MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 34052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014002	TTC	2	6	239774	239779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494897
4002	NC_014002	AGG	2	6	239811	239816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494897
4003	NC_014002	TCCT	2	8	239830	239837	0 %	50 %	0 %	50 %	294494897
4004	NC_014002	CTG	2	6	239843	239848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494897
4005	NC_014002	CAT	2	6	239849	239854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494897
4006	NC_014002	CTT	2	6	239911	239916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494897
4007	NC_014002	TA	3	6	240111	240116	50 %	50 %	0 %	0 %	294494898
4008	NC_014002	GTC	2	6	240327	240332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494898
4009	NC_014002	ATA	2	6	240373	240378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494898
4010	NC_014002	TCC	2	6	240381	240386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494898
4011	NC_014002	CAA	2	6	240446	240451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494898
4012	NC_014002	CGG	3	9	240536	240544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294494898
4013	NC_014002	AAGG	2	8	240549	240556	50 %	0 %	50 %	0 %	294494898
4014	NC_014002	TCC	2	6	240606	240611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494898
4015	NC_014002	CAA	2	6	240725	240730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494898
4016	NC_014002	TCC	2	6	240756	240761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494898
4017	NC_014002	GTG	2	6	240795	240800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494898
4018	NC_014002	CTCCA	2	10	240860	240869	20 %	20 %	0 %	60 %	294494898
4019	NC_014002	TA	3	6	240892	240897	50 %	50 %	0 %	0 %	294494898
4020	NC_014002	GAA	2	6	241002	241007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494898
4021	NC_014002	GAA	2	6	241221	241226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494898
4022	NC_014002	CTG	2	6	241304	241309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494898
4023	NC_014002	GCT	2	6	241315	241320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494898
4024	NC_014002	ACAAT	2	10	241331	241340	60 %	20 %	0 %	20 %	294494898
4025	NC_014002	CA	3	6	241347	241352	50 %	0 %	0 %	50 %	294494898
4026	NC_014002	ATTC	2	8	241748	241755	25 %	50 %	0 %	25 %	294494899
4027	NC_014002	GGT	2	6	241821	241826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494899
4028	NC_014002	TAG	2	6	241900	241905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494899
4029	NC_014002	GCCA	2	8	241938	241945	25 %	0 %	25 %	50 %	294494899
4030	NC_014002	TC	3	6	242037	242042	0 %	50 %	0 %	50 %	294494899
4031	NC_014002	AAAT	2	8	242094	242101	75 %	25 %	0 %	0 %	294494899
4032	NC_014002	TGAA	2	8	242121	242128	50 %	25 %	25 %	0 %	294494900
4033	NC_014002	AAAG	2	8	242153	242160	75 %	0 %	25 %	0 %	294494900
4034	NC_014002	TTC	2	6	242274	242279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494900
4035	NC_014002	AAT	2	6	242314	242319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494900
4036	NC_014002	AAT	2	6	242488	242493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494901
4037	NC_014002	TCA	2	6	242501	242506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494901
4038	NC_014002	A	6	6	242569	242574	100 %	0 %	0 %	0 %	294494901
4039	NC_014002	TCA	2	6	242605	242610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494901
4040	NC_014002	AGG	2	6	242792	242797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494901
4041	NC_014002	TTTC	2	8	242813	242820	0 %	75 %	0 %	25 %	294494901
4042	NC_014002	TTTTCC	2	12	242843	242854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494901
4043	NC_014002	ATG	3	9	243038	243046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494901
4044	NC_014002	CT	3	6	243047	243052	0 %	50 %	0 %	50 %	294494901
4045	NC_014002	TGCA	2	8	243116	243123	25 %	25 %	25 %	25 %	294494901
4046	NC_014002	CCTTTC	2	12	243177	243188	0 %	50 %	0 %	50 %	294494901
4047	NC_014002	TCATT	2	10	243252	243261	20 %	60 %	0 %	20 %	294494901
4048	NC_014002	CTG	2	6	243404	243409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494901
4049	NC_014002	TCCT	2	8	243450	243457	0 %	50 %	0 %	50 %	294494901
4050	NC_014002	GATC	2	8	243519	243526	25 %	25 %	25 %	25 %	294494901
4051	NC_014002	CTG	2	6	243610	243615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494901
4052	NC_014002	GCA	2	6	243619	243624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494901
4053	NC_014002	ATC	2	6	243626	243631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494901
4054	NC_014002	CTG	2	6	243685	243690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494901
4055	NC_014002	CAATG	2	10	243759	243768	40 %	20 %	20 %	20 %	294494901
4056	NC_014002	AT	3	6	243771	243776	50 %	50 %	0 %	0 %	294494901
