MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanosaeta concilii GP6 chromosome

Total Repeats: 35500

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015416	GGC	2	6	59	64	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506320
2	NC_015416	ATA	2	6	161	166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330506320
3	NC_015416	TAT	2	6	281	286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506320
4	NC_015416	TAC	2	6	325	330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506320
5	NC_015416	ATC	2	6	396	401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506320
6	NC_015416	CAA	2	6	431	436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330506320
7	NC_015416	AAC	3	9	500	508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330506320
8	NC_015416	GAT	2	6	521	526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506320
9	NC_015416	CCT	2	6	552	557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506320
10	NC_015416	TGA	2	6	586	591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506320
11	NC_015416	TGG	2	6	595	600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506320
12	NC_015416	ATA	2	6	794	799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330506320
13	NC_015416	GAG	2	6	821	826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506320
14	NC_015416	ATG	2	6	855	860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506320
15	NC_015416	TGT	2	6	889	894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330506320
16	NC_015416	TGA	2	6	937	942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506320
17	NC_015416	ACG	2	6	1014	1019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506320
18	NC_015416	TGG	2	6	1091	1096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506320
19	NC_015416	AAC	2	6	1097	1102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330506320
20	NC_015416	TCC	2	6	1103	1108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506320
21	NC_015416	GAG	2	6	1113	1118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506320
22	NC_015416	TCT	2	6	1133	1138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506320
23	NC_015416	GGC	2	6	1256	1261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506320
24	NC_015416	AAG	2	6	1323	1328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506320
25	NC_015416	CGC	2	6	1432	1437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506320
26	NC_015416	CTG	2	6	1676	1681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506320
27	NC_015416	TAT	2	6	1694	1699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506320
28	NC_015416	ATG	2	6	1797	1802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506320
29	NC_015416	TAG	2	6	1812	1817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506320
30	NC_015416	ATG	2	6	1890	1895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506320
31	NC_015416	TGT	2	6	1903	1908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330506320
32	NC_015416	AAG	2	6	1913	1918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506320
33	NC_015416	AGT	2	6	1948	1953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506320
34	NC_015416	ATG	2	6	2079	2084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506320
35	NC_015416	GAT	2	6	2126	2131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506320
36	NC_015416	GGA	2	6	2275	2280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506320
37	NC_015416	GAA	2	6	2412	2417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506320
38	NC_015416	ATT	2	6	2435	2440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506320
39	NC_015416	TGA	2	6	2443	2448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506320
40	NC_015416	GAT	2	6	2717	2722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506320
41	NC_015416	GGA	2	6	2732	2737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506320
42	NC_015416	AGG	2	6	2760	2765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506320
43	NC_015416	CGA	2	6	2887	2892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506320
44	NC_015416	CTC	2	6	2985	2990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506320
45	NC_015416	ATG	2	6	4272	4277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506321
46	NC_015416	TCA	2	6	4291	4296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506321
47	NC_015416	ATG	2	6	4365	4370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506321
48	NC_015416	TTG	2	6	4560	4565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330506321
49	NC_015416	ATG	2	6	4592	4597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506321
50	NC_015416	AGG	2	6	4615	4620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506321
51	NC_015416	TCC	2	6	4743	4748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506321
52	NC_015416	CAG	2	6	4871	4876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506321
53	NC_015416	CTC	2	6	4913	4918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506321
54	NC_015416	TCG	2	6	4926	4931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506321
55	NC_015416	TCC	2	6	4998	5003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506321
56	NC_015416	TTA	2	6	5124	5129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506321
57	NC_015416	TTA	2	6	5314	5319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506321
58	NC_015416	TAT	2	6	5392	5397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506322
59	NC_015416	TGC	2	6	5420	5425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506322
60	NC_015416	TAC	2	6	5426	5431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506322
61	NC_015416	AGC	2	6	5435	5440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506322
62	NC_015416	ATT	2	6	5459	5464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506322
63	NC_015416	ACT	2	6	5465	5470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506322
64	NC_015416	CCT	2	6	5655	5660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506322
65	NC_015416	GAC	2	6	5683	5688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506322
66	NC_015416	ATC	2	6	5724	5729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506322
67	NC_015416	AAT	3	9	5828	5836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330506322
68	NC_015416	GAA	2	6	6007	6012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506322
69	NC_015416	GAT	2	6	6038	6043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506322
70	NC_015416	ATA	2	6	6071	6076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330506322
