MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Marinithermus hydrothermalis DSM 14884 chromosome

Total Repeats: 52970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015387	GCG	2	6	151059	151064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949686
3502	NC_015387	CGGG	2	8	151078	151085	0 %	0 %	75 %	25 %	328949686
3503	NC_015387	CGG	2	6	151120	151125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949686
3504	NC_015387	GCG	2	6	151136	151141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949686
3505	NC_015387	TCG	2	6	151221	151226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949686
3506	NC_015387	GCA	2	6	151291	151296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949686
3507	NC_015387	CG	3	6	151308	151313	0 %	0 %	50 %	50 %	328949686
3508	NC_015387	CGA	2	6	151324	151329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949686
3509	NC_015387	GCT	2	6	151357	151362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949686
3510	NC_015387	TGC	2	6	151383	151388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949686
3511	NC_015387	CTC	3	9	151412	151420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949686
3512	NC_015387	GCG	2	6	151469	151474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949686
3513	NC_015387	CCT	2	6	151489	151494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949686
3514	NC_015387	GCT	2	6	151498	151503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949686
3515	NC_015387	CG	4	8	151679	151686	0 %	0 %	50 %	50 %	328949687
3516	NC_015387	G	6	6	151719	151724	0 %	0 %	100 %	0 %	328949687
3517	NC_015387	GAC	2	6	151735	151740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949687
3518	NC_015387	GGC	2	6	151798	151803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949687
3519	NC_015387	GCG	2	6	151811	151816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949687
3520	NC_015387	CCT	2	6	151818	151823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949687
3521	NC_015387	GAG	2	6	151918	151923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949687
3522	NC_015387	CG	3	6	151924	151929	0 %	0 %	50 %	50 %	328949687
3523	NC_015387	GC	4	8	151960	151967	0 %	0 %	50 %	50 %	328949687
3524	NC_015387	G	7	7	151991	151997	0 %	0 %	100 %	0 %	328949687
3525	NC_015387	TGGGG	2	10	152026	152035	0 %	20 %	80 %	0 %	328949687
3526	NC_015387	GGA	2	6	152043	152048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949687
3527	NC_015387	GGGC	2	8	152055	152062	0 %	0 %	75 %	25 %	328949687
3528	NC_015387	CGGG	2	8	152067	152074	0 %	0 %	75 %	25 %	328949687
3529	NC_015387	G	6	6	152082	152087	0 %	0 %	100 %	0 %	328949687
3530	NC_015387	GTG	2	6	152123	152128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949687
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3532	NC_015387	CG	3	6	152186	152191	0 %	0 %	50 %	50 %	328949687
3533	NC_015387	GCC	2	6	152220	152225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949687
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3535	NC_015387	GCC	2	6	152352	152357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949687
3536	NC_015387	GAG	2	6	152362	152367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949687
3537	NC_015387	GGC	2	6	152389	152394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949687
3538	NC_015387	AAC	2	6	152396	152401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328949687
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3540	NC_015387	CTCGGC	2	12	152482	152493	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	328949687
3541	NC_015387	AGC	2	6	152549	152554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949687
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3543	NC_015387	CAG	2	6	152665	152670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949687
3544	NC_015387	TCC	2	6	152672	152677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949687
3545	NC_015387	GGTT	2	8	152692	152699	0 %	50 %	50 %	0 %	328949687
3546	NC_015387	CGC	2	6	152766	152771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949688
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3548	NC_015387	GC	3	6	152845	152850	0 %	0 %	50 %	50 %	328949688
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3551	NC_015387	CCCG	2	8	152953	152960	0 %	0 %	25 %	75 %	328949688
3552	NC_015387	CCG	2	6	152988	152993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949688
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3554	NC_015387	GC	5	10	153009	153018	0 %	0 %	50 %	50 %	328949688
