MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanothermus fervidus DSM 2088 chromosome

Total Repeats: 30373

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014658	T	6	6	203227	203232	0 %	100 %	0 %	0 %	312136434
5002	NC_014658	GAA	2	6	203364	203369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136434
5003	NC_014658	T	7	7	203375	203381	0 %	100 %	0 %	0 %	312136434
5004	NC_014658	CCA	2	6	203396	203401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136434
5005	NC_014658	CCA	2	6	203414	203419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136434
5006	NC_014658	GCT	2	6	203429	203434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136434
5007	NC_014658	TCC	2	6	203452	203457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136434
5008	NC_014658	AAT	2	6	203505	203510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136434
5009	NC_014658	TTA	2	6	203514	203519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136434
5010	NC_014658	T	8	8	203580	203587	0 %	100 %	0 %	0 %	312136434
5011	NC_014658	TCA	2	6	203612	203617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136434
5012	NC_014658	AAT	2	6	203619	203624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136434
5013	NC_014658	T	6	6	203631	203636	0 %	100 %	0 %	0 %	312136434
5014	NC_014658	TATTT	2	10	203650	203659	20 %	80 %	0 %	0 %	312136434
5015	NC_014658	AT	3	6	203660	203665	50 %	50 %	0 %	0 %	312136434
5016	NC_014658	TC	3	6	203707	203712	0 %	50 %	0 %	50 %	312136434
5017	NC_014658	TTA	2	6	203727	203732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136434
5018	NC_014658	T	6	6	203743	203748	0 %	100 %	0 %	0 %	312136434
5019	NC_014658	AATTCC	2	12	203755	203766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136434
5020	NC_014658	TTC	2	6	203775	203780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136434
5021	NC_014658	CTT	2	6	203849	203854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136435
5022	NC_014658	T	6	6	203870	203875	0 %	100 %	0 %	0 %	312136435
5023	NC_014658	ATT	2	6	203880	203885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136435
5024	NC_014658	TGAAT	2	10	203892	203901	40 %	40 %	20 %	0 %	312136435
5025	NC_014658	TAC	2	6	203905	203910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136435
5026	NC_014658	TAT	2	6	203918	203923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136435
5027	NC_014658	TAT	2	6	203948	203953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136435
5028	NC_014658	ATGC	2	8	203999	204006	25 %	25 %	25 %	25 %	312136435
5029	NC_014658	TAA	2	6	204014	204019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136435
5030	NC_014658	TCTT	2	8	204056	204063	0 %	75 %	0 %	25 %	312136435
5031	NC_014658	T	6	6	204083	204088	0 %	100 %	0 %	0 %	312136435
5032	NC_014658	ATT	2	6	204123	204128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136435
5033	NC_014658	TTAAA	2	10	204133	204142	60 %	40 %	0 %	0 %	312136435
5034	NC_014658	T	6	6	204197	204202	0 %	100 %	0 %	0 %	312136435
5035	NC_014658	TCA	2	6	204267	204272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136435
5036	NC_014658	AT	4	8	204280	204287	50 %	50 %	0 %	0 %	312136435
5037	NC_014658	TGC	2	6	204290	204295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136435
5038	NC_014658	TGA	2	6	204306	204311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136435
5039	NC_014658	AATT	2	8	204350	204357	50 %	50 %	0 %	0 %	312136435
5040	NC_014658	ACT	2	6	204369	204374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136435
5041	NC_014658	GAT	2	6	204375	204380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136435
5042	NC_014658	TCCT	2	8	204457	204464	0 %	50 %	0 %	50 %	312136435
5043	NC_014658	TTC	2	6	204487	204492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136435
5044	NC_014658	CAT	2	6	204532	204537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136435
5045	NC_014658	TAA	2	6	204556	204561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136435
5046	NC_014658	AT	3	6	204690	204695	50 %	50 %	0 %	0 %	312136435
5047	NC_014658	TAAA	2	8	204722	204729	75 %	25 %	0 %	0 %	312136435
5048	NC_014658	T	7	7	204755	204761	0 %	100 %	0 %	0 %	312136435
5049	NC_014658	CTT	2	6	204823	204828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136435
5050	NC_014658	TTA	2	6	204841	204846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136435
5051	NC_014658	TCC	2	6	204878	204883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136435
5052	NC_014658	TAT	2	6	204916	204921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136435
5053	NC_014658	AGC	2	6	204986	204991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136435
5054	NC_014658	GTTA	2	8	205028	205035	25 %	50 %	25 %	0 %	312136435
5055	NC_014658	TG	3	6	205055	205060	0 %	50 %	50 %	0 %	312136435
5056	NC_014658	T	6	6	205101	205106	0 %	100 %	0 %	0 %	312136435
5057	NC_014658	TTTG	2	8	205110	205117	0 %	75 %	25 %	0 %	312136435
5058	NC_014658	T	6	6	205122	205127	0 %	100 %	0 %	0 %	312136435
5059	NC_014658	ATG	2	6	205230	205235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136435
5060	NC_014658	TAT	2	6	205240	205245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136435
5061	NC_014658	CTT	2	6	205246	205251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136435
5062	NC_014658	ATTG	2	8	205410	205417	25 %	50 %	25 %	0 %	312136436
