MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Methanohalobium evestigatum Z-7303 plasmid pMETEV01

Total Repeats: 186

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014254	GA	3	6	3455	3460	50 %	0 %	50 %	0 %	298676129
2	NC_014254	TC	3	6	3731	3736	0 %	50 %	0 %	50 %	298676129
3	NC_014254	AG	3	6	3811	3816	50 %	0 %	50 %	0 %	298676129
4	NC_014254	TG	3	6	4307	4312	0 %	50 %	50 %	0 %	298676130
5	NC_014254	AT	3	6	4447	4452	50 %	50 %	0 %	0 %	298676130
6	NC_014254	GA	3	6	7056	7061	50 %	0 %	50 %	0 %	298676130
7	NC_014254	GA	3	6	7396	7401	50 %	0 %	50 %	0 %	298676130
8	NC_014254	GA	3	6	7735	7740	50 %	0 %	50 %	0 %	298676131
9	NC_014254	TA	3	6	8305	8310	50 %	50 %	0 %	0 %	298676131
10	NC_014254	TA	3	6	8566	8571	50 %	50 %	0 %	0 %	298676131
11	NC_014254	AT	3	6	10073	10078	50 %	50 %	0 %	0 %	298676132
12	NC_014254	TA	3	6	10088	10093	50 %	50 %	0 %	0 %	298676132
13	NC_014254	TA	3	6	10369	10374	50 %	50 %	0 %	0 %	298676132
14	NC_014254	AT	3	6	10892	10897	50 %	50 %	0 %	0 %	298676132
15	NC_014254	TA	3	6	10954	10959	50 %	50 %	0 %	0 %	298676132
16	NC_014254	AG	3	6	11289	11294	50 %	0 %	50 %	0 %	298676132
17	NC_014254	AT	3	6	11363	11368	50 %	50 %	0 %	0 %	298676132
18	NC_014254	AT	5	10	12027	12036	50 %	50 %	0 %	0 %	298676132
19	NC_014254	AT	3	6	14989	14994	50 %	50 %	0 %	0 %	298676133
20	NC_014254	GT	3	6	16209	16214	0 %	50 %	50 %	0 %	298676134
21	NC_014254	GA	3	6	16618	16623	50 %	0 %	50 %	0 %	298676134
22	NC_014254	CA	3	6	18626	18631	50 %	0 %	0 %	50 %	298676136
23	NC_014254	AT	3	6	20591	20596	50 %	50 %	0 %	0 %	298676136
24	NC_014254	AT	3	6	20751	20756	50 %	50 %	0 %	0 %	298676136
25	NC_014254	AT	3	6	21552	21557	50 %	50 %	0 %	0 %	298676136
26	NC_014254	TA	3	6	22260	22265	50 %	50 %	0 %	0 %	298676136
27	NC_014254	TA	3	6	24881	24886	50 %	50 %	0 %	0 %	298676137
28	NC_014254	AG	3	6	24936	24941	50 %	0 %	50 %	0 %	298676137
29	NC_014254	CT	3	6	25161	25166	0 %	50 %	0 %	50 %	298676137
30	NC_014254	AT	3	6	25733	25738	50 %	50 %	0 %	0 %	298676138
31	NC_014254	AT	3	6	27145	27150	50 %	50 %	0 %	0 %	298676139
32	NC_014254	TG	3	6	30312	30317	0 %	50 %	50 %	0 %	298676141
33	NC_014254	GT	3	6	30697	30702	0 %	50 %	50 %	0 %	298676141
34	NC_014254	TC	3	6	30970	30975	0 %	50 %	0 %	50 %	298676142
35	NC_014254	TG	3	6	31151	31156	0 %	50 %	50 %	0 %	298676142
36	NC_014254	TG	4	8	31200	31207	0 %	50 %	50 %	0 %	298676142
37	NC_014254	TG	3	6	32481	32486	0 %	50 %	50 %	0 %	298676143
38	NC_014254	TC	3	6	32517	32522	0 %	50 %	0 %	50 %	298676143
39	NC_014254	AT	3	6	36598	36603	50 %	50 %	0 %	0 %	298676147
40	NC_014254	TA	3	6	37044	37049	50 %	50 %	0 %	0 %	298676147
41	NC_014254	CA	3	6	37734	37739	50 %	0 %	0 %	50 %	298676148
42	NC_014254	TA	3	6	39671	39676	50 %	50 %	0 %	0 %	298676149
43	NC_014254	AT	3	6	39796	39801	50 %	50 %	0 %	0 %	298676149
