MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 34052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014002	GTC	2	6	33271	33276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494723
502	NC_014002	GGA	2	6	33316	33321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494723
503	NC_014002	ATTCC	2	10	33343	33352	20 %	40 %	0 %	40 %	294494723
504	NC_014002	ATG	2	6	33353	33358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494723
505	NC_014002	TAT	2	6	33370	33375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494723
506	NC_014002	ACC	2	6	33449	33454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494723
507	NC_014002	AGT	2	6	33482	33487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494724
508	NC_014002	TCC	2	6	33542	33547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494724
509	NC_014002	CTT	2	6	33553	33558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494724
510	NC_014002	GAAG	2	8	33569	33576	50 %	0 %	50 %	0 %	294494724
511	NC_014002	ATT	2	6	33579	33584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494724
512	NC_014002	AAGGG	2	10	33648	33657	40 %	0 %	60 %	0 %	294494724
513	NC_014002	ATG	2	6	33798	33803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494724
514	NC_014002	CCTG	2	8	33807	33814	0 %	25 %	25 %	50 %	294494724
515	NC_014002	C	6	6	33972	33977	0 %	0 %	0 %	100 %	294494724
516	NC_014002	GGC	2	6	34058	34063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294494724
517	NC_014002	GGC	2	6	34157	34162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294494724
518	NC_014002	GTT	2	6	34222	34227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494724
519	NC_014002	CAG	2	6	34247	34252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494724
520	NC_014002	CGG	2	6	34312	34317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294494724
521	NC_014002	CCG	2	6	34482	34487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294494725
522	NC_014002	ATA	2	6	34496	34501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494725
523	NC_014002	TTC	2	6	34652	34657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494725
524	NC_014002	CAT	2	6	34684	34689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494725
525	NC_014002	TGC	2	6	34691	34696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494725
526	NC_014002	CTG	2	6	34757	34762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494725
527	NC_014002	AGT	2	6	34813	34818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494725
528	NC_014002	TGC	2	6	34830	34835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494725
529	NC_014002	CAG	2	6	34868	34873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494725
530	NC_014002	AAT	2	6	34970	34975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494725
531	NC_014002	TGT	2	6	35023	35028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494725
532	NC_014002	CTGC	2	8	35062	35069	0 %	25 %	25 %	50 %	294494725
533	NC_014002	CTG	2	6	35087	35092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494725
534	NC_014002	CCTG	2	8	35095	35102	0 %	25 %	25 %	50 %	294494725
535	NC_014002	TGGAT	2	10	35157	35166	20 %	40 %	40 %	0 %	294494725
536	NC_014002	GCA	2	6	35254	35259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494725
537	NC_014002	T	6	6	35315	35320	0 %	100 %	0 %	0 %	294494725
538	NC_014002	CAT	2	6	35402	35407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494725
539	NC_014002	TGG	2	6	35461	35466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494725
540	NC_014002	GAA	2	6	35487	35492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494725
541	NC_014002	T	6	6	35523	35528	0 %	100 %	0 %	0 %	294494725
542	NC_014002	TTGT	2	8	35556	35563	0 %	75 %	25 %	0 %	294494725
543	NC_014002	TGA	2	6	35744	35749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494726
544	NC_014002	TAA	2	6	35769	35774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494726
545	NC_014002	AGCA	2	8	35777	35784	50 %	0 %	25 %	25 %	294494726
546	NC_014002	ATA	2	6	35803	35808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494726
547	NC_014002	CCCT	2	8	35852	35859	0 %	25 %	0 %	75 %	294494726
548	NC_014002	ATAC	2	8	35873	35880	50 %	25 %	0 %	25 %	294494726
549	NC_014002	AC	3	6	35891	35896	50 %	0 %	0 %	50 %	294494726
550	NC_014002	CAG	2	6	35905	35910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494726
551	NC_014002	CAA	3	9	35922	35930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494726
552	NC_014002	TAT	3	9	35977	35985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494726
553	NC_014002	AGT	2	6	35992	35997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494726
554	NC_014002	AG	3	6	36047	36052	50 %	0 %	50 %	0 %	294494726
555	NC_014002	CAA	2	6	36065	36070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494726
556	NC_014002	ATA	2	6	36085	36090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494726
557	NC_014002	TAAACA	2	12	36119	36130	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	294494726
558	NC_014002	AAG	2	6	36143	36148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494726
559	NC_014002	AAAC	2	8	36162	36169	75 %	0 %	0 %	25 %	294494726
560	NC_014002	TGG	2	6	36189	36194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494726
561	NC_014002	TTGATG	2	12	36209	36220	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	294494726
562	NC_014002	GGT	2	6	36256	36261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494726
563	NC_014002	AAG	2	6	36263	36268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494726
