MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanothermus fervidus DSM 2088 chromosome

Total Repeats: 30373

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014658	TG	3	6	89	94	0 %	50 %	50 %	0 %	312136231
2	NC_014658	GCT	2	6	127	132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136231
3	NC_014658	A	6	6	223	228	100 %	0 %	0 %	0 %	312136231
4	NC_014658	TGA	2	6	243	248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136231
5	NC_014658	AGTA	2	8	249	256	50 %	25 %	25 %	0 %	312136231
6	NC_014658	T	6	6	267	272	0 %	100 %	0 %	0 %	312136231
7	NC_014658	TCC	2	6	324	329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136231
8	NC_014658	CA	3	6	330	335	50 %	0 %	0 %	50 %	312136231
9	NC_014658	CTCA	2	8	350	357	25 %	25 %	0 %	50 %	312136231
10	NC_014658	TAA	2	6	363	368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136231
11	NC_014658	GTT	2	6	376	381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136231
12	NC_014658	TAT	2	6	393	398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136231
13	NC_014658	AAAG	2	8	417	424	75 %	0 %	25 %	0 %	312136231
14	NC_014658	TAA	2	6	428	433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136231
15	NC_014658	AAG	2	6	434	439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136231
16	NC_014658	AAAG	2	8	502	509	75 %	0 %	25 %	0 %	312136231
17	NC_014658	AGA	2	6	519	524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136231
18	NC_014658	TAA	2	6	572	577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136231
19	NC_014658	ATA	2	6	601	606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136231
20	NC_014658	GTT	2	6	631	636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136231
21	NC_014658	T	7	7	656	662	0 %	100 %	0 %	0 %	312136231
22	NC_014658	CAG	2	6	677	682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136231
23	NC_014658	AAAT	2	8	696	703	75 %	25 %	0 %	0 %	312136231
24	NC_014658	GA	4	8	718	725	50 %	0 %	50 %	0 %	312136231
25	NC_014658	ATG	3	9	743	751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136231
26	NC_014658	ATT	2	6	778	783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136231
27	NC_014658	A	6	6	916	921	100 %	0 %	0 %	0 %	312136231
28	NC_014658	A	6	6	928	933	100 %	0 %	0 %	0 %	312136231
29	NC_014658	A	6	6	936	941	100 %	0 %	0 %	0 %	312136231
30	NC_014658	TTG	2	6	959	964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136231
31	NC_014658	TAG	2	6	992	997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136231
32	NC_014658	TCAG	2	8	1110	1117	25 %	25 %	25 %	25 %	312136231
33	NC_014658	AAAT	2	8	1158	1165	75 %	25 %	0 %	0 %	312136231
34	NC_014658	GTT	2	6	1189	1194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136231
35	NC_014658	TGC	2	6	1260	1265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136231
36	NC_014658	AAT	2	6	1335	1340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136231
37	NC_014658	A	7	7	1351	1357	100 %	0 %	0 %	0 %	312136231
38	NC_014658	AAAAT	2	10	1391	1400	80 %	20 %	0 %	0 %	312136231
39	NC_014658	ATG	2	6	1433	1438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136231
40	NC_014658	ACTTAA	2	12	1488	1499	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	312136231
41	NC_014658	GCA	2	6	1531	1536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136231
42	NC_014658	AGA	2	6	1569	1574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136231
43	NC_014658	AGA	2	6	1638	1643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136231
44	NC_014658	TTTC	2	8	1750	1757	0 %	75 %	0 %	25 %	312136231
45	NC_014658	AGT	2	6	1865	1870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136231
46	NC_014658	TGA	2	6	1889	1894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136232
47	NC_014658	TGA	2	6	1902	1907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136232
48	NC_014658	A	6	6	1939	1944	100 %	0 %	0 %	0 %	312136232
49	NC_014658	ATC	2	6	1952	1957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136232
50	NC_014658	T	6	6	1959	1964	0 %	100 %	0 %	0 %	312136232
51	NC_014658	AAG	2	6	2021	2026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136232
52	NC_014658	ACC	2	6	2043	2048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136232
53	NC_014658	TAACA	2	10	2049	2058	60 %	20 %	0 %	20 %	312136232
54	NC_014658	GAAA	2	8	2118	2125	75 %	0 %	25 %	0 %	312136232
55	NC_014658	AT	3	6	2151	2156	50 %	50 %	0 %	0 %	312136232
56	NC_014658	ATG	2	6	2294	2299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136232
57	NC_014658	TGA	2	6	2325	2330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136232
58	NC_014658	AT	3	6	2336	2341	50 %	50 %	0 %	0 %	312136232