44	NC_014254	TC	3	6	43402	43407	0 %	50 %	0 %	50 %	298676151
45	NC_014254	TA	3	6	43782	43787	50 %	50 %	0 %	0 %	298676151
46	NC_014254	TA	3	6	44184	44189	50 %	50 %	0 %	0 %	298676151
47	NC_014254	TA	4	8	44666	44673	50 %	50 %	0 %	0 %	298676151
48	NC_014254	AT	3	6	45088	45093	50 %	50 %	0 %	0 %	298676151
49	NC_014254	AT	3	6	45334	45339	50 %	50 %	0 %	0 %	298676152
50	NC_014254	TA	3	6	45737	45742	50 %	50 %	0 %	0 %	298676152
51	NC_014254	AT	3	6	46536	46541	50 %	50 %	0 %	0 %	298676153
52	NC_014254	TA	4	8	46578	46585	50 %	50 %	0 %	0 %	298676153
53	NC_014254	TA	3	6	47046	47051	50 %	50 %	0 %	0 %	298676153
54	NC_014254	AT	5	10	48640	48649	50 %	50 %	0 %	0 %	298676154
55	NC_014254	TA	3	6	49285	49290	50 %	50 %	0 %	0 %	298676155
56	NC_014254	AT	3	6	50121	50126	50 %	50 %	0 %	0 %	298676155
57	NC_014254	TC	3	6	55304	55309	0 %	50 %	0 %	50 %	298676158
58	NC_014254	TG	3	6	56121	56126	0 %	50 %	50 %	0 %	298676158
59	NC_014254	AT	3	6	57021	57026	50 %	50 %	0 %	0 %	298676159
60	NC_014254	CT	3	6	57502	57507	0 %	50 %	0 %	50 %	298676159
61	NC_014254	TC	3	6	58154	58159	0 %	50 %	0 %	50 %	298676160
62	NC_014254	TA	3	6	66594	66599	50 %	50 %	0 %	0 %	298676163
63	NC_014254	TA	3	6	67801	67806	50 %	50 %	0 %	0 %	298676163
64	NC_014254	AT	3	6	68404	68409	50 %	50 %	0 %	0 %	298676163
65	NC_014254	AT	3	6	68517	68522	50 %	50 %	0 %	0 %	298676163
66	NC_014254	TG	3	6	68579	68584	0 %	50 %	50 %	0 %	298676163
67	NC_014254	TG	3	6	68918	68923	0 %	50 %	50 %	0 %	298676163
68	NC_014254	AC	3	6	69607	69612	50 %	0 %	0 %	50 %	298676164
69	NC_014254	AT	3	6	69717	69722	50 %	50 %	0 %	0 %	298676164
70	NC_014254	AT	3	6	70596	70601	50 %	50 %	0 %	0 %	298676164
71	NC_014254	AG	3	6	71392	71397	50 %	0 %	50 %	0 %	298676164
72	NC_014254	AT	3	6	72002	72007	50 %	50 %	0 %	0 %	298676165
73	NC_014254	TA	3	6	72736	72741	50 %	50 %	0 %	0 %	298676165
74	NC_014254	AT	3	6	73243	73248	50 %	50 %	0 %	0 %	298676165
75	NC_014254	AT	3	6	73482	73487	50 %	50 %	0 %	0 %	298676166
76	NC_014254	TA	3	6	74173	74178	50 %	50 %	0 %	0 %	298676166
77	NC_014254	TA	3	6	74874	74879	50 %	50 %	0 %	0 %	298676167
78	NC_014254	AT	3	6	75006	75011	50 %	50 %	0 %	0 %	298676167
79	NC_014254	AT	3	6	77510	77515	50 %	50 %	0 %	0 %	298676167
80	NC_014254	AT	3	6	77605	77610	50 %	50 %	0 %	0 %	298676167
81	NC_014254	GT	3	6	78467	78472	0 %	50 %	50 %	0 %	298676168
82	NC_014254	TA	3	6	79700	79705	50 %	50 %	0 %	0 %	298676169
83	NC_014254	TA	3	6	79762	79767	50 %	50 %	0 %	0 %	298676169
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86	NC_014254	AT	3	6	82190	82195	50 %	50 %	0 %	0 %	298676172
87	NC_014254	AT	4	8	83976	83983	50 %	50 %	0 %	0 %	298676172
88	NC_014254	AT	3	6	84043	84048	50 %	50 %	0 %	0 %	298676172
89	NC_014254	AT	3	6	84608	84613	50 %	50 %	0 %	0 %	298676173
90	NC_014254	GA	3	6	85896	85901	50 %	0 %	50 %	0 %	298676174
