MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Meiothermus silvanus DSM 9946 chromosome

Total Repeats: 58234

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014212	GCT	2	6	57292	57297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564538
1002	NC_014212	GGC	2	6	57306	57311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564538
1003	NC_014212	CCT	2	6	57349	57354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297564538
1004	NC_014212	CCT	2	6	57408	57413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297564538
1005	NC_014212	GGC	2	6	57495	57500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564538
1006	NC_014212	AGT	2	6	57555	57560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297564538
1007	NC_014212	CCG	2	6	57600	57605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564538
1008	NC_014212	ACCTCC	2	12	57647	57658	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	297564538
1009	NC_014212	CGG	2	6	57737	57742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564539
1010	NC_014212	TTC	2	6	57745	57750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297564539
1011	NC_014212	GAG	2	6	57844	57849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564539
1012	NC_014212	CAT	2	6	57862	57867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564539
1013	NC_014212	GCC	2	6	57870	57875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564539
1014	NC_014212	AGCCC	2	10	57952	57961	20 %	0 %	20 %	60 %	297564539
1015	NC_014212	GAG	2	6	58030	58035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564539
1016	NC_014212	GCGG	2	8	58039	58046	0 %	0 %	75 %	25 %	297564539
1017	NC_014212	TCC	2	6	58109	58114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297564539
1018	NC_014212	CCA	2	6	58290	58295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564539
1019	NC_014212	GCC	2	6	58332	58337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564539
1020	NC_014212	CTA	2	6	58404	58409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564539
1021	NC_014212	TCC	2	6	58805	58810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297564540
1022	NC_014212	TCT	2	6	58836	58841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297564540
1023	NC_014212	TCT	2	6	58850	58855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297564540
1024	NC_014212	C	7	7	58866	58872	0 %	0 %	0 %	100 %	297564540
1025	NC_014212	TCG	2	6	58877	58882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564540
1026	NC_014212	CTC	2	6	58897	58902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297564540
1027	NC_014212	TCC	2	6	58916	58921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297564540
1028	NC_014212	CGC	2	6	58929	58934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564540
1029	NC_014212	GCTC	2	8	59043	59050	0 %	25 %	25 %	50 %	297564540
1030	NC_014212	GCA	2	6	59055	59060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564540
1031	NC_014212	CCT	2	6	59070	59075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297564540
1032	NC_014212	TCA	2	6	59082	59087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564540
1033	NC_014212	CAC	2	6	59326	59331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564541
1034	NC_014212	GGA	2	6	59358	59363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564541
1035	NC_014212	GCT	2	6	59373	59378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564541
1036	NC_014212	GGC	2	6	59415	59420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564541
1037	NC_014212	GCG	2	6	59433	59438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564541
1038	NC_014212	CTG	3	9	59484	59492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564541
1039	NC_014212	GGC	2	6	59493	59498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564541
1040	NC_014212	GCT	2	6	59625	59630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564541
1041	NC_014212	CAG	2	6	59673	59678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564541
1042	NC_014212	GCG	2	6	59692	59697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564541
1043	NC_014212	CTG	3	9	59725	59733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564541
1044	NC_014212	AGG	2	6	59795	59800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564541
1045	NC_014212	GTCCAA	2	12	59979	59990	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	297564542
1046	NC_014212	GCAGC	2	10	60120	60129	20 %	0 %	40 %	40 %	297564542
1047	NC_014212	GGC	2	6	60131	60136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564542
1048	NC_014212	CGG	2	6	60146	60151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564542
1049	NC_014212	TCA	2	6	60183	60188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564543
1050	NC_014212	AGCC	2	8	60193	60200	25 %	0 %	25 %	50 %	297564543
1051	NC_014212	GCTC	2	8	60217	60224	0 %	25 %	25 %	50 %	297564543
1052	NC_014212	GGT	2	6	60319	60324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564543
1053	NC_014212	CAA	2	6	60412	60417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297564543
1054	NC_014212	AGC	2	6	60639	60644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564543
1055	NC_014212	AGC	2	6	60666	60671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564543
1056	NC_014212	AAG	2	6	60726	60731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297564543
1057	NC_014212	C	6	6	60764	60769	0 %	0 %	0 %	100 %	297564543
1058	NC_014212	GAG	2	6	60950	60955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564543
1059	NC_014212	GACC	2	8	60959	60966	25 %	0 %	25 %	50 %	297564543
1060	NC_014212	CGGG	2	8	60994	61001	0 %	0 %	75 %	25 %	297564543
1061	NC_014212	GCT	2	6	61012	61017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564543
1062	NC_014212	TGAGG	2	10	61093	61102	20 %	20 %	60 %	0 %	297564543
1063	NC_014212	GGC	2	6	61114	61119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564543
1064	NC_014212	AAG	2	6	61131	61136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297564543
1065	NC_014212	ATCC	2	8	61151	61158	25 %	25 %	0 %	50 %	297564543