71	NC_015416	GCT	2	6	6077	6082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506322
72	NC_015416	CGG	2	6	6141	6146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506322
73	NC_015416	ATA	2	6	6221	6226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330506322
74	NC_015416	CAA	2	6	6256	6261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330506322
75	NC_015416	TGA	2	6	6268	6273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506322
76	NC_015416	ACC	2	6	6299	6304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506322
77	NC_015416	ACG	2	6	6345	6350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506322
78	NC_015416	TGG	2	6	6422	6427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506322
79	NC_015416	CAG	2	6	6598	6603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506322
80	NC_015416	CGC	2	6	6609	6614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506322
81	NC_015416	TCT	2	6	6707	6712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506322
82	NC_015416	TAT	2	6	7028	7033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506322
83	NC_015416	CTG	2	6	7209	7214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506322
84	NC_015416	GAT	2	6	7223	7228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506322
85	NC_015416	TGA	2	6	7333	7338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506322
86	NC_015416	CAC	2	6	7372	7377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506322
87	NC_015416	CCG	2	6	7686	7691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506322
88	NC_015416	ATA	2	6	7841	7846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330506322
89	NC_015416	GGT	2	6	7891	7896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506322
90	NC_015416	TAA	2	6	7906	7911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330506322
91	NC_015416	GAG	2	6	8057	8062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506322
92	NC_015416	CGA	2	6	8122	8127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506322
93	NC_015416	AGC	2	6	8216	8221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506322
94	NC_015416	ATG	2	6	8256	8261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506322
95	NC_015416	CTT	2	6	8271	8276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506322
96	NC_015416	ATA	2	6	8285	8290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330506322
97	NC_015416	CGG	2	6	8338	8343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506322
98	NC_015416	TGG	2	6	8487	8492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506322
99	NC_015416	CTG	2	6	8619	8624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506322
100	NC_015416	GAA	2	6	8647	8652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506322
101	NC_015416	ATC	2	6	8908	8913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506322
102	NC_015416	ATT	2	6	9429	9434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506323
103	NC_015416	GCC	2	6	9479	9484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506323
104	NC_015416	CCT	2	6	9498	9503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506323
105	NC_015416	GAA	2	6	9583	9588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506323
106	NC_015416	ATT	2	6	9616	9621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506323
107	NC_015416	GAG	2	6	9792	9797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506323
108	NC_015416	AGG	2	6	9883	9888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506323
109	NC_015416	GCC	2	6	9988	9993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506323
110	NC_015416	ATA	2	6	10007	10012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330506323
111	NC_015416	TTC	2	6	10040	10045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506323
112	NC_015416	AGC	2	6	10184	10189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506323
113	NC_015416	AAT	2	6	10212	10217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330506323
114	NC_015416	CCG	2	6	10232	10237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506323
115	NC_015416	ATC	2	6	10276	10281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506323
116	NC_015416	TGA	2	6	10347	10352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506323
117	NC_015416	ATA	2	6	10438	10443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330506323
118	NC_015416	GTA	2	6	10444	10449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506323
119	NC_015416	CAT	2	6	10461	10466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506323
120	NC_015416	GTC	2	6	10495	10500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506323
121	NC_015416	GAA	2	6	10519	10524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506323
122	NC_015416	CAT	2	6	10530	10535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506323
123	NC_015416	GTC	2	6	10558	10563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506323
124	NC_015416	CGG	2	6	10608	10613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506323
125	NC_015416	TAG	2	6	10635	10640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506323
126	NC_015416	TCT	2	6	10691	10696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506323
127	NC_015416	CCA	2	6	10895	10900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506323
128	NC_015416	GTC	2	6	10933	10938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506323
129	NC_015416	TTC	2	6	10967	10972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506323
130	NC_015416	GCC	2	6	10987	10992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506323
131	NC_015416	ATG	2	6	11051	11056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506323
132	NC_015416	GCC	2	6	12107	12112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506324
133	NC_015416	CTC	2	6	12130	12135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506324
134	NC_015416	CCT	2	6	12162	12167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506324
135	NC_015416	AGA	2	6	12177	12182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506324
136	NC_015416	AAG	2	6	12367	12372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506325
137	NC_015416	GAA	2	6	12482	12487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506325
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139	NC_015416	GCT	2	6	12963	12968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506325
