MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Coding Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 2338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013946	GTTAG	2	10	1352	1361	20 %	40 %	40 %	0 %	291294405
2	NC_013946	ACTCG	2	10	3149	3158	20 %	20 %	20 %	40 %	291294407
3	NC_013946	GGGCT	2	10	3483	3492	0 %	20 %	60 %	20 %	291294407
4	NC_013946	TGCCC	2	10	6499	6508	0 %	20 %	20 %	60 %	291294409
5	NC_013946	CCCTG	2	10	7834	7843	0 %	20 %	20 %	60 %	291294411
6	NC_013946	TGGGG	2	10	8362	8371	0 %	20 %	80 %	0 %	291294412
7	NC_013946	TGTCC	2	10	8994	9003	0 %	40 %	20 %	40 %	291294413
8	NC_013946	TGCGG	2	10	9380	9389	0 %	20 %	60 %	20 %	291294414
9	NC_013946	GGGCG	2	10	9863	9872	0 %	0 %	80 %	20 %	291294414
10	NC_013946	CGGCC	2	10	10019	10028	0 %	0 %	40 %	60 %	291294414
11	NC_013946	CTGCG	2	10	12909	12918	0 %	20 %	40 %	40 %	291294417
12	NC_013946	GCACC	2	10	13738	13747	20 %	0 %	20 %	60 %	291294418
13	NC_013946	CTGCC	2	10	21125	21134	0 %	20 %	20 %	60 %	291294428
14	NC_013946	CCAGC	2	10	21569	21578	20 %	0 %	20 %	60 %	291294428
15	NC_013946	CCAGA	2	10	22003	22012	40 %	0 %	20 %	40 %	291294428
16	NC_013946	AGCGC	2	10	22707	22716	20 %	0 %	40 %	40 %	291294430
17	NC_013946	GGCGG	2	10	23022	23031	0 %	0 %	80 %	20 %	291294430
18	NC_013946	CCAGG	2	10	24445	24454	20 %	0 %	40 %	40 %	291294432
19	NC_013946	GGCGG	2	10	24873	24882	0 %	0 %	80 %	20 %	291294432
20	NC_013946	CGGCC	2	10	26595	26604	0 %	0 %	40 %	60 %	291294434
21	NC_013946	CCCGG	2	10	29914	29923	0 %	0 %	40 %	60 %	291294437
22	NC_013946	CTGGG	2	10	32900	32909	0 %	20 %	60 %	20 %	291294441
23	NC_013946	CGGCC	2	10	33010	33019	0 %	0 %	40 %	60 %	291294441
24	NC_013946	ACCCC	2	10	34428	34437	20 %	0 %	0 %	80 %	291294444
25	NC_013946	GGCCA	2	10	34561	34570	20 %	0 %	40 %	40 %	291294444
26	NC_013946	CCAGG	2	10	35011	35020	20 %	0 %	40 %	40 %	291294444
27	NC_013946	TCCAG	2	10	36269	36278	20 %	20 %	20 %	40 %	291294445
28	NC_013946	TGACC	2	10	39386	39395	20 %	20 %	20 %	40 %	291294448
29	NC_013946	GCCAC	2	10	41719	41728	20 %	0 %	20 %	60 %	291294451
30	NC_013946	TCAGC	2	10	45485	45494	20 %	20 %	20 %	40 %	291294457
31	NC_013946	TCGAA	2	10	48593	48602	40 %	20 %	20 %	20 %	291294460
32	NC_013946	CAGGG	2	10	50103	50112	20 %	0 %	60 %	20 %	291294462
33	NC_013946	CTGGG	2	10	52099	52108	0 %	20 %	60 %	20 %	291294464
34	NC_013946	AGCCC	2	10	52760	52769	20 %	0 %	20 %	60 %	291294464
35	NC_013946	TGGCC	2	10	53226	53235	0 %	20 %	40 %	40 %	291294464
36	NC_013946	GCGGG	2	10	53567	53576	0 %	0 %	80 %	20 %	291294465
37	NC_013946	CGGTG	2	10	53986	53995	0 %	20 %	60 %	20 %	291294465
38	NC_013946	ACCTG	2	10	54746	54755	20 %	20 %	20 %	40 %	291294466
39	NC_013946	CACTG	2	10	55769	55778	20 %	20 %	20 %	40 %	291294468
40	NC_013946	CACCC	2	10	57064	57073	20 %	0 %	0 %	80 %	291294470
41	NC_013946	GGGAG	2	10	60265	60274	20 %	0 %	80 %	0 %	291294475
42	NC_013946	AGCCC	2	10	62783	62792	20 %	0 %	20 %	60 %	291294478
43	NC_013946	GCCGG	2	10	65906	65915	0 %	0 %	60 %	40 %	291294481
44	NC_013946	AAAGG	2	10	66524	66533	60 %	0 %	40 %	0 %	291294483
