MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycoplasma hyorhinis HUB-1 chromosome

Total Repeats: 506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014448	GAAAGA	2	12	1146	1157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372806
2	NC_014448	GAAAAA	2	12	1382	1393	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	304372807
3	NC_014448	TTCAAA	2	12	1429	1440	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	304372807
4	NC_014448	GTTTAA	2	12	1860	1871	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	304372807
5	NC_014448	TCTTTT	2	12	10920	10931	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	304372814
6	NC_014448	CATTCA	2	12	15393	15404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304372817
7	NC_014448	AAATAA	2	12	15681	15692	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	304372817
8	NC_014448	AATTAA	2	12	16140	16151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372817
9	NC_014448	TTTGAA	2	12	24000	24011	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	304372820
10	NC_014448	AAGATG	2	12	26643	26654	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	304372824
11	NC_014448	TGCAAA	2	12	27999	28010	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	304372825
12	NC_014448	TCAAGT	2	12	29609	29620	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	304372826
13	NC_014448	TTTAGA	2	12	33394	33405	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	304372829
14	NC_014448	GAATTT	2	12	35624	35635	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	304372831
15	NC_014448	ATAAAA	2	12	35811	35822	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	304372831
16	NC_014448	AATTTA	2	12	37254	37265	50 %	50 %	0 %	0 %	304372832
17	NC_014448	TTTATC	2	12	41123	41134	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	304372836
18	NC_014448	AAAGCA	2	12	45478	45489	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	304372840
19	NC_014448	ATTTCT	2	12	46346	46357	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	304372840
20	NC_014448	ATTTTT	2	12	53664	53675	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	304372846
21	NC_014448	ATGGTA	2	12	54273	54284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304372846
22	NC_014448	AAATTG	2	12	56751	56762	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	304372846
23	NC_014448	AGAAAA	2	12	56824	56835	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	304372846
24	NC_014448	TAAATA	2	12	59861	59872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372849
25	NC_014448	ATTTAA	2	12	62964	62975	50 %	50 %	0 %	0 %	304372852
26	NC_014448	TTTCTA	2	12	66018	66029	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	304372854
27	NC_014448	TTGCAG	2	12	68789	68800	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	304372857
28	NC_014448	AGGATT	2	12	68910	68921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304372857
29	NC_014448	TATATG	2	12	72336	72347	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	304372858
30	NC_014448	GAAAAA	2	12	73681	73692	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	304372859
31	NC_014448	AAGGTC	2	12	74690	74701	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	304372859
32	NC_014448	CTTTGT	2	12	78416	78427	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	304372862
33	NC_014448	TCTAAA	2	12	78583	78594	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	304372862
34	NC_014448	TCAAGT	2	12	78808	78819	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	304372862
35	NC_014448	GAAAAT	2	12	79573	79584	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	304372863
36	NC_014448	TTAAAA	2	12	80177	80188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372864
37	NC_014448	AAAGAA	2	12	81839	81850	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	304372864
38	NC_014448	AAGCAA	2	12	82520	82531	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	304372865
39	NC_014448	TGAAAA	2	12	85452	85463	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	304372866
40	NC_014448	TTTTAA	2	12	88012	88023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372868
41	NC_014448	AAAAAC	2	12	91148	91159	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	304372871
42	NC_014448	TAAAAA	2	12	91593	91604	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	304372871
43	NC_014448	TGAAAA	2	12	92867	92878	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	304372873
44	NC_014448	ACAGAT	2	12	94095	94106	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	304372873
45	NC_014448	TAGGAA	2	12	96416	96427	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	304372876
46	NC_014448	ACGGAA	2	12	97370	97381	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	304372876
47	NC_014448	TTTTAT	2	12	97837	97848	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	304372877
48	NC_014448	CAAAAT	2	12	98404	98415	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	304372877
49	NC_014448	TTAAAT	2	12	98423	98434	50 %	50 %	0 %	0 %	304372877
50	NC_014448	ATTCAA	2	12	98709	98720	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	304372877
51	NC_014448	CAAAAA	2	12	99293	99304	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	304372877
52	NC_014448	TAAAGA	2	12	105513	105524	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	304372884
53	NC_014448	CAAAAA	2	12	107367	107378	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	304372887
54	NC_014448	CCAAAT	2	12	108018	108029	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	304372887
55	NC_014448	TAAAAG	2	12	112819	112830	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	304372890
56	NC_014448	AGACAA	2	12	113404	113415	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	304372891
57	NC_014448	ATTCAA	2	12	114696	114707	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	304372891
58	NC_014448	TTAATA	2	12	115170	115181	50 %	50 %	0 %	0 %	304372893
59	NC_014448	TTGTTA	2	12	116317	116328	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	304372894
60	NC_014448	ATTGAC	2	12	116889	116900	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	304372894
61	NC_014448	ATTACA	2	12	118427	118438	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	304372897
62	NC_014448	ATCTAA	2	12	120051	120062	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	304372899
63	NC_014448	AAGGAA	2	12	121413	121424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372901
64	NC_014448	CTCTTT	2	12	122632	122643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304372902
65	NC_014448	AAAGAA	2	12	123903	123914	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	304372903
66	NC_014448	TTTTGA	2	12	129014	129025	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	304372910
