MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Marinithermus hydrothermalis DSM 14884 chromosome

Total Repeats: 52970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015387	G	6	6	58	63	0 %	0 %	100 %	0 %	328949541
2	NC_015387	CAA	2	6	116	121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328949541
3	NC_015387	AGG	2	6	179	184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949541
4	NC_015387	CCT	2	6	208	213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949541
5	NC_015387	AAG	2	6	231	236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328949541
6	NC_015387	AGG	2	6	256	261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949541
7	NC_015387	GA	3	6	367	372	50 %	0 %	50 %	0 %	328949541
8	NC_015387	CAA	3	9	425	433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328949541
9	NC_015387	CGC	3	9	443	451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949541
10	NC_015387	CCGG	2	8	472	479	0 %	0 %	50 %	50 %	328949541
11	NC_015387	CGG	2	6	503	508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949541
12	NC_015387	CCT	2	6	680	685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949541
13	NC_015387	AGG	2	6	730	735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949541
14	NC_015387	TTC	2	6	738	743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949541
15	NC_015387	ATC	2	6	780	785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949541
16	NC_015387	C	7	7	800	806	0 %	0 %	0 %	100 %	328949541
17	NC_015387	TCA	2	6	859	864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949541
18	NC_015387	C	6	6	876	881	0 %	0 %	0 %	100 %	328949541
19	NC_015387	GGA	2	6	944	949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949541
20	NC_015387	CCT	2	6	1030	1035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949541
21	NC_015387	GGC	2	6	1064	1069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949541
22	NC_015387	GAAG	2	8	1097	1104	50 %	0 %	50 %	0 %	328949541
23	NC_015387	GGA	2	6	1118	1123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949541
24	NC_015387	GTG	2	6	1134	1139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949541
25	NC_015387	GAG	2	6	1164	1169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949541
26	NC_015387	GGGCGC	2	12	1176	1187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949541
27	NC_015387	AGG	2	6	1192	1197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949541
28	NC_015387	TTC	2	6	1272	1277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949541
29	NC_015387	ACG	2	6	1293	1298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949541
30	NC_015387	AGC	2	6	1378	1383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949541
31	NC_015387	CAT	2	6	1717	1722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949542
32	NC_015387	GCA	3	9	1731	1739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949542
33	NC_015387	TCC	2	6	1761	1766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949542
34	NC_015387	GGC	2	6	2041	2046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949542
35	NC_015387	CG	3	6	2056	2061	0 %	0 %	50 %	50 %	328949542
36	NC_015387	GAG	2	6	2096	2101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949542
37	NC_015387	CG	3	6	2182	2187	0 %	0 %	50 %	50 %	328949542
38	NC_015387	AAG	2	6	2219	2224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328949542
39	NC_015387	GTG	2	6	2228	2233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949542
40	NC_015387	ATC	2	6	2255	2260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949542
41	NC_015387	GGAA	2	8	2305	2312	50 %	0 %	50 %	0 %	328949542
42	NC_015387	GCA	2	6	2395	2400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949542
43	NC_015387	AAC	2	6	2477	2482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328949542
44	NC_015387	CTT	2	6	2497	2502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949542
45	NC_015387	GTG	2	6	2726	2731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949542
46	NC_015387	GAC	2	6	2794	2799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949543
47	NC_015387	ACTCG	2	10	2827	2836	20 %	20 %	20 %	40 %	328949543
48	NC_015387	GC	4	8	2880	2887	0 %	0 %	50 %	50 %	328949543
49	NC_015387	GGGC	2	8	2888	2895	0 %	0 %	75 %	25 %	328949543
50	NC_015387	CGG	2	6	2950	2955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949543
51	NC_015387	GTG	2	6	2978	2983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949543
52	NC_015387	AGG	2	6	3048	3053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949543
53	NC_015387	CAA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328949543
54	NC_015387	CG	4	8	3142	3149	0 %	0 %	50 %	50 %	328949543
55	NC_015387	G	6	6	3190	3195	0 %	0 %	100 %	0 %	328949543
56	NC_015387	CGG	2	6	3241	3246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949543
57	NC_015387	CGG	2	6	3294	3299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949543
58	NC_015387	CCA	2	6	3346	3351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949543
59	NC_015387	ACA	2	6	3381	3386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328949543
60	NC_015387	GAG	2	6	3434	3439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949543
61	NC_015387	CTC	2	6	3452	3457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949543
62	NC_015387	AGG	2	6	3492	3497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949543
63	NC_015387	ACC	2	6	3549	3554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949543
64	NC_015387	GAGGGG	2	12	3557	3568	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	328949543
65	NC_015387	GAG	2	6	3584	3589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949543
66	NC_015387	GCG	2	6	3605	3610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949543
67	NC_015387	TCGA	2	8	3635	3642	25 %	25 %	25 %	25 %	328949543
68	NC_015387	GGA	2	6	3655	3660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949543
69	NC_015387	GAC	2	6	3722	3727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949543
70	NC_015387	CG	3	6	3745	3750	0 %	0 %	50 %	50 %	328949543
71	NC_015387	AAGG	2	8	3755	3762	50 %	0 %	50 %	0 %	328949543
72	NC_015387	CTC	2	6	3998	4003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949543
73	NC_015387	GAG	2	6	4010	4015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949543