4057	NC_014002	GAT	2	6	243849	243854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494902
4058	NC_014002	CAT	2	6	243893	243898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494902
4059	NC_014002	GCT	2	6	243921	243926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494902
4060	NC_014002	TCT	2	6	243936	243941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494902
4061	NC_014002	TA	3	6	244065	244070	50 %	50 %	0 %	0 %	294494902
4062	NC_014002	GAT	3	9	244113	244121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494902
4063	NC_014002	CTT	2	6	244156	244161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494902
4064	NC_014002	GAT	2	6	244185	244190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494902
4065	NC_014002	AC	3	6	244214	244219	50 %	0 %	0 %	50 %	294494902
4066	NC_014002	AAC	2	6	244285	244290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494902
4067	NC_014002	TGA	2	6	244388	244393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494902
4068	NC_014002	ATG	2	6	244498	244503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494902
4069	NC_014002	ACAG	2	8	244509	244516	50 %	0 %	25 %	25 %	294494902
4070	NC_014002	TAA	2	6	244538	244543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494902
4071	NC_014002	AAT	2	6	244556	244561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494902
4072	NC_014002	TGA	2	6	244574	244579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494902
4073	NC_014002	AT	3	6	244610	244615	50 %	50 %	0 %	0 %	294494902
4074	NC_014002	AAG	2	6	244654	244659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494902
4075	NC_014002	AATT	2	8	244664	244671	50 %	50 %	0 %	0 %	294494902
4076	NC_014002	TTC	2	6	244688	244693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494902
4077	NC_014002	CAG	2	6	244699	244704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494902
4078	NC_014002	A	6	6	244712	244717	100 %	0 %	0 %	0 %	294494902
4079	NC_014002	ATA	2	6	244788	244793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494902
4080	NC_014002	ATCTTA	2	12	244870	244881	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294494902
4081	NC_014002	ATA	2	6	244884	244889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494902
4082	NC_014002	CAT	2	6	244897	244902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494902
4083	NC_014002	TAA	2	6	244915	244920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494902
4084	NC_014002	TGA	2	6	244922	244927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494902
4085	NC_014002	GGT	2	6	245031	245036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494902
4086	NC_014002	TTA	2	6	245071	245076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494902
4087	NC_014002	AGT	2	6	245114	245119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494902
4088	NC_014002	GAT	2	6	245268	245273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494902
4089	NC_014002	TCC	2	6	245317	245322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494902
4090	NC_014002	TCCT	2	8	245360	245367	0 %	50 %	0 %	50 %	294494902
4091	NC_014002	TAC	2	6	245375	245380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494902
4092	NC_014002	CGATT	2	10	245444	245453	20 %	40 %	20 %	20 %	294494902
4093	NC_014002	ATG	2	6	245611	245616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494902
4094	NC_014002	TTA	2	6	245621	245626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494902
4095	NC_014002	CTA	2	6	245629	245634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494902
4096	NC_014002	TCAT	2	8	245651	245658	25 %	50 %	0 %	25 %	294494902
4097	NC_014002	TGA	3	9	245699	245707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494902
4098	NC_014002	ACAA	2	8	245715	245722	75 %	0 %	0 %	25 %	294494902
4099	NC_014002	TGT	2	6	245752	245757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494902
4100	NC_014002	ATG	2	6	245764	245769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494902
4101	NC_014002	TGG	2	6	245813	245818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494902
4102	NC_014002	GCA	2	6	245848	245853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494902
4103	NC_014002	AGAT	2	8	245875	245882	50 %	25 %	25 %	0 %	294494902
4104	NC_014002	ATA	2	6	245893	245898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494902
4105	NC_014002	TGA	2	6	245912	245917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494902
4106	NC_014002	AG	3	6	245960	245965	50 %	0 %	50 %	0 %	294494902
4107	NC_014002	ATT	2	6	245986	245991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494902
4108	NC_014002	TGG	2	6	245993	245998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494902
4109	NC_014002	TCC	2	6	246008	246013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494902
