MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Meiothermus silvanus DSM 9946 chromosome

Total Repeats: 2528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014212	CT	3	6	2555	2560	0 %	50 %	0 %	50 %	297564486
2	NC_014212	CT	3	6	2720	2725	0 %	50 %	0 %	50 %	297564486
3	NC_014212	GT	3	6	3121	3126	0 %	50 %	50 %	0 %	297564487
4	NC_014212	CG	3	6	3287	3292	0 %	0 %	50 %	50 %	297564487
5	NC_014212	CG	3	6	3890	3895	0 %	0 %	50 %	50 %	297564487
6	NC_014212	CT	3	6	5122	5127	0 %	50 %	0 %	50 %	297564488
7	NC_014212	CG	3	6	6400	6405	0 %	0 %	50 %	50 %	297564489
8	NC_014212	AG	3	6	6410	6415	50 %	0 %	50 %	0 %	297564489
9	NC_014212	TC	3	6	9866	9871	0 %	50 %	0 %	50 %	297564490
10	NC_014212	CG	3	6	11391	11396	0 %	0 %	50 %	50 %	297564492
11	NC_014212	GC	3	6	11727	11732	0 %	0 %	50 %	50 %	297564492
12	NC_014212	GA	3	6	12418	12423	50 %	0 %	50 %	0 %	297564493
13	NC_014212	CT	3	6	19165	19170	0 %	50 %	0 %	50 %	297564501
14	NC_014212	GC	3	6	20430	20435	0 %	0 %	50 %	50 %	297564503
15	NC_014212	GA	3	6	20733	20738	50 %	0 %	50 %	0 %	297564503
16	NC_014212	GC	3	6	25530	25535	0 %	0 %	50 %	50 %	297564508
17	NC_014212	GT	3	6	25650	25655	0 %	50 %	50 %	0 %	297564508
18	NC_014212	CT	3	6	26376	26381	0 %	50 %	0 %	50 %	297564509
19	NC_014212	TC	3	6	26864	26869	0 %	50 %	0 %	50 %	297564510
20	NC_014212	CG	3	6	30344	30349	0 %	0 %	50 %	50 %	297564513
21	NC_014212	GC	3	6	30448	30453	0 %	0 %	50 %	50 %	297564513
22	NC_014212	CG	3	6	31218	31223	0 %	0 %	50 %	50 %	297564513
23	NC_014212	CG	3	6	31743	31748	0 %	0 %	50 %	50 %	297564513
24	NC_014212	GC	4	8	31991	31998	0 %	0 %	50 %	50 %	297564513
25	NC_014212	CG	3	6	32283	32288	0 %	0 %	50 %	50 %	297564514
26	NC_014212	GC	3	6	33592	33597	0 %	0 %	50 %	50 %	297564515
27	NC_014212	CA	3	6	33670	33675	50 %	0 %	0 %	50 %	297564515
28	NC_014212	GC	3	6	34792	34797	0 %	0 %	50 %	50 %	297564516
29	NC_014212	GC	3	6	35044	35049	0 %	0 %	50 %	50 %	297564516
30	NC_014212	CG	3	6	35426	35431	0 %	0 %	50 %	50 %	297564516
31	NC_014212	CT	3	6	37428	37433	0 %	50 %	0 %	50 %	297564518
32	NC_014212	CG	3	6	39159	39164	0 %	0 %	50 %	50 %	297564519
33	NC_014212	CG	3	6	39658	39663	0 %	0 %	50 %	50 %	297564519
34	NC_014212	GC	3	6	41219	41224	0 %	0 %	50 %	50 %	297564520
35	NC_014212	GT	3	6	41913	41918	0 %	50 %	50 %	0 %	297564521
36	NC_014212	GC	3	6	42203	42208	0 %	0 %	50 %	50 %	297564521
37	NC_014212	CG	3	6	43041	43046	0 %	0 %	50 %	50 %	297564522
38	NC_014212	CA	3	6	43385	43390	50 %	0 %	0 %	50 %	297564522
39	NC_014212	GT	3	6	46023	46028	0 %	50 %	50 %	0 %	297564525
40	NC_014212	TA	3	6	48798	48803	50 %	50 %	0 %	0 %	297564528
41	NC_014212	CT	3	6	50227	50232	0 %	50 %	0 %	50 %	297564531
