MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mesorhizobium ciceri biovar biserrulae WSM1271 plasmid pMESCI01

Total Repeats: 267

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014918	CCAGA	2	10	5033	5042	40 %	0 %	20 %	40 %	319777794
2	NC_014918	TAGCC	2	10	5162	5171	20 %	20 %	20 %	40 %	319777794
3	NC_014918	TGCGC	2	10	6039	6048	0 %	20 %	40 %	40 %	319777796
4	NC_014918	CGGCC	2	10	10145	10154	0 %	0 %	40 %	60 %	319777800
5	NC_014918	GGTGA	2	10	11579	11588	20 %	20 %	60 %	0 %	319777801
6	NC_014918	TGCCT	2	10	12457	12466	0 %	40 %	20 %	40 %	319777802
7	NC_014918	ACCAG	2	10	13313	13322	40 %	0 %	20 %	40 %	319777803
8	NC_014918	CGGAT	2	10	13367	13376	20 %	20 %	40 %	20 %	319777803
9	NC_014918	GGGCC	2	10	17512	17521	0 %	0 %	60 %	40 %	319777806
10	NC_014918	CGGCC	2	10	18101	18110	0 %	0 %	40 %	60 %	319777807
11	NC_014918	GTGCA	2	10	24137	24146	20 %	20 %	40 %	20 %	319777812
12	NC_014918	CGAAC	2	10	27180	27189	40 %	0 %	20 %	40 %	319777814
13	NC_014918	GCACG	2	10	32043	32052	20 %	0 %	40 %	40 %	319777820
14	NC_014918	TGCCG	2	10	34258	34267	0 %	20 %	40 %	40 %	319777823
15	NC_014918	CCGGC	2	10	35814	35823	0 %	0 %	40 %	60 %	319777824
16	NC_014918	GGCAA	2	10	37707	37716	40 %	0 %	40 %	20 %	319777826
17	NC_014918	CAGCG	2	10	38016	38025	20 %	0 %	40 %	40 %	319777826
18	NC_014918	GCAGA	2	10	39183	39192	40 %	0 %	40 %	20 %	319777828
19	NC_014918	TGCAA	2	10	39541	39550	40 %	20 %	20 %	20 %	319777828
20	NC_014918	CATCG	2	10	40452	40461	20 %	20 %	20 %	40 %	319777829
21	NC_014918	TGATC	2	10	40658	40667	20 %	40 %	20 %	20 %	319777829
22	NC_014918	CCCTG	2	10	41318	41327	0 %	20 %	20 %	60 %	319777830
23	NC_014918	ATCCT	2	10	48267	48276	20 %	40 %	0 %	40 %	319777839
24	NC_014918	CGTGG	2	10	49303	49312	0 %	20 %	60 %	20 %	319777840
25	NC_014918	GGCGA	2	10	49706	49715	20 %	0 %	60 %	20 %	319777841
26	NC_014918	CGCGG	2	10	50880	50889	0 %	0 %	60 %	40 %	319777842
27	NC_014918	GAAGT	2	10	52129	52138	40 %	20 %	40 %	0 %	319777842
28	NC_014918	CCATC	2	10	53330	53339	20 %	20 %	0 %	60 %	319777843
29	NC_014918	TCCGG	2	10	56892	56901	0 %	20 %	40 %	40 %	319777846
30	NC_014918	GCCTG	2	10	60428	60437	0 %	20 %	40 %	40 %	319777850
31	NC_014918	GATCG	2	10	61069	61078	20 %	20 %	40 %	20 %	319777850
32	NC_014918	TCCGA	2	10	61198	61207	20 %	20 %	20 %	40 %	319777850
33	NC_014918	AGCAC	2	10	62155	62164	40 %	0 %	20 %	40 %	319777851
34	NC_014918	CCATC	2	10	70875	70884	20 %	20 %	0 %	60 %	319777859
