MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycoplasma suis str. Illinois chromosome

Total Repeats: 11563

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015155	AGA	2	6	18	23	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972868
2	NC_015155	AAG	2	6	28	33	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972868
3	NC_015155	TAA	2	6	51	56	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972868
4	NC_015155	GAA	2	6	127	132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972868
5	NC_015155	AAG	2	6	376	381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972868
6	NC_015155	AGA	2	6	396	401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972868
7	NC_015155	ATT	2	6	493	498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972868
8	NC_015155	AAT	2	6	514	519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972868
9	NC_015155	AAT	2	6	775	780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972868
10	NC_015155	ATT	2	6	793	798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972868
11	NC_015155	AAG	2	6	831	836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972868
12	NC_015155	ATT	2	6	959	964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972868
13	NC_015155	AGA	3	9	982	990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972868
14	NC_015155	AGA	2	6	1283	1288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972869
15	NC_015155	TTA	2	6	1294	1299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972869
16	NC_015155	GAA	2	6	1311	1316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972869
17	NC_015155	AAT	2	6	1332	1337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972869
18	NC_015155	TAA	2	6	1405	1410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972869
19	NC_015155	GAA	2	6	1455	1460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972869
20	NC_015155	TCT	2	6	1500	1505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972869
21	NC_015155	TAA	2	6	1549	1554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972869
22	NC_015155	GAA	2	6	1569	1574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972869
23	NC_015155	TAA	2	6	1615	1620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972869
24	NC_015155	TTC	2	6	1649	1654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972869
25	NC_015155	AGA	2	6	1724	1729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972869
26	NC_015155	ATC	2	6	1737	1742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972869
27	NC_015155	TTC	2	6	1751	1756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972869
28	NC_015155	AGA	2	6	1793	1798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972869
29	NC_015155	ATA	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972869
30	NC_015155	AGA	2	6	2153	2158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972869
31	NC_015155	ATA	2	6	2173	2178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972869
32	NC_015155	AAC	2	6	2227	2232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972869
33	NC_015155	ATA	2	6	2259	2264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972869
34	NC_015155	AAT	2	6	2291	2296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972869
35	NC_015155	GAA	3	9	2307	2315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972869
36	NC_015155	TCA	2	6	2462	2467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972870
37	NC_015155	GTA	2	6	2482	2487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972870
38	NC_015155	ATT	2	6	2567	2572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972870
39	NC_015155	AAT	3	9	2670	2678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972870
40	NC_015155	GAA	2	6	2793	2798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972870
41	NC_015155	TTG	2	6	2846	2851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972870
42	NC_015155	ATT	2	6	2863	2868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972870
43	NC_015155	AAT	2	6	2914	2919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972870
44	NC_015155	AGA	2	6	3047	3052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972870
45	NC_015155	ATT	2	6	3263	3268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972870
46	NC_015155	AGA	2	6	3269	3274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972870
47	NC_015155	AGA	4	12	3326	3337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972871
48	NC_015155	TCT	2	6	3338	3343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972871
49	NC_015155	AAG	2	6	3400	3405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972871
50	NC_015155	AGT	2	6	3411	3416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972871
51	NC_015155	TCT	2	6	3450	3455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972871
52	NC_015155	TCT	2	6	3519	3524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972871
53	NC_015155	GAA	2	6	3526	3531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972871
54	NC_015155	CTA	2	6	3535	3540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972871
55	NC_015155	ATT	2	6	3678	3683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972871
56	NC_015155	TAT	2	6	3785	3790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972871
57	NC_015155	CTT	2	6	3802	3807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972871
58	NC_015155	AGA	2	6	3839	3844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972871
59	NC_015155	ACT	2	6	3881	3886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972871
60	NC_015155	TAG	2	6	3898	3903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972871
61	NC_015155	CTA	2	6	3934	3939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972871
62	NC_015155	ACA	2	6	4054	4059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972871
63	NC_015155	ATT	2	6	4068	4073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972871
64	NC_015155	AAT	2	6	4092	4097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972871
65	NC_015155	CTA	2	6	4228	4233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972871
66	NC_015155	CAT	2	6	4271	4276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972871
