MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanocaldococcus infernus ME chromosome

Total Repeats: 32544

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_014122	TGT	3	9	199172	199180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296108904
5003	NC_014122	TTAC	2	8	199215	199222	25 %	50 %	0 %	25 %	296108904
5004	NC_014122	AT	4	8	199236	199243	50 %	50 %	0 %	0 %	296108904
5005	NC_014122	GAA	2	6	199350	199355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108904
5006	NC_014122	AG	3	6	199361	199366	50 %	0 %	50 %	0 %	296108904
5007	NC_014122	GA	3	6	199371	199376	50 %	0 %	50 %	0 %	296108904
5008	NC_014122	GA	3	6	199378	199383	50 %	0 %	50 %	0 %	296108904
5009	NC_014122	AT	4	8	199443	199450	50 %	50 %	0 %	0 %	296108904
5010	NC_014122	AG	3	6	199575	199580	50 %	0 %	50 %	0 %	296108904
5011	NC_014122	AG	3	6	199632	199637	50 %	0 %	50 %	0 %	296108904
5012	NC_014122	TAA	2	6	199642	199647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108904
5013	NC_014122	TTG	2	6	199729	199734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296108904
5014	NC_014122	AGA	3	9	199750	199758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108904
5015	NC_014122	AG	3	6	199789	199794	50 %	0 %	50 %	0 %	296108905
5016	NC_014122	GA	3	6	199795	199800	50 %	0 %	50 %	0 %	296108905
5017	NC_014122	AGAGTT	2	12	199801	199812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108905
5018	NC_014122	A	7	7	199816	199822	100 %	0 %	0 %	0 %	296108905
5019	NC_014122	GAG	2	6	199883	199888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296108905
5020	NC_014122	TTTAAA	2	12	199909	199920	50 %	50 %	0 %	0 %	296108905
5021	NC_014122	AGA	2	6	199971	199976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108905
5022	NC_014122	AGAA	2	8	199988	199995	75 %	0 %	25 %	0 %	296108905
5023	NC_014122	GAGG	2	8	200015	200022	25 %	0 %	75 %	0 %	296108905
5024	NC_014122	GA	3	6	200195	200200	50 %	0 %	50 %	0 %	296108905
5025	NC_014122	T	6	6	200216	200221	0 %	100 %	0 %	0 %	296108905
5026	NC_014122	AGA	2	6	200222	200227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108905
5027	NC_014122	AAG	2	6	200243	200248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108905
5028	NC_014122	AGT	2	6	200260	200265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108905
5029	NC_014122	T	6	6	200323	200328	0 %	100 %	0 %	0 %	296108905
5030	NC_014122	TAA	2	6	200374	200379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108905
5031	NC_014122	AGAA	2	8	200411	200418	75 %	0 %	25 %	0 %	296108905
5032	NC_014122	TTA	2	6	200421	200426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108905
5033	NC_014122	GTT	2	6	200441	200446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296108905
5034	NC_014122	TCC	2	6	200505	200510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296108906
5035	NC_014122	AGAT	2	8	200606	200613	50 %	25 %	25 %	0 %	296108906
5036	NC_014122	ATCTGT	2	12	200635	200646	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	296108906
5037	NC_014122	TAT	2	6	200706	200711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108906
5038	NC_014122	AGG	2	6	200742	200747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296108906
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5040	NC_014122	GAA	2	6	200802	200807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108906
5041	NC_014122	AGA	2	6	200859	200864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108906
5042	NC_014122	GA	3	6	200884	200889	50 %	0 %	50 %	0 %	296108906
5043	NC_014122	ATA	2	6	200894	200899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108906
5044	NC_014122	AG	3	6	200926	200931	50 %	0 %	50 %	0 %	296108906
5045	NC_014122	AAG	2	6	200959	200964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108906
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5047	NC_014122	GTT	2	6	201035	201040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296108906
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5049	NC_014122	GAG	2	6	201103	201108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296108906