1066	NC_014212	CTG	2	6	61298	61303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564544
1067	NC_014212	C	6	6	61321	61326	0 %	0 %	0 %	100 %	297564544
1068	NC_014212	TCA	2	6	61448	61453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564544
1069	NC_014212	CGC	2	6	61473	61478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564544
1070	NC_014212	GGA	2	6	61572	61577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564544
1071	NC_014212	TTTTC	2	10	61741	61750	0 %	80 %	0 %	20 %	297564544
1072	NC_014212	CCT	2	6	61767	61772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297564544
1073	NC_014212	GCTACG	2	12	61793	61804	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	297564544
1074	NC_014212	ACC	2	6	61846	61851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564544
1075	NC_014212	CGG	2	6	61877	61882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564544
1076	NC_014212	ATC	2	6	61903	61908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564544
1077	NC_014212	TGG	2	6	61916	61921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564544
1078	NC_014212	CTG	2	6	61948	61953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564544
1079	NC_014212	GGA	2	6	61974	61979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564544
1080	NC_014212	GCC	2	6	61986	61991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564544
1081	NC_014212	C	6	6	62013	62018	0 %	0 %	0 %	100 %	297564544
1082	NC_014212	CCGC	2	8	62024	62031	0 %	0 %	25 %	75 %	297564544
1083	NC_014212	CGG	2	6	62059	62064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564544
1084	NC_014212	CGGT	2	8	62072	62079	0 %	25 %	50 %	25 %	297564544
1085	NC_014212	TCA	2	6	62159	62164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564544
1086	NC_014212	C	6	6	62165	62170	0 %	0 %	0 %	100 %	297564544
1087	NC_014212	TGA	2	6	62234	62239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297564544
1088	NC_014212	GCGGG	2	10	62254	62263	0 %	0 %	80 %	20 %	297564544
1089	NC_014212	GCG	2	6	62287	62292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564544
1090	NC_014212	GAA	2	6	62648	62653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297564545
1091	NC_014212	ACT	2	6	62658	62663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564545
1092	NC_014212	GCC	2	6	62668	62673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564545
1093	NC_014212	G	6	6	62748	62753	0 %	0 %	100 %	0 %	297564545
1094	NC_014212	GAA	2	6	62872	62877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297564546
1095	NC_014212	GGC	2	6	62892	62897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564546
1096	NC_014212	ACCC	2	8	62942	62949	25 %	0 %	0 %	75 %	297564546
1097	NC_014212	GCG	2	6	62970	62975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564546
1098	NC_014212	GGT	2	6	63054	63059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564546
1099	NC_014212	CGG	2	6	63090	63095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564546
1100	NC_014212	GTG	2	6	63168	63173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564546
1101	NC_014212	GCC	2	6	63321	63326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564547
1102	NC_014212	TGG	2	6	63417	63422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564547
1103	NC_014212	CTG	2	6	63425	63430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564547
1104	NC_014212	CCA	2	6	63481	63486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564547
1105	NC_014212	GGC	2	6	63488	63493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564547
1106	NC_014212	GCC	2	6	63520	63525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564547
1107	NC_014212	G	6	6	63537	63542	0 %	0 %	100 %	0 %	297564547
1108	NC_014212	AAG	2	6	63590	63595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297564547
1109	NC_014212	GCC	2	6	63633	63638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564547
1110	NC_014212	GGC	2	6	63662	63667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564547
1111	NC_014212	GGA	2	6	63868	63873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564547
1112	NC_014212	CGC	2	6	63925	63930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564547
1113	NC_014212	TGG	2	6	64005	64010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564547
1114	NC_014212	CTG	2	6	64046	64051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564547
1115	NC_014212	CCG	2	6	64056	64061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564547
1116	NC_014212	CGTGG	2	10	64159	64168	0 %	20 %	60 %	20 %	297564547
1117	NC_014212	GGA	2	6	64189	64194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564547
1118	NC_014212	GCCAAG	2	12	64253	64264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564547
1119	NC_014212	A	7	7	64284	64290	100 %	0 %	0 %	0 %	297564547
1120	NC_014212	GGA	2	6	64315	64320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564547
1121	NC_014212	GGA	2	6	64375	64380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564547
1122	NC_014212	GC	3	6	64381	64386	0 %	0 %	50 %	50 %	297564547
1123	NC_014212	GGGGC	2	10	64428	64437	0 %	0 %	80 %	20 %	297564547
1124	NC_014212	TGC	2	6	64483	64488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564548
1125	NC_014212	GCTT	2	8	64492	64499	0 %	50 %	25 %	25 %	297564548
1126	NC_014212	GAT	2	6	64506	64511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297564548
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1131	NC_014212	CTT	2	6	64676	64681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297564548
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1243	NC_014212	G	6	6	70461	70466	0 %	0 %	100 %	0 %	297564553
1244	NC_014212	ACC	2	6	70480	70485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564553
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1250	NC_014212	CAC	2	6	71111	71116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564554
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1252	NC_014212	GCC	2	6	71181	71186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564554
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