42	NC_014212	GT	3	6	50820	50825	0 %	50 %	50 %	0 %	297564532
43	NC_014212	CG	3	6	52729	52734	0 %	0 %	50 %	50 %	297564533
44	NC_014212	TC	3	6	55104	55109	0 %	50 %	0 %	50 %	297564536
45	NC_014212	CG	3	6	55390	55395	0 %	0 %	50 %	50 %	297564536
46	NC_014212	CT	3	6	56638	56643	0 %	50 %	0 %	50 %	297564537
47	NC_014212	GC	3	6	64381	64386	0 %	0 %	50 %	50 %	297564547
48	NC_014212	CT	3	6	64620	64625	0 %	50 %	0 %	50 %	297564548
49	NC_014212	AG	3	6	67053	67058	50 %	0 %	50 %	0 %	297564551
50	NC_014212	CG	3	6	67178	67183	0 %	0 %	50 %	50 %	297564551
51	NC_014212	CG	3	6	70438	70443	0 %	0 %	50 %	50 %	297564553
52	NC_014212	CT	3	6	74400	74405	0 %	50 %	0 %	50 %	297564558
53	NC_014212	CG	3	6	74408	74413	0 %	0 %	50 %	50 %	297564558
54	NC_014212	TC	3	6	76910	76915	0 %	50 %	0 %	50 %	297564560
55	NC_014212	GC	3	6	77756	77761	0 %	0 %	50 %	50 %	297564560
56	NC_014212	CT	3	6	77901	77906	0 %	50 %	0 %	50 %	297564560
57	NC_014212	CG	3	6	78409	78414	0 %	0 %	50 %	50 %	297564561
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60	NC_014212	CG	3	6	79469	79474	0 %	0 %	50 %	50 %	297564562
61	NC_014212	AG	3	6	85464	85469	50 %	0 %	50 %	0 %	297564567
62	NC_014212	CT	3	6	85513	85518	0 %	50 %	0 %	50 %	297564567
63	NC_014212	GA	3	6	89577	89582	50 %	0 %	50 %	0 %	297564569
64	NC_014212	CG	3	6	92065	92070	0 %	0 %	50 %	50 %	297564570
65	NC_014212	TG	3	6	94812	94817	0 %	50 %	50 %	0 %	297564573
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67	NC_014212	CT	3	6	96433	96438	0 %	50 %	0 %	50 %	297564575
68	NC_014212	CT	3	6	96797	96802	0 %	50 %	0 %	50 %	297564575
69	NC_014212	TC	3	6	98587	98592	0 %	50 %	0 %	50 %	297564577
70	NC_014212	CG	3	6	99022	99027	0 %	0 %	50 %	50 %	297564578
71	NC_014212	CG	3	6	100024	100029	0 %	0 %	50 %	50 %	297564579
72	NC_014212	CG	3	6	103871	103876	0 %	0 %	50 %	50 %	297564583
73	NC_014212	GA	3	6	103971	103976	50 %	0 %	50 %	0 %	297564583
74	NC_014212	GA	3	6	104637	104642	50 %	0 %	50 %	0 %	297564583
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79	NC_014212	GA	3	6	109764	109769	50 %	0 %	50 %	0 %	297564587
80	NC_014212	CA	3	6	109948	109953	50 %	0 %	0 %	50 %	297564587
81	NC_014212	TC	3	6	111452	111457	0 %	50 %	0 %	50 %	297564588
82	NC_014212	CG	3	6	112686	112691	0 %	0 %	50 %	50 %	297564588
83	NC_014212	TC	3	6	113093	113098	0 %	50 %	0 %	50 %	297564588
84	NC_014212	GT	3	6	113338	113343	0 %	50 %	50 %	0 %	297564588
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88	NC_014212	AG	3	6	120126	120131	50 %	0 %	50 %	0 %	297564595
89	NC_014212	GC	3	6	121446	121451	0 %	0 %	50 %	50 %	297564597
90	NC_014212	CG	3	6	122384	122389	0 %	0 %	50 %	50 %	297564597
91	NC_014212	GA	3	6	123321	123326	50 %	0 %	50 %	0 %	297564598
