MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Methanotorris igneus Kol 5 chromosome

Total Repeats: 4656

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015562	TTTA	2	8	64	71	25 %	75 %	0 %	0 %	333909895
2	NC_015562	CAAT	2	8	291	298	50 %	25 %	0 %	25 %	333909896
3	NC_015562	AGTC	3	12	543	554	25 %	25 %	25 %	25 %	333909896
4	NC_015562	AGAA	2	8	722	729	75 %	0 %	25 %	0 %	333909896
5	NC_015562	AGTT	2	8	871	878	25 %	50 %	25 %	0 %	333909896
6	NC_015562	AGCA	2	8	1063	1070	50 %	0 %	25 %	25 %	333909896
7	NC_015562	AAGG	2	8	1118	1125	50 %	0 %	50 %	0 %	333909896
8	NC_015562	TGCT	2	8	1497	1504	0 %	50 %	25 %	25 %	333909897
9	NC_015562	AAAC	2	8	1785	1792	75 %	0 %	0 %	25 %	333909897
10	NC_015562	GCAT	2	8	2050	2057	25 %	25 %	25 %	25 %	333909897
11	NC_015562	ATCA	2	8	2503	2510	50 %	25 %	0 %	25 %	333909897
12	NC_015562	AGAT	2	8	2556	2563	50 %	25 %	25 %	0 %	333909897
13	NC_015562	AAAT	2	8	3550	3557	75 %	25 %	0 %	0 %	333909898
14	NC_015562	GCAT	2	8	3829	3836	25 %	25 %	25 %	25 %	333909898
15	NC_015562	ATCC	2	8	3921	3928	25 %	25 %	0 %	50 %	333909899
16	NC_015562	TTTC	2	8	3987	3994	0 %	75 %	0 %	25 %	333909899
17	NC_015562	CTTT	2	8	4416	4423	0 %	75 %	0 %	25 %	333909899
18	NC_015562	AAGG	2	8	5195	5202	50 %	0 %	50 %	0 %	333909900
19	NC_015562	TAAG	2	8	5538	5545	50 %	25 %	25 %	0 %	333909900
20	NC_015562	AAAT	2	8	5550	5557	75 %	25 %	0 %	0 %	333909900
21	NC_015562	AGAT	2	8	5772	5779	50 %	25 %	25 %	0 %	333909901
22	NC_015562	ATGG	2	8	5813	5820	25 %	25 %	50 %	0 %	333909901
23	NC_015562	GATT	2	8	6430	6437	25 %	50 %	25 %	0 %	333909901
24	NC_015562	TGAA	2	8	6854	6861	50 %	25 %	25 %	0 %	333909902
25	NC_015562	AATT	2	8	6950	6957	50 %	50 %	0 %	0 %	333909902
26	NC_015562	TTAG	2	8	7253	7260	25 %	50 %	25 %	0 %	333909903
27	NC_015562	ATTG	2	8	7525	7532	25 %	50 %	25 %	0 %	333909903
28	NC_015562	ATTT	2	8	9220	9227	25 %	75 %	0 %	0 %	333909904
29	NC_015562	ACAT	2	8	9386	9393	50 %	25 %	0 %	25 %	333909904
30	NC_015562	ATCA	2	8	9617	9624	50 %	25 %	0 %	25 %	333909904
31	NC_015562	CATT	2	8	10156	10163	25 %	50 %	0 %	25 %	333909904
32	NC_015562	TCCA	2	8	10348	10355	25 %	25 %	0 %	50 %	333909904
33	NC_015562	TTAA	2	8	10485	10492	50 %	50 %	0 %	0 %	333909904
34	NC_015562	TGAA	2	8	11001	11008	50 %	25 %	25 %	0 %	333909905
35	NC_015562	TATC	2	8	11119	11126	25 %	50 %	0 %	25 %	333909905
36	NC_015562	AATT	2	8	11427	11434	50 %	50 %	0 %	0 %	333909906
37	NC_015562	CATG	2	8	11901	11908	25 %	25 %	25 %	25 %	333909906
38	NC_015562	TCCT	2	8	12579	12586	0 %	50 %	0 %	50 %	333909906
39	NC_015562	ATAA	2	8	13745	13752	75 %	25 %	0 %	0 %	333909908
40	NC_015562	ATGA	2	8	13820	13827	50 %	25 %	25 %	0 %	333909908
41	NC_015562	CAAC	2	8	14104	14111	50 %	0 %	0 %	50 %	333909908
42	NC_015562	AGAT	2	8	15474	15481	50 %	25 %	25 %	0 %	333909909
43	NC_015562	AAAG	2	8	16029	16036	75 %	0 %	25 %	0 %	333909909
44	NC_015562	GTAT	2	8	16273	16280	25 %	50 %	25 %	0 %	333909910
45	NC_015562	TTCA	2	8	16306	16313	25 %	50 %	0 %	25 %	333909910
46	NC_015562	TCCA	2	8	18646	18653	25 %	25 %	0 %	50 %	333909911