67	NC_014448	TTTTGT	2	12	129528	129539	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	304372911
68	NC_014448	AAGAAA	2	12	131142	131153	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	304372912
69	NC_014448	ATAATT	2	12	131397	131408	50 %	50 %	0 %	0 %	304372912
70	NC_014448	TTCATA	2	12	133890	133901	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	304372914
71	NC_014448	TTAAAA	2	12	134469	134480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372915
72	NC_014448	CTTCAT	2	12	136812	136823	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	304372915
73	NC_014448	TAAAAA	2	12	137906	137917	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	304372917
74	NC_014448	AGAATT	2	12	141130	141141	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	304372920
75	NC_014448	AAATAG	2	12	142770	142781	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	304372922
76	NC_014448	CAAAAT	2	12	143380	143391	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	304372922
77	NC_014448	ATAAAG	2	12	143821	143832	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	304372923
78	NC_014448	GTTTTT	2	12	149217	149228	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	304372929
79	NC_014448	ATTGAA	2	12	153901	153912	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	304372932
80	NC_014448	AAAAGA	2	12	154734	154745	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	304372932
81	NC_014448	TTTTGT	2	12	154749	154760	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	304372932
82	NC_014448	GTTACT	2	12	156739	156750	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	304372933
83	NC_014448	TGAAAA	2	12	163208	163219	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	304372937
84	NC_014448	AACTAA	2	12	166513	166524	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	304372938
85	NC_014448	GAAAAA	2	12	167880	167891	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	304372940
86	NC_014448	ATAGCA	2	12	169227	169238	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	304372941
87	NC_014448	GAAGGA	2	12	172916	172927	50 %	0 %	50 %	0 %	304372944
88	NC_014448	TCCAAA	2	12	173137	173148	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	304372944
89	NC_014448	ATTTTT	2	12	178340	178351	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	304372947
90	NC_014448	TGAAAA	2	12	179439	179450	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	304372947
91	NC_014448	TTTATT	2	12	181731	181742	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	304372950
92	NC_014448	GTTTGA	2	12	182096	182107	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	304372950
93	NC_014448	AACAAT	2	12	184198	184209	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	304372951
94	NC_014448	ACAAAA	2	12	188515	188526	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	304372953
95	NC_014448	AAGAAA	2	12	190198	190209	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	304372953
96	NC_014448	ACACAA	2	12	192807	192818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304372953
97	NC_014448	AGTTGA	2	12	192974	192985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304372953
98	NC_014448	CAAGAA	2	12	193563	193574	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	304372953
99	NC_014448	ATTGAT	2	12	193614	193625	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	304372953
100	NC_014448	CAAACA	2	12	193785	193796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304372953
101	NC_014448	AAATGA	2	12	194054	194065	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	304372953
102	NC_014448	TTACTA	2	12	194287	194298	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	304372953
103	NC_014448	AAAAGT	2	12	194729	194740	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	304372953
104	NC_014448	CAAATG	2	12	195847	195858	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	304372953
105	NC_014448	TAAAAT	2	12	196021	196032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372953
106	NC_014448	AAACCA	2	12	199377	199388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304372954
107	NC_014448	CAAAAA	2	12	200537	200548	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	304372954
108	NC_014448	TACTTT	2	12	201952	201963	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	304372954
109	NC_014448	AATCAA	2	12	203989	204000	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	304372955
110	NC_014448	TCTAAA	2	12	204499	204510	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	304372955
111	NC_014448	TGCTTC	2	12	204654	204665	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	304372955
112	NC_014448	CAAATG	2	12	205103	205114	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	304372955
113	NC_014448	TAAAAT	2	12	206042	206053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372955
114	NC_014448	ATGATT	2	12	207905	207916	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	304372955
115	NC_014448	ATTTTG	2	12	209584	209595	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	304372956
116	NC_014448	TTTGAA	2	12	209822	209833	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	304372956
117	NC_014448	AATTAG	2	12	211345	211356	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	304372957
118	NC_014448	AAAAGA	2	12	212207	212218	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	304372958
119	NC_014448	TGTTTC	2	12	216729	216740	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	304372963
120	NC_014448	TTTATA	2	12	218876	218887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372965
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122	NC_014448	TGAAAT	2	12	222843	222854	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	304372969
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235	NC_014448	GTTATT	2	12	421927	421938	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	304373125
236	NC_014448	AATCAT	2	12	423862	423873	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	304373126
237	NC_014448	TCATTA	2	12	424221	424232	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	304373126
238	NC_014448	TTTAAA	2	12	424886	424897	50 %	50 %	0 %	0 %	304373126
239	NC_014448	ATTTTT	2	12	425846	425857	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	304373126
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242	NC_014448	TTTAGA	2	12	430204	430215	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	304373127
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351	NC_014448	GTAAAA	2	12	606101	606112	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	304373275
352	NC_014448	TATTTG	2	12	606814	606825	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	304373277
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