35	NC_014918	CTCTC	2	10	71651	71660	0 %	40 %	0 %	60 %	319777860
36	NC_014918	GACGC	2	10	72408	72417	20 %	0 %	40 %	40 %	319777861
37	NC_014918	GAGCG	2	10	78006	78015	20 %	0 %	60 %	20 %	319777866
38	NC_014918	TGGAA	2	10	79978	79987	40 %	20 %	40 %	0 %	319777867
39	NC_014918	CGTTC	2	10	83215	83224	0 %	40 %	20 %	40 %	319777872
40	NC_014918	ACCAG	2	10	87320	87329	40 %	0 %	20 %	40 %	319777875
41	NC_014918	GGGCC	2	10	88439	88448	0 %	0 %	60 %	40 %	319777875
42	NC_014918	CGTGG	2	10	89074	89083	0 %	20 %	60 %	20 %	319777876
43	NC_014918	GGCGC	2	10	90029	90038	0 %	0 %	60 %	40 %	319777877
44	NC_014918	GCTCC	2	10	90683	90692	0 %	20 %	20 %	60 %	319777877
45	NC_014918	GCCAC	2	10	91400	91409	20 %	0 %	20 %	60 %	319777878
46	NC_014918	CGCGC	2	10	91490	91499	0 %	0 %	40 %	60 %	319777878
47	NC_014918	TTTCC	2	10	91899	91908	0 %	60 %	0 %	40 %	319777879
48	NC_014918	TTTCC	2	10	92057	92066	0 %	60 %	0 %	40 %	319777879
49	NC_014918	GCCTG	2	10	96493	96502	0 %	20 %	40 %	40 %	319777885
50	NC_014918	CTTCG	2	10	97533	97542	0 %	40 %	20 %	40 %	319777887
51	NC_014918	CATCA	2	10	99302	99311	40 %	20 %	0 %	40 %	319777888
52	NC_014918	GCTCG	2	10	99777	99786	0 %	20 %	40 %	40 %	319777888
53	NC_014918	GAGCC	2	10	102261	102270	20 %	0 %	40 %	40 %	319777890
54	NC_014918	TCCGC	2	10	109808	109817	0 %	20 %	20 %	60 %	319777898
55	NC_014918	GACCA	2	10	114331	114340	40 %	0 %	20 %	40 %	319777904
56	NC_014918	AGGTC	2	10	118031	118040	20 %	20 %	40 %	20 %	319777907
57	NC_014918	TCACC	2	10	118394	118403	20 %	20 %	0 %	60 %	319777907
58	NC_014918	GCACC	2	10	119209	119218	20 %	0 %	20 %	60 %	319777908
59	NC_014918	CGGGA	2	10	123009	123018	20 %	0 %	60 %	20 %	319777914
60	NC_014918	GGCAT	2	10	123908	123917	20 %	20 %	40 %	20 %	319777915
61	NC_014918	CGGCA	2	10	124543	124552	20 %	0 %	40 %	40 %	319777915
62	NC_014918	CCGGA	2	10	124967	124976	20 %	0 %	40 %	40 %	319777915
63	NC_014918	CGTGA	2	10	126317	126326	20 %	20 %	40 %	20 %	319777915
64	NC_014918	GATGC	2	10	127446	127455	20 %	20 %	40 %	20 %	319777918
65	NC_014918	GGCGG	2	10	132977	132986	0 %	0 %	80 %	20 %	319777926
66	NC_014918	TCGCG	2	10	134056	134065	0 %	20 %	40 %	40 %	319777927
67	NC_014918	GCCTT	2	10	135013	135022	0 %	40 %	20 %	40 %	319777928
68	NC_014918	CGGCG	2	10	135124	135133	0 %	0 %	60 %	40 %	319777928
69	NC_014918	AGCGC	2	10	138391	138400	20 %	0 %	40 %	40 %	319777931
70	NC_014918	GGGAG	2	10	139328	139337	20 %	0 %	80 %	0 %	319777933
71	NC_014918	TGGCT	2	10	139414	139423	0 %	40 %	40 %	20 %	319777933