59	NC_014658	GGAC	2	8	2358	2365	25 %	0 %	50 %	25 %	312136232
60	NC_014658	AC	3	6	2372	2377	50 %	0 %	0 %	50 %	312136232
61	NC_014658	AGT	2	6	2458	2463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136232
62	NC_014658	AG	3	6	2473	2478	50 %	0 %	50 %	0 %	312136232
63	NC_014658	CCA	2	6	2488	2493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136232
64	NC_014658	AGA	2	6	2523	2528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136232
65	NC_014658	A	8	8	2548	2555	100 %	0 %	0 %	0 %	312136232
66	NC_014658	GAT	2	6	2566	2571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136232
67	NC_014658	GCA	2	6	2587	2592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136232
68	NC_014658	AGC	2	6	2595	2600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136232
69	NC_014658	AGA	2	6	2604	2609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136232
70	NC_014658	ATA	2	6	2726	2731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136232
71	NC_014658	TTTA	2	8	2792	2799	25 %	75 %	0 %	0 %	312136232
72	NC_014658	GAA	2	6	2812	2817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136232
73	NC_014658	A	6	6	2848	2853	100 %	0 %	0 %	0 %	312136232
74	NC_014658	AGA	2	6	2884	2889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136232
75	NC_014658	ATT	2	6	2916	2921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136232
76	NC_014658	TAGAGG	2	12	2949	2960	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	312136232
77	NC_014658	ATA	2	6	2977	2982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136232
78	NC_014658	AGA	2	6	3009	3014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136232
79	NC_014658	TAAT	2	8	3031	3038	50 %	50 %	0 %	0 %	312136232
80	NC_014658	TTCC	2	8	3169	3176	0 %	50 %	0 %	50 %	312136233
81	NC_014658	TCTT	2	8	3239	3246	0 %	75 %	0 %	25 %	312136233
82	NC_014658	ATA	2	6	3265	3270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136233
83	NC_014658	ATC	2	6	3278	3283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136233
84	NC_014658	TCT	2	6	3339	3344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136233
85	NC_014658	TCT	2	6	3351	3356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136233
86	NC_014658	AATG	2	8	3423	3430	50 %	25 %	25 %	0 %	312136233
87	NC_014658	TTC	2	6	3436	3441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136233
88	NC_014658	ATTT	2	8	3479	3486	25 %	75 %	0 %	0 %	312136233
89	NC_014658	TA	3	6	3508	3513	50 %	50 %	0 %	0 %	312136233
90	NC_014658	AGG	2	6	3519	3524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312136233
91	NC_014658	CAA	2	6	3577	3582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136233
92	NC_014658	CCT	2	6	3729	3734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136233
93	NC_014658	CAT	2	6	3791	3796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136233
94	NC_014658	TCT	2	6	3829	3834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136233
95	NC_014658	T	8	8	3890	3897	0 %	100 %	0 %	0 %	312136233
96	NC_014658	TTTTAA	2	12	3923	3934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136233
97	NC_014658	TTG	2	6	4084	4089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136234
98	NC_014658	GCA	2	6	4092	4097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136234
99	NC_014658	TGG	2	6	4151	4156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136234
100	NC_014658	ATT	2	6	4196	4201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136234
101	NC_014658	GTA	2	6	4210	4215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136234
102	NC_014658	ATTT	2	8	4224	4231	25 %	75 %	0 %	0 %	312136235
103	NC_014658	CTA	2	6	4258	4263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136235
104	NC_014658	TCA	2	6	4269	4274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136235
105	NC_014658	ATT	2	6	4316	4321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136235
106	NC_014658	TAT	2	6	4373	4378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136235
107	NC_014658	AACAGG	2	12	4493	4504	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	312136235
108	NC_014658	TCA	2	6	4518	4523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136235
109	NC_014658	T	6	6	4556	4561	0 %	100 %	0 %	0 %	312136235
110	NC_014658	AAT	2	6	4567	4572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136235
111	NC_014658	CTA	2	6	4573	4578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136235
112	NC_014658	T	6	6	4579	4584	0 %	100 %	0 %	0 %	312136235
113	NC_014658	CCT	2	6	4599	4604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136235