47	NC_015562	GTTT	2	8	19024	19031	0 %	75 %	25 %	0 %	333909911
48	NC_015562	AGGG	2	8	19724	19731	25 %	0 %	75 %	0 %	333909912
49	NC_015562	TAAA	2	8	19990	19997	75 %	25 %	0 %	0 %	333909912
50	NC_015562	CTTT	2	8	20184	20191	0 %	75 %	0 %	25 %	333909912
51	NC_015562	TCCA	2	8	20475	20482	25 %	25 %	0 %	50 %	333909912
52	NC_015562	TCTT	2	8	20574	20581	0 %	75 %	0 %	25 %	333909912
53	NC_015562	CTCC	2	8	20813	20820	0 %	25 %	0 %	75 %	333909912
54	NC_015562	CAAC	2	8	21286	21293	50 %	0 %	0 %	50 %	333909913
55	NC_015562	TGTA	2	8	21678	21685	25 %	50 %	25 %	0 %	333909914
56	NC_015562	TAAT	2	8	22444	22451	50 %	50 %	0 %	0 %	333909915
57	NC_015562	TCAT	2	8	23140	23147	25 %	50 %	0 %	25 %	333909915
58	NC_015562	GCTT	2	8	23637	23644	0 %	50 %	25 %	25 %	333909916
59	NC_015562	GTAT	2	8	23984	23991	25 %	50 %	25 %	0 %	333909916
60	NC_015562	ATGA	2	8	24512	24519	50 %	25 %	25 %	0 %	333909917
61	NC_015562	TCCT	2	8	24973	24980	0 %	50 %	0 %	50 %	333909917
62	NC_015562	ATTT	2	8	25622	25629	25 %	75 %	0 %	0 %	333909917
63	NC_015562	AGAA	2	8	26613	26620	75 %	0 %	25 %	0 %	333909918
64	NC_015562	TATG	2	8	26953	26960	25 %	50 %	25 %	0 %	333909918
65	NC_015562	TTGG	2	8	27173	27180	0 %	50 %	50 %	0 %	333909918
66	NC_015562	GATG	2	8	27247	27254	25 %	25 %	50 %	0 %	333909918
67	NC_015562	ATAG	2	8	27473	27480	50 %	25 %	25 %	0 %	333909918
68	NC_015562	TAAA	2	8	30166	30173	75 %	25 %	0 %	0 %	333909920
69	NC_015562	TTAA	2	8	30870	30877	50 %	50 %	0 %	0 %	333909920
70	NC_015562	TTTG	2	8	31193	31200	0 %	75 %	25 %	0 %	333909920
71	NC_015562	TTAT	2	8	31919	31926	25 %	75 %	0 %	0 %	333909921
72	NC_015562	TTCA	2	8	31975	31982	25 %	50 %	0 %	25 %	333909921
73	NC_015562	ATCA	2	8	32963	32970	50 %	25 %	0 %	25 %	333909922
74	NC_015562	ACCC	2	8	33215	33222	25 %	0 %	0 %	75 %	333909922
75	NC_015562	CTTT	2	8	33235	33242	0 %	75 %	0 %	25 %	333909922
76	NC_015562	CAAT	2	8	33952	33959	50 %	25 %	0 %	25 %	333909923
77	NC_015562	TGAT	2	8	34167	34174	25 %	50 %	25 %	0 %	333909923
78	NC_015562	AATT	2	8	34284	34291	50 %	50 %	0 %	0 %	333909923
79	NC_015562	AATA	2	8	34522	34529	75 %	25 %	0 %	0 %	333909923
80	NC_015562	ATTA	2	8	34999	35006	50 %	50 %	0 %	0 %	333909923
81	NC_015562	AAAC	2	8	35685	35692	75 %	0 %	0 %	25 %	333909924
82	NC_015562	TGTA	2	8	37167	37174	25 %	50 %	25 %	0 %	333909926
83	NC_015562	TAAA	2	8	37358	37365	75 %	25 %	0 %	0 %	333909926
84	NC_015562	CATC	2	8	37438	37445	25 %	25 %	0 %	50 %	333909926
85	NC_015562	AAAT	2	8	37487	37494	75 %	25 %	0 %	0 %	333909926
86	NC_015562	TACA	2	8	39143	39150	50 %	25 %	0 %	25 %	333909928
87	NC_015562	CAAT	2	8	39575	39582	50 %	25 %	0 %	25 %	333909928
88	NC_015562	AAGC	2	8	40842	40849	50 %	0 %	25 %	25 %	333909929
89	NC_015562	TAGG	2	8	41180	41187	25 %	25 %	50 %	0 %	333909929
90	NC_015562	AATG	2	8	41572	41579	50 %	25 %	25 %	0 %	333909929
91	NC_015562	TCCT	2	8	41804	41811	0 %	50 %	0 %	50 %	333909930
92	NC_015562	TCTG	2	8	41868	41875	0 %	50 %	25 %	25 %	333909930
93	NC_015562	ATTT	2	8	42037	42044	25 %	75 %	0 %	0 %	333909930