3555	NC_015387	TCC	2	6	153027	153032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949688
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3557	NC_015387	GC	5	10	153099	153108	0 %	0 %	50 %	50 %	328949688
3558	NC_015387	GAG	2	6	153119	153124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949688
3559	NC_015387	GAGGGC	2	12	153152	153163	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	328949688
3560	NC_015387	GCG	2	6	153227	153232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949689
3561	NC_015387	GGC	2	6	153234	153239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949689
3562	NC_015387	GCGCG	2	10	153288	153297	0 %	0 %	60 %	40 %	328949689
3563	NC_015387	GTT	2	6	153403	153408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	328949689
3564	NC_015387	CGGCG	2	10	153432	153441	0 %	0 %	60 %	40 %	328949689
3565	NC_015387	GA	3	6	153470	153475	50 %	0 %	50 %	0 %	328949689
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3571	NC_015387	CGGC	2	8	153691	153698	0 %	0 %	50 %	50 %	328949690
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3574	NC_015387	GC	3	6	153801	153806	0 %	0 %	50 %	50 %	328949690
3575	NC_015387	CCGCTC	2	12	153860	153871	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	328949690
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3581	NC_015387	AGC	2	6	154195	154200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949691
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3588	NC_015387	TGC	2	6	154578	154583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949692
3589	NC_015387	CGGG	2	8	154586	154593	0 %	0 %	75 %	25 %	328949692
3590	NC_015387	GGCG	2	8	154597	154604	0 %	0 %	75 %	25 %	328949692
3591	NC_015387	GCT	2	6	154606	154611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949692
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3593	NC_015387	GCG	2	6	154724	154729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949692
3594	NC_015387	GC	3	6	154757	154762	0 %	0 %	50 %	50 %	328949692
3595	NC_015387	CGGC	2	8	154769	154776	0 %	0 %	50 %	50 %	328949692
3596	NC_015387	ACG	2	6	154788	154793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949692
3597	NC_015387	GC	3	6	154796	154801	0 %	0 %	50 %	50 %	328949692
3598	NC_015387	GC	3	6	154852	154857	0 %	0 %	50 %	50 %	328949692
3599	NC_015387	AGGC	2	8	154878	154885	25 %	0 %	50 %	25 %	328949692
3600	NC_015387	TGC	2	6	154899	154904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949692
3601	NC_015387	GC	3	6	154946	154951	0 %	0 %	50 %	50 %	328949692
3602	NC_015387	G	6	6	154953	154958	0 %	0 %	100 %	0 %	328949692
3603	NC_015387	AGA	2	6	155040	155045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328949692
3604	NC_015387	CCG	2	6	155063	155068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949692
3605	NC_015387	CGG	2	6	155091	155096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949692
3606	NC_015387	GACCG	2	10	155150	155159	20 %	0 %	40 %	40 %	328949692
3607	NC_015387	GCG	2	6	155172	155177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949692
3608	NC_015387	CGA	2	6	155193	155198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949692
3609	NC_015387	CG	3	6	155207	155212	0 %	0 %	50 %	50 %	328949692
3610	NC_015387	GCGCC	2	10	155242	155251	0 %	0 %	40 %	60 %	328949692
3611	NC_015387	CTA	2	6	155269	155274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949692
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3615	NC_015387	GTAC	2	8	155473	155480	25 %	25 %	25 %	25 %	328949692
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3620	NC_015387	TCG	2	6	155634	155639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949692
3621	NC_015387	AGCCCG	2	12	155652	155663	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	328949692
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3993	NC_015387	GAT	2	6	171277	171282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949709
3994	NC_015387	AGG	2	6	171306	171311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949709
3995	NC_015387	GCGG	2	8	171398	171405	0 %	0 %	75 %	25 %	328949709
3996	NC_015387	GAC	2	6	171407	171412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949709
3997	NC_015387	CCAC	2	8	171432	171439	25 %	0 %	0 %	75 %	328949709
3998	NC_015387	GTTG	2	8	171562	171569	0 %	50 %	50 %	0 %	328949709
3999	NC_015387	TGC	2	6	171618	171623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949709
4000	NC_015387	GGC	2	6	171694	171699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949709

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