MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Methanococcus voltae A3 chromosome

Total Repeats: 869

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014222	ATGGTG	2	12	1275	1286	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	297618529
2	NC_014222	GATAGC	2	12	7913	7924	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	297618539
3	NC_014222	CAGGAA	2	12	9525	9536	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	297618541
4	NC_014222	TTTATA	2	12	19434	19445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297618555
5	NC_014222	ATCTTT	2	12	20043	20054	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	297618556
6	NC_014222	TGGTAT	2	12	20375	20386	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	297618556
7	NC_014222	AACATT	2	12	21850	21861	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	297618557
8	NC_014222	ATTTAA	2	12	23078	23089	50 %	50 %	0 %	0 %	297618558
9	NC_014222	AAATAA	2	12	23256	23267	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	297618558
10	NC_014222	TATAGA	2	12	23583	23594	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	297618558
11	NC_014222	AGTTTT	2	12	23673	23684	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	297618558
12	NC_014222	ATATAA	2	12	23964	23975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297618558
13	NC_014222	AATGAT	2	12	26229	26240	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	297618560
14	NC_014222	TATTTT	2	12	28605	28616	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	297618562
15	NC_014222	CTTTTT	3	18	28674	28691	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	297618562
16	NC_014222	TCTTTA	2	12	28769	28780	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	297618562
17	NC_014222	TTTCCA	4	24	29069	29092	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	297618562
18	NC_014222	AGATTT	2	12	32503	32514	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	297618563
19	NC_014222	GTTGCT	2	12	33662	33673	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	297618563
20	NC_014222	ACCTGG	2	12	38460	38471	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	297618568
21	NC_014222	TCTATG	2	12	39533	39544	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	297618569
22	NC_014222	AGGTCA	2	12	40680	40691	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	297618569
23	NC_014222	TCAAAT	2	12	43890	43901	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	297618573
24	NC_014222	GGTGAA	2	12	44076	44087	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	297618573
25	NC_014222	AATCTA	2	12	45592	45603	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	297618574
26	NC_014222	AAATAA	2	12	45806	45817	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	297618574
27	NC_014222	ATATTC	2	12	47182	47193	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	297618576
28	NC_014222	TTAGTT	2	12	47549	47560	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	297618576
29	NC_014222	ACCGCC	2	12	47935	47946	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	297618576
30	NC_014222	CATCTT	2	12	56144	56155	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	297618584
31	NC_014222	AAAGCA	2	12	57814	57825	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	297618586
32	NC_014222	AAAACA	2	12	59695	59706	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	297618588
33	NC_014222	AACTTA	2	12	65356	65367	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	297618592
34	NC_014222	TTTTAT	2	12	67539	67550	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	297618594
35	NC_014222	TTTTAT	2	12	68361	68372	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	297618594
36	NC_014222	TTTAAA	2	12	69402	69413	50 %	50 %	0 %	0 %	297618595
37	NC_014222	GATAGC	2	12	72169	72180	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	297618599
38	NC_014222	CAGGAA	2	12	73781	73792	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	297618601
39	NC_014222	TTTATA	2	12	83690	83701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297618615
40	NC_014222	ATCTTT	2	12	84299	84310	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	297618616
41	NC_014222	TGGTAT	2	12	84631	84642	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	297618616
42	NC_014222	AACATT	2	12	86106	86117	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	297618617
43	NC_014222	ATTTAA	2	12	87334	87345	50 %	50 %	0 %	0 %	297618618
44	NC_014222	AAATAA	2	12	87512	87523	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	297618618
45	NC_014222	TATAGA	2	12	87839	87850	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	297618618
46	NC_014222	AGTTTT	2	12	87929	87940	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	297618618
47	NC_014222	ATATAA	2	12	88220	88231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297618618
48	NC_014222	AATGAT	2	12	90485	90496	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	297618620
49	NC_014222	TATTTT	2	12	92861	92872	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	297618622
50	NC_014222	CTTTTT	3	18	92930	92947	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	297618622
51	NC_014222	TCTTTA	2	12	93025	93036	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	297618622
52	NC_014222	TTTCCA	4	24	93325	93348	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	297618622
53	NC_014222	AGATTT	2	12	96759	96770	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	297618623
54	NC_014222	GTTGCT	2	12	97918	97929	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	297618623
55	NC_014222	ACCTGG	2	12	102716	102727	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	297618628
56	NC_014222	TCTATG	2	12	103789	103800	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	297618629
57	NC_014222	AGGTCA	2	12	104936	104947	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	297618629
58	NC_014222	TCAAAT	2	12	108146	108157	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	297618633
59	NC_014222	GGTGAA	2	12	108332	108343	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	297618633
60	NC_014222	AATCTA	2	12	109848	109859	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	297618634
61	NC_014222	AAATAA	2	12	110062	110073	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	297618634
62	NC_014222	ATATTC	2	12	111438	111449	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	297618636
63	NC_014222	TTAGTT	2	12	111805	111816	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	297618636