72	NC_014918	ATCCG	2	10	140006	140015	20 %	20 %	20 %	40 %	319777933
73	NC_014918	ATGGC	2	10	140170	140179	20 %	20 %	40 %	20 %	319777934
74	NC_014918	ATTGC	2	10	141614	141623	20 %	40 %	20 %	20 %	319777936
75	NC_014918	AGCCT	2	10	141725	141734	20 %	20 %	20 %	40 %	319777937
76	NC_014918	GGCGC	2	10	142386	142395	0 %	0 %	60 %	40 %	319777938
77	NC_014918	GCCAG	2	10	145194	145203	20 %	0 %	40 %	40 %	319777939
78	NC_014918	TTGCG	2	10	145375	145384	0 %	40 %	40 %	20 %	319777940
79	NC_014918	CGTGG	2	10	145506	145515	0 %	20 %	60 %	20 %	319777940
80	NC_014918	TGGCA	2	10	145586	145595	20 %	20 %	40 %	20 %	319777940
81	NC_014918	ACGTC	2	10	146296	146305	20 %	20 %	20 %	40 %	319777941
82	NC_014918	CTTGC	2	10	147456	147465	0 %	40 %	20 %	40 %	319777942
83	NC_014918	CCGTG	2	10	147638	147647	0 %	20 %	40 %	40 %	319777942
84	NC_014918	CGATG	2	10	151812	151821	20 %	20 %	40 %	20 %	319777946
85	NC_014918	CGCCC	2	10	151960	151969	0 %	0 %	20 %	80 %	319777946
86	NC_014918	ATCCA	2	10	152959	152968	40 %	20 %	0 %	40 %	319777946
87	NC_014918	CCGAA	2	10	153744	153753	40 %	0 %	20 %	40 %	319777947
88	NC_014918	GAGCC	2	10	155298	155307	20 %	0 %	40 %	40 %	319777948
89	NC_014918	CGGCG	2	10	156400	156409	0 %	0 %	60 %	40 %	319777950
90	NC_014918	TGGTC	2	10	156668	156677	0 %	40 %	40 %	20 %	319777950
91	NC_014918	TGTCG	2	10	156710	156719	0 %	40 %	40 %	20 %	319777950
92	NC_014918	AGCGG	2	10	158172	158181	20 %	0 %	60 %	20 %	319777951
93	NC_014918	GTAGC	2	10	158448	158457	20 %	20 %	40 %	20 %	319777952
94	NC_014918	TCGGT	2	10	159769	159778	0 %	40 %	40 %	20 %	319777953
95	NC_014918	GCGAG	2	10	161635	161644	20 %	0 %	60 %	20 %	319777955
96	NC_014918	GCGCG	2	10	163727	163736	0 %	0 %	60 %	40 %	319777957
97	NC_014918	GCTAG	2	10	163924	163933	20 %	20 %	40 %	20 %	319777957
98	NC_014918	GGCGC	2	10	164060	164069	0 %	0 %	60 %	40 %	319777958
99	NC_014918	CTGGC	2	10	167997	168006	0 %	20 %	40 %	40 %	319777962
100	NC_014918	CCGGG	2	10	170145	170154	0 %	0 %	60 %	40 %	319777964
101	NC_014918	CAGGA	2	10	171351	171360	40 %	0 %	40 %	20 %	319777966
102	NC_014918	CTGGC	2	10	171373	171382	0 %	20 %	40 %	40 %	319777966
103	NC_014918	CTTCA	2	10	172771	172780	20 %	40 %	0 %	40 %	319777968
104	NC_014918	TTACC	2	10	173617	173626	20 %	40 %	0 %	40 %	319777968
105	NC_014918	CCGCG	2	10	175466	175475	0 %	0 %	40 %	60 %	319777970
106	NC_014918	AGGCG	2	10	176172	176181	20 %	0 %	60 %	20 %	319777971
107	NC_014918	CAGCC	2	10	176320	176329	20 %	0 %	20 %	60 %	319777971
