MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanothermus fervidus DSM 2088 chromosome

Total Repeats: 30373

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_014658	AAT	2	6	260900	260905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136499
6502	NC_014658	TCA	2	6	260952	260957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136499
6503	NC_014658	TCC	3	9	261029	261037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136499
6504	NC_014658	T	7	7	261065	261071	0 %	100 %	0 %	0 %	312136499
6505	NC_014658	T	7	7	261141	261147	0 %	100 %	0 %	0 %	312136499
6506	NC_014658	ATT	4	12	261174	261185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136499
6507	NC_014658	GCT	2	6	261186	261191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136499
6508	NC_014658	ATT	2	6	261192	261197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136499
6509	NC_014658	T	6	6	261209	261214	0 %	100 %	0 %	0 %	312136499
6510	NC_014658	T	7	7	261220	261226	0 %	100 %	0 %	0 %	312136499
6511	NC_014658	AGAAA	2	10	261393	261402	80 %	0 %	20 %	0 %	312136500
6512	NC_014658	TGG	2	6	261521	261526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136500
6513	NC_014658	TG	3	6	261535	261540	0 %	50 %	50 %	0 %	312136500
6514	NC_014658	ATT	2	6	261557	261562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136500
6515	NC_014658	A	7	7	261587	261593	100 %	0 %	0 %	0 %	312136500
6516	NC_014658	TCT	2	6	261612	261617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136500
6517	NC_014658	AGA	2	6	261626	261631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136500
6518	NC_014658	T	6	6	261666	261671	0 %	100 %	0 %	0 %	312136500
6519	NC_014658	AG	3	6	261689	261694	50 %	0 %	50 %	0 %	312136500
6520	NC_014658	TA	3	6	261705	261710	50 %	50 %	0 %	0 %	312136500
6521	NC_014658	AT	3	6	261770	261775	50 %	50 %	0 %	0 %	312136500
6522	NC_014658	A	6	6	261777	261782	100 %	0 %	0 %	0 %	312136500
6523	NC_014658	TGT	2	6	261798	261803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136500
6524	NC_014658	ATG	2	6	261856	261861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136500
6525	NC_014658	AAAG	2	8	261938	261945	75 %	0 %	25 %	0 %	312136500
6526	NC_014658	AT	3	6	261968	261973	50 %	50 %	0 %	0 %	312136500
6527	NC_014658	AGA	3	9	261998	262006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136500
6528	NC_014658	CCT	2	6	262137	262142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136500
6529	NC_014658	TAAA	2	8	262168	262175	75 %	25 %	0 %	0 %	312136500
6530	NC_014658	AAT	2	6	262202	262207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136500
6531	NC_014658	A	7	7	262271	262277	100 %	0 %	0 %	0 %	312136500
6532	NC_014658	TAA	2	6	262279	262284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136500
6533	NC_014658	ATGTAA	2	12	262325	262336	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	312136500
6534	NC_014658	A	6	6	262335	262340	100 %	0 %	0 %	0 %	312136500
6535	NC_014658	ATA	2	6	262389	262394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136500
6536	NC_014658	CATT	2	8	262400	262407	25 %	50 %	0 %	25 %	312136500
6537	NC_014658	GTT	2	6	262421	262426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136501
6538	NC_014658	A	6	6	262467	262472	100 %	0 %	0 %	0 %	312136501
6539	NC_014658	A	6	6	262494	262499	100 %	0 %	0 %	0 %	312136501
6540	NC_014658	A	7	7	262506	262512	100 %	0 %	0 %	0 %	312136501
6541	NC_014658	A	7	7	262514	262520	100 %	0 %	0 %	0 %	312136501
6542	NC_014658	ATT	2	6	262535	262540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136501
6543	NC_014658	ATC	2	6	262552	262557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136501
6544	NC_014658	AGG	2	6	262590	262595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312136501
6545	NC_014658	TAAT	2	8	262624	262631	50 %	50 %	0 %	0 %	312136501
6546	NC_014658	TAA	2	6	262649	262654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136501
6547	NC_014658	AT	3	6	262671	262676	50 %	50 %	0 %	0 %	312136501
6548	NC_014658	TA	3	6	262700	262705	50 %	50 %	0 %	0 %	312136501
6549	NC_014658	ATT	2	6	262766	262771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136501
6550	NC_014658	TAAAAA	2	12	262772	262783	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	312136501
6551	NC_014658	A	7	7	262779	262785	100 %	0 %	0 %	0 %	312136501
6552	NC_014658	TCT	2	6	262802	262807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136501
6553	NC_014658	TAA	2	6	262837	262842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136501
6554	NC_014658	TTGT	2	8	262863	262870	0 %	75 %	25 %	0 %	312136501
6555	NC_014658	GT	3	6	262940	262945	0 %	50 %	50 %	0 %	312136501
6556	NC_014658	TTG	2	6	262948	262953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136501
6557	NC_014658	ATCT	2	8	263003	263010	25 %	50 %	0 %	25 %	312136501