64	NC_014222	ACCGCC	2	12	112191	112202	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	297618636
65	NC_014222	CATCTT	2	12	120400	120411	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	297618644
66	NC_014222	AAAGCA	2	12	122070	122081	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	297618646
67	NC_014222	AAAACA	2	12	123951	123962	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	297618648
68	NC_014222	AACTTA	2	12	129612	129623	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	297618652
69	NC_014222	TTTTAT	2	12	131795	131806	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	297618654
70	NC_014222	TTTTAT	2	12	132617	132628	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	297618654
71	NC_014222	TTTAAA	2	12	133658	133669	50 %	50 %	0 %	0 %	297618655
72	NC_014222	AAAAGA	2	12	135823	135834	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	297618657
73	NC_014222	CTAATA	4	24	138601	138624	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	297618660
74	NC_014222	AGATTC	2	12	139094	139105	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	297618660
75	NC_014222	ATATCC	2	12	143259	143270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297618666
76	NC_014222	AATTTT	2	12	143277	143288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297618666
77	NC_014222	GAGCAA	2	12	147300	147311	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	297618670
78	NC_014222	ATCTTC	2	12	148579	148590	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	297618671
79	NC_014222	ATTTTA	2	12	148655	148666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297618671
80	NC_014222	TTTTAA	2	12	148723	148734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297618671
81	NC_014222	CTACAT	2	12	149613	149624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297618671
82	NC_014222	TTAATT	2	12	153695	153706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297618675
83	NC_014222	TCTTAC	2	12	158285	158296	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	297618680
84	NC_014222	GGTTGT	2	12	158373	158384	0 %	50 %	50 %	0 %	297618680
85	NC_014222	TAATAG	2	12	160425	160436	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	297618683
86	NC_014222	ACCTGC	2	12	163377	163388	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	297618686
87	NC_014222	ATGGGT	2	12	168806	168817	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	297618692
88	NC_014222	AGGAAA	2	12	169069	169080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297618692
89	NC_014222	AAAAAT	2	12	169718	169729	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	297618693
90	NC_014222	TTATTT	2	12	172405	172416	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	297618697
91	NC_014222	TAATCA	2	12	174555	174566	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	297618699
92	NC_014222	TTATTT	3	18	179627	179644	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	297618703
93	NC_014222	TTCGTT	2	12	180100	180111	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	297618703
94	NC_014222	TAATGT	2	12	181296	181307	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	297618704
95	NC_014222	GATAAA	2	12	182682	182693	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	297618705
96	NC_014222	TTTAAA	2	12	183940	183951	50 %	50 %	0 %	0 %	297618706
97	NC_014222	TAGTAT	2	12	186021	186032	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	297618709
98	NC_014222	GAAAGA	2	12	198414	198425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297618719
99	NC_014222	CAGGTT	2	12	199351	199362	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	297618720
100	NC_014222	AGGAGA	2	12	199412	199423	50 %	0 %	50 %	0 %	297618720
101	NC_014222	ATTTTT	2	12	202488	202499	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	297618723
102	NC_014222	TTAAAG	2	12	208191	208202	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	297618726
103	NC_014222	GCAATG	2	12	210572	210583	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	297618728
104	NC_014222	TACATA	2	12	210619	210630	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	297618728
105	NC_014222	ATATTA	2	12	211754	211765	50 %	50 %	0 %	0 %	297618728
106	NC_014222	AAAATA	2	12	220413	220424	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	297618735
107	NC_014222	GAAAAT	2	12	224652	224663	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	297618738
108	NC_014222	ACATCG	2	12	233823	233834	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	297618748
109	NC_014222	AAGCAG	2	12	233862	233873	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	297618748
110	NC_014222	TTTAGC	2	12	239633	239644	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	297618756
111	NC_014222	CTGCAA	2	12	241123	241134	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	297618757
112	NC_014222	TAAAAT	2	12	246102	246113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297618759
113	NC_014222	ATTATG	2	12	246414	246425	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	297618760
114	NC_014222	AAGAAA	2	12	248739	248750	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	297618762
115	NC_014222	TTATAA	2	12	249127	249138	50 %	50 %	0 %	0 %	297618762
116	NC_014222	TTTAAT	2	12	251588	251599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297618765
117	NC_014222	CAAATA	2	12	258002	258013	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	297618769
118	NC_014222	TTTTAT	2	12	260024	260035	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	297618772
119	NC_014222	TAAAAA	2	12	260909	260920	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	297618773
120	NC_014222	AGACAA	2	12	261497	261508	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	297618773
121	NC_014222	GATAAT	2	12	263014	263025	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	297618775
122	NC_014222	GAAATT	2	12	263827	263838	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	297618775
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127	NC_014222	ATATTA	2	12	275097	275108	50 %	50 %	0 %	0 %	297618785
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230	NC_014222	GCAATA	2	12	507483	507494	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	297619014
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232	NC_014222	AACCAA	2	12	513109	513120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297619022