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142	NC_015416	AAT	2	6	13373	13378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330506326
143	NC_015416	ATT	2	6	13543	13548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506326
144	NC_015416	ATT	2	6	13742	13747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506326
145	NC_015416	ATT	2	6	13762	13767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506326
146	NC_015416	TGA	2	6	13808	13813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506326
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151	NC_015416	TCG	2	6	14405	14410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506326
152	NC_015416	ATT	2	6	14450	14455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506326
153	NC_015416	ATA	2	6	14463	14468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330506326
154	NC_015416	TAG	2	6	14614	14619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506327
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159	NC_015416	GAA	2	6	15031	15036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506327
160	NC_015416	TCT	2	6	15062	15067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506327
161	NC_015416	TCC	2	6	15081	15086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506327
162	NC_015416	TAT	2	6	15206	15211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506327
163	NC_015416	GCC	2	6	15231	15236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506327
164	NC_015416	CCT	2	6	15307	15312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506327
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253	NC_015416	TCC	2	6	23759	23764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506334
254	NC_015416	GCC	2	6	23807	23812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506334
255	NC_015416	CTG	2	6	23914	23919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506334
256	NC_015416	GGC	2	6	24082	24087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506334
257	NC_015416	CAT	2	6	24091	24096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506334
258	NC_015416	GCT	2	6	24318	24323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506335
259	NC_015416	TTC	2	6	24365	24370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506335
260	NC_015416	CTG	2	6	24529	24534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506335
261	NC_015416	GAC	2	6	24538	24543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506335
262	NC_015416	TCC	2	6	24635	24640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506335
263	NC_015416	TTC	2	6	24711	24716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506335
264	NC_015416	CCT	2	6	24729	24734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506336
265	NC_015416	GAT	2	6	24757	24762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506336
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269	NC_015416	ATC	2	6	25259	25264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506337
270	NC_015416	CAT	3	9	25269	25277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506337
271	NC_015416	AGT	2	6	25281	25286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506337
272	NC_015416	GGA	2	6	25410	25415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506337
273	NC_015416	TAG	2	6	25466	25471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506337
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277	NC_015416	TGG	2	6	25839	25844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506337
278	NC_015416	TGG	3	9	25875	25883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506337
279	NC_015416	AAG	2	6	26189	26194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506338
280	NC_015416	AGG	2	6	26223	26228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506338
281	NC_015416	GCA	2	6	26247	26252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506338
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287	NC_015416	AGG	2	6	26756	26761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506338
288	NC_015416	TCT	2	6	26815	26820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506338
289	NC_015416	CTG	2	6	26851	26856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506338
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292	NC_015416	TTC	2	6	26898	26903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506338
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294	NC_015416	CAT	2	6	26950	26955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506338
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299	NC_015416	TAT	2	6	27032	27037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506338
300	NC_015416	GCT	2	6	27206	27211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506338
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331	NC_015416	TGA	2	6	29693	29698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506341
332	NC_015416	CCA	2	6	29845	29850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506341
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343	NC_015416	CTT	2	6	31137	31142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506342
344	NC_015416	ACC	2	6	31165	31170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506342
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347	NC_015416	ATA	2	6	31479	31484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330506343
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363	NC_015416	ATG	2	6	32579	32584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506345
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367	NC_015416	ATT	2	6	32960	32965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506345
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369	NC_015416	GAG	2	6	33067	33072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506345
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379	NC_015416	ATG	2	6	33980	33985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506345
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383	NC_015416	CTT	2	6	34187	34192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506345
384	NC_015416	AGC	2	6	34251	34256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506345
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499	NC_015416	CAG	2	6	44865	44870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506355
500	NC_015416	CGG	2	6	44883	44888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506355

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