92	NC_014212	GC	3	6	124037	124042	0 %	0 %	50 %	50 %	297564598
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94	NC_014212	TC	3	6	125577	125582	0 %	50 %	0 %	50 %	297564599
95	NC_014212	CT	3	6	130266	130271	0 %	50 %	0 %	50 %	297564604
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99	NC_014212	GA	3	6	132772	132777	50 %	0 %	50 %	0 %	297564606
100	NC_014212	GC	3	6	134007	134012	0 %	0 %	50 %	50 %	297564607
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102	NC_014212	GA	3	6	135114	135119	50 %	0 %	50 %	0 %	297564609
103	NC_014212	GC	3	6	136326	136331	0 %	0 %	50 %	50 %	297564609
104	NC_014212	AG	3	6	136867	136872	50 %	0 %	50 %	0 %	297564610
105	NC_014212	CG	3	6	138787	138792	0 %	0 %	50 %	50 %	297564610
106	NC_014212	GC	3	6	139001	139006	0 %	0 %	50 %	50 %	297564610
107	NC_014212	CA	3	6	139564	139569	50 %	0 %	0 %	50 %	297564611
108	NC_014212	GC	3	6	139636	139641	0 %	0 %	50 %	50 %	297564611
109	NC_014212	GC	3	6	140765	140770	0 %	0 %	50 %	50 %	297564614
110	NC_014212	GC	3	6	141912	141917	0 %	0 %	50 %	50 %	297564614
111	NC_014212	GC	4	8	143408	143415	0 %	0 %	50 %	50 %	297564616
112	NC_014212	CG	3	6	143432	143437	0 %	0 %	50 %	50 %	297564616
113	NC_014212	GA	3	6	147589	147594	50 %	0 %	50 %	0 %	297564622
114	NC_014212	GA	3	6	147804	147809	50 %	0 %	50 %	0 %	297564622
115	NC_014212	CG	3	6	148519	148524	0 %	0 %	50 %	50 %	297564623
116	NC_014212	CG	3	6	149429	149434	0 %	0 %	50 %	50 %	297564624
117	NC_014212	GC	3	6	151653	151658	0 %	0 %	50 %	50 %	297564626
118	NC_014212	GA	3	6	152219	152224	50 %	0 %	50 %	0 %	297564627
119	NC_014212	CT	3	6	152436	152441	0 %	50 %	0 %	50 %	297564627
120	NC_014212	GT	3	6	154534	154539	0 %	50 %	50 %	0 %	297564629
121	NC_014212	GC	3	6	158793	158798	0 %	0 %	50 %	50 %	297564635
122	NC_014212	CA	3	6	159455	159460	50 %	0 %	0 %	50 %	297564635
123	NC_014212	GC	3	6	160585	160590	0 %	0 %	50 %	50 %	297564636
124	NC_014212	AC	3	6	163252	163257	50 %	0 %	0 %	50 %	297564639
125	NC_014212	CT	3	6	166345	166350	0 %	50 %	0 %	50 %	297564642
126	NC_014212	AG	3	6	166776	166781	50 %	0 %	50 %	0 %	297564642
127	NC_014212	CT	3	6	167307	167312	0 %	50 %	0 %	50 %	297564643
128	NC_014212	AG	3	6	170826	170831	50 %	0 %	50 %	0 %	297564646
129	NC_014212	CG	3	6	171221	171226	0 %	0 %	50 %	50 %	297564647
130	NC_014212	GA	3	6	173441	173446	50 %	0 %	50 %	0 %	297564650
131	NC_014212	GA	3	6	174658	174663	50 %	0 %	50 %	0 %	297564652
132	NC_014212	TC	3	6	177519	177524	0 %	50 %	0 %	50 %	297564654
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139	NC_014212	AG	3	6	187870	187875	50 %	0 %	50 %	0 %	297564664
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