MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Meiothermus silvanus DSM 9946 plasmid pMESIL01

Total Repeats: 6565

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014213	CTC	2	6	434	439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567558
2	NC_014213	CTC	2	6	443	448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567558
3	NC_014213	GCCCAG	2	12	464	475	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	297567558
4	NC_014213	C	6	6	527	532	0 %	0 %	0 %	100 %	297567558
5	NC_014213	CTACC	2	10	547	556	20 %	20 %	0 %	60 %	297567558
6	NC_014213	GC	3	6	560	565	0 %	0 %	50 %	50 %	297567558
7	NC_014213	CTG	3	9	569	577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567558
8	NC_014213	GAG	2	6	611	616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567558
9	NC_014213	TGGTCT	2	12	708	719	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	297567558
10	NC_014213	GCTG	2	8	813	820	0 %	25 %	50 %	25 %	297567558
11	NC_014213	GTG	2	6	877	882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567559
12	NC_014213	TCCA	2	8	904	911	25 %	25 %	0 %	50 %	297567559
13	NC_014213	GGC	2	6	957	962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567559
14	NC_014213	G	7	7	1005	1011	0 %	0 %	100 %	0 %	297567559
15	NC_014213	ACC	2	6	1049	1054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567559
16	NC_014213	TGG	2	6	1055	1060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567559
17	NC_014213	GGC	2	6	1110	1115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567559
18	NC_014213	TCC	2	6	1121	1126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567559
19	NC_014213	C	7	7	1125	1131	0 %	0 %	0 %	100 %	297567559
20	NC_014213	GACG	2	8	1183	1190	25 %	0 %	50 %	25 %	297567559
21	NC_014213	TGGC	2	8	1214	1221	0 %	25 %	50 %	25 %	297567559
22	NC_014213	ATG	2	6	1300	1305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297567559
23	NC_014213	GAT	2	6	1323	1328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297567559
24	NC_014213	CTG	3	9	1378	1386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567559
25	NC_014213	CGGCC	2	10	1437	1446	0 %	0 %	40 %	60 %	297567559
26	NC_014213	GCCG	2	8	1500	1507	0 %	0 %	50 %	50 %	297567559
27	NC_014213	GCC	2	6	1516	1521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567559
28	NC_014213	CTT	2	6	1530	1535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567559
29	NC_014213	CGG	2	6	1551	1556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567559
30	NC_014213	TGG	2	6	1562	1567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567559
31	NC_014213	CAT	2	6	1593	1598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297567559
32	NC_014213	AGG	2	6	1637	1642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567559
33	NC_014213	AGG	2	6	1707	1712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567559
34	NC_014213	CCG	2	6	1732	1737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567560
35	NC_014213	GCC	2	6	1757	1762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567560
36	NC_014213	GCCA	2	8	1784	1791	25 %	0 %	25 %	50 %	297567560
37	NC_014213	ACGC	2	8	1815	1822	25 %	0 %	25 %	50 %	297567560
38	NC_014213	C	7	7	1822	1828	0 %	0 %	0 %	100 %	297567560
39	NC_014213	GTA	2	6	1862	1867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297567560
40	NC_014213	GTGG	2	8	1868	1875	0 %	25 %	75 %	0 %	297567560
41	NC_014213	CAC	2	6	1888	1893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567560
42	NC_014213	AGC	3	9	1911	1919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567560
43	NC_014213	GGT	2	6	1933	1938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567560
44	NC_014213	GGT	2	6	2038	2043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567560
45	NC_014213	GGT	2	6	2053	2058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567560
46	NC_014213	CGG	2	6	2096	2101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567560
47	NC_014213	CCT	2	6	2206	2211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567560
48	NC_014213	GCG	2	6	2248	2253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567560
49	NC_014213	CGA	2	6	2269	2274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567560
50	NC_014213	G	7	7	2279	2285	0 %	0 %	100 %	0 %	297567560
51	NC_014213	C	7	7	2308	2314	0 %	0 %	0 %	100 %	297567560
52	NC_014213	C	6	6	2324	2329	0 %	0 %	0 %	100 %	297567560
53	NC_014213	GCGG	2	8	2341	2348	0 %	0 %	75 %	25 %	297567560
54	NC_014213	CTGGC	2	10	2354	2363	0 %	20 %	40 %	40 %	297567560
55	NC_014213	GCC	2	6	2447	2452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567560
56	NC_014213	GAA	2	6	2521	2526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297567560
57	NC_014213	C	7	7	2578	2584	0 %	0 %	0 %	100 %	297567560
58	NC_014213	GCC	2	6	2591	2596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567560
59	NC_014213	C	6	6	2645	2650	0 %	0 %	0 %	100 %	297567560
60	NC_014213	TGG	2	6	2685	2690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567560
61	NC_014213	CAGC	2	8	2770	2777	25 %	0 %	25 %	50 %	297567560
62	NC_014213	GGA	2	6	2851	2856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567560
63	NC_014213	GGC	2	6	2893	2898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567560
64	NC_014213	CCG	2	6	2955	2960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567560