114	NC_014658	AATTA	2	10	4613	4622	60 %	40 %	0 %	0 %	312136235
115	NC_014658	TCA	2	6	4638	4643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136235
116	NC_014658	CAT	2	6	4666	4671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136235
117	NC_014658	TTC	2	6	4673	4678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136235
118	NC_014658	TGT	2	6	4682	4687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136235
119	NC_014658	T	6	6	4704	4709	0 %	100 %	0 %	0 %	312136235
120	NC_014658	TGAT	2	8	4721	4728	25 %	50 %	25 %	0 %	312136235
121	NC_014658	AAG	2	6	4729	4734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136235
122	NC_014658	CCTTT	2	10	4760	4769	0 %	60 %	0 %	40 %	312136235
123	NC_014658	TGT	2	6	4805	4810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136235
124	NC_014658	ACT	2	6	4827	4832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136235
125	NC_014658	TAA	2	6	4925	4930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136236
126	NC_014658	ATCT	2	8	4996	5003	25 %	50 %	0 %	25 %	312136236
127	NC_014658	TGTT	2	8	5049	5056	0 %	75 %	25 %	0 %	312136236
128	NC_014658	TCG	2	6	5083	5088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136236
129	NC_014658	CAA	2	6	5146	5151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136236
130	NC_014658	TAT	2	6	5210	5215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136236
131	NC_014658	CTTT	2	8	5311	5318	0 %	75 %	0 %	25 %	312136236
132	NC_014658	T	6	6	5324	5329	0 %	100 %	0 %	0 %	312136236
133	NC_014658	TTA	2	6	5341	5346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136236
134	NC_014658	TC	3	6	5348	5353	0 %	50 %	0 %	50 %	312136236
135	NC_014658	TTCC	2	8	5356	5363	0 %	50 %	0 %	50 %	312136236
136	NC_014658	T	6	6	5381	5386	0 %	100 %	0 %	0 %	312136237
137	NC_014658	GCT	2	6	5422	5427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136237
138	NC_014658	TCCT	2	8	5464	5471	0 %	50 %	0 %	50 %	312136237
139	NC_014658	AT	3	6	5503	5508	50 %	50 %	0 %	0 %	312136237
140	NC_014658	T	7	7	5552	5558	0 %	100 %	0 %	0 %	312136237
141	NC_014658	CAT	3	9	5601	5609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136237
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143	NC_014658	CTG	2	6	5710	5715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136237
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146	NC_014658	TTC	2	6	5775	5780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136237
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148	NC_014658	TTA	2	6	5810	5815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136237
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151	NC_014658	TTA	2	6	5966	5971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136237
152	NC_014658	TGTCTG	2	12	5972	5983	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	312136237
153	NC_014658	T	6	6	6034	6039	0 %	100 %	0 %	0 %	312136237
154	NC_014658	CAT	2	6	6065	6070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136237
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159	NC_014658	ATTT	2	8	6185	6192	25 %	75 %	0 %	0 %	312136237
160	NC_014658	ACA	2	6	6205	6210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136237
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162	NC_014658	T	6	6	6279	6284	0 %	100 %	0 %	0 %	312136237
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165	NC_014658	TG	3	6	6387	6392	0 %	50 %	50 %	0 %	312136237
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260	NC_014658	AGG	2	6	9923	9928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312136239
261	NC_014658	AAATA	2	10	9932	9941	80 %	20 %	0 %	0 %	312136239
262	NC_014658	ATA	2	6	9981	9986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136239
263	NC_014658	AAT	2	6	10008	10013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136239
264	NC_014658	CTT	2	6	10084	10089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136239
265	NC_014658	CCAT	2	8	10188	10195	25 %	25 %	0 %	50 %	312136239
266	NC_014658	TAAAAT	2	12	10223	10234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136239
267	NC_014658	GTA	2	6	10348	10353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136240
268	NC_014658	AAC	2	6	10354	10359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136240
269	NC_014658	TTAT	2	8	10360	10367	25 %	75 %	0 %	0 %	312136240
270	NC_014658	GCT	2	6	10416	10421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136240
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272	NC_014658	GTT	2	6	10446	10451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136240
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