67	NC_015155	AAG	2	6	4420	4425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972872
68	NC_015155	CTT	2	6	4444	4449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972872
69	NC_015155	AAC	2	6	4490	4495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972872
70	NC_015155	ATT	2	6	4502	4507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972872
71	NC_015155	TAA	2	6	4542	4547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972872
72	NC_015155	AGA	2	6	4566	4571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972872
73	NC_015155	TAA	2	6	4662	4667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972872
74	NC_015155	TCC	2	6	4699	4704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972872
75	NC_015155	TTC	2	6	4764	4769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972872
76	NC_015155	ACT	2	6	4777	4782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972872
77	NC_015155	AGA	2	6	4806	4811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972872
78	NC_015155	ATT	2	6	4827	4832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972872
79	NC_015155	AGT	2	6	4918	4923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972872
80	NC_015155	AAT	2	6	4953	4958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972872
81	NC_015155	AGA	2	6	5019	5024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972872
82	NC_015155	ATG	2	6	5038	5043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972872
83	NC_015155	CTT	2	6	5056	5061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972872
84	NC_015155	TCC	2	6	5103	5108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972872
85	NC_015155	TTA	2	6	5283	5288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972872
86	NC_015155	TCT	2	6	5341	5346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972872
87	NC_015155	GAA	2	6	5356	5361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972872
88	NC_015155	GAA	2	6	5412	5417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972872
89	NC_015155	CAA	2	6	5479	5484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972872
90	NC_015155	ATT	2	6	5488	5493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972872
91	NC_015155	AGA	2	6	5526	5531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972872
92	NC_015155	CAA	2	6	5603	5608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972872
93	NC_015155	TAA	2	6	5648	5653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972873
94	NC_015155	TTG	2	6	5678	5683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972873
95	NC_015155	CTT	2	6	5759	5764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972873
96	NC_015155	TAA	2	6	5840	5845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972873
97	NC_015155	ATT	2	6	5853	5858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972873
98	NC_015155	TGA	2	6	6421	6426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972875
99	NC_015155	AGA	2	6	6471	6476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972875
100	NC_015155	TCA	2	6	6479	6484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972875
101	NC_015155	TAA	2	6	6524	6529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972875
102	NC_015155	ATT	2	6	6550	6555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972875
103	NC_015155	TAC	2	6	6681	6686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972876
104	NC_015155	AGA	2	6	6728	6733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972876
105	NC_015155	TTC	2	6	6824	6829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972876
106	NC_015155	AGA	2	6	6854	6859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972876
107	NC_015155	GAT	2	6	6889	6894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972876
108	NC_015155	ACA	2	6	6959	6964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972876
109	NC_015155	GAA	2	6	7026	7031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972876
110	NC_015155	AAC	2	6	7082	7087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972876
111	NC_015155	TTC	2	6	7164	7169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972876
112	NC_015155	TGA	2	6	7298	7303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972876
113	NC_015155	GAT	2	6	7413	7418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972876
114	NC_015155	AGA	2	6	7445	7450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972876
115	NC_015155	AGA	3	9	7472	7480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972876
116	NC_015155	GTT	2	6	7581	7586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972876
117	NC_015155	GAT	2	6	7748	7753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972877
118	NC_015155	TAA	2	6	7764	7769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972877
119	NC_015155	GTA	2	6	7796	7801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972877
120	NC_015155	TGA	2	6	7819	7824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972877
121	NC_015155	GAA	2	6	7889	7894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972877
122	NC_015155	AAG	2	6	7895	7900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972877
123	NC_015155	AGT	2	6	7906	7911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972877
124	NC_015155	AGG	2	6	7921	7926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972877
125	NC_015155	AGT	2	6	7936	7941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972877
126	NC_015155	ATT	2	6	7964	7969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972877
127	NC_015155	AAT	2	6	8128	8133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972877
128	NC_015155	GAA	2	6	8165	8170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972877
129	NC_015155	GTT	2	6	8243	8248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972877
130	NC_015155	ATT	2	6	8300	8305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972877
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132	NC_015155	GTT	2	6	8427	8432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972878
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