MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Metallosphaera cuprina Ar-4 chromosome

Total Repeats: 30316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015435	CATC	2	8	166286	166293	25 %	25 %	0 %	50 %	330834052
3002	NC_015435	AGT	2	6	166373	166378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330834052
3003	NC_015435	TAA	3	9	166380	166388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330834052
3004	NC_015435	CAC	2	6	166424	166429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330834052
3005	NC_015435	T	6	6	166434	166439	0 %	100 %	0 %	0 %	330834052
3006	NC_015435	TTCA	2	8	166524	166531	25 %	50 %	0 %	25 %	330834053
3007	NC_015435	AT	3	6	166598	166603	50 %	50 %	0 %	0 %	330834053
3008	NC_015435	CATCT	2	10	166765	166774	20 %	40 %	0 %	40 %	330834053
3009	NC_015435	CCA	2	6	166785	166790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330834053
3010	NC_015435	CTT	2	6	166970	166975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330834053
3011	NC_015435	CT	4	8	166999	167006	0 %	50 %	0 %	50 %	330834053
3012	NC_015435	ATT	2	6	167087	167092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330834053
3013	NC_015435	GGA	2	6	167217	167222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330834054
3014	NC_015435	TAT	2	6	167250	167255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330834054
3015	NC_015435	AAT	2	6	167268	167273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330834054
3016	NC_015435	CAACC	2	10	167321	167330	40 %	0 %	0 %	60 %	330834055
3017	NC_015435	GCA	2	6	167481	167486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330834055
3018	NC_015435	CAC	2	6	167512	167517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330834055
3019	NC_015435	TC	3	6	167696	167701	0 %	50 %	0 %	50 %	330834055
3020	NC_015435	AT	3	6	167766	167771	50 %	50 %	0 %	0 %	330834055
3021	NC_015435	TGAAAT	2	12	167787	167798	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	330834055
3022	NC_015435	TATT	2	8	167845	167852	25 %	75 %	0 %	0 %	330834055
3023	NC_015435	AG	3	6	167964	167969	50 %	0 %	50 %	0 %	330834056
3024	NC_015435	TAC	2	6	168019	168024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330834056
3025	NC_015435	AGA	2	6	168034	168039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330834056
3026	NC_015435	CTC	2	6	168125	168130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330834056
3027	NC_015435	AGAGG	2	10	168141	168150	40 %	0 %	60 %	0 %	330834056
3028	NC_015435	ATT	2	6	168181	168186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330834056
3029	NC_015435	AGA	2	6	168200	168205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330834056
3030	NC_015435	AAC	2	6	168214	168219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330834056
3031	NC_015435	AAG	2	6	168269	168274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330834056
3032	NC_015435	AAG	2	6	168354	168359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330834056
3033	NC_015435	TAA	2	6	168479	168484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330834056
3034	NC_015435	ATA	2	6	168574	168579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330834056
3035	NC_015435	GAA	2	6	168635	168640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330834056
3036	NC_015435	GGA	2	6	168657	168662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330834056
3037	NC_015435	TGGA	2	8	168689	168696	25 %	25 %	50 %	0 %	330834056
3038	NC_015435	AG	3	6	168798	168803	50 %	0 %	50 %	0 %	330834056
3039	NC_015435	AATC	2	8	168840	168847	50 %	25 %	0 %	25 %	330834056
3040	NC_015435	AT	3	6	169078	169083	50 %	50 %	0 %	0 %	330834057
3041	NC_015435	TAG	2	6	169128	169133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330834057
3042	NC_015435	GTT	2	6	169148	169153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330834057
3043	NC_015435	ATT	2	6	169182	169187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330834057
3044	NC_015435	TAG	2	6	169401	169406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330834058
3045	NC_015435	CAC	2	6	169482	169487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330834058
3046	NC_015435	CCT	2	6	169668	169673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330834058
3047	NC_015435	AAG	2	6	169778	169783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330834058
3048	NC_015435	AGA	2	6	169784	169789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330834058
3049	NC_015435	A	6	6	169792	169797	100 %	0 %	0 %	0 %	330834058
3050	NC_015435	CAA	2	6	169801	169806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330834058
3051	NC_015435	TTA	2	6	169993	169998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330834059
