MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methanosaeta concilii GP6 chromosome

Total Repeats: 1799

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015416	AGGTC	2	10	1156	1165	20 %	20 %	40 %	20 %	330506320
2	NC_015416	TCACC	2	10	6828	6837	20 %	20 %	0 %	60 %	330506322
3	NC_015416	TTTAA	2	10	6863	6872	40 %	60 %	0 %	0 %	330506322
4	NC_015416	TCGGA	2	10	8202	8211	20 %	20 %	40 %	20 %	330506322
5	NC_015416	AAAGG	2	10	8666	8675	60 %	0 %	40 %	0 %	330506322
6	NC_015416	GAAGA	2	10	8822	8831	60 %	0 %	40 %	0 %	330506322
7	NC_015416	TCCAC	2	10	9932	9941	20 %	20 %	0 %	60 %	330506323
8	NC_015416	TAAAA	2	10	17592	17601	80 %	20 %	0 %	0 %	330506328
9	NC_015416	AGATC	2	10	18112	18121	40 %	20 %	20 %	20 %	330506329
10	NC_015416	CCTAT	2	10	21184	21193	20 %	40 %	0 %	40 %	330506332
11	NC_015416	GCTGA	2	10	21889	21898	20 %	20 %	40 %	20 %	330506334
12	NC_015416	GCTCC	2	10	22695	22704	0 %	20 %	20 %	60 %	330506334
13	NC_015416	TACAT	2	10	23417	23426	40 %	40 %	0 %	20 %	330506334
14	NC_015416	CCTTT	2	10	23674	23683	0 %	60 %	0 %	40 %	330506334
15	NC_015416	TCTCC	2	10	23700	23709	0 %	40 %	0 %	60 %	330506334
16	NC_015416	TCAGC	2	10	24108	24117	20 %	20 %	20 %	40 %	330506334
17	NC_015416	AGCTC	2	10	24397	24406	20 %	20 %	20 %	40 %	330506335
18	NC_015416	CGGAG	2	10	25714	25723	20 %	0 %	60 %	20 %	330506337
19	NC_015416	CCTTC	2	10	26695	26704	0 %	40 %	0 %	60 %	330506338
20	NC_015416	ATGCA	2	10	27165	27174	40 %	20 %	20 %	20 %	330506338
21	NC_015416	CAGGG	2	10	28218	28227	20 %	0 %	60 %	20 %	330506339
22	NC_015416	GTCCA	2	10	29176	29185	20 %	20 %	20 %	40 %	330506340
23	NC_015416	CAGGA	2	10	31527	31536	40 %	0 %	40 %	20 %	330506343
24	NC_015416	TTATT	2	10	35513	35522	20 %	80 %	0 %	0 %	330506347
25	NC_015416	ATCAA	2	10	36897	36906	60 %	20 %	0 %	20 %	330506349
26	NC_015416	CGATT	2	10	41777	41786	20 %	40 %	20 %	20 %	330506353
27	NC_015416	CCAGA	2	10	42634	42643	40 %	0 %	20 %	40 %	330506353
28	NC_015416	ATTTA	2	10	43684	43693	40 %	60 %	0 %	0 %	330506354
29	NC_015416	TTTCT	2	10	43753	43762	0 %	80 %	0 %	20 %	330506354
30	NC_015416	CAGAT	2	10	47419	47428	40 %	20 %	20 %	20 %	330506359
31	NC_015416	TCAAT	2	10	47883	47892	40 %	40 %	0 %	20 %	330506360
32	NC_015416	GACCT	2	10	50029	50038	20 %	20 %	20 %	40 %	330506365
33	NC_015416	ATTTC	2	10	51937	51946	20 %	60 %	0 %	20 %	330506367
34	NC_015416	TGCAT	2	10	54105	54114	20 %	40 %	20 %	20 %	330506368
35	NC_015416	TATCT	2	10	54327	54336	20 %	60 %	0 %	20 %	330506368
36	NC_015416	CTCCG	2	10	58843	58852	0 %	20 %	20 %	60 %	330506374
37	NC_015416	CAATC	2	10	60297	60306	40 %	20 %	0 %	40 %	330506374
