MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanoplanus petrolearius DSM 11571 chromosome

Total Repeats: 34751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014507	TTC	2	6	485	490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352169
2	NC_014507	CGG	2	6	515	520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307352169
3	NC_014507	ATA	2	6	541	546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307352169
4	NC_014507	ACA	2	6	859	864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307352169
5	NC_014507	TTG	2	6	943	948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307352169
6	NC_014507	TCC	2	6	1131	1136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352169
7	NC_014507	GAA	3	9	1143	1151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352169
8	NC_014507	TCC	2	6	1192	1197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352169
9	NC_014507	TGA	2	6	1235	1240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352169
10	NC_014507	CAG	2	6	1383	1388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352169
11	NC_014507	CTT	2	6	1467	1472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352169
12	NC_014507	CAA	2	6	1481	1486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307352169
13	NC_014507	GAA	2	6	1722	1727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352169
14	NC_014507	CAC	2	6	2116	2121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307352170
15	NC_014507	TCG	3	9	2174	2182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352170
16	NC_014507	TCA	2	6	2264	2269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307352170
17	NC_014507	GGA	2	6	2436	2441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352171
18	NC_014507	ACT	2	6	2609	2614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307352171
19	NC_014507	GAA	2	6	2619	2624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352171
20	NC_014507	TTC	2	6	2849	2854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352171
21	NC_014507	AAC	2	6	2869	2874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307352171
22	NC_014507	TGA	2	6	2888	2893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352171
23	NC_014507	ATC	2	6	2923	2928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307352171
24	NC_014507	CCG	2	6	2999	3004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307352171
25	NC_014507	GGA	2	6	3102	3107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352171
26	NC_014507	TCA	2	6	3132	3137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307352171
27	NC_014507	CGC	2	6	3174	3179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307352171
28	NC_014507	CAT	2	6	3379	3384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307352171
29	NC_014507	TGT	2	6	3390	3395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307352171
30	NC_014507	CTG	2	6	3473	3478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352171
31	NC_014507	ATA	2	6	3973	3978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307352172
32	NC_014507	TCT	2	6	4041	4046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352172
33	NC_014507	GCA	2	6	4047	4052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352172
34	NC_014507	CCG	2	6	4062	4067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307352172
35	NC_014507	TAC	2	6	4069	4074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307352172
36	NC_014507	CAG	2	6	4095	4100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352172
37	NC_014507	GCT	2	6	4106	4111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352172
38	NC_014507	CCG	2	6	4127	4132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307352172
39	NC_014507	GTC	2	6	4180	4185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352172
40	NC_014507	CGA	2	6	4309	4314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352172
41	NC_014507	CTC	2	6	4522	4527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352172
42	NC_014507	TCC	2	6	4532	4537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352172
43	NC_014507	ATA	2	6	4550	4555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307352172
44	NC_014507	TCC	2	6	4583	4588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352172
45	NC_014507	TCC	2	6	4619	4624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352172
46	NC_014507	AGA	2	6	4632	4637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352172
47	NC_014507	GTA	2	6	4810	4815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352172
48	NC_014507	GAA	2	6	4931	4936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352172
49	NC_014507	GAC	2	6	5086	5091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352172
50	NC_014507	TGA	2	6	5133	5138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352172
51	NC_014507	TGA	2	6	5232	5237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352172
52	NC_014507	TCA	2	6	5364	5369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307352172
53	NC_014507	GGA	2	6	5425	5430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352172
54	NC_014507	CGT	2	6	5511	5516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352172
55	NC_014507	GTA	2	6	5524	5529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352172
56	NC_014507	GCC	2	6	5571	5576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307352172
57	NC_014507	CGG	2	6	5598	5603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307352172
58	NC_014507	TGT	2	6	5610	5615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307352172
59	NC_014507	GAG	2	6	5782	5787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352172
60	NC_014507	TGA	2	6	5829	5834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352172
61	NC_014507	AGA	2	6	5975	5980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352172
62	NC_014507	AGA	2	6	6023	6028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352172
63	NC_014507	AGG	2	6	6065	6070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352172
64	NC_014507	GAC	2	6	6326	6331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352172
65	NC_014507	GGC	2	6	6340	6345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307352172
66	NC_014507	GAA	2	6	6460	6465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352172
67	NC_014507	AGC	2	6	6475	6480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352172
68	NC_014507	ATT	2	6	6506	6511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307352172
69	NC_014507	CCT	2	6	6522	6527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352172
70	NC_014507	ATG	2	6	6596	6601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352172
71	NC_014507	AGC	2	6	6602	6607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352172
72	NC_014507	GCT	3	9	6611	6619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352172
73	NC_014507	GAA	2	6	6752	6757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352173
74	NC_014507	CCT	2	6	6836	6841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352173
75	NC_014507	TTG	2	6	6929	6934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307352173
76	NC_014507	CGG	2	6	7181	7186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307352173
77	NC_014507	GAT	2	6	7224	7229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352173
78	NC_014507	TCC	2	6	7252	7257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352173