6558	NC_014658	AAT	2	6	263048	263053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136501
6559	NC_014658	AAAAT	2	10	263065	263074	80 %	20 %	0 %	0 %	312136501
6560	NC_014658	A	6	6	263082	263087	100 %	0 %	0 %	0 %	312136501
6561	NC_014658	TAA	2	6	263100	263105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136501
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6563	NC_014658	TTTTA	2	10	263204	263213	20 %	80 %	0 %	0 %	312136502
6564	NC_014658	ATC	2	6	263222	263227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136502
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6567	NC_014658	TAA	2	6	263306	263311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136502
6568	NC_014658	TGG	3	9	263363	263371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136502
6569	NC_014658	GCT	2	6	263379	263384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136502
6570	NC_014658	TCA	2	6	263433	263438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136502
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6572	NC_014658	CTT	2	6	263503	263508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136502
6573	NC_014658	AGC	2	6	263522	263527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136502
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6575	NC_014658	CAT	2	6	263594	263599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136502
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6578	NC_014658	T	6	6	263677	263682	0 %	100 %	0 %	0 %	312136502
6579	NC_014658	TTG	2	6	263704	263709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136502
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6581	NC_014658	TTG	2	6	263899	263904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136502
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6588	NC_014658	ATA	2	6	264381	264386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136503
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6590	NC_014658	ATTC	2	8	264440	264447	25 %	50 %	0 %	25 %	312136503
6591	NC_014658	TCC	2	6	264454	264459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136503
6592	NC_014658	CTACA	2	10	264488	264497	40 %	20 %	0 %	40 %	312136503
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6595	NC_014658	TGG	2	6	264637	264642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136503
6596	NC_014658	T	6	6	264703	264708	0 %	100 %	0 %	0 %	312136503
6597	NC_014658	TA	3	6	264723	264728	50 %	50 %	0 %	0 %	312136503
6598	NC_014658	ATT	2	6	264740	264745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136503
6599	NC_014658	T	6	6	264758	264763	0 %	100 %	0 %	0 %	312136503
6600	NC_014658	A	8	8	264789	264796	100 %	0 %	0 %	0 %	312136503
6601	NC_014658	T	6	6	264820	264825	0 %	100 %	0 %	0 %	312136503
6602	NC_014658	AT	3	6	264860	264865	50 %	50 %	0 %	0 %	312136503
6603	NC_014658	GTT	2	6	264878	264883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136503
6604	NC_014658	TAG	2	6	264910	264915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136503
6605	NC_014658	AAGA	2	8	264920	264927	75 %	0 %	25 %	0 %	312136503
6606	NC_014658	T	6	6	264953	264958	0 %	100 %	0 %	0 %	312136503
6607	NC_014658	CTTT	2	8	264963	264970	0 %	75 %	0 %	25 %	312136503
6608	NC_014658	TTA	2	6	264977	264982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136503
6609	NC_014658	AT	3	6	265056	265061	50 %	50 %	0 %	0 %	312136503
6610	NC_014658	CAA	2	6	265110	265115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136503
6611	NC_014658	ATT	3	9	265124	265132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136503
6612	NC_014658	T	7	7	265137	265143	0 %	100 %	0 %	0 %	312136503
6613	NC_014658	TATT	2	8	265149	265156	25 %	75 %	0 %	0 %	312136503
6614	NC_014658	ATT	2	6	265163	265168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136503
6615	NC_014658	AAT	2	6	265210	265215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136503
6616	NC_014658	TTA	2	6	265244	265249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136503
6617	NC_014658	T	8	8	265268	265275	0 %	100 %	0 %	0 %	312136503
6618	NC_014658	ACT	2	6	265276	265281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136503
6619	NC_014658	TTCA	2	8	265291	265298	25 %	50 %	0 %	25 %	312136503
6620	NC_014658	TGC	2	6	265309	265314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136503
6621	NC_014658	A	6	6	265319	265324	100 %	0 %	0 %	0 %	312136503
6622	NC_014658	ATC	2	6	265341	265346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136503
6623	NC_014658	ATT	2	6	265370	265375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136503
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6999	NC_014658	TAT	2	6	280612	280617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136520
7000	NC_014658	CCA	2	6	280658	280663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136520

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