94	NC_015562	TATT	2	8	42069	42076	25 %	75 %	0 %	0 %	333909930
95	NC_015562	TCAT	2	8	42444	42451	25 %	50 %	0 %	25 %	333909930
96	NC_015562	CAAC	2	8	43041	43048	50 %	0 %	0 %	50 %	333909931
97	NC_015562	CTTT	2	8	43924	43931	0 %	75 %	0 %	25 %	333909932
98	NC_015562	CAAT	2	8	44441	44448	50 %	25 %	0 %	25 %	333909932
99	NC_015562	AACC	2	8	45540	45547	50 %	0 %	0 %	50 %	333909933
100	NC_015562	AGAA	2	8	45708	45715	75 %	0 %	25 %	0 %	333909933
101	NC_015562	CATA	2	8	45817	45824	50 %	25 %	0 %	25 %	333909933
102	NC_015562	CAAC	2	8	45981	45988	50 %	0 %	0 %	50 %	333909933
103	NC_015562	ATTG	2	8	46024	46031	25 %	50 %	25 %	0 %	333909933
104	NC_015562	GGGA	2	8	46258	46265	25 %	0 %	75 %	0 %	333909933
105	NC_015562	CAAA	2	8	46677	46684	75 %	0 %	0 %	25 %	333909934
106	NC_015562	ATTT	2	8	46796	46803	25 %	75 %	0 %	0 %	333909934
107	NC_015562	AACA	2	8	46935	46942	75 %	0 %	0 %	25 %	333909934
108	NC_015562	ATAA	2	8	46963	46970	75 %	25 %	0 %	0 %	333909934
109	NC_015562	TTTC	2	8	47048	47055	0 %	75 %	0 %	25 %	333909934
110	NC_015562	CAAG	2	8	47153	47160	50 %	0 %	25 %	25 %	333909934
111	NC_015562	CTTT	2	8	47420	47427	0 %	75 %	0 %	25 %	333909934
112	NC_015562	CTCC	2	8	47723	47730	0 %	25 %	0 %	75 %	333909934
113	NC_015562	TTTA	2	8	47856	47863	25 %	75 %	0 %	0 %	333909934
114	NC_015562	TTTC	2	8	48013	48020	0 %	75 %	0 %	25 %	333909934
115	NC_015562	TTCT	2	8	48054	48061	0 %	75 %	0 %	25 %	333909934
116	NC_015562	GCAA	2	8	48394	48401	50 %	0 %	25 %	25 %	333909934
117	NC_015562	ATGC	2	8	48435	48442	25 %	25 %	25 %	25 %	333909934
118	NC_015562	AAAT	2	8	48557	48564	75 %	25 %	0 %	0 %	333909934
119	NC_015562	GCAA	2	8	48573	48580	50 %	0 %	25 %	25 %	333909934
120	NC_015562	TTTG	2	8	48622	48629	0 %	75 %	25 %	0 %	333909934
121	NC_015562	AATT	2	8	48818	48825	50 %	50 %	0 %	0 %	333909934
122	NC_015562	TTAT	2	8	49578	49585	25 %	75 %	0 %	0 %	333909935
123	NC_015562	ATTT	2	8	49683	49690	25 %	75 %	0 %	0 %	333909935
124	NC_015562	GCAA	2	8	50058	50065	50 %	0 %	25 %	25 %	333909935
125	NC_015562	TTTA	2	8	50974	50981	25 %	75 %	0 %	0 %	333909936
126	NC_015562	AAAG	2	8	52815	52822	75 %	0 %	25 %	0 %	333909937
127	NC_015562	TAAA	2	8	53318	53325	75 %	25 %	0 %	0 %	333909937
128	NC_015562	ATAA	2	8	54201	54208	75 %	25 %	0 %	0 %	333909938
129	NC_015562	AATT	2	8	54976	54983	50 %	50 %	0 %	0 %	333909939
130	NC_015562	AATT	2	8	55066	55073	50 %	50 %	0 %	0 %	333909939
131	NC_015562	CAAA	2	8	55102	55109	75 %	0 %	0 %	25 %	333909939
132	NC_015562	ATAC	2	8	55902	55909	50 %	25 %	0 %	25 %	333909940
133	NC_015562	ATTT	2	8	56257	56264	25 %	75 %	0 %	0 %	333909941
134	NC_015562	GGAA	2	8	56439	56446	50 %	0 %	50 %	0 %	333909941
135	NC_015562	CTAT	2	8	56830	56837	25 %	50 %	0 %	25 %	333909942
136	NC_015562	TTGG	2	8	56988	56995	0 %	50 %	50 %	0 %	333909942
137	NC_015562	ATGG	2	8	57073	57080	25 %	25 %	50 %	0 %	333909942
138	NC_015562	ATTT	2	8	57239	57246	25 %	75 %	0 %	0 %	333909942
139	NC_015562	TAAA	2	8	57484	57491	75 %	25 %	0 %	0 %	333909942
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