79	NC_014507	GGA	2	6	7349	7354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352173
80	NC_014507	TCT	2	6	7361	7366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352173
81	NC_014507	CGA	2	6	7376	7381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352173
82	NC_014507	GTG	2	6	7495	7500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307352173
83	NC_014507	GAT	2	6	7724	7729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352174
84	NC_014507	GAT	2	6	7802	7807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352174
85	NC_014507	GTT	2	6	7856	7861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307352174
86	NC_014507	GGC	2	6	7877	7882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307352174
87	NC_014507	GCC	2	6	7900	7905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307352174
88	NC_014507	TCC	2	6	7950	7955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352174
89	NC_014507	GAC	2	6	7982	7987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352174
90	NC_014507	GAT	2	6	8243	8248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352174
91	NC_014507	TTC	2	6	8279	8284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352174
92	NC_014507	TGC	2	6	8324	8329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352174
93	NC_014507	TGA	2	6	8353	8358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352174
94	NC_014507	AGA	2	6	8392	8397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352174
95	NC_014507	CTG	2	6	8431	8436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352174
96	NC_014507	TAG	2	6	8460	8465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352174
97	NC_014507	AAG	2	6	8555	8560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352174
98	NC_014507	TAT	2	6	8578	8583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307352174
99	NC_014507	TAA	2	6	8877	8882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307352175
100	NC_014507	AAT	2	6	8956	8961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307352175
101	NC_014507	GAT	2	6	9031	9036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352175
102	NC_014507	GCG	2	6	9081	9086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307352175
103	NC_014507	CGA	2	6	9136	9141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352175
104	NC_014507	GCA	2	6	9165	9170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352175
105	NC_014507	CGA	2	6	9499	9504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352175
106	NC_014507	AGA	2	6	9574	9579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352175
107	NC_014507	GCG	2	6	9695	9700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307352175
108	NC_014507	GCG	2	6	10013	10018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307352176
109	NC_014507	CTT	2	6	10051	10056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352176
110	NC_014507	GAT	2	6	10190	10195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352177
111	NC_014507	GAC	2	6	10281	10286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352177
112	NC_014507	GGA	2	6	10427	10432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352177
113	NC_014507	GAG	2	6	10446	10451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352177
114	NC_014507	TTC	2	6	10570	10575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352177
115	NC_014507	GTT	2	6	10587	10592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307352177
116	NC_014507	TTC	2	6	10602	10607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352177
117	NC_014507	CCG	2	6	10658	10663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307352178
118	NC_014507	TGG	2	6	10706	10711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307352178
119	NC_014507	CGC	2	6	10843	10848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307352178
120	NC_014507	TCT	2	6	10855	10860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352178
121	NC_014507	GAG	2	6	10889	10894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352178
122	NC_014507	AGG	2	6	10992	10997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352178
123	NC_014507	CGC	2	6	11005	11010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307352178
124	NC_014507	CTA	2	6	11062	11067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307352178
125	NC_014507	CGG	2	6	11083	11088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307352178
126	NC_014507	CTT	2	6	11095	11100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352178
127	NC_014507	GGT	2	6	11160	11165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307352178
128	NC_014507	CGA	2	6	11179	11184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352178
129	NC_014507	CGG	2	6	11338	11343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307352178
130	NC_014507	AAT	2	6	11449	11454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307352178
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132	NC_014507	TGC	2	6	11485	11490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352178
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253	NC_014507	GCA	2	6	21832	21837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352188
254	NC_014507	TCG	2	6	21865	21870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352188
255	NC_014507	ACA	2	6	21886	21891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307352188
256	NC_014507	AGG	2	6	22181	22186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352188
257	NC_014507	GTA	2	6	22260	22265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352188
258	NC_014507	GGA	2	6	22331	22336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352188
259	NC_014507	GAA	4	12	22370	22381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352188
260	NC_014507	AAC	2	6	22418	22423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307352188
261	NC_014507	AGT	2	6	22502	22507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352188
262	NC_014507	ACG	2	6	22660	22665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352188
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266	NC_014507	GAG	2	6	22823	22828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352188
267	NC_014507	GCC	2	6	22908	22913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307352188
268	NC_014507	CGG	2	6	23048	23053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307352188
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270	NC_014507	CCT	2	6	23193	23198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352189
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282	NC_014507	GGA	2	6	24282	24287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352190
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286	NC_014507	ACC	2	6	24504	24509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307352190
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290	NC_014507	CTC	2	6	24650	24655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352190
291	NC_014507	TGG	2	6	24822	24827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307352190
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330	NC_014507	CGA	2	6	27373	27378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352192
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500	NC_014507	AAG	3	9	42039	42047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352196

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