38	NC_015416	TGGAA	2	10	60659	60668	40 %	20 %	40 %	0 %	330506374
39	NC_015416	GAGAA	2	10	61538	61547	60 %	0 %	40 %	0 %	330506374
40	NC_015416	TGATC	2	10	61605	61614	20 %	40 %	20 %	20 %	330506374
41	NC_015416	AGATC	2	10	61803	61812	40 %	20 %	20 %	20 %	330506374
42	NC_015416	AAATA	2	10	61955	61964	80 %	20 %	0 %	0 %	330506374
43	NC_015416	AGTCC	2	10	62583	62592	20 %	20 %	20 %	40 %	330506374
44	NC_015416	TGAGT	2	10	64518	64527	20 %	40 %	40 %	0 %	330506374
45	NC_015416	TATCA	2	10	66532	66541	40 %	40 %	0 %	20 %	330506374
46	NC_015416	GCGGA	2	10	68512	68521	20 %	0 %	60 %	20 %	330506377
47	NC_015416	CTGGT	2	10	68778	68787	0 %	40 %	40 %	20 %	330506377
48	NC_015416	GAAAC	2	10	69270	69279	60 %	0 %	20 %	20 %	330506378
49	NC_015416	CTTCG	2	10	70207	70216	0 %	40 %	20 %	40 %	330506379
50	NC_015416	TTGAA	2	10	72831	72840	40 %	40 %	20 %	0 %	330506383
51	NC_015416	AGCTG	2	10	81401	81410	20 %	20 %	40 %	20 %	330506388
52	NC_015416	GGCCA	2	10	81935	81944	20 %	0 %	40 %	40 %	330506388
53	NC_015416	ATCTC	2	10	83605	83614	20 %	40 %	0 %	40 %	330506389
54	NC_015416	GCGCC	2	10	84776	84785	0 %	0 %	40 %	60 %	330506389
55	NC_015416	TCGCC	2	10	85180	85189	0 %	20 %	20 %	60 %	330506389
56	NC_015416	AGACC	2	10	85777	85786	40 %	0 %	20 %	40 %	330506389
57	NC_015416	AGCAA	2	10	87550	87559	60 %	0 %	20 %	20 %	330506391
58	NC_015416	ATCCC	2	10	90828	90837	20 %	20 %	0 %	60 %	330506395
59	NC_015416	AGAGA	2	10	92897	92906	60 %	0 %	40 %	0 %	330506397
60	NC_015416	GAGAT	2	10	93831	93840	40 %	20 %	40 %	0 %	330506398
61	NC_015416	GGAGT	2	10	95019	95028	20 %	20 %	60 %	0 %	330506399
62	NC_015416	TGGCT	2	10	100004	100013	0 %	40 %	40 %	20 %	330506406
63	NC_015416	CAGGA	2	10	103323	103332	40 %	0 %	40 %	20 %	330506408
64	NC_015416	CCCCG	2	10	103452	103461	0 %	0 %	20 %	80 %	330506408
65	NC_015416	TGAGA	2	10	105823	105832	40 %	20 %	40 %	0 %	330506411
66	NC_015416	TCTCC	2	10	106259	106268	0 %	40 %	0 %	60 %	330506411
67	NC_015416	TCAGC	2	10	106496	106505	20 %	20 %	20 %	40 %	330506411
68	NC_015416	TGGCC	2	10	109772	109781	0 %	20 %	40 %	40 %	330506413
69	NC_015416	TGGGC	2	10	110270	110279	0 %	20 %	60 %	20 %	330506413
70	NC_015416	CTTCT	2	10	111762	111771	0 %	60 %	0 %	40 %	330506414
71	NC_015416	CTCCG	2	10	112180	112189	0 %	20 %	20 %	60 %	330506415
72	NC_015416	TCCAA	2	10	112196	112205	40 %	20 %	0 %	40 %	330506415
73	NC_015416	GAATT	2	10	112616	112625	40 %	40 %	20 %	0 %	330506415
74	NC_015416	TATGA	2	10	118218	118227	40 %	40 %	20 %	0 %	330506419
75	NC_015416	TCGAT	2	10	118921	118930	20 %	40 %	20 %	20 %	330506419
76	NC_015416	GAGAG	2	10	119516	119525	40 %	0 %	60 %	0 %	330506420