5050	NC_014122	CT	4	8	201116	201123	0 %	50 %	0 %	50 %	296108906
5051	NC_014122	GAAG	2	8	201195	201202	50 %	0 %	50 %	0 %	296108906
5052	NC_014122	CT	3	6	201255	201260	0 %	50 %	0 %	50 %	296108906
5053	NC_014122	GAA	2	6	201316	201321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108906
5054	NC_014122	AG	3	6	201328	201333	50 %	0 %	50 %	0 %	296108906
5055	NC_014122	TGC	2	6	201375	201380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296108906
5056	NC_014122	TGA	2	6	201399	201404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108906
5057	NC_014122	AAT	2	6	201421	201426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108906
5058	NC_014122	TTA	2	6	201427	201432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108906
5059	NC_014122	TGG	2	6	201480	201485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296108906
5060	NC_014122	GA	3	6	201494	201499	50 %	0 %	50 %	0 %	296108906
5061	NC_014122	AAAT	2	8	201572	201579	75 %	25 %	0 %	0 %	296108906
5062	NC_014122	AT	3	6	201598	201603	50 %	50 %	0 %	0 %	296108906
5063	NC_014122	GTT	2	6	201643	201648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296108906
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5067	NC_014122	AAG	3	9	201724	201732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108906
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5069	NC_014122	GATA	2	8	201744	201751	50 %	25 %	25 %	0 %	296108906
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5072	NC_014122	TTG	2	6	201863	201868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296108906
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5094	NC_014122	A	6	6	202544	202549	100 %	0 %	0 %	0 %	296108907
5095	NC_014122	AAGT	2	8	202551	202558	50 %	25 %	25 %	0 %	296108907
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5098	NC_014122	AG	4	8	202645	202652	50 %	0 %	50 %	0 %	296108907
5099	NC_014122	GAA	2	6	202667	202672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108907
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5107	NC_014122	T	6	6	202839	202844	0 %	100 %	0 %	0 %	296108908
5108	NC_014122	ATC	2	6	202871	202876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108908
5109	NC_014122	AGAA	2	8	202881	202888	75 %	0 %	25 %	0 %	296108908
5110	NC_014122	A	6	6	202935	202940	100 %	0 %	0 %	0 %	296108908
5111	NC_014122	TAC	2	6	202978	202983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108908
5112	NC_014122	A	6	6	203008	203013	100 %	0 %	0 %	0 %	296108908
5113	NC_014122	ATA	3	9	203032	203040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108908
5114	NC_014122	ATAG	2	8	203056	203063	50 %	25 %	25 %	0 %	296108908
5115	NC_014122	ATTTAC	2	12	203078	203089	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	296108908
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5117	NC_014122	GAA	2	6	203119	203124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108908
5118	NC_014122	A	7	7	203138	203144	100 %	0 %	0 %	0 %	296108908
5119	NC_014122	TAT	2	6	203197	203202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108908
5120	NC_014122	AT	3	6	203217	203222	50 %	50 %	0 %	0 %	296108908
5121	NC_014122	AT	3	6	203245	203250	50 %	50 %	0 %	0 %	296108908
5122	NC_014122	ATG	2	6	203255	203260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108908
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5252	NC_014122	CCT	2	6	209739	209744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296108913
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5256	NC_014122	T	6	6	209908	209913	0 %	100 %	0 %	0 %	296108913
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5272	NC_014122	CT	4	8	210499	210506	0 %	50 %	0 %	50 %	296108914
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5379	NC_014122	AT	3	6	214350	214355	50 %	50 %	0 %	0 %	296108916
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5490	NC_014122	TTCTC	2	10	218350	218359	0 %	60 %	0 %	40 %	296108921
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5497	NC_014122	TC	3	6	218601	218606	0 %	50 %	0 %	50 %	296108922
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