MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium gilvum Spyr1 plasmid pMSPYR101

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014811	GCGCT	2	10	3093	3102	0 %	20 %	40 %	40 %	315441478
2	NC_014811	TCGAC	2	10	5438	5447	20 %	20 %	20 %	40 %	315441480
3	NC_014811	GTCAT	2	10	6996	7005	20 %	40 %	20 %	20 %	315441482
4	NC_014811	TTGCC	2	10	7569	7578	0 %	40 %	20 %	40 %	315441482
5	NC_014811	CACGC	2	10	7871	7880	20 %	0 %	20 %	60 %	315441483
6	NC_014811	CAGCG	3	15	12825	12839	20 %	0 %	40 %	40 %	315441487
7	NC_014811	GGGGT	2	10	14495	14504	0 %	20 %	80 %	0 %	315441488
8	NC_014811	TGCGA	2	10	15892	15901	20 %	20 %	40 %	20 %	315441489
9	NC_014811	CGACG	2	10	16006	16015	20 %	0 %	40 %	40 %	315441489
10	NC_014811	GGGCG	2	10	23448	23457	0 %	0 %	80 %	20 %	315441500
11	NC_014811	CCAGC	2	10	26556	26565	20 %	0 %	20 %	60 %	315441503
12	NC_014811	CCGGT	2	10	26698	26707	0 %	20 %	40 %	40 %	315441503
13	NC_014811	ATCCC	2	10	27567	27576	20 %	20 %	0 %	60 %	315441505
14	NC_014811	TTGAT	2	10	27718	27727	20 %	60 %	20 %	0 %	315441505
15	NC_014811	CGAGA	2	10	30738	30747	40 %	0 %	40 %	20 %	315441508
16	NC_014811	GTCGA	2	10	32087	32096	20 %	20 %	40 %	20 %	315441509
17	NC_014811	GGCCC	2	10	33209	33218	0 %	0 %	40 %	60 %	315441510
18	NC_014811	CGGAT	2	10	34024	34033	20 %	20 %	40 %	20 %	315441510
19	NC_014811	TCGTG	2	10	34563	34572	0 %	40 %	40 %	20 %	315441511
20	NC_014811	CGGTG	2	10	35350	35359	0 %	20 %	60 %	20 %	315441511
21	NC_014811	CCCGG	2	10	35779	35788	0 %	0 %	40 %	60 %	315441511
22	NC_014811	GCGTC	2	10	38726	38735	0 %	20 %	40 %	40 %	315441513
23	NC_014811	GAAGT	2	10	39023	39032	40 %	20 %	40 %	0 %	315441513
24	NC_014811	CGCTT	2	10	42056	42065	0 %	40 %	20 %	40 %	315441517
25	NC_014811	AGCCG	2	10	46640	46649	20 %	0 %	40 %	40 %	315441520
26	NC_014811	GGCGG	2	10	56279	56288	0 %	0 %	80 %	20 %	315441527
27	NC_014811	AGCCA	2	10	57228	57237	40 %	0 %	20 %	40 %	315441528
28	NC_014811	AAGTC	2	10	62950	62959	40 %	20 %	20 %	20 %	315441531
29	NC_014811	GGCGA	2	10	63012	63021	20 %	0 %	60 %	20 %	315441531
30	NC_014811	AGGTC	2	10	63437	63446	20 %	20 %	40 %	20 %	315441532
31	NC_014811	TGGTG	2	10	66692	66701	0 %	40 %	60 %	0 %	315441534
32	NC_014811	TCGCT	2	10	67211	67220	0 %	40 %	20 %	40 %	315441534
33	NC_014811	TCGGG	2	10	67518	67527	0 %	20 %	60 %	20 %	315441535
34	NC_014811	TCGGG	2	10	68299	68308	0 %	20 %	60 %	20 %	315441535
35	NC_014811	AGGCC	2	10	72293	72302	20 %	0 %	40 %	40 %	315441537
36	NC_014811	ATCGG	2	10	72772	72781	20 %	20 %	40 %	20 %	315441538
37	NC_014811	GGGCA	2	10	72803	72812	20 %	0 %	60 %	20 %	315441538
38	NC_014811	GTCGC	2	10	72841	72850	0 %	20 %	40 %	40 %	315441538
39	NC_014811	TCGGC	2	10	73063	73072	0 %	20 %	40 %	40 %	315441538
40	NC_014811	ACCGA	2	10	75908	75917	40 %	0 %	20 %	40 %	315441540
41	NC_014811	ACCGA	2	10	77097	77106	40 %	0 %	20 %	40 %	315441541
42	NC_014811	GCATT	2	10	77466	77475	20 %	40 %	20 %	20 %	315441541
43	NC_014811	CAAGC	2	10	78942	78951	40 %	0 %	20 %	40 %	315441542
44	NC_014811	CGGGC	2	10	78971	78980	0 %	0 %	60 %	40 %	315441542