3052	NC_015435	TAG	2	6	170008	170013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330834059
3053	NC_015435	TTG	2	6	170057	170062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330834059
3054	NC_015435	TCC	2	6	170075	170080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330834059
3055	NC_015435	AGCTAG	2	12	170292	170303	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	330834059
3056	NC_015435	TAA	2	6	170315	170320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330834059
3057	NC_015435	GAA	2	6	170340	170345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330834059
3058	NC_015435	TGA	2	6	170435	170440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330834059
3059	NC_015435	CTTC	2	8	170465	170472	0 %	50 %	0 %	50 %	330834059
3060	NC_015435	T	6	6	170492	170497	0 %	100 %	0 %	0 %	330834059
3061	NC_015435	TAAT	2	8	170503	170510	50 %	50 %	0 %	0 %	330834059
3062	NC_015435	TCA	2	6	170603	170608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330834059
3063	NC_015435	GAT	2	6	170707	170712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330834059
3064	NC_015435	CTT	2	6	170724	170729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330834059
3065	NC_015435	CT	3	6	170815	170820	0 %	50 %	0 %	50 %	330834059
3066	NC_015435	GT	3	6	170847	170852	0 %	50 %	50 %	0 %	330834059
3067	NC_015435	AAC	2	6	170862	170867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330834059
3068	NC_015435	CCA	2	6	170986	170991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330834059
3069	NC_015435	AAC	2	6	171042	171047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330834059
3070	NC_015435	TCC	2	6	171067	171072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330834059
3071	NC_015435	TAT	2	6	171150	171155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330834059
3072	NC_015435	GTC	2	6	171175	171180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330834059
3073	NC_015435	CCT	2	6	171188	171193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330834059
3074	NC_015435	GCCA	2	8	171389	171396	25 %	0 %	25 %	50 %	330834059
3075	NC_015435	TA	3	6	171402	171407	50 %	50 %	0 %	0 %	330834059
3076	NC_015435	TAG	2	6	171426	171431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330834059
3077	NC_015435	TC	3	6	171449	171454	0 %	50 %	0 %	50 %	330834059
3078	NC_015435	GGC	2	6	171474	171479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330834059
3079	NC_015435	ACC	2	6	171529	171534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330834059
3080	NC_015435	TTA	2	6	171611	171616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330834060
3081	NC_015435	CTT	2	6	171631	171636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330834060
3082	NC_015435	GTT	2	6	171637	171642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330834060
3083	NC_015435	CTT	2	6	171649	171654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330834060
3084	NC_015435	TAT	2	6	171673	171678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330834060
3085	NC_015435	ACG	2	6	171698	171703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330834060
3086	NC_015435	GTG	2	6	171719	171724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330834060
3087	NC_015435	TAACGT	2	12	171813	171824	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	330834060
3088	NC_015435	TTA	2	6	171829	171834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330834060
3089	NC_015435	TAA	2	6	171854	171859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330834060
3090	NC_015435	TACA	2	8	171904	171911	50 %	25 %	0 %	25 %	330834060
3091	NC_015435	TAA	2	6	171914	171919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330834060
3092	NC_015435	TTA	2	6	172101	172106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330834061
3093	NC_015435	C	6	6	172159	172164	0 %	0 %	0 %	100 %	330834061
3094	NC_015435	TTC	2	6	172185	172190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330834061
3095	NC_015435	TCA	2	6	172239	172244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330834061
3096	NC_015435	CT	3	6	172283	172288	0 %	50 %	0 %	50 %	330834061
3097	NC_015435	CCA	2	6	172410	172415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330834061
3098	NC_015435	TAAA	2	8	172487	172494	75 %	25 %	0 %	0 %	330834061
3099	NC_015435	TTG	2	6	172545	172550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330834061
3100	NC_015435	TAGTG	2	10	172640	172649	20 %	40 %	40 %	0 %	330834061
3101	NC_015435	CTA	2	6	172762	172767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330834061
3102	NC_015435	CAAG	2	8	172783	172790	50 %	0 %	25 %	25 %	330834061
