MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Methanohalobium evestigatum Z-7303 plasmid pMETEV01

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014254	TCAAGA	2	12	3490	3501	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	298676129
2	NC_014254	CAACAG	2	12	3700	3711	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	298676129
3	NC_014254	GAATGG	2	12	5095	5106	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	298676130
4	NC_014254	ATGGAG	2	12	6453	6464	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	298676130
5	NC_014254	GAAGCT	2	12	11674	11685	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	298676132
6	NC_014254	ACTGTT	2	12	12115	12126	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	298676132
7	NC_014254	TTCAGA	2	12	19198	19209	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298676136
8	NC_014254	CATTTA	2	12	20217	20228	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	298676136
9	NC_014254	AAGTTA	2	12	20421	20432	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	298676136
10	NC_014254	TAGTTA	2	12	21201	21212	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	298676136
11	NC_014254	TCTCCT	2	12	21371	21382	0 %	50 %	0 %	50 %	298676136
12	NC_014254	TCATTT	2	12	23297	23308	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	298676136
13	NC_014254	ATAAAA	2	12	26126	26137	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	298676138
14	NC_014254	GGAGAT	2	12	35318	35329	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	298676145
15	NC_014254	ATTTAA	2	12	37880	37891	50 %	50 %	0 %	0 %	298676148
16	NC_014254	ATTTAA	2	12	38369	38380	50 %	50 %	0 %	0 %	298676148
17	NC_014254	GTAAAT	2	12	39618	39629	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	298676149
18	NC_014254	ATAAGT	2	12	39709	39720	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	298676149
19	NC_014254	TCTAAA	2	12	39858	39869	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	298676149
20	NC_014254	TTTATC	2	12	43832	43843	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	298676151
21	NC_014254	ATCAAA	2	12	44752	44763	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	298676151
22	NC_014254	TATCTA	2	12	45777	45788	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	298676152
23	NC_014254	TTGTTT	2	12	49844	49855	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	298676155
24	NC_014254	ATCATT	2	12	59307	59318	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	298676161
25	NC_014254	TACAGT	2	12	63214	63225	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298676163
26	NC_014254	TATCGT	2	12	65706	65717	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	298676163
27	NC_014254	GGCAGT	2	12	66739	66750	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	298676163
28	NC_014254	AACATT	2	12	66949	66960	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	298676163
29	NC_014254	TTTCTG	2	12	69090	69101	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	298676163
30	NC_014254	TGATTT	2	12	75290	75301	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	298676167
31	NC_014254	CTTTTT	2	12	76601	76612	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	298676167
32	NC_014254	TGATTT	2	12	78819	78830	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	298676168
33	NC_014254	TACCTA	2	12	79166	79177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298676168
34	NC_014254	TAGTTG	2	12	82917	82928	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	298676172
35	NC_014254	ATCTTT	2	12	84339	84350	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	298676173
36	NC_014254	TGGATG	2	12	86437	86448	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	298676174
37	NC_014254	ATAATT	2	12	88108	88119	50 %	50 %	0 %	0 %	298676175
38	NC_014254	TAGCAG	2	12	92256	92267	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	298676180
39	NC_014254	AGAATT	2	12	94656	94667	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	298676182
40	NC_014254	CAGAAA	2	12	97429	97440	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	298676185
41	NC_014254	ATAACA	3	18	97903	97920	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	298676185
42	NC_014254	CTTATT	2	12	98106	98117	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	298676185
43	NC_014254	TAATGG	2	12	102896	102907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298676191
44	NC_014254	GATGTA	2	12	106261	106272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298676194
45	NC_014254	CATCAC	2	12	106644	106655	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	298676194
46	NC_014254	TGTTAA	2	12	106953	106964	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	298676194
47	NC_014254	GTTCAG	2	12	108977	108988	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	298676194
48	NC_014254	AGGTAA	2	12	109221	109232	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	298676194
49	NC_014254	AAAGCG	2	12	109457	109468	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	298676194
50	NC_014254	TGTTAA	2	12	112036	112047	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	298676197
51	NC_014254	GAACAA	2	12	112348	112359	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	298676197
52	NC_014254	GATGAA	2	12	113866	113877	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	298676199
53	NC_014254	TTGTTT	2	12	115165	115176	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	298676201
54	NC_014254	ATGGCA	2	12	116096	116107	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	298676202
55	NC_014254	AGAAGG	2	12	119442	119453	50 %	0 %	50 %	0 %	298676207
56	NC_014254	AGAACC	2	12	123898	123909	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	298676209
57	NC_014254	AACCAG	2	12	123984	123995	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	298676209
58	NC_014254	CATAAG	2	12	124059	124070	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	298676209
59	NC_014254	ACAAAT	2	12	126292	126303	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	298676209
60	NC_014254	TAACAT	2	12	126546	126557	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	298676209
61	NC_014254	ACTTAT	2	12	126565	126576	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	298676209
62	NC_014254	AAAAGA	2	12	129898	129909	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	298676210
63	NC_014254	TAAAAC	2	12	130737	130748	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	298676212
64	NC_014254	ATTCTA	2	12	134816	134827	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	298676219
65	NC_014254	CATATA	2	12	135206	135217	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	298676219
66	NC_014254	TAATGA	2	12	136113	136124	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	298676220
67	NC_014254	ACAGTA	2	12	137717	137728	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	298676220
68	NC_014254	GAAGTG	2	12	139786	139797	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	298676221
69	NC_014254	ACAGTG	2	12	145590	145601	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	298676223
70	NC_014254	AACCAA	2	12	146562	146573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298676223
71	NC_014254	AGAACC	2	12	147163	147174	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	298676223
72	NC_014254	ACCATG	2	12	148767	148778	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	298676223
73	NC_014254	TGAAAC	2	12	150773	150784	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	298676224
74	NC_014254	TAATGA	2	12	154645	154656	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	298676229
75	NC_014254	GAAGTG	2	12	158559	158570	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	298676230
76	NC_014254	GGTGCA	2	12	158787	158798	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	298676230

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.