45	NC_014811	GTCAG	2	10	80546	80555	20 %	20 %	40 %	20 %	315441544
46	NC_014811	CGGGC	2	10	80925	80934	0 %	0 %	60 %	40 %	315441544
47	NC_014811	GACAT	2	10	82109	82118	40 %	20 %	20 %	20 %	315441545
48	NC_014811	CGTTG	2	10	83624	83633	0 %	40 %	40 %	20 %	315441547
49	NC_014811	ACTGG	2	10	86294	86303	20 %	20 %	40 %	20 %	315441549
50	NC_014811	GCGGG	2	10	86883	86892	0 %	0 %	80 %	20 %	315441549
51	NC_014811	GCGCC	2	10	90115	90124	0 %	0 %	40 %	60 %	315441553
52	NC_014811	GTGAT	2	10	93000	93009	20 %	40 %	40 %	0 %	315441558
53	NC_014811	GTGGA	2	10	93591	93600	20 %	20 %	60 %	0 %	315441559
54	NC_014811	CGGCA	2	10	95314	95323	20 %	0 %	40 %	40 %	315441561
55	NC_014811	ACGCG	2	10	96639	96648	20 %	0 %	40 %	40 %	315441563
56	NC_014811	TAGCG	2	10	98476	98485	20 %	20 %	40 %	20 %	315441566
57	NC_014811	CGGCG	2	10	99255	99264	0 %	0 %	60 %	40 %	315441566
58	NC_014811	TGCGC	2	10	100343	100352	0 %	20 %	40 %	40 %	315441567
59	NC_014811	GCCAA	2	10	100885	100894	40 %	0 %	20 %	40 %	315441568
60	NC_014811	GCGCG	2	10	101032	101041	0 %	0 %	60 %	40 %	315441568
61	NC_014811	AGCGC	2	10	102929	102938	20 %	0 %	40 %	40 %	315441571
62	NC_014811	CCGCG	2	10	110341	110350	0 %	0 %	40 %	60 %	315441578
63	NC_014811	GCCGG	2	10	111507	111516	0 %	0 %	60 %	40 %	315441580
64	NC_014811	CGCAC	2	10	111935	111944	20 %	0 %	20 %	60 %	315441580
65	NC_014811	CACGA	2	10	112724	112733	40 %	0 %	20 %	40 %	315441580
66	NC_014811	CGGTG	2	10	114753	114762	0 %	20 %	60 %	20 %	315441581
67	NC_014811	GATGA	2	10	119179	119188	40 %	20 %	40 %	0 %	315441585
68	NC_014811	GCTGG	2	10	119382	119391	0 %	20 %	60 %	20 %	315441585
69	NC_014811	AACGC	2	10	119603	119612	40 %	0 %	20 %	40 %	315441585
70	NC_014811	GCGCG	2	10	120114	120123	0 %	0 %	60 %	40 %	315441585
71	NC_014811	CTTGT	2	10	122538	122547	0 %	60 %	20 %	20 %	315441588
72	NC_014811	CCCAC	2	10	123363	123372	20 %	0 %	0 %	80 %	315441589
73	NC_014811	CCCAC	2	10	123381	123390	20 %	0 %	0 %	80 %	315441589
74	NC_014811	GACGT	2	10	123603	123612	20 %	20 %	40 %	20 %	315441589
75	NC_014811	GCCGG	2	10	131106	131115	0 %	0 %	60 %	40 %	315441593
76	NC_014811	CGCAC	2	10	131565	131574	20 %	0 %	20 %	60 %	315441593
77	NC_014811	GCCGG	2	10	137595	137604	0 %	0 %	60 %	40 %	315441597
78	NC_014811	CGCAC	2	10	138023	138032	20 %	0 %	20 %	60 %	315441597
79	NC_014811	CACGA	2	10	138812	138821	40 %	0 %	20 %	40 %	315441597
80	NC_014811	CAGCC	2	10	143924	143933	20 %	0 %	20 %	60 %	315441600
81	NC_014811	GCCAC	2	10	144058	144067	20 %	0 %	20 %	60 %	315441600
82	NC_014811	GCCCG	2	10	144273	144282	0 %	0 %	40 %	60 %	315441600
83	NC_014811	GTGCT	2	10	146168	146177	0 %	40 %	40 %	20 %	315441602
84	NC_014811	GTCGC	2	10	146973	146982	0 %	20 %	40 %	40 %	315441603
85	NC_014811	GGCGC	2	10	147019	147028	0 %	0 %	60 %	40 %	315441603
86	NC_014811	CGGCG	2	10	147138	147147	0 %	0 %	60 %	40 %	315441603
87	NC_014811	CGGCC	2	10	151925	151934	0 %	0 %	40 %	60 %	315441605
88	NC_014811	GCCGC	2	10	152121	152130	0 %	0 %	40 %	60 %	315441605