74	NC_015387	GCC	2	6	4025	4030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949543
75	NC_015387	TCG	2	6	4072	4077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949544
76	NC_015387	CCA	2	6	4078	4083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949544
77	NC_015387	CGGCC	2	10	4085	4094	0 %	0 %	40 %	60 %	328949544
78	NC_015387	GTG	2	6	4143	4148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949544
79	NC_015387	ACC	2	6	4180	4185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949544
80	NC_015387	TGC	2	6	4243	4248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949544
81	NC_015387	ACC	2	6	4332	4337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949544
82	NC_015387	GAG	2	6	4338	4343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949544
83	NC_015387	GGA	2	6	4400	4405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949544
84	NC_015387	CTC	2	6	4419	4424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949544
85	NC_015387	GAC	2	6	4425	4430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949544
86	NC_015387	GTC	2	6	4482	4487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949544
87	NC_015387	G	6	6	4494	4499	0 %	0 %	100 %	0 %	328949544
88	NC_015387	CAA	3	9	4508	4516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328949544
89	NC_015387	CCGG	2	8	4531	4538	0 %	0 %	50 %	50 %	328949544
90	NC_015387	CGA	2	6	4640	4645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949544
91	NC_015387	CTC	2	6	4650	4655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949544
92	NC_015387	GGA	2	6	4748	4753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949544
93	NC_015387	TGG	2	6	4768	4773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949544
94	NC_015387	GCC	2	6	4799	4804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949544
95	NC_015387	GAG	2	6	4806	4811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949544
96	NC_015387	GC	4	8	4845	4852	0 %	0 %	50 %	50 %	328949544
97	NC_015387	GACGG	2	10	4956	4965	20 %	0 %	60 %	20 %	328949544
98	NC_015387	CGG	2	6	4981	4986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949544
99	NC_015387	CGG	2	6	4993	4998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949544
100	NC_015387	CGC	2	6	5012	5017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949544
101	NC_015387	GAT	2	6	5024	5029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949544
102	NC_015387	ATCG	2	8	5070	5077	25 %	25 %	25 %	25 %	328949544
103	NC_015387	GAACC	2	10	5097	5106	40 %	0 %	20 %	40 %	328949544
104	NC_015387	GCCC	2	8	5159	5166	0 %	0 %	25 %	75 %	328949544
105	NC_015387	TCG	2	6	5173	5178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949544
106	NC_015387	GTC	2	6	5195	5200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949544
107	NC_015387	GGT	2	6	5210	5215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949544
108	NC_015387	CGA	2	6	5330	5335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949544
109	NC_015387	GGCG	2	8	5424	5431	0 %	0 %	75 %	25 %	328949544
110	NC_015387	CAC	2	6	5435	5440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949544
111	NC_015387	GCT	2	6	5524	5529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949545
112	NC_015387	CTC	2	6	5546	5551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949545
113	NC_015387	GCTTC	2	10	5566	5575	0 %	40 %	20 %	40 %	328949545
114	NC_015387	GTG	2	6	5586	5591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949545
115	NC_015387	GCA	2	6	5614	5619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949545
116	NC_015387	GTG	2	6	5625	5630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949545
117	NC_015387	CGGT	2	8	5691	5698	0 %	25 %	50 %	25 %	328949545
118	NC_015387	CAA	2	6	5705	5710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328949545
119	NC_015387	CGG	2	6	5722	5727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949545
120	NC_015387	AGCG	2	8	5750	5757	25 %	0 %	50 %	25 %	328949545
121	NC_015387	CCT	2	6	5764	5769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949545
122	NC_015387	C	6	6	5794	5799	0 %	0 %	0 %	100 %	328949545
123	NC_015387	C	7	7	5859	5865	0 %	0 %	0 %	100 %	328949545
124	NC_015387	GCG	2	6	5866	5871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949545
125	NC_015387	GTA	2	6	5969	5974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949545
126	NC_015387	A	8	8	5974	5981	100 %	0 %	0 %	0 %	328949545
127	NC_015387	C	6	6	6043	6048	0 %	0 %	0 %	100 %	328949545
128	NC_015387	GCTC	2	8	6141	6148	0 %	25 %	25 %	50 %	328949545
129	NC_015387	CGG	2	6	6244	6249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949546
130	NC_015387	TTC	2	6	6251	6256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949546
131	NC_015387	CCT	2	6	6304	6309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949546
132	NC_015387	CCT	2	6	6448	6453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949546
133	NC_015387	CCTTC	2	10	6538	6547	0 %	40 %	0 %	60 %	328949546
134	NC_015387	GAA	2	6	6575	6580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328949546
135	NC_015387	G	6	6	6600	6605	0 %	0 %	100 %	0 %	328949546
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267	NC_015387	ACC	2	6	11757	11762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949552
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271	NC_015387	CG	3	6	11928	11933	0 %	0 %	50 %	50 %	328949552
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280	NC_015387	GCC	2	6	12253	12258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949552
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387	NC_015387	CG	3	6	16052	16057	0 %	0 %	50 %	50 %	328949556
388	NC_015387	CCA	2	6	16109	16114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949556
389	NC_015387	CG	3	6	16135	16140	0 %	0 %	50 %	50 %	328949556
390	NC_015387	ACCCC	2	10	16165	16174	20 %	0 %	0 %	80 %	328949557
391	NC_015387	GC	3	6	16192	16197	0 %	0 %	50 %	50 %	328949557
392	NC_015387	GCG	3	9	16211	16219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949557
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394	NC_015387	GC	3	6	16247	16252	0 %	0 %	50 %	50 %	328949557
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