MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Melissococcus plutonius ATCC 35311 plasmid pMP1

Total Repeats: 123

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015517	AAAAG	2	10	3477	3486	80 %	0 %	20 %	0 %	332687280
2	NC_015517	GAAAA	2	10	4290	4299	80 %	0 %	20 %	0 %	332687282
3	NC_015517	TTTTA	2	10	5509	5518	20 %	80 %	0 %	0 %	332687283
4	NC_015517	ACAAA	2	10	6374	6383	80 %	0 %	0 %	20 %	332687284
5	NC_015517	CTTTT	2	10	7020	7029	0 %	80 %	0 %	20 %	332687285
6	NC_015517	CTTTT	2	10	7432	7441	0 %	80 %	0 %	20 %	332687285
7	NC_015517	CATCT	2	10	7646	7655	20 %	40 %	0 %	40 %	332687286
8	NC_015517	AATTT	2	10	11508	11517	40 %	60 %	0 %	0 %	332687290
9	NC_015517	TCTAT	2	10	12301	12310	20 %	60 %	0 %	20 %	332687291
10	NC_015517	ATTTA	2	10	12747	12756	40 %	60 %	0 %	0 %	332687291
11	NC_015517	AATTA	2	10	13245	13254	60 %	40 %	0 %	0 %	332687291
12	NC_015517	TCAAT	2	10	22114	22123	40 %	40 %	0 %	20 %	332687298
13	NC_015517	AAAAT	2	10	22337	22346	80 %	20 %	0 %	0 %	332687298
14	NC_015517	CTAAA	2	10	23010	23019	60 %	20 %	0 %	20 %	332687299
15	NC_015517	TAAAA	2	10	23446	23455	80 %	20 %	0 %	0 %	332687299
16	NC_015517	TCAAA	2	10	24180	24189	60 %	20 %	0 %	20 %	332687300
17	NC_015517	AAACA	2	10	24339	24348	80 %	0 %	0 %	20 %	332687300
18	NC_015517	TTTTA	2	10	28589	28598	20 %	80 %	0 %	0 %	332687303
19	NC_015517	ATTTT	2	10	29293	29302	20 %	80 %	0 %	0 %	332687304
20	NC_015517	AAAAG	2	10	29360	29369	80 %	0 %	20 %	0 %	332687304
21	NC_015517	TGTAT	2	10	29580	29589	20 %	60 %	20 %	0 %	332687304
22	NC_015517	CTTTT	2	10	30178	30187	0 %	80 %	0 %	20 %	332687305
23	NC_015517	TCTTT	2	10	30199	30208	0 %	80 %	0 %	20 %	332687305
24	NC_015517	AACAT	2	10	30585	30594	60 %	20 %	0 %	20 %	332687306
25	NC_015517	CTTTT	2	10	38598	38607	0 %	80 %	0 %	20 %	332687313
26	NC_015517	TTTTG	2	10	38626	38635	0 %	80 %	20 %	0 %	332687313
27	NC_015517	AAAAC	2	10	40296	40305	80 %	0 %	0 %	20 %	332687314
28	NC_015517	AATTA	2	10	41074	41083	60 %	40 %	0 %	0 %	332687314
29	NC_015517	TTTTG	2	10	41174	41183	0 %	80 %	20 %	0 %	332687314
30	NC_015517	ATGGG	2	10	42367	42376	20 %	20 %	60 %	0 %	332687315
31	NC_015517	AAATC	2	10	43385	43394	60 %	20 %	0 %	20 %	332687316
32	NC_015517	CAAAA	2	10	44566	44575	80 %	0 %	0 %	20 %	332687316
33	NC_015517	ATTCT	2	10	49445	49454	20 %	60 %	0 %	20 %	332687321
34	NC_015517	AATTA	2	10	49910	49919	60 %	40 %	0 %	0 %	332687321
35	NC_015517	CACTT	2	10	50126	50135	20 %	40 %	0 %	40 %	332687321
36	NC_015517	GTGAT	2	10	50389	50398	20 %	40 %	40 %	0 %	332687321
37	NC_015517	TCCAG	2	10	50561	50570	20 %	20 %	20 %	40 %	332687321
38	NC_015517	ATTTA	2	10	51439	51448	40 %	60 %	0 %	0 %	332687322
39	NC_015517	TAAAG	2	10	53677	53686	60 %	20 %	20 %	0 %	332687325
40	NC_015517	AGGTA	2	10	55171	55180	40 %	20 %	40 %	0 %	332687327