5063	NC_014658	TAAT	2	8	205424	205431	50 %	50 %	0 %	0 %	312136436
5064	NC_014658	T	6	6	205438	205443	0 %	100 %	0 %	0 %	312136436
5065	NC_014658	AT	3	6	205455	205460	50 %	50 %	0 %	0 %	312136436
5066	NC_014658	TGG	2	6	205485	205490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136436
5067	NC_014658	A	7	7	205528	205534	100 %	0 %	0 %	0 %	312136436
5068	NC_014658	CTTT	2	8	205580	205587	0 %	75 %	0 %	25 %	312136436
5069	NC_014658	TTG	2	6	205604	205609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136436
5070	NC_014658	ACT	2	6	205642	205647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136436
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5072	NC_014658	AG	4	8	205722	205729	50 %	0 %	50 %	0 %	312136436
5073	NC_014658	ATT	3	9	205776	205784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136436
5074	NC_014658	ACC	2	6	205803	205808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136436
5075	NC_014658	ATT	2	6	205821	205826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136436
5076	NC_014658	TAA	4	12	205829	205840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136436
5077	NC_014658	ATT	2	6	205843	205848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136436
5078	NC_014658	TCA	2	6	205918	205923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136437
5079	NC_014658	CTT	2	6	205960	205965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136437
5080	NC_014658	AGT	2	6	206045	206050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136437
5081	NC_014658	TA	3	6	206126	206131	50 %	50 %	0 %	0 %	312136437
5082	NC_014658	TCTT	2	8	206151	206158	0 %	75 %	0 %	25 %	312136437
5083	NC_014658	AAC	2	6	206183	206188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136437
5084	NC_014658	TCTT	2	8	206211	206218	0 %	75 %	0 %	25 %	312136437
5085	NC_014658	CATA	2	8	206247	206254	50 %	25 %	0 %	25 %	312136437
5086	NC_014658	T	6	6	206258	206263	0 %	100 %	0 %	0 %	312136437
5087	NC_014658	ATC	2	6	206336	206341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136437
5088	NC_014658	CAA	2	6	206356	206361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136437
5089	NC_014658	TA	3	6	206392	206397	50 %	50 %	0 %	0 %	312136437
5090	NC_014658	AGC	2	6	206441	206446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136437
5091	NC_014658	ATG	2	6	206469	206474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136437
5092	NC_014658	GTA	2	6	206481	206486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136437
5093	NC_014658	CAA	2	6	206497	206502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136437
5094	NC_014658	TTC	2	6	206521	206526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136437
5095	NC_014658	T	6	6	206580	206585	0 %	100 %	0 %	0 %	312136437
5096	NC_014658	TA	3	6	206618	206623	50 %	50 %	0 %	0 %	312136437
5097	NC_014658	CTT	2	6	206677	206682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136437
5098	NC_014658	TTTTGT	2	12	206683	206694	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	312136437
5099	NC_014658	CTTT	2	8	206745	206752	0 %	75 %	0 %	25 %	312136437
5100	NC_014658	CTTTT	2	10	206783	206792	0 %	80 %	0 %	20 %	312136437
5101	NC_014658	TTTTA	2	10	206834	206843	20 %	80 %	0 %	0 %	312136437
5102	NC_014658	CTA	2	6	206857	206862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136437
5103	NC_014658	CCT	2	6	206883	206888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136437
5104	NC_014658	TCT	2	6	206938	206943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136438
5105	NC_014658	T	6	6	206943	206948	0 %	100 %	0 %	0 %	312136438
5106	NC_014658	AATT	2	8	207008	207015	50 %	50 %	0 %	0 %	312136438
5107	NC_014658	AT	3	6	207058	207063	50 %	50 %	0 %	0 %	312136438
5108	NC_014658	ATTT	2	8	207081	207088	25 %	75 %	0 %	0 %	312136438
5109	NC_014658	CAA	2	6	207089	207094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136438
5110	NC_014658	ACT	2	6	207112	207117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136438
5111	NC_014658	T	6	6	207244	207249	0 %	100 %	0 %	0 %	312136438
5112	NC_014658	ATA	2	6	207302	207307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136438
5113	NC_014658	T	7	7	207368	207374	0 %	100 %	0 %	0 %	312136438
5114	NC_014658	TTC	2	6	207384	207389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136438
5115	NC_014658	T	6	6	207461	207466	0 %	100 %	0 %	0 %	312136438
5116	NC_014658	T	6	6	207468	207473	0 %	100 %	0 %	0 %	312136438
5117	NC_014658	T	6	6	207514	207519	0 %	100 %	0 %	0 %	312136438
5118	NC_014658	TAT	2	6	207579	207584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136438
5119	NC_014658	TCAA	2	8	207601	207608	50 %	25 %	0 %	25 %	312136438
5120	NC_014658	A	7	7	207651	207657	100 %	0 %	0 %	0 %	312136438
5121	NC_014658	T	7	7	207679	207685	0 %	100 %	0 %	0 %	312136438
5122	NC_014658	AAT	2	6	207721	207726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136438
5123	NC_014658	TAAA	2	8	207913	207920	75 %	25 %	0 %	0 %	312136439
5124	NC_014658	TAAG	2	8	207949	207956	50 %	25 %	25 %	0 %	312136439
5125	NC_014658	AAAT	2	8	207967	207974	75 %	25 %	0 %	0 %	312136439
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5330	NC_014658	AT	3	6	216062	216067	50 %	50 %	0 %	0 %	312136444
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5371	NC_014658	TGGGT	2	10	217774	217783	0 %	40 %	60 %	0 %	312136446
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