4110	NC_014002	TGA	2	6	246047	246052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494902
4111	NC_014002	GTAAT	2	10	246085	246094	40 %	40 %	20 %	0 %	294494902
4112	NC_014002	TCTATG	2	12	246100	246111	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	294494902
4113	NC_014002	GAA	2	6	246120	246125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494902
4114	NC_014002	AAATAT	2	12	246149	246160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494902
4115	NC_014002	CAAT	2	8	246184	246191	50 %	25 %	0 %	25 %	294494902
4116	NC_014002	AAT	2	6	246241	246246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494902
4117	NC_014002	TGC	2	6	246382	246387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494903
4118	NC_014002	TG	3	6	246621	246626	0 %	50 %	50 %	0 %	294494903
4119	NC_014002	GAGTAT	2	12	246630	246641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494903
4120	NC_014002	GAG	2	6	246708	246713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494903
4121	NC_014002	TTG	2	6	246724	246729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494903
4122	NC_014002	AAGA	2	8	246825	246832	75 %	0 %	25 %	0 %	294494903
4123	NC_014002	CAT	2	6	246977	246982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494904
4124	NC_014002	AAAT	2	8	247027	247034	75 %	25 %	0 %	0 %	294494904
4125	NC_014002	GCC	2	6	247068	247073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294494904
4126	NC_014002	TCA	2	6	247123	247128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494904
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4128	NC_014002	ATCCC	2	10	247336	247345	20 %	20 %	0 %	60 %	294494905
4129	NC_014002	CCTT	2	8	247386	247393	0 %	50 %	0 %	50 %	294494905
4130	NC_014002	GGA	2	6	247396	247401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494905
4131	NC_014002	CAG	2	6	247472	247477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494905
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4135	NC_014002	TC	3	6	247807	247812	0 %	50 %	0 %	50 %	294494905
4136	NC_014002	TGG	2	6	248158	248163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494905
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4140	NC_014002	ATTT	2	8	248347	248354	25 %	75 %	0 %	0 %	294494906
4141	NC_014002	T	6	6	248352	248357	0 %	100 %	0 %	0 %	294494906
4142	NC_014002	TCCA	2	8	248401	248408	25 %	25 %	0 %	50 %	294494906
4143	NC_014002	CA	3	6	248431	248436	50 %	0 %	0 %	50 %	294494906
4144	NC_014002	GGC	2	6	248614	248619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294494906
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4146	NC_014002	TAC	2	6	248695	248700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494906
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4148	NC_014002	CTT	2	6	248928	248933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494906
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4151	NC_014002	T	6	6	249111	249116	0 %	100 %	0 %	0 %	294494906
4152	NC_014002	AAC	2	6	249217	249222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494906
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4155	NC_014002	CAT	2	6	249393	249398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494906
4156	NC_014002	T	7	7	249403	249409	0 %	100 %	0 %	0 %	294494906
4157	NC_014002	CCA	2	6	249497	249502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494906
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4161	NC_014002	CAG	2	6	249805	249810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494907
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4227	NC_014002	ATC	2	6	253591	253596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494910
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4230	NC_014002	TAT	2	6	253642	253647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494911
4231	NC_014002	CAT	2	6	253659	253664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494911
4232	NC_014002	ATG	2	6	253695	253700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494911
4233	NC_014002	GT	3	6	253765	253770	0 %	50 %	50 %	0 %	294494911
4234	NC_014002	AG	3	6	253776	253781	50 %	0 %	50 %	0 %	294494911
4235	NC_014002	TGC	2	6	253810	253815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494911
4236	NC_014002	T	7	7	253886	253892	0 %	100 %	0 %	0 %	294494911
4237	NC_014002	ATTA	2	8	254304	254311	50 %	50 %	0 %	0 %	294494912
4238	NC_014002	TTCC	2	8	254472	254479	0 %	50 %	0 %	50 %	294494912
4239	NC_014002	CAG	2	6	254647	254652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494912
4240	NC_014002	CAG	2	6	254726	254731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494912
4241	NC_014002	T	7	7	254735	254741	0 %	100 %	0 %	0 %	294494912
4242	NC_014002	TTC	2	6	254781	254786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494912
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4244	NC_014002	GCA	2	6	254857	254862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494912