108	NC_014918	GCGCT	2	10	176822	176831	0 %	20 %	40 %	40 %	319777972
109	NC_014918	GCGCC	2	10	179990	179999	0 %	0 %	40 %	60 %	319777975
110	NC_014918	ACGGC	2	10	180042	180051	20 %	0 %	40 %	40 %	319777975
111	NC_014918	GCGGG	2	10	181469	181478	0 %	0 %	80 %	20 %	319777976
112	NC_014918	GCATC	2	10	181784	181793	20 %	20 %	20 %	40 %	319777977
113	NC_014918	TCCGT	2	10	184011	184020	0 %	40 %	20 %	40 %	319777980
114	NC_014918	CCGTG	2	10	186235	186244	0 %	20 %	40 %	40 %	319777982
115	NC_014918	ATCGA	2	10	187919	187928	40 %	20 %	20 %	20 %	319777984
116	NC_014918	GCAAC	2	10	189619	189628	40 %	0 %	20 %	40 %	319777986
117	NC_014918	GAAAT	2	10	193899	193908	60 %	20 %	20 %	0 %	319777989
118	NC_014918	CGCCA	2	10	194637	194646	20 %	0 %	20 %	60 %	319777989
119	NC_014918	GGCCG	2	10	198491	198500	0 %	0 %	60 %	40 %	319777994
120	NC_014918	CGATA	2	10	199827	199836	40 %	20 %	20 %	20 %	319777997
121	NC_014918	CTGGT	2	10	199911	199920	0 %	40 %	40 %	20 %	319777997
122	NC_014918	GGCAA	2	10	200444	200453	40 %	0 %	40 %	20 %	319777998
123	NC_014918	TCACT	2	10	200903	200912	20 %	40 %	0 %	40 %	319777998
124	NC_014918	AACGG	2	10	202831	202840	40 %	0 %	40 %	20 %	319778000
125	NC_014918	GCGGT	2	10	207685	207694	0 %	20 %	60 %	20 %	319778004
126	NC_014918	AAGGC	2	10	208348	208357	40 %	0 %	40 %	20 %	319778004
127	NC_014918	TGTGG	2	10	208461	208470	0 %	40 %	60 %	0 %	319778004
128	NC_014918	GGGCG	2	10	208885	208894	0 %	0 %	80 %	20 %	319778005
129	NC_014918	CGGCT	2	10	210515	210524	0 %	20 %	40 %	40 %	319778006
130	NC_014918	GTGCT	2	10	211180	211189	0 %	40 %	40 %	20 %	319778007
131	NC_014918	GGGTT	2	10	216478	216487	0 %	40 %	60 %	0 %	319778011
132	NC_014918	CCTGC	2	10	221159	221168	0 %	20 %	20 %	60 %	319778015
133	NC_014918	ATCGC	2	10	222750	222759	20 %	20 %	20 %	40 %	319778017
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260	NC_014918	GACTG	2	10	416268	416277	20 %	20 %	40 %	20 %	319778171
261	NC_014918	TGGGC	2	10	417236	417245	0 %	20 %	60 %	20 %	319778172
262	NC_014918	TCCGG	2	10	417599	417608	0 %	20 %	40 %	40 %	319778173
263	NC_014918	CCATC	2	10	419107	419116	20 %	20 %	0 %	60 %	319778176
264	NC_014918	CGCGG	2	10	419146	419155	0 %	0 %	60 %	40 %	319778176
265	NC_014918	CGTCC	2	10	419667	419676	0 %	20 %	20 %	60 %	319778176
266	NC_014918	CATCG	2	10	425017	425026	20 %	20 %	20 %	40 %	319778183
267	NC_014918	GCTGG	2	10	425136	425145	0 %	20 %	60 %	20 %	319778183

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.