MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 34052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_014002	GGT	2	6	1099489	1099494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495733
18502	NC_014002	GAA	2	6	1099633	1099638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495733
18503	NC_014002	CCA	2	6	1099654	1099659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294495733
18504	NC_014002	TGCC	2	8	1099669	1099676	0 %	25 %	25 %	50 %	294495733
18505	NC_014002	GAA	2	6	1099711	1099716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495733
18506	NC_014002	TCAT	2	8	1099755	1099762	25 %	50 %	0 %	25 %	294495733
18507	NC_014002	CGG	2	6	1099764	1099769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294495733
18508	NC_014002	ATAC	2	8	1099784	1099791	50 %	25 %	0 %	25 %	294495733
18509	NC_014002	GCCT	2	8	1099808	1099815	0 %	25 %	25 %	50 %	294495733
18510	NC_014002	CTT	2	6	1099855	1099860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495733
18511	NC_014002	GAA	2	6	1099867	1099872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495733
18512	NC_014002	AGC	2	6	1099877	1099882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495733
18513	NC_014002	ATA	2	6	1099922	1099927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495733
18514	NC_014002	ATGAAA	2	12	1100030	1100041	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	294495733
18515	NC_014002	CA	3	6	1100103	1100108	50 %	0 %	0 %	50 %	294495733
18516	NC_014002	TA	3	6	1100109	1100114	50 %	50 %	0 %	0 %	294495733
18517	NC_014002	AT	3	6	1100239	1100244	50 %	50 %	0 %	0 %	294495733
18518	NC_014002	GGC	2	6	1100262	1100267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294495733
18519	NC_014002	TTG	2	6	1100400	1100405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495734
18520	NC_014002	TTC	2	6	1100411	1100416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495734
18521	NC_014002	TAC	2	6	1100427	1100432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495734
18522	NC_014002	GAC	2	6	1100450	1100455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495734
18523	NC_014002	ATG	2	6	1100526	1100531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495734
18524	NC_014002	ATT	2	6	1100609	1100614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495734
18525	NC_014002	CAA	2	6	1100620	1100625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495734
18526	NC_014002	AAGG	2	8	1100729	1100736	50 %	0 %	50 %	0 %	294495734
18527	NC_014002	TA	3	6	1100752	1100757	50 %	50 %	0 %	0 %	294495734
18528	NC_014002	CAA	2	6	1100855	1100860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495735
18529	NC_014002	T	6	6	1100876	1100881	0 %	100 %	0 %	0 %	294495735
18530	NC_014002	CTG	2	6	1100894	1100899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495735
18531	NC_014002	TCT	2	6	1100956	1100961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495735
18532	NC_014002	CTT	2	6	1100975	1100980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495735
18533	NC_014002	AAG	2	6	1101024	1101029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495735
18534	NC_014002	ATC	2	6	1101126	1101131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495735
18535	NC_014002	ATC	2	6	1101150	1101155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495735
18536	NC_014002	ATC	2	6	1101207	1101212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495735
18537	NC_014002	TTC	2	6	1101310	1101315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495735
18538	NC_014002	TTTCAT	2	12	1101497	1101508	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	294495735
18539	NC_014002	TG	3	6	1101658	1101663	0 %	50 %	50 %	0 %	294495735
18540	NC_014002	CAAAA	2	10	1101675	1101684	80 %	0 %	0 %	20 %	294495735
18541	NC_014002	ATTGA	2	10	1101739	1101748	40 %	40 %	20 %	0 %	294495735
18542	NC_014002	TCCA	2	8	1101864	1101871	25 %	25 %	0 %	50 %	294495735
18543	NC_014002	AAG	3	9	1101893	1101901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495735
18544	NC_014002	TTC	2	6	1101939	1101944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495735
18545	NC_014002	CTTT	2	8	1101983	1101990	0 %	75 %	0 %	25 %	294495735
18546	NC_014002	TCG	2	6	1102009	1102014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495735
18547	NC_014002	TCA	2	6	1102085	1102090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495735
18548	NC_014002	CTTCCT	2	12	1102157	1102168	0 %	50 %	0 %	50 %	294495735
18549	NC_014002	TAT	2	6	1102205	1102210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495735
18550	NC_014002	ATTTT	2	10	1102275	1102284	20 %	80 %	0 %	0 %	294495736
18551	NC_014002	TGTT	2	8	1102376	1102383	0 %	75 %	25 %	0 %	294495736
18552	NC_014002	TCA	2	6	1102471	1102476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495736
18553	NC_014002	GCA	2	6	1102516	1102521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495736
18554	NC_014002	CAA	2	6	1102574	1102579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495736
18555	NC_014002	ACT	2	6	1102606	1102611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495736
18556	NC_014002	CAT	2	6	1102664	1102669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495736
18557	NC_014002	GAT	2	6	1102738	1102743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495736
18558	NC_014002	CAG	2	6	1102767	1102772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495736
