MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 44766

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013946	GGT	2	6	138	143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294405
2	NC_013946	CTT	2	6	177	182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291294405
3	NC_013946	GCT	2	6	213	218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294405
4	NC_013946	AGG	2	6	293	298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294405
5	NC_013946	CAA	2	6	321	326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291294405
6	NC_013946	TGG	2	6	380	385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294405
7	NC_013946	AAC	3	9	391	399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291294405
8	NC_013946	CGG	2	6	410	415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294405
9	NC_013946	TGG	2	6	468	473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294405
10	NC_013946	CTG	3	9	646	654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294405
11	NC_013946	AGG	2	6	695	700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294405
12	NC_013946	ATT	2	6	745	750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291294405
13	NC_013946	GTC	2	6	753	758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294405
14	NC_013946	GAG	2	6	910	915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294405
15	NC_013946	AGA	2	6	1083	1088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291294405
16	NC_013946	GGA	2	6	1128	1133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294405
17	NC_013946	TTC	2	6	1237	1242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291294405
18	NC_013946	CAA	2	6	1318	1323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291294405
19	NC_013946	ATC	2	6	1919	1924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294406
20	NC_013946	CCG	2	6	2034	2039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294406
21	NC_013946	TGG	2	6	2115	2120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294406
22	NC_013946	CCA	2	6	2184	2189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294406
23	NC_013946	GAG	2	6	2300	2305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294406
24	NC_013946	CCA	2	6	2346	2351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294406
25	NC_013946	CGA	2	6	2449	2454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294406
26	NC_013946	TGG	2	6	2523	2528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294406
27	NC_013946	CAA	2	6	2677	2682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291294406
28	NC_013946	TCT	2	6	2695	2700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291294406
29	NC_013946	CAA	2	6	2710	2715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291294406
30	NC_013946	TGG	2	6	2796	2801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294406
31	NC_013946	GGA	2	6	2902	2907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294406
32	NC_013946	GGT	3	9	2923	2931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294406
33	NC_013946	GGT	2	6	3185	3190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294407
34	NC_013946	TGC	2	6	3301	3306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294407
35	NC_013946	GGC	2	6	3314	3319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294407
36	NC_013946	CGA	2	6	3338	3343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294407
37	NC_013946	AGG	2	6	3370	3375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294407
38	NC_013946	CAA	2	6	3413	3418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291294407
39	NC_013946	GCG	2	6	3471	3476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294407
40	NC_013946	TGA	2	6	3547	3552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294407
41	NC_013946	AAC	2	6	3582	3587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291294407
42	NC_013946	GAG	2	6	3756	3761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294407
43	NC_013946	TGC	2	6	3772	3777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294407
44	NC_013946	AGG	2	6	3859	3864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294407
45	NC_013946	TGG	2	6	3913	3918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294407
46	NC_013946	CGA	2	6	4043	4048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294407
47	NC_013946	ACC	2	6	4188	4193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294407
48	NC_013946	ACC	2	6	4539	4544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294408
49	NC_013946	GAT	2	6	4558	4563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294408
50	NC_013946	TCA	3	9	4683	4691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294408
51	NC_013946	CCG	2	6	4692	4697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294408
52	NC_013946	ACC	2	6	4730	4735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294408
53	NC_013946	GAT	2	6	4784	4789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294408
54	NC_013946	CAC	2	6	4837	4842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294408
55	NC_013946	CAA	3	9	4867	4875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291294408
56	NC_013946	CGA	2	6	4933	4938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294408
57	NC_013946	CGA	2	6	4999	5004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294408
58	NC_013946	CTG	3	9	5006	5014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294408
59	NC_013946	CGA	2	6	5095	5100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294408
60	NC_013946	GAG	2	6	5108	5113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294408
61	NC_013946	CAT	2	6	5122	5127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294408
62	NC_013946	GGA	2	6	5164	5169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294408
63	NC_013946	CGG	2	6	5175	5180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294408
64	NC_013946	CAT	2	6	5191	5196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294408
65	NC_013946	CCG	2	6	5453	5458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294408
66	NC_013946	TGG	2	6	5505	5510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294408
67	NC_013946	GTG	3	9	5531	5539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294408
68	NC_013946	GCG	2	6	5550	5555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294408
69	NC_013946	GGC	2	6	5557	5562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294408
70	NC_013946	CCG	2	6	5563	5568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294408
71	NC_013946	TGC	2	6	5655	5660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294408
72	NC_013946	CTG	2	6	5663	5668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294408
73	NC_013946	CGA	2	6	5689	5694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294408
74	NC_013946	GCC	2	6	5765	5770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294408
75	NC_013946	ACC	2	6	5795	5800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294408
76	NC_013946	TGC	2	6	5877	5882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294409
77	NC_013946	GGT	2	6	5962	5967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294409
78	NC_013946	GCC	2	6	6000	6005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294409
79	NC_013946	CAA	2	6	6053	6058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291294409
80	NC_013946	CGC	2	6	6124	6129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294409
81	NC_013946	TGG	2	6	6234	6239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294409