65	NC_014213	CG	4	8	3003	3010	0 %	0 %	50 %	50 %	297567560
66	NC_014213	GAG	2	6	3012	3017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567560
67	NC_014213	GGA	2	6	3030	3035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567561
68	NC_014213	GCT	2	6	3046	3051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567561
69	NC_014213	G	6	6	3052	3057	0 %	0 %	100 %	0 %	297567561
70	NC_014213	CTC	2	6	3065	3070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567561
71	NC_014213	AGCCCA	2	12	3085	3096	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	297567561
72	NC_014213	A	6	6	3114	3119	100 %	0 %	0 %	0 %	297567561
73	NC_014213	GGT	2	6	3190	3195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567561
74	NC_014213	TCA	2	6	3270	3275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297567561
75	NC_014213	CAC	2	6	3302	3307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567561
76	NC_014213	G	7	7	3308	3314	0 %	0 %	100 %	0 %	297567561
77	NC_014213	TGG	2	6	3360	3365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567561
78	NC_014213	AGA	2	6	3388	3393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297567561
79	NC_014213	C	7	7	3469	3475	0 %	0 %	0 %	100 %	297567561
80	NC_014213	CTG	3	9	3548	3556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567561
81	NC_014213	GGA	2	6	3652	3657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567561
82	NC_014213	TGG	2	6	3663	3668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567561
83	NC_014213	TGG	2	6	3723	3728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567561
84	NC_014213	GGGAG	2	10	3738	3747	20 %	0 %	80 %	0 %	297567561
85	NC_014213	CCA	2	6	3792	3797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567561
86	NC_014213	CAT	2	6	3883	3888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297567561
87	NC_014213	GCCTG	2	10	3942	3951	0 %	20 %	40 %	40 %	297567561
88	NC_014213	CGA	2	6	3991	3996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567561
89	NC_014213	GGT	2	6	4090	4095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567561
90	NC_014213	G	7	7	4120	4126	0 %	0 %	100 %	0 %	297567561
91	NC_014213	GAG	2	6	4145	4150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567561
92	NC_014213	TTC	2	6	4151	4156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567561
93	NC_014213	AAC	2	6	4172	4177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297567561
94	NC_014213	TGGG	2	8	4251	4258	0 %	25 %	75 %	0 %	297567561
95	NC_014213	CGG	2	6	4272	4277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567561
96	NC_014213	GCG	2	6	4284	4289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567561
97	NC_014213	CTG	2	6	4326	4331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567562
98	NC_014213	GCC	2	6	4350	4355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567562
99	NC_014213	C	6	6	4372	4377	0 %	0 %	0 %	100 %	297567562
100	NC_014213	CGG	2	6	4414	4419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567562
101	NC_014213	C	6	6	4443	4448	0 %	0 %	0 %	100 %	297567562
102	NC_014213	G	6	6	4454	4459	0 %	0 %	100 %	0 %	297567562
103	NC_014213	GGA	2	6	4463	4468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567562
104	NC_014213	TGG	2	6	4543	4548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567562
105	NC_014213	CCAG	2	8	4582	4589	25 %	0 %	25 %	50 %	297567562
106	NC_014213	ACT	2	6	4603	4608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297567562
107	NC_014213	CAC	2	6	4619	4624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567562
108	NC_014213	CCG	2	6	4640	4645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567562
109	NC_014213	TGG	2	6	4699	4704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567562
110	NC_014213	GCT	2	6	4709	4714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567562
111	NC_014213	CAGC	2	8	4739	4746	25 %	0 %	25 %	50 %	297567562
112	NC_014213	CCTA	2	8	4934	4941	25 %	25 %	0 %	50 %	297567563
113	NC_014213	G	6	6	4954	4959	0 %	0 %	100 %	0 %	297567563
114	NC_014213	T	6	6	4990	4995	0 %	100 %	0 %	0 %	297567563
115	NC_014213	CGG	2	6	5010	5015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567563
116	NC_014213	CTG	2	6	5057	5062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567563
117	NC_014213	AGG	2	6	5092	5097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567563
118	NC_014213	G	6	6	5096	5101	0 %	0 %	100 %	0 %	297567563
119	NC_014213	CTG	2	6	5111	5116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567563
120	NC_014213	G	6	6	5148	5153	0 %	0 %	100 %	0 %	297567563
121	NC_014213	ACC	2	6	5177	5182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567563
122	NC_014213	G	6	6	5190	5195	0 %	0 %	100 %	0 %	297567563
123	NC_014213	GCTGGG	2	12	5215	5226	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	297567563
124	NC_014213	GGC	2	6	5255	5260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567563
125	NC_014213	GCT	2	6	5296	5301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567563
126	NC_014213	TCC	2	6	5334	5339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567563
127	NC_014213	TGG	2	6	5340	5345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567563
128	NC_014213	ACCG	2	8	5354	5361	25 %	0 %	25 %	50 %	297567563