45	NC_013946	GGCCT	2	10	68462	68471	0 %	20 %	40 %	40 %	291294487
46	NC_013946	TACGC	2	10	69071	69080	20 %	20 %	20 %	40 %	291294488
47	NC_013946	GGCCA	2	10	69273	69282	20 %	0 %	40 %	40 %	291294489
48	NC_013946	CACCC	2	10	69518	69527	20 %	0 %	0 %	80 %	291294489
49	NC_013946	GCCCT	2	10	72452	72461	0 %	20 %	20 %	60 %	291294493
50	NC_013946	GCACC	2	10	73646	73655	20 %	0 %	20 %	60 %	291294496
51	NC_013946	TTTGG	2	10	75422	75431	0 %	60 %	40 %	0 %	291294500
52	NC_013946	GGCCA	2	10	76033	76042	20 %	0 %	40 %	40 %	291294501
53	NC_013946	ACGGG	2	10	76541	76550	20 %	0 %	60 %	20 %	291294501
54	NC_013946	GCCCG	2	10	77325	77334	0 %	0 %	40 %	60 %	291294501
55	NC_013946	GTGCG	2	10	78230	78239	0 %	20 %	60 %	20 %	291294501
56	NC_013946	GGTGA	2	10	78469	78478	20 %	20 %	60 %	0 %	291294502
57	NC_013946	CTGGC	2	10	80073	80082	0 %	20 %	40 %	40 %	291294504
58	NC_013946	CAGCC	2	10	81141	81150	20 %	0 %	20 %	60 %	291294506
59	NC_013946	CGCCA	2	10	81425	81434	20 %	0 %	20 %	60 %	291294506
60	NC_013946	GGTGG	2	10	82658	82667	0 %	20 %	80 %	0 %	291294508
61	NC_013946	GGGGT	2	10	83342	83351	0 %	20 %	80 %	0 %	291294508
62	NC_013946	GGCCC	2	10	84560	84569	0 %	0 %	40 %	60 %	291294511
63	NC_013946	CGGTG	2	10	91314	91323	0 %	20 %	60 %	20 %	291294517
64	NC_013946	GGTGG	2	10	96061	96070	0 %	20 %	80 %	0 %	291294522
65	NC_013946	TCTCC	2	10	103167	103176	0 %	40 %	0 %	60 %	291294526
66	NC_013946	TACGC	2	10	103338	103347	20 %	20 %	20 %	40 %	291294526
67	NC_013946	CCGAA	2	10	104081	104090	40 %	0 %	20 %	40 %	291294527
68	NC_013946	GCCCC	2	10	106658	106667	0 %	0 %	20 %	80 %	291294530
69	NC_013946	GGCCA	2	10	107137	107146	20 %	0 %	40 %	40 %	291294531
70	NC_013946	GCCGA	2	10	108240	108249	20 %	0 %	40 %	40 %	291294532
71	NC_013946	ATCGG	2	10	109207	109216	20 %	20 %	40 %	20 %	291294533
72	NC_013946	GGGCT	2	10	114517	114526	0 %	20 %	60 %	20 %	291294539
73	NC_013946	TGGAC	2	10	114996	115005	20 %	20 %	40 %	20 %	291294539
74	NC_013946	GCCGG	2	10	117054	117063	0 %	0 %	60 %	40 %	291294541
75	NC_013946	GCCGG	2	10	117343	117352	0 %	0 %	60 %	40 %	291294541
76	NC_013946	CTTCA	2	10	117557	117566	20 %	40 %	0 %	40 %	291294541
77	NC_013946	CAGCT	2	10	118528	118537	20 %	20 %	20 %	40 %	291294543
78	NC_013946	GACCA	2	10	120051	120060	40 %	0 %	20 %	40 %	291294546
79	NC_013946	TGGGG	2	10	124360	124369	0 %	20 %	80 %	0 %	291294548
80	NC_013946	TGGCG	2	10	125741	125750	0 %	20 %	60 %	20 %	291294549
81	NC_013946	CCTGG	2	10	126253	126262	0 %	20 %	40 %	40 %	291294550
82	NC_013946	TGGTT	2	10	127091	127100	0 %	60 %	40 %	0 %	291294550
83	NC_013946	GCTGG	2	10	128947	128956	0 %	20 %	60 %	20 %	291294552
84	NC_013946	GCCCG	2	10	129131	129140	0 %	0 %	40 %	60 %	291294552
85	NC_013946	GCCAC	2	10	129851	129860	20 %	0 %	20 %	60 %	291294553
86	NC_013946	GCGCA	2	10	133119	133128	20 %	0 %	40 %	40 %	291294556
87	NC_013946	CACTG	2	10	134698	134707	20 %	20 %	20 %	40 %	291294557
88	NC_013946	GGGCA	2	10	135533	135542	20 %	0 %	60 %	20 %	291294557
89	NC_013946	ACAGA	2	10	135900	135909	60 %	0 %	20 %	20 %	291294558
90	NC_013946	CCTCA	2	10	136143	136152	20 %	20 %	0 %	60 %	291294558