41	NC_015517	AATCC	2	10	58488	58497	40 %	20 %	0 %	40 %	332687330
42	NC_015517	TTTGA	2	10	59430	59439	20 %	60 %	20 %	0 %	332687330
43	NC_015517	ACCAA	2	10	59640	59649	60 %	0 %	0 %	40 %	332687330
44	NC_015517	AAAGA	2	10	59697	59706	80 %	0 %	20 %	0 %	332687330
45	NC_015517	ACTTA	2	10	61074	61083	40 %	40 %	0 %	20 %	332687331
46	NC_015517	AGAAA	2	10	63684	63693	80 %	0 %	20 %	0 %	332687334
47	NC_015517	AAATG	2	10	64192	64201	60 %	20 %	20 %	0 %	332687334
48	NC_015517	TAAAT	2	10	64597	64606	60 %	40 %	0 %	0 %	332687335
49	NC_015517	TGATT	2	10	65680	65689	20 %	60 %	20 %	0 %	332687336
50	NC_015517	TGGAT	2	10	65758	65767	20 %	40 %	40 %	0 %	332687336
51	NC_015517	ATTTC	2	10	65769	65778	20 %	60 %	0 %	20 %	332687336
52	NC_015517	CAAAA	2	10	66306	66315	80 %	0 %	0 %	20 %	332687337
53	NC_015517	AATTA	2	10	66734	66743	60 %	40 %	0 %	0 %	332687337
54	NC_015517	GTTTT	2	10	66811	66820	0 %	80 %	20 %	0 %	332687337
55	NC_015517	TTTAT	2	10	66939	66948	20 %	80 %	0 %	0 %	332687337
56	NC_015517	GATGG	2	10	68794	68803	20 %	20 %	60 %	0 %	332687338
57	NC_015517	ACAGG	2	10	71850	71859	40 %	0 %	40 %	20 %	332687340
58	NC_015517	ATAAC	2	10	74456	74465	60 %	20 %	0 %	20 %	332687342
59	NC_015517	TACAA	2	10	80453	80462	60 %	20 %	0 %	20 %	332687347
60	NC_015517	ATCTT	2	10	82343	82352	20 %	60 %	0 %	20 %	332687349
61	NC_015517	AAGAA	2	10	83991	84000	80 %	0 %	20 %	0 %	332687350
62	NC_015517	CCATT	2	10	84252	84261	20 %	40 %	0 %	40 %	332687350
63	NC_015517	TACCA	2	10	84751	84760	40 %	20 %	0 %	40 %	332687350
64	NC_015517	TGGAT	2	10	86836	86845	20 %	40 %	40 %	0 %	332687351
65	NC_015517	ACAAA	2	10	87608	87617	80 %	0 %	0 %	20 %	332687352
66	NC_015517	TATTT	2	10	90821	90830	20 %	80 %	0 %	0 %	332687356
67	NC_015517	TTTCA	2	10	91532	91541	20 %	60 %	0 %	20 %	332687356
68	NC_015517	GGTGG	2	10	91943	91952	0 %	20 %	80 %	0 %	332687356
69	NC_015517	TTAAT	2	10	92769	92778	40 %	60 %	0 %	0 %	332687357
70	NC_015517	TATAA	2	10	92803	92812	60 %	40 %	0 %	0 %	332687357
71	NC_015517	TTTTA	2	10	93906	93915	20 %	80 %	0 %	0 %	332687359
72	NC_015517	ATTTT	2	10	94704	94713	20 %	80 %	0 %	0 %	332687360
73	NC_015517	TATCT	2	10	94922	94931	20 %	60 %	0 %	20 %	332687361
74	NC_015517	TACTT	2	10	95947	95956	20 %	60 %	0 %	20 %	332687361
75	NC_015517	ATTTA	2	10	96859	96868	40 %	60 %	0 %	0 %	332687361
76	NC_015517	GAAAT	2	10	99059	99068	60 %	20 %	20 %	0 %	332687362
77	NC_015517	AATGA	2	10	107209	107218	60 %	20 %	20 %	0 %	332687367
78	NC_015517	GATAG	2	10	115916	115925	40 %	20 %	40 %	0 %	332687373
79	NC_015517	AATCA	2	10	116017	116026	60 %	20 %	0 %	20 %	332687373
80	NC_015517	TATAA	2	10	117593	117602	60 %	40 %	0 %	0 %	332687374
81	NC_015517	TTGAT	2	10	121640	121649	20 %	60 %	20 %	0 %	332687376
82	NC_015517	CTATC	2	10	121742	121751	20 %	40 %	0 %	40 %	332687376
83	NC_015517	TCATT	2	10	130449	130458	20 %	60 %	0 %	20 %	332687382