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4247	NC_014002	TGC	2	6	254997	255002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494912
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4253	NC_014002	ACT	2	6	255755	255760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494913
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4348	NC_014002	AAAT	2	8	261232	261239	75 %	25 %	0 %	0 %	294494918
4349	NC_014002	ATTTT	2	10	261243	261252	20 %	80 %	0 %	0 %	294494918
4350	NC_014002	ATA	2	6	261286	261291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494918
4351	NC_014002	ATA	2	6	261305	261310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494918
4352	NC_014002	A	6	6	261310	261315	100 %	0 %	0 %	0 %	294494918
4353	NC_014002	CT	3	6	261317	261322	0 %	50 %	0 %	50 %	294494918
4354	NC_014002	ATT	2	6	261393	261398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494918
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4358	NC_014002	AAG	2	6	261539	261544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494918
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4360	NC_014002	T	7	7	261671	261677	0 %	100 %	0 %	0 %	294494918
4361	NC_014002	GCA	2	6	261715	261720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494918
4362	NC_014002	ATG	2	6	261829	261834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494919
4363	NC_014002	AAGG	2	8	261901	261908	50 %	0 %	50 %	0 %	294494919
4364	NC_014002	AC	3	6	261957	261962	50 %	0 %	0 %	50 %	294494919
4365	NC_014002	GAA	2	6	262111	262116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494919
4366	NC_014002	GAT	2	6	262141	262146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494919
4367	NC_014002	TACTG	2	10	262272	262281	20 %	40 %	20 %	20 %	294494919
4368	NC_014002	TGT	2	6	262395	262400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494919
4369	NC_014002	CTC	2	6	262445	262450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494919
4370	NC_014002	TGT	2	6	262731	262736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494919
4371	NC_014002	TGG	2	6	262836	262841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494919
4372	NC_014002	TTG	2	6	262892	262897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494919
4373	NC_014002	TCG	2	6	262949	262954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494919
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4382	NC_014002	ATCA	2	8	263288	263295	50 %	25 %	0 %	25 %	294494920
4383	NC_014002	GTGC	2	8	263336	263343	0 %	25 %	50 %	25 %	294494920
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4389	NC_014002	TG	3	6	263547	263552	0 %	50 %	50 %	0 %	294494920
4390	NC_014002	AGA	2	6	263641	263646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494920
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4396	NC_014002	T	6	6	263985	263990	0 %	100 %	0 %	0 %	294494921
4397	NC_014002	CGG	2	6	264123	264128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294494922
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4399	NC_014002	TGT	2	6	264239	264244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494922
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4411	NC_014002	AGGG	2	8	265001	265008	25 %	0 %	75 %	0 %	294494922
4412	NC_014002	T	6	6	265066	265071	0 %	100 %	0 %	0 %	294494922
4413	NC_014002	T	9	9	265087	265095	0 %	100 %	0 %	0 %	294494922
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4485	NC_014002	CTT	3	9	270160	270168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494928
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4488	NC_014002	CCG	2	6	270320	270325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294494928
4489	NC_014002	AAG	2	6	270383	270388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494928
4490	NC_014002	ATC	2	6	270400	270405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494929
4491	NC_014002	TTC	2	6	270423	270428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494929
4492	NC_014002	A	6	6	270463	270468	100 %	0 %	0 %	0 %	294494929
4493	NC_014002	TCT	2	6	270580	270585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494929
4494	NC_014002	AGGGAT	2	12	270626	270637	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	294494929
4495	NC_014002	TGT	2	6	270653	270658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494929
4496	NC_014002	CCG	2	6	270661	270666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294494929
4497	NC_014002	TTG	2	6	270682	270687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494929
4498	NC_014002	TCTG	2	8	270702	270709	0 %	50 %	25 %	25 %	294494929
4499	NC_014002	ATGA	2	8	271308	271315	50 %	25 %	25 %	0 %	294494930
4500	NC_014002	TGCC	2	8	271349	271356	0 %	25 %	25 %	50 %	294494930

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