89	NC_014811	CTCGT	2	10	154129	154138	0 %	40 %	20 %	40 %	315441605
90	NC_014811	GATCA	2	10	155432	155441	40 %	20 %	20 %	20 %	315441606
91	NC_014811	CAGTC	2	10	155890	155899	20 %	20 %	20 %	40 %	315441606
92	NC_014811	TCGAC	2	10	155986	155995	20 %	20 %	20 %	40 %	315441606
93	NC_014811	CGCGG	2	10	156905	156914	0 %	0 %	60 %	40 %	315441608
94	NC_014811	GATCG	2	10	158202	158211	20 %	20 %	40 %	20 %	315441609
95	NC_014811	TCGCG	2	10	159633	159642	0 %	20 %	40 %	40 %	315441611
96	NC_014811	TGCGC	2	10	159858	159867	0 %	20 %	40 %	40 %	315441611
97	NC_014811	GGGGT	2	10	161150	161159	0 %	20 %	80 %	0 %	315441613
98	NC_014811	TCGGC	2	10	161280	161289	0 %	20 %	40 %	40 %	315441613
99	NC_014811	CAGGC	2	10	161427	161436	20 %	0 %	40 %	40 %	315441613
100	NC_014811	ACACC	2	10	161778	161787	40 %	0 %	0 %	60 %	315441614
101	NC_014811	GCGGG	2	10	161825	161834	0 %	0 %	80 %	20 %	315441614
102	NC_014811	CAGGG	2	10	162682	162691	20 %	0 %	60 %	20 %	315441615
103	NC_014811	GATCG	2	10	164232	164241	20 %	20 %	40 %	20 %	315441616
104	NC_014811	GGCGC	2	10	164915	164924	0 %	0 %	60 %	40 %	315441617
105	NC_014811	AGTCG	2	10	166685	166694	20 %	20 %	40 %	20 %	315441620
106	NC_014811	GATCG	2	10	168350	168359	20 %	20 %	40 %	20 %	315441622
107	NC_014811	AGGTC	2	10	168931	168940	20 %	20 %	40 %	20 %	315441623
108	NC_014811	CGTCG	2	10	171063	171072	0 %	20 %	40 %	40 %	315441625
109	NC_014811	GTCGG	2	10	171223	171232	0 %	20 %	60 %	20 %	315441626
110	NC_014811	CGCAC	2	10	174689	174698	20 %	0 %	20 %	60 %	315441631
111	NC_014811	TTGCA	2	10	176025	176034	20 %	40 %	20 %	20 %	315441633
112	NC_014811	ACCGC	2	10	179421	179430	20 %	0 %	20 %	60 %	315441635
113	NC_014811	GCGGG	2	10	179572	179581	0 %	0 %	80 %	20 %	315441635
114	NC_014811	TCCCG	2	10	180579	180588	0 %	20 %	20 %	60 %	315441637
115	NC_014811	CTGGC	2	10	181498	181507	0 %	20 %	40 %	40 %	315441637
116	NC_014811	CGGCG	2	10	186604	186613	0 %	0 %	60 %	40 %	315441641
117	NC_014811	CGGGG	2	10	187458	187467	0 %	0 %	80 %	20 %	315441642
118	NC_014811	CGCAG	2	10	187860	187869	20 %	0 %	40 %	40 %	315441642
119	NC_014811	CAGCG	2	10	189257	189266	20 %	0 %	40 %	40 %	315441645
120	NC_014811	GGGCG	2	10	189278	189287	0 %	0 %	80 %	20 %	315441645
121	NC_014811	GCAAG	2	10	190224	190233	40 %	0 %	40 %	20 %	315441646
122	NC_014811	CCGCG	2	10	192328	192337	0 %	0 %	40 %	60 %	315441649
123	NC_014811	GCGTG	2	10	195324	195333	0 %	20 %	60 %	20 %	315441652
124	NC_014811	ATCGG	2	10	198149	198158	20 %	20 %	40 %	20 %	315441656
125	NC_014811	GCCTG	2	10	198167	198176	0 %	20 %	40 %	40 %	315441656
126	NC_014811	CGGTG	2	10	202780	202789	0 %	20 %	60 %	20 %	315441661
127	NC_014811	ATCGC	2	10	205141	205150	20 %	20 %	20 %	40 %	315441663
128	NC_014811	ACCAC	2	10	205837	205846	40 %	0 %	0 %	60 %	315441663
129	NC_014811	ATGGC	2	10	209130	209139	20 %	20 %	40 %	20 %	315441668
130	NC_014811	CGCGC	2	10	209438	209447	0 %	0 %	40 %	60 %	315441668
131	NC_014811	GACAG	2	10	210653	210662	40 %	0 %	40 %	20 %	315441670

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.