84	NC_015517	TTTGT	2	10	133264	133273	0 %	80 %	20 %	0 %	332687385
85	NC_015517	AGTTA	2	10	133374	133383	40 %	40 %	20 %	0 %	332687385
86	NC_015517	ATTTA	2	10	134888	134897	40 %	60 %	0 %	0 %	332687386
87	NC_015517	TTACC	2	10	136434	136443	20 %	40 %	0 %	40 %	332687388
88	NC_015517	TGTAA	2	10	138136	138145	40 %	40 %	20 %	0 %	332687389
89	NC_015517	AAGAT	2	10	138171	138180	60 %	20 %	20 %	0 %	332687389
90	NC_015517	GGGAT	2	10	140533	140542	20 %	20 %	60 %	0 %	332687390
91	NC_015517	ACAGG	2	10	141499	141508	40 %	0 %	40 %	20 %	332687390
92	NC_015517	ATTTT	2	10	144180	144189	20 %	80 %	0 %	0 %	332687393
93	NC_015517	TTGGT	2	10	144190	144199	0 %	60 %	40 %	0 %	332687393
94	NC_015517	ATTTT	2	10	144609	144618	20 %	80 %	0 %	0 %	332687393
95	NC_015517	TGATT	2	10	145082	145091	20 %	60 %	20 %	0 %	332687393
96	NC_015517	AAAAG	2	10	145337	145346	80 %	0 %	20 %	0 %	332687393
97	NC_015517	CTTAT	2	10	145484	145493	20 %	60 %	0 %	20 %	332687393
98	NC_015517	TTTAT	2	10	145867	145876	20 %	80 %	0 %	0 %	332687393
99	NC_015517	TAGTT	2	10	147285	147294	20 %	60 %	20 %	0 %	332687395
100	NC_015517	GAAAA	2	10	148431	148440	80 %	0 %	20 %	0 %	332687396
101	NC_015517	GCTAA	2	10	150813	150822	40 %	20 %	20 %	20 %	332687399
102	NC_015517	TAAAG	2	10	150992	151001	60 %	20 %	20 %	0 %	332687399
103	NC_015517	GAATA	2	10	151072	151081	60 %	20 %	20 %	0 %	332687399
104	NC_015517	CAAAC	2	10	152004	152013	60 %	0 %	0 %	40 %	332687400
105	NC_015517	ATTGG	2	10	153194	153203	20 %	40 %	40 %	0 %	332687401
106	NC_015517	GTAAT	2	10	153414	153423	40 %	40 %	20 %	0 %	332687401
107	NC_015517	AAAAT	2	10	155977	155986	80 %	20 %	0 %	0 %	332687404
108	NC_015517	AATTA	2	10	160489	160498	60 %	40 %	0 %	0 %	332687407
109	NC_015517	AAAAT	2	10	163006	163015	80 %	20 %	0 %	0 %	332687411
110	NC_015517	AATAA	2	10	163148	163157	80 %	20 %	0 %	0 %	332687411
111	NC_015517	GTATT	2	10	164032	164041	20 %	60 %	20 %	0 %	332687411
112	NC_015517	ATGAA	2	10	164086	164095	60 %	20 %	20 %	0 %	332687412
113	NC_015517	CTACA	2	10	164709	164718	40 %	20 %	0 %	40 %	332687412
114	NC_015517	TTCAA	2	10	166982	166991	40 %	40 %	0 %	20 %	332687413
115	NC_015517	ACAAT	2	10	168174	168183	60 %	20 %	0 %	20 %	332687413
116	NC_015517	CTTTT	2	10	168211	168220	0 %	80 %	0 %	20 %	332687413
117	NC_015517	AATCG	2	10	171652	171661	40 %	20 %	20 %	20 %	332687417
118	NC_015517	TGATT	2	10	171960	171969	20 %	60 %	20 %	0 %	332687417
119	NC_015517	AATAA	2	10	172326	172335	80 %	20 %	0 %	0 %	332687418
120	NC_015517	CCATT	2	10	173791	173800	20 %	40 %	0 %	40 %	332687419
121	NC_015517	AAAAT	2	10	174048	174057	80 %	20 %	0 %	0 %	332687419
122	NC_015517	CATTT	2	10	174700	174709	20 %	60 %	0 %	20 %	332687419
123	NC_015517	ATTTT	2	10	176422	176431	20 %	80 %	0 %	0 %	332687420

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.