564	NC_014002	AATT	2	8	36279	36286	50 %	50 %	0 %	0 %	294494726
565	NC_014002	CAA	2	6	36306	36311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494726
566	NC_014002	A	6	6	36321	36326	100 %	0 %	0 %	0 %	294494726
567	NC_014002	TAA	2	6	36360	36365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494726
568	NC_014002	AACA	2	8	36387	36394	75 %	0 %	0 %	25 %	294494726
569	NC_014002	ATCT	2	8	36409	36416	25 %	50 %	0 %	25 %	294494726
570	NC_014002	TATT	2	8	36438	36445	25 %	75 %	0 %	0 %	294494726
571	NC_014002	GGTA	2	8	36487	36494	25 %	25 %	50 %	0 %	294494726
572	NC_014002	TTC	2	6	36507	36512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494726
573	NC_014002	TGA	2	6	36518	36523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494726
574	NC_014002	GAA	2	6	36541	36546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494726
575	NC_014002	CAA	2	6	36552	36557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494726
576	NC_014002	TAC	2	6	36568	36573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494726
577	NC_014002	GAT	2	6	36574	36579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494726
578	NC_014002	GAT	2	6	36601	36606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494726
579	NC_014002	ATA	2	6	36617	36622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494726
580	NC_014002	TAG	2	6	36647	36652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494726
581	NC_014002	GAG	2	6	36688	36693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494726
582	NC_014002	GAA	2	6	36730	36735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494726
583	NC_014002	CCA	2	6	36739	36744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494726
584	NC_014002	ACA	2	6	36772	36777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494726
585	NC_014002	GGAA	2	8	36798	36805	50 %	0 %	50 %	0 %	294494726
586	NC_014002	ATG	2	6	36839	36844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494726
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590	NC_014002	CAA	2	6	37092	37097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494726
591	NC_014002	AAT	2	6	37108	37113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494726
592	NC_014002	GGAAT	2	10	37115	37124	40 %	20 %	40 %	0 %	294494726
593	NC_014002	TA	3	6	37130	37135	50 %	50 %	0 %	0 %	294494726
594	NC_014002	TAA	2	6	37140	37145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494726
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596	NC_014002	TAA	3	9	37173	37181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494726
597	NC_014002	ATA	3	9	37208	37216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494726
598	NC_014002	AAC	2	6	37228	37233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494726
599	NC_014002	ATA	2	6	37234	37239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494726
600	NC_014002	AAT	2	6	37243	37248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494726
601	NC_014002	ATCT	2	8	37270	37277	25 %	50 %	0 %	25 %	294494726
602	NC_014002	ATA	2	6	37292	37297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494726
603	NC_014002	CATT	2	8	37298	37305	25 %	50 %	0 %	25 %	294494726
604	NC_014002	TAA	2	6	37308	37313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494726
605	NC_014002	ATA	2	6	37355	37360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494726
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607	NC_014002	A	6	6	37479	37484	100 %	0 %	0 %	0 %	294494726
608	NC_014002	ATA	3	9	37538	37546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494726
609	NC_014002	TCC	2	6	37589	37594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494726
610	NC_014002	ATA	2	6	37607	37612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494726
611	NC_014002	AAC	2	6	37621	37626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494726
612	NC_014002	AACA	2	8	37632	37639	75 %	0 %	0 %	25 %	294494726
613	NC_014002	AAT	2	6	37684	37689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494726
614	NC_014002	TAA	2	6	37698	37703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494726
615	NC_014002	ATA	2	6	37715	37720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494726
616	NC_014002	A	6	6	37723	37728	100 %	0 %	0 %	0 %	294494726
617	NC_014002	GAT	2	6	37750	37755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494726
618	NC_014002	TAA	2	6	37767	37772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494726
619	NC_014002	AAC	2	6	37779	37784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494726
620	NC_014002	AAC	2	6	37840	37845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494726
621	NC_014002	ATCT	2	8	37867	37874	25 %	50 %	0 %	25 %	294494726
622	NC_014002	TATT	2	8	37896	37903	25 %	75 %	0 %	0 %	294494726
623	NC_014002	ATTT	2	8	37933	37940	25 %	75 %	0 %	0 %	294494726
624	NC_014002	TGATGT	2	12	37941	37952	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	294494726
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626	NC_014002	GA	3	6	38090	38095	50 %	0 %	50 %	0 %	294494726
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756	NC_014002	GAA	2	6	46933	46938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494732
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761	NC_014002	CCCT	2	8	47092	47099	0 %	25 %	0 %	75 %	294494732
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775	NC_014002	AT	3	6	47940	47945	50 %	50 %	0 %	0 %	294494733
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