91	NC_013946	TTCCA	2	10	137002	137011	20 %	40 %	0 %	40 %	291294559
92	NC_013946	CGGGC	2	10	139373	139382	0 %	0 %	60 %	40 %	291294562
93	NC_013946	CGCAG	2	10	139615	139624	20 %	0 %	40 %	40 %	291294562
94	NC_013946	CGCTG	2	10	143119	143128	0 %	20 %	40 %	40 %	291294565
95	NC_013946	CGGCA	2	10	143653	143662	20 %	0 %	40 %	40 %	291294565
96	NC_013946	CGGAG	2	10	145155	145164	20 %	0 %	60 %	20 %	291294567
97	NC_013946	AGGGG	2	10	146863	146872	20 %	0 %	80 %	0 %	291294569
98	NC_013946	CTGGG	2	10	147404	147413	0 %	20 %	60 %	20 %	291294569
99	NC_013946	CCCGG	2	10	151714	151723	0 %	0 %	40 %	60 %	291294574
100	NC_013946	GGGGT	2	10	152981	152990	0 %	20 %	80 %	0 %	291294575
101	NC_013946	CGGCC	2	10	153926	153935	0 %	0 %	40 %	60 %	291294575
102	NC_013946	CCCGG	2	10	154399	154408	0 %	0 %	40 %	60 %	291294576
103	NC_013946	GGGCT	2	10	154960	154969	0 %	20 %	60 %	20 %	291294576
104	NC_013946	GGCGG	2	10	158880	158889	0 %	0 %	80 %	20 %	291294580
105	NC_013946	GGGCG	2	10	158900	158909	0 %	0 %	80 %	20 %	291294580
106	NC_013946	CGGCG	2	10	159673	159682	0 %	0 %	60 %	40 %	291294581
107	NC_013946	CGGCG	2	10	160886	160895	0 %	0 %	60 %	40 %	291294583
108	NC_013946	CAAGC	2	10	167496	167505	40 %	0 %	20 %	40 %	291294595
109	NC_013946	CTGGC	2	10	169879	169888	0 %	20 %	40 %	40 %	291294597
110	NC_013946	GATCA	2	10	170388	170397	40 %	20 %	20 %	20 %	291294598
111	NC_013946	GCCCA	2	10	170615	170624	20 %	0 %	20 %	60 %	291294598
112	NC_013946	CCAGC	2	10	172642	172651	20 %	0 %	20 %	60 %	291294600
113	NC_013946	GGGTG	2	10	175103	175112	0 %	20 %	80 %	0 %	291294603
114	NC_013946	GTGCG	2	10	176641	176650	0 %	20 %	60 %	20 %	291294605
115	NC_013946	GCCCT	2	10	179769	179778	0 %	20 %	20 %	60 %	291294610
116	NC_013946	GGCCT	2	10	179865	179874	0 %	20 %	40 %	40 %	291294610
117	NC_013946	CTGGC	2	10	180360	180369	0 %	20 %	40 %	40 %	291294610
118	NC_013946	CGGCC	2	10	183578	183587	0 %	0 %	40 %	60 %	291294612
119	NC_013946	GGGTG	2	10	185997	186006	0 %	20 %	80 %	0 %	291294613
120	NC_013946	TGCGG	2	10	186951	186960	0 %	20 %	60 %	20 %	291294614
121	NC_013946	CCCTA	2	10	190585	190594	20 %	20 %	0 %	60 %	291294617
122	NC_013946	CTGGG	2	10	190934	190943	0 %	20 %	60 %	20 %	291294617
123	NC_013946	ACGAA	2	10	191626	191635	60 %	0 %	20 %	20 %	291294618
124	NC_013946	CCGCC	2	10	192737	192746	0 %	0 %	20 %	80 %	291294620
125	NC_013946	CCTGG	2	10	192771	192780	0 %	20 %	40 %	40 %	291294620
126	NC_013946	GCCCC	2	10	192885	192894	0 %	0 %	20 %	80 %	291294620
127	NC_013946	TTCGG	2	10	196355	196364	0 %	40 %	40 %	20 %	291294625
128	NC_013946	TGGGG	2	10	196441	196450	0 %	20 %	80 %	0 %	291294625
129	NC_013946	GCGCT	2	10	200380	200389	0 %	20 %	40 %	40 %	291294629
130	NC_013946	CTGGC	2	10	201804	201813	0 %	20 %	40 %	40 %	291294630
131	NC_013946	GCCGC	2	10	202248	202257	0 %	0 %	40 %	60 %	291294630
132	NC_013946	TGGTT	2	10	203062	203071	0 %	60 %	40 %	0 %	291294631
133	NC_013946	CAAAT	2	10	206725	206734	60 %	20 %	0 %	20 %	291294636
134	NC_013946	CTTCA	2	10	206745	206754	20 %	40 %	0 %	40 %	291294637
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