77	NC_015416	GAATA	2	10	119752	119761	60 %	20 %	20 %	0 %	330506420
78	NC_015416	GTCGG	2	10	119815	119824	0 %	20 %	60 %	20 %	330506420
79	NC_015416	GATTG	2	10	119887	119896	20 %	40 %	40 %	0 %	330506420
80	NC_015416	ACTGC	2	10	119924	119933	20 %	20 %	20 %	40 %	330506420
81	NC_015416	ATCTG	2	10	122167	122176	20 %	40 %	20 %	20 %	330506424
82	NC_015416	AGGGC	2	10	122820	122829	20 %	0 %	60 %	20 %	330506425
83	NC_015416	ACTCT	2	10	125775	125784	20 %	40 %	0 %	40 %	330506427
84	NC_015416	CCTGA	2	10	126779	126788	20 %	20 %	20 %	40 %	330506428
85	NC_015416	TCGGC	2	10	127569	127578	0 %	20 %	40 %	40 %	330506428
86	NC_015416	CCAGA	2	10	127959	127968	40 %	0 %	20 %	40 %	330506429
87	NC_015416	CTTCC	2	10	129411	129420	0 %	40 %	0 %	60 %	330506431
88	NC_015416	CATGG	2	10	130228	130237	20 %	20 %	40 %	20 %	330506432
89	NC_015416	GGATG	2	10	130399	130408	20 %	20 %	60 %	0 %	330506432
90	NC_015416	GACCC	2	10	131149	131158	20 %	0 %	20 %	60 %	330506434
91	NC_015416	GCTGC	2	10	131589	131598	0 %	20 %	40 %	40 %	330506435
92	NC_015416	GATCG	2	10	132569	132578	20 %	20 %	40 %	20 %	330506438
93	NC_015416	AGGGG	2	10	136382	136391	20 %	0 %	80 %	0 %	330506442
94	NC_015416	GATAG	2	10	136764	136773	40 %	20 %	40 %	0 %	330506442
95	NC_015416	TAAGA	2	10	137351	137360	60 %	20 %	20 %	0 %	330506443
96	NC_015416	ATCGC	2	10	138906	138915	20 %	20 %	20 %	40 %	330506445
97	NC_015416	AGAAA	2	10	141809	141818	80 %	0 %	20 %	0 %	330506447
98	NC_015416	ATTGC	2	10	141918	141927	20 %	40 %	20 %	20 %	330506447
99	NC_015416	GCAGG	2	10	143340	143349	20 %	0 %	60 %	20 %	330506448
100	NC_015416	ATCTC	2	10	145345	145354	20 %	40 %	0 %	40 %	330506450
101	NC_015416	CCTGA	2	10	149270	149279	20 %	20 %	20 %	40 %	330506454
102	NC_015416	GCAGG	2	10	149839	149848	20 %	0 %	60 %	20 %	330506454
103	NC_015416	GACTC	2	10	154356	154365	20 %	20 %	20 %	40 %	330506460
104	NC_015416	GCTCG	2	10	154523	154532	0 %	20 %	40 %	40 %	330506460
105	NC_015416	CTTAT	2	10	156982	156991	20 %	60 %	0 %	20 %	330506462
106	NC_015416	GAGCA	2	10	157062	157071	40 %	0 %	40 %	20 %	330506462
107	NC_015416	GATCG	2	10	157100	157109	20 %	20 %	40 %	20 %	330506462
108	NC_015416	GCCTC	2	10	158403	158412	0 %	20 %	20 %	60 %	330506464
109	NC_015416	GAGAA	2	10	159120	159129	60 %	0 %	40 %	0 %	330506465
110	NC_015416	TGGTC	2	10	159407	159416	0 %	40 %	40 %	20 %	330506465
111	NC_015416	TCCTC	2	10	160283	160292	0 %	40 %	0 %	60 %	330506467
112	NC_015416	AGATG	2	10	162482	162491	40 %	20 %	40 %	0 %	330506468
113	NC_015416	GATAG	2	10	163107	163116	40 %	20 %	40 %	0 %	330506468