18559	NC_014002	GGT	2	6	1102816	1102821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495736
18560	NC_014002	CCCT	2	8	1102864	1102871	0 %	25 %	0 %	75 %	294495736
18561	NC_014002	GAAA	2	8	1102906	1102913	75 %	0 %	25 %	0 %	294495736
18562	NC_014002	TA	3	6	1102932	1102937	50 %	50 %	0 %	0 %	294495736
18563	NC_014002	CTG	2	6	1103054	1103059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495736
18564	NC_014002	GAAC	2	8	1103102	1103109	50 %	0 %	25 %	25 %	294495736
18565	NC_014002	CACT	2	8	1103138	1103145	25 %	25 %	0 %	50 %	294495736
18566	NC_014002	TGA	2	6	1103231	1103236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495736
18567	NC_014002	TTA	2	6	1103282	1103287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495736
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18569	NC_014002	CTA	2	6	1103318	1103323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495736
18570	NC_014002	TTC	2	6	1103536	1103541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495737
18571	NC_014002	AC	3	6	1103620	1103625	50 %	0 %	0 %	50 %	294495737
18572	NC_014002	CTGT	3	12	1103651	1103662	0 %	50 %	25 %	25 %	294495737
18573	NC_014002	AGCA	2	8	1103692	1103699	50 %	0 %	25 %	25 %	294495737
18574	NC_014002	TTGT	2	8	1103736	1103743	0 %	75 %	25 %	0 %	294495737
18575	NC_014002	TCA	2	6	1103771	1103776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495737
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18582	NC_014002	AGA	2	6	1104047	1104052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495737
18583	NC_014002	GAAAT	2	10	1104068	1104077	60 %	20 %	20 %	0 %	294495737
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18585	NC_014002	ACG	2	6	1104175	1104180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495737
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18588	NC_014002	GAT	2	6	1104364	1104369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495737
18589	NC_014002	AG	3	6	1104422	1104427	50 %	0 %	50 %	0 %	294495737
18590	NC_014002	CGC	2	6	1104433	1104438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294495737
18591	NC_014002	TGC	2	6	1104451	1104456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495737
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18596	NC_014002	GTTG	2	8	1104646	1104653	0 %	50 %	50 %	0 %	294495737
18597	NC_014002	CCAT	2	8	1104689	1104696	25 %	25 %	0 %	50 %	294495737
18598	NC_014002	AGT	2	6	1104704	1104709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495737
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18600	NC_014002	TCA	2	6	1104776	1104781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495737
18601	NC_014002	ATA	2	6	1104788	1104793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495737
18602	NC_014002	AAATA	2	10	1104888	1104897	80 %	20 %	0 %	0 %	294495737
18603	NC_014002	GGA	2	6	1104950	1104955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294495737
18604	NC_014002	AAT	2	6	1105001	1105006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495737
18605	NC_014002	GGA	2	6	1105109	1105114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294495737
18606	NC_014002	GAG	2	6	1105176	1105181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294495737
18607	NC_014002	GAA	2	6	1105223	1105228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495737
18608	NC_014002	GAA	2	6	1105243	1105248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495737
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18611	NC_014002	TCTGT	2	10	1105330	1105339	0 %	60 %	20 %	20 %	294495737
18612	NC_014002	CGAA	2	8	1105345	1105352	50 %	0 %	25 %	25 %	294495737
18613	NC_014002	GCT	2	6	1105367	1105372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495737
18614	NC_014002	CTTC	2	8	1105416	1105423	0 %	50 %	0 %	50 %	294495737
18615	NC_014002	TA	3	6	1105444	1105449	50 %	50 %	0 %	0 %	294495737
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18617	NC_014002	TAT	2	6	1105498	1105503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495737
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18736	NC_014002	GTA	2	6	1112435	1112440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495746
18737	NC_014002	GAA	2	6	1112518	1112523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495746
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18739	NC_014002	GCA	2	6	1112566	1112571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495746
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18741	NC_014002	GA	3	6	1112723	1112728	50 %	0 %	50 %	0 %	294495747
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18754	NC_014002	TGAG	2	8	1113437	1113444	25 %	25 %	50 %	0 %	294495748
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18845	NC_014002	TC	3	6	1118134	1118139	0 %	50 %	0 %	50 %	294495751
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18852	NC_014002	AAG	2	6	1118855	1118860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495752
18853	NC_014002	TCA	2	6	1118880	1118885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495752
18854	NC_014002	AAT	2	6	1119005	1119010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495752
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18857	NC_014002	GCA	2	6	1119766	1119771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495753
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