333909992
73	NC_015562	TTCAC	2	10	108454	108463	20 %	40 %	0 %	40 %	333909996
74	NC_015562	ATTTG	2	10	110803	110812	20 %	60 %	20 %	0 %	333909998
75	NC_015562	TCAAA	2	10	111848	111857	60 %	20 %	0 %	20 %	333909999
76	NC_015562	TAAAA	2	10	114261	114270	80 %	20 %	0 %	0 %	333910002
77	NC_015562	CTGTT	2	10	115747	115756	0 %	60 %	20 %	20 %	333910005
78	NC_015562	CAGTA	2	10	116449	116458	40 %	20 %	20 %	20 %	333910005
79	NC_015562	AGCGA	2	10	117732	117741	40 %	0 %	40 %	20 %	333910007
80	NC_015562	AATTT	2	10	121543	121552	40 %	60 %	0 %	0 %	333910013
81	NC_015562	GTTTT	2	10	121636	121645	0 %	80 %	20 %	0 %	333910013
82	NC_015562	TTATT	2	10	121892	121901	20 %	80 %	0 %	0 %	333910013
83	NC_015562	TTGAT	2	10	121913	121922	20 %	60 %	20 %	0 %	333910013
84	NC_015562	TTAGA	2	10	122902	122911	40 %	40 %	20 %	0 %	333910014
85	NC_015562	AATCT	2	10	124407	124416	40 %	40 %	0 %	20 %	333910016
86	NC_015562	TGTTA	2	10	125921	125930	20 %	60 %	20 %	0 %	333910016
87	NC_015562	TATTT	2	10	125961	125970	20 %	80 %	0 %	0 %	333910016
88	NC_015562	TCCTT	2	10	126330	126339	0 %	60 %	0 %	40 %	333910016
89	NC_015562	AAAGA	2	10	130800	130809	80 %	0 %	20 %	0 %	333910019
90	NC_015562	TATTT	2	10	131347	131356	20 %	80 %	0 %	0 %	333910020
91	NC_015562	GAAGA	2	10	133102	133111	60 %	0 %	40 %	0 %	333910022
92	NC_015562	GAGAA	2	10	133814	133823	60 %	0 %	40 %	0 %	333910022
93	NC_015562	TTGAA	2	10	135578	135587	40 %	40 %	20 %	0 %	333910025
94	NC_015562	TAAAA	2	10	135870	135879	80 %	20 %	0 %	0 %	333910025
95	NC_015562	AAAGA	2	10	136149	136158	80 %	0 %	20 %	0 %	333910025
96	NC_015562	AATAA	2	10	137299	137308	80 %	20 %	0 %	0 %	333910025
97	NC_015562	CATAA	2	10	139138	139147	60 %	20 %	0 %	20 %	333910026
98	NC_015562	TCCCT	2	10	139185	139194	0 %	40 %	0 %	60 %	333910026
99	NC_015562	ATAAA	2	10	140442	140451	80 %	20 %	0 %	0 %	333910027
100	NC_015562	GATTA	2	10	140602	140611	40 %	40 %	20 %	0 %	333910027
101	NC_015562	AACAT	2	10	141186	141195	60 %	20 %	0 %	20 %	333910027
102	NC_015562	AAATA	2	10	141389	141398	80 %	20 %	0 %	0 %	333910028
103	NC_015562	AAGTT	2	10	141422	141431	40 %	40 %	20 %	0 %	333910028
104	NC_015562	AATTA	2	10	141750	141759	60 %	40 %	0 %	0 %	333910028
105	NC_015562	ATAAC	2	10	142458	142467	60 %	20 %	0 %	20 %	333910029
106	NC_015562	TAAAA	2	10	146115	146124	80 %	20 %	0 %	0 %	333910032
107	NC_015562	ATAGG	2	10	147650	147659	40 %	20 %	40 %	0 %	333910033
108	NC_015562	ATGAG	2	10	148649	148658	40 %	20 %	40 %	0 %	333910033
109	NC_015562	ATTTA	2	10	150269	150278	40 %	60 %	0 %	0 %	333910034
110	NC_015562	ATATT	2	10	151845	151854	40 %	60 %	0 %	0 %	333910037
111	NC_015562	CATTT	2	10	154479	154488	20 %	60 %	0 %	20 %	333910041
112	NC_015562	TTAAA	2	10	155194	155203	60 %	40 %	0 %	0 %	333910042
113	NC_015562	AGTGG	2	10	155281	155290	20 %	20 %	60 %	0 %	333910042
114	NC_015562	CAGTG	2	10	156299	156308	20 %	20 %	40 %	20 %	333910043
115	NC_015562	ATTAT	2	10	158113	158122	40 %	60 %	0 %	0 %	333910044
116	NC_015562	TAAAA	2	10	158873	158882	80 %	20 %	0 %	0 %	333910046
117	NC_015562	TTTTA	2	10	161031	161040	20 %	80 %	0 %	0 %	333910048
118	NC_015562	ATTCC	2	10	164865	164874	20 %	40 %	0 %	40 %	333910052
119	NC_015562	TCTTT	2	10	165020	165029	0 %	80 %	0 %	20 %	333910052
120	NC_015562	TAAAA	2	10	168580	168589	80 %	20 %	0 %	0 %	333910054
121	NC_015562	TTCTT	2	10	170375	170384	0 %	80 %	0 %	20 %	333910056
122	NC_015562	ATAGA	2	10	173418	173427	60 %	20 %	20 %	0 %	333910059
123	NC_015562	ACCAC	2	10	173947	173956	40 %	0 %	0 %	60 %	333910060
124	NC_015562	GCAAG	2	10	174437	174446	40 %	0 %	40 %	20 %	333910060
125	NC_015562	AAGAA	2	10	174903	174912	80 %	0 %	20 %	0 %	333910061
126	NC_015562	ATTTA	2	10	174922	174931	40 %	60 %	0 %	0 %	333910061
127	NC_015562	AAGCA	2	10	175687	175696	60 %	0 %	20 %	20 %	333910062
128	NC_015562	TAATT	2	10	176446	176455	40 %	60 %	0 %	0 %	333910064
129	NC_015562	ATTTA	2	10	176486	176495	40 %	60 %	0 %	0 %	333910064
130	NC_015562	ATTTA	2	10	176501	176510	40 %	60 %	0 %	0 %	333910064
131	NC_015562	CTTTT	2	10	176876	176885	0 %	80 %	0 %	20 %	333910064
132	NC_015562	CTTTA	2	10	177914	177923	20 %	60 %	0 %	20 %	333910064
133	NC_015562	AGAAA	2	10	178967	178976	80 %	0 %	20 %	0 %	333910065
134	NC_015562	AAAGA	2	10	179210	179219	80 %	0 %	20 %	0 %	333910065
135	NC_015562	CTATA	2	10	180862	180871	40 %	40 %	0 %	20 %	333910066
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