91	NC_014254	CA	3	6	86067	86072	50 %	0 %	0 %	50 %	298676174
92	NC_014254	TA	3	6	86103	86108	50 %	50 %	0 %	0 %	298676174
93	NC_014254	TA	3	6	86137	86142	50 %	50 %	0 %	0 %	298676174
94	NC_014254	TA	3	6	86317	86322	50 %	50 %	0 %	0 %	298676174
95	NC_014254	AT	3	6	87878	87883	50 %	50 %	0 %	0 %	298676175
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97	NC_014254	TA	3	6	90726	90731	50 %	50 %	0 %	0 %	298676178
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99	NC_014254	AT	3	6	91325	91330	50 %	50 %	0 %	0 %	298676179
100	NC_014254	TA	3	6	91476	91481	50 %	50 %	0 %	0 %	298676179
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102	NC_014254	CA	3	6	91616	91621	50 %	0 %	0 %	50 %	298676179
103	NC_014254	AT	3	6	92042	92047	50 %	50 %	0 %	0 %	298676180
104	NC_014254	TA	3	6	93274	93279	50 %	50 %	0 %	0 %	298676181
105	NC_014254	AT	3	6	94052	94057	50 %	50 %	0 %	0 %	298676182
106	NC_014254	AT	3	6	94375	94380	50 %	50 %	0 %	0 %	298676182
107	NC_014254	TA	3	6	95384	95389	50 %	50 %	0 %	0 %	298676183
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109	NC_014254	TA	3	6	95648	95653	50 %	50 %	0 %	0 %	298676183
110	NC_014254	AT	3	6	96397	96402	50 %	50 %	0 %	0 %	298676184
111	NC_014254	AT	3	6	97505	97510	50 %	50 %	0 %	0 %	298676185
112	NC_014254	TA	3	6	97824	97829	50 %	50 %	0 %	0 %	298676185
113	NC_014254	TA	3	6	101435	101440	50 %	50 %	0 %	0 %	298676188
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117	NC_014254	TA	3	6	106569	106574	50 %	50 %	0 %	0 %	298676194
118	NC_014254	CT	3	6	107170	107175	0 %	50 %	0 %	50 %	298676194
119	NC_014254	CA	3	6	107526	107531	50 %	0 %	0 %	50 %	298676194
120	NC_014254	CA	3	6	107715	107720	50 %	0 %	0 %	50 %	298676194
121	NC_014254	TC	3	6	108870	108875	0 %	50 %	0 %	50 %	298676194
122	NC_014254	AC	3	6	109103	109108	50 %	0 %	0 %	50 %	298676194
123	NC_014254	AT	3	6	115777	115782	50 %	50 %	0 %	0 %	298676202
124	NC_014254	GA	3	6	115830	115835	50 %	0 %	50 %	0 %	298676202
125	NC_014254	AG	3	6	118346	118351	50 %	0 %	50 %	0 %	298676206
126	NC_014254	GA	3	6	118471	118476	50 %	0 %	50 %	0 %	298676206
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128	NC_014254	AT	3	6	119970	119975	50 %	50 %	0 %	0 %	298676207
129	NC_014254	TA	3	6	120560	120565	50 %	50 %	0 %	0 %	298676208
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131	NC_014254	AT	3	6	120747	120752	50 %	50 %	0 %	0 %	298676208
132	NC_014254	TG	3	6	123322	123327	0 %	50 %	50 %	0 %	298676209
133	NC_014254	AT	3	6	124871	124876	50 %	50 %	0 %	0 %	298676209
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138	NC_014254	CT	3	6	130261	130266	0 %	50 %	0 %	50 %	298676211
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141	NC_014254	AT	3	6	130859	130864	50 %	50 %	0 %	0 %	298676212
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.