114	NC_015416	TGCGA	2	10	163231	163240	20 %	20 %	40 %	20 %	330506469
115	NC_015416	ATCTC	2	10	164355	164364	20 %	40 %	0 %	40 %	330506469
116	NC_015416	TAATA	2	10	164910	164919	60 %	40 %	0 %	0 %	330506469
117	NC_015416	TGATC	2	10	165375	165384	20 %	40 %	20 %	20 %	330506469
118	NC_015416	ATAAA	2	10	165833	165842	80 %	20 %	0 %	0 %	330506469
119	NC_015416	TTTTG	2	10	165993	166002	0 %	80 %	20 %	0 %	330506469
120	NC_015416	AGATA	2	10	170274	170283	60 %	20 %	20 %	0 %	330506474
121	NC_015416	TTTTA	2	10	171825	171834	20 %	80 %	0 %	0 %	330506475
122	NC_015416	GCGCA	2	10	172206	172215	20 %	0 %	40 %	40 %	330506476
123	NC_015416	AAAGA	2	10	172290	172299	80 %	0 %	20 %	0 %	330506476
124	NC_015416	CAAAT	2	10	172608	172617	60 %	20 %	0 %	20 %	330506476
125	NC_015416	TGGAT	2	10	177559	177568	20 %	40 %	40 %	0 %	330506479
126	NC_015416	ATGAT	2	10	177940	177949	40 %	40 %	20 %	0 %	330506479
127	NC_015416	TTGGA	2	10	179195	179204	20 %	40 %	40 %	0 %	330506482
128	NC_015416	GTGGA	2	10	183412	183421	20 %	20 %	60 %	0 %	330506486
129	NC_015416	TGCGC	2	10	184422	184431	0 %	20 %	40 %	40 %	330506487
130	NC_015416	GATGG	2	10	186550	186559	20 %	20 %	60 %	0 %	330506489
131	NC_015416	TGGAC	2	10	186721	186730	20 %	20 %	40 %	20 %	330506489
132	NC_015416	TGATC	2	10	187256	187265	20 %	40 %	20 %	20 %	330506491
133	NC_015416	GGCTG	2	10	190740	190749	0 %	20 %	60 %	20 %	330506493
134	NC_015416	CAGGC	2	10	191626	191635	20 %	0 %	40 %	40 %	330506495
135	NC_015416	GACCA	2	10	191842	191851	40 %	0 %	20 %	40 %	330506495
136	NC_015416	TCATC	2	10	192147	192156	20 %	40 %	0 %	40 %	330506495
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149	NC_015416	TCTCT	2	10	211661	211670	0 %	60 %	0 %	40 %	330506518
150	NC_015416	GGCGA	2	10	211749	211758	20 %	0 %	60 %	20 %	330506518
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156	NC_015416	GGGCC	2	10	217441	217450	0 %	0 %	60 %	40 %	330506525
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164	NC_015416	CTGCA	2	10	222216	222225	20 %	20 %	20 %	40 %	330506532
165	NC_015416	GCTGC	2	10	223579	223588	0 %	20 %	40 %	40 %	330506535
166	NC_015416	AGGAT	2	10	224752	224761	40 %	20 %	40 %	0 %	330506536
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172	NC_015416	CTGGA	2	10	232414	232423	20 %	20 %	40 %	20 %	330506543
173	NC_015416	CTGGA	2	10	232729	232738	20 %	20 %	40 %	20 %	330506543
174	NC_015416	TAAGG	2	10	235271	235280	40 %	20 %	40 %	0 %	330506546
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230	NC_015416	GGGCA	2	10	356257	356266	20 %	0 %	60 %	20 %	330506662
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234	NC_015416	CTATC	2	10	368498	368507	20 %	40 %	0 %	40 %	330506671