129	NC_014213	TGG	4	12	5430	5441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567563
130	NC_014213	TGC	3	9	5445	5453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567563
131	NC_014213	CTT	2	6	5482	5487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567563
132	NC_014213	TGC	2	6	5595	5600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567564
133	NC_014213	AAG	3	9	5648	5656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297567564
134	NC_014213	TTG	2	6	5660	5665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297567564
135	NC_014213	CTG	2	6	5666	5671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567564
136	NC_014213	CGG	2	6	5784	5789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567564
137	NC_014213	GAG	2	6	5807	5812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567564
138	NC_014213	TGC	2	6	5814	5819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567564
139	NC_014213	CGC	2	6	5888	5893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567564
140	NC_014213	CGA	2	6	5923	5928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567564
141	NC_014213	GGA	2	6	5947	5952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567564
142	NC_014213	GGC	2	6	5995	6000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567564
143	NC_014213	CTGGG	2	10	6032	6041	0 %	20 %	60 %	20 %	297567564
144	NC_014213	GCA	2	6	6064	6069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567564
145	NC_014213	T	6	6	6151	6156	0 %	100 %	0 %	0 %	297567564
146	NC_014213	TGG	2	6	6168	6173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567564
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148	NC_014213	TCTGGG	2	12	6196	6207	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	297567564
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150	NC_014213	GCT	2	6	6341	6346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567564
151	NC_014213	CG	3	6	6365	6370	0 %	0 %	50 %	50 %	297567564
152	NC_014213	CTG	2	6	6410	6415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567564
153	NC_014213	GCGGGC	2	12	6505	6516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567564
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158	NC_014213	GCCGAG	2	12	6959	6970	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	297567564
159	NC_014213	CTGGCC	2	12	6989	7000	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	297567564
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179	NC_014213	GTCT	2	8	7706	7713	0 %	50 %	25 %	25 %	297567565
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248	NC_014213	GCA	2	6	11035	11040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567567
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253	NC_014213	GTGC	2	8	11450	11457	0 %	25 %	50 %	25 %	297567568
254	NC_014213	CGA	2	6	11468	11473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567568
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258	NC_014213	GCGGG	2	10	11765	11774	0 %	0 %	80 %	20 %	297567568
259	NC_014213	CTA	2	6	11778	11783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297567568
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261	NC_014213	CCG	2	6	11915	11920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567568
262	NC_014213	C	6	6	11929	11934	0 %	0 %	0 %	100 %	297567568
263	NC_014213	GGACG	2	10	11970	11979	20 %	0 %	60 %	20 %	297567568
264	NC_014213	CGG	2	6	12086	12091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567568
265	NC_014213	AGG	2	6	12165	12170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567568
266	NC_014213	T	7	7	12192	12198	0 %	100 %	0 %	0 %	297567569
267	NC_014213	TGC	3	9	12204	12212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567569
268	NC_014213	GCG	3	9	12231	12239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567569
269	NC_014213	TGG	2	6	12261	12266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567569
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391	NC_014213	CGGC	2	8	18749	18756	0 %	0 %	50 %	50 %	297567574
392	NC_014213	AGC	2	6	18829	18834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567574
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395	NC_014213	TGG	2	6	19058	19063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567574
396	NC_014213	GCT	2	6	19161	19166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567574
397	NC_014213	GCT	2	6	19203	19208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567574
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399	NC_014213	CTGG	2	8	19383	19390	0 %	25 %	50 %	25 %	297567574
400	NC_014213	TGC	2	6	19394	19399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567574
401	NC_014213	CGG	2	6	19427	19432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567574
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463	NC_014213	CGGG	2	8	22438	22445	0 %	0 %	75 %	25 %	297567577
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497	NC_014213	GAG	2	6	26165	26170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567581
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499	NC_014213	GCC	2	6	26225	26230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567581
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