82	NC_013946	CAG	2	6	6295	6300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294409
83	NC_013946	CAG	2	6	6350	6355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294409
84	NC_013946	GCT	2	6	6385	6390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294409
85	NC_013946	CGG	2	6	6403	6408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294409
86	NC_013946	CAA	2	6	6478	6483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291294409
87	NC_013946	GGC	2	6	6652	6657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294409
88	NC_013946	GAC	2	6	6665	6670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294409
89	NC_013946	CCT	2	6	6736	6741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294409
90	NC_013946	GCC	3	9	6749	6757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294409
91	NC_013946	ACT	2	6	6810	6815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294409
92	NC_013946	GCT	2	6	6819	6824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294409
93	NC_013946	CAC	2	6	6961	6966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294409
94	NC_013946	CAC	2	6	7110	7115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294410
95	NC_013946	CCT	2	6	7130	7135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294410
96	NC_013946	GCC	2	6	7144	7149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294410
97	NC_013946	CGG	2	6	7230	7235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294410
98	NC_013946	TGC	2	6	7238	7243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294410
99	NC_013946	GCC	2	6	7319	7324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294411
100	NC_013946	TGG	2	6	7473	7478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294411
101	NC_013946	GGC	2	6	7501	7506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294411
102	NC_013946	TGG	2	6	7533	7538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294411
103	NC_013946	CTC	2	6	7561	7566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294411
104	NC_013946	GGC	2	6	7615	7620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294411
105	NC_013946	TGG	2	6	7629	7634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294411
106	NC_013946	AGC	2	6	7739	7744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294411
107	NC_013946	GCC	2	6	7865	7870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294411
108	NC_013946	TGG	2	6	7872	7877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294411
109	NC_013946	TGG	2	6	7884	7889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294411
110	NC_013946	CGG	2	6	7953	7958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294411
111	NC_013946	AAG	2	6	8019	8024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291294411
112	NC_013946	CTA	2	6	8149	8154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294412
113	NC_013946	CTC	2	6	8165	8170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294412
114	NC_013946	CTG	2	6	8220	8225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294412
115	NC_013946	TGG	2	6	8325	8330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294412
116	NC_013946	GCT	2	6	8350	8355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294412
117	NC_013946	CTG	2	6	8372	8377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294412
118	NC_013946	GCT	2	6	8386	8391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294412
119	NC_013946	TGC	2	6	8441	8446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294413
120	NC_013946	TGC	2	6	8561	8566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294413
121	NC_013946	GCT	3	9	8619	8627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294413
122	NC_013946	GGC	2	6	8688	8693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294413
123	NC_013946	CCT	2	6	8727	8732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294413
124	NC_013946	TGC	2	6	8744	8749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294413
125	NC_013946	TGC	2	6	8783	8788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294413
126	NC_013946	TGG	3	9	8810	8818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294413
127	NC_013946	CCA	2	6	8894	8899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294413
128	NC_013946	TGC	2	6	8928	8933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294413
129	NC_013946	GGT	2	6	8958	8963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294413
130	NC_013946	GGC	3	9	8973	8981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294413
131	NC_013946	CGC	2	6	9038	9043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294413
132	NC_013946	AAC	2	6	9121	9126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291294413
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255	NC_013946	AGA	2	6	17238	17243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291294421
256	NC_013946	TCT	2	6	17328	17333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291294421
257	NC_013946	CCG	2	6	17437	17442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294421
258	NC_013946	CTG	2	6	17666	17671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294422
259	NC_013946	CTG	2	6	17675	17680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294422
260	NC_013946	CTA	2	6	17722	17727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294422
261	NC_013946	AAG	2	6	17804	17809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291294422
262	NC_013946	GGC	2	6	17885	17890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294423
263	NC_013946	GCT	2	6	17924	17929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294423
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265	NC_013946	CTG	2	6	17992	17997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294423
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272	NC_013946	GCC	2	6	18437	18442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294423
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275	NC_013946	CGG	2	6	18606	18611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294424
276	NC_013946	CTG	2	6	18613	18618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294424
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279	NC_013946	ACC	2	6	19046	19051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294425
280	NC_013946	GTG	2	6	19118	19123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294425
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284	NC_013946	CAT	2	6	19465	19470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294425
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286	NC_013946	CAT	2	6	19543	19548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294425
287	NC_013946	GCG	2	6	19551	19556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294425
288	NC_013946	CAG	2	6	19562	19567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294425
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291	NC_013946	TGG	2	6	19658	19663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294426
292	NC_013946	TGG	2	6	19670	19675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294426
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376	NC_013946	CGA	2	6	26752	26757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294434
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500	NC_013946	CCA	2	6	35037	35042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294444

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