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242	NC_015416	GGGGA	2	10	381575	381584	20 %	0 %	80 %	0 %	330506681
243	NC_015416	GGATC	2	10	382840	382849	20 %	20 %	40 %	20 %	330506682
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247	NC_015416	CGTCC	2	10	386859	386868	0 %	20 %	20 %	60 %	330506687
248	NC_015416	CGGAA	2	10	392270	392279	40 %	0 %	40 %	20 %	330506689
249	NC_015416	TCAGA	2	10	393914	393923	40 %	20 %	20 %	20 %	330506691
250	NC_015416	GAAAG	2	10	395605	395614	60 %	0 %	40 %	0 %	330506693
251	NC_015416	CTCTT	2	10	396308	396317	0 %	60 %	0 %	40 %	330506694
252	NC_015416	TCCTT	2	10	398701	398710	0 %	60 %	0 %	40 %	330506697
253	NC_015416	GAAGA	2	10	399665	399674	60 %	0 %	40 %	0 %	330506698
254	NC_015416	GTCCA	2	10	401129	401138	20 %	20 %	20 %	40 %	330506700
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256	NC_015416	TTTTA	2	10	402847	402856	20 %	80 %	0 %	0 %	330506703
257	NC_015416	GAGAG	2	10	402975	402984	40 %	0 %	60 %	0 %	330506703
258	NC_015416	CTGGA	2	10	404822	404831	20 %	20 %	40 %	20 %	330506703
259	NC_015416	GCCTT	2	10	405615	405624	0 %	40 %	20 %	40 %	330506703
260	NC_015416	CCTGG	2	10	406363	406372	0 %	20 %	40 %	40 %	330506703
261	NC_015416	AGCCC	2	10	415081	415090	20 %	0 %	20 %	60 %	330506712
262	NC_015416	AGGGA	2	10	419714	419723	40 %	0 %	60 %	0 %	330506714
263	NC_015416	GAACC	2	10	419732	419741	40 %	0 %	20 %	40 %	330506714
264	NC_015416	ACAAT	2	10	421041	421050	60 %	20 %	0 %	20 %	330506716
265	NC_015416	GAGAC	2	10	422612	422621	40 %	0 %	40 %	20 %	330506717
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380	NC_015416	TGATC	2	10	659771	659780	20 %	40 %	20 %	20 %	330506937
381	NC_015416	TGAGA	2	10	662405	662414	40 %	20 %	40 %	0 %	330506940
382	NC_015416	GAAAA	2	10	664136	664145	80 %	0 %	20 %	0 %	330506942
383	NC_015416	TATCC	2	10	664866	664875	20 %	40 %	0 %	40 %	330506943
384	NC_015416	TCCCA	2	10	665178	665187	20 %	20 %	0 %	60 %	330506943
385	NC_015416	GTCTC	2	10	665625	665634	0 %	40 %	20 %	40 %	330506944
386	NC_015416	GAGCA	2	10	665682	665691	40 %	0 %	40 %	20 %	330506944
387	NC_015416	GATAT	2	10	673256	673265	40 %	40 %	20 %	0 %	330506953
388	NC_015416	CAGGG	2	10	675173	675182	20 %	0 %	60 %	20 %	330506954
389	NC_015416	ATGCC	2	10	678872	678881	20 %	20 %	20 %	40 %	330506958
390	NC_015416	CAGAA	2	10	679062	679071	60 %	0 %	20 %	20 %	330506958
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500	NC_015416	CGATC	2	10	877990	877999	20 %	20 %	20 %	40 %	330507164

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