3103	NC_015435	GCT	2	6	172806	172811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330834061
3104	NC_015435	ACC	2	6	172892	172897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330834062
3105	NC_015435	ACTG	2	8	172967	172974	25 %	25 %	25 %	25 %	330834062
3106	NC_015435	TCCA	2	8	173010	173017	25 %	25 %	0 %	50 %	330834062
3107	NC_015435	CTC	2	6	173063	173068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330834062
3108	NC_015435	ATA	2	6	173133	173138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330834062
3109	NC_015435	GAA	2	6	173153	173158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330834062
3110	NC_015435	AAT	2	6	173242	173247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330834062
3111	NC_015435	TCA	2	6	173249	173254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330834062
3112	NC_015435	TC	3	6	173323	173328	0 %	50 %	0 %	50 %	330834062
3113	NC_015435	GCCT	2	8	173342	173349	0 %	25 %	25 %	50 %	330834062
3114	NC_015435	TAT	2	6	173443	173448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330834062
3115	NC_015435	TCC	2	6	173497	173502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330834062
3116	NC_015435	ACT	2	6	173548	173553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330834063
3117	NC_015435	AAG	2	6	173606	173611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330834063
3118	NC_015435	TC	3	6	173637	173642	0 %	50 %	0 %	50 %	330834063
3119	NC_015435	CTT	2	6	173671	173676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330834063
3120	NC_015435	T	7	7	173733	173739	0 %	100 %	0 %	0 %	330834063
3121	NC_015435	TCGT	2	8	173742	173749	0 %	50 %	25 %	25 %	330834063
3122	NC_015435	CTT	2	6	173788	173793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330834063
3123	NC_015435	TAC	2	6	173823	173828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330834063
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3235	NC_015435	AG	3	6	180263	180268	50 %	0 %	50 %	0 %	330834066
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3241	NC_015435	TAG	2	6	180533	180538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330834066
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3357	NC_015435	CTAT	2	8	186110	186117	25 %	50 %	0 %	25 %	330834072
3358	NC_015435	CTAT	2	8	186131	186138	25 %	50 %	0 %	25 %	330834072
3359	NC_015435	TCC	2	6	186297	186302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330834072
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3362	NC_015435	CTC	2	6	186496	186501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330834072
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3364	NC_015435	ACTTG	2	10	186515	186524	20 %	40 %	20 %	20 %	330834072
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3368	NC_015435	TAT	2	6	186664	186669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330834072
3369	NC_015435	TCA	2	6	186689	186694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330834072
3370	NC_015435	ATC	2	6	186782	186787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330834072
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3372	NC_015435	GGCA	2	8	186835	186842	25 %	0 %	50 %	25 %	330834072
3373	NC_015435	CTT	2	6	186986	186991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330834072
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3391	NC_015435	TCT	2	6	187745	187750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330834073
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3394	NC_015435	TTC	2	6	187973	187978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330834073
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3471	NC_015435	CT	3	6	192692	192697	0 %	50 %	0 %	50 %	330834078
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3487	NC_015435	A	6	6	193579	193584	100 %	0 %	0 %	0 %	330834079
3488	NC_015435	GA	3	6	193598	193603	50 %	0 %	50 %	0 %	330834079
3489	NC_015435	CT	3	6	193636	193641	0 %	50 %	0 %	50 %	330834079
3490	NC_015435	AAAGG	2	10	193678	193687	60 %	0 %	40 %	0 %	330834079
3491	NC_015435	CTGG	2	8	193709	193716	0 %	25 %	50 %	25 %	330834079
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3493	NC_015435	GGC	2	6	193849	193854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330834079
3494	NC_015435	AGC	2	6	193907	193912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330834079
3495	NC_015435	AGAT	2	8	194042	194049	50 %	25 %	25 %	0 %	330834079
3496	NC_015435	AG	3	6	194098	194103	50 %	0 %	50 %	0 %	330834079
3497	NC_015435	AGT	2	6	194121	194126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330834079
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