233	NC_014222	TATCTT	2	12	514796	514807	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	297619026
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235	NC_014222	ATCATT	2	12	521573	521584	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	297619031
236	NC_014222	CATAAT	2	12	521851	521862	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	297619031
237	NC_014222	TAATAT	2	12	524738	524749	50 %	50 %	0 %	0 %	297619039
238	NC_014222	AGAAAC	2	12	527317	527328	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	297619042
239	NC_014222	CAGATT	2	12	527584	527595	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	297619042
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340	NC_014222	ATTTGC	2	12	768996	769007	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	297619225
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342	NC_014222	TCTGCT	2	12	776565	776576	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	297619230
343	NC_014222	TAAATT	2	12	779832	779843	50 %	50 %	0 %	0 %	297619232
344	NC_014222	TTCTAA	2	12	780105	780116	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	297619232
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349	NC_014222	CAATTG	2	12	793119	793130	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	297619242
350	NC_014222	ACAATT	2	12	795377	795388	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	297619244
351	NC_014222	CATCTT	2	12	799585	799596	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	297619248
352	NC_014222	CATTTT	2	12	800498	800509	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	297619248
353	NC_014222	AAATAT	2	12	805248	805259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297619251
354	NC_014222	AATGTA	2	12	805315	805326	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	297619251
355	NC_014222	TGAACC	2	12	809054	809065	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	297619252
356	NC_014222	TGACGA	2	12	810037	810048	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	297619253
357	NC_014222	ATAATG	2	12	812522	812533	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	297619255
358	NC_014222	GCTACT	2	12	816454	816465	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	297619258
359	NC_014222	TAAATC	3	18	817155	817172	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	297619259
360	NC_014222	TTTAGA	2	12	817620	817631	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	297619259
361	NC_014222	AAAGTT	2	12	831190	831201	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	297619269
362	NC_014222	ACTCCA	2	12	831811	831822	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	297619270
363	NC_014222	CCATTC	2	12	832713	832724	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	297619270
364	NC_014222	TACCAC	2	12	836137	836148	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	297619273
365	NC_014222	TTAAAT	2	12	840473	840484	50 %	50 %	0 %	0 %	297619277
366	NC_014222	AATTAA	2	12	840705	840716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297619277
367	NC_014222	AAGAGC	2	12	842219	842230	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	297619279
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370	NC_014222	ATATTT	2	12	847350	847361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297619283
371	NC_014222	CAAAAT	2	12	847375	847386	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	297619283
372	NC_014222	AAAATA	2	12	847904	847915	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	297619283
373	NC_014222	TCATAC	2	12	847927	847938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297619283
374	NC_014222	TTGCTT	2	12	848509	848520	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	297619284
375	NC_014222	TTAAAT	2	12	848653	848664	50 %	50 %	0 %	0 %	297619284
376	NC_014222	GTTATT	2	12	853308	853319	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	297619288
377	NC_014222	TAGTAA	2	12	856395	856406	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	297619290
378	NC_014222	TAGTAA	2	12	856437	856448	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	297619290
379	NC_014222	ATGAAA	2	12	858922	858933	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	297619292
380	NC_014222	CGAAAA	2	12	860291	860302	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	297619292
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382	NC_014222	CATATT	2	12	863002	863013	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	297619294
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387	NC_014222	TCATTG	2	12	877354	877365	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	297619306
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394	NC_014222	TTTCTT	2	12	889228	889239	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	297619315
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423	NC_014222	TCTTTT	2	12	945541	945552	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	297619360
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451	NC_014222	TTAAAA	2	12	1007131	1007142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297619418
452	NC_014222	AAATTT	2	12	1010969	1010980	50 %	50 %	0 %	0 %	297619422
453	NC_014222	TTTTCT	2	12	1011039	1011050	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	297619423
454	NC_014222	TTTAAA	2	12	1012502	1012513	50 %	50 %	0 %	0 %	297619423
455	NC_014222	ATCATA	2	12	1013507	1013518	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	297619424
456	NC_014222	CCTGAC	2	12	1017602	1017613	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	297619427
457	NC_014222	TGCTGT	2	12	1018096	1018107	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	297619427
458	NC_014222	GCTTGA	2	12	1021042	1021053	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	297619430
459	NC_014222	TAATTC	2	12	1021132	1021143	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	297619430
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461	NC_014222	ATTTTT	2	12	1033412	1033423	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	297619434
462	NC_014222	TAATCT	2	12	1038049	1038060	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	297619439
463	NC_014222	GTTAAG	2	12	1042738	1042749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297619443
464	NC_014222	ATATTT	2	12	1059087	1059098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297619456
465	NC_014222	TTAAAT	2	12	1059337	1059348	50 %	50 %	0 %	0 %	297619456
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