MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanocaldococcus sp. FS406-22 plasmid pFS01

Total Repeats: 126

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013888	ATT	2	6	482	487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289193302
2	NC_013888	ACA	2	6	502	507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289193302
3	NC_013888	AAC	2	6	607	612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289193302
4	NC_013888	GTT	2	6	648	653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289193302
5	NC_013888	ATA	2	6	696	701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289193302
6	NC_013888	TAT	2	6	811	816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289193302
7	NC_013888	ATA	2	6	2494	2499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289193303
8	NC_013888	TCA	2	6	2640	2645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289193303
9	NC_013888	AAC	2	6	2657	2662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289193303
10	NC_013888	TCT	2	6	2700	2705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289193303
11	NC_013888	CTT	2	6	2793	2798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289193304
12	NC_013888	CTA	2	6	2838	2843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289193304
13	NC_013888	TGT	2	6	2924	2929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289193304
14	NC_013888	TCT	2	6	3003	3008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289193304
15	NC_013888	ATA	2	6	3127	3132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289193304
16	NC_013888	TCT	2	6	3157	3162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289193304
17	NC_013888	CAT	2	6	3207	3212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289193304
18	NC_013888	TGT	2	6	3219	3224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289193304
19	NC_013888	ACA	2	6	3398	3403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289193304
20	NC_013888	CTT	2	6	3555	3560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289193304
21	NC_013888	TGT	2	6	3679	3684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289193304
22	NC_013888	TTA	2	6	3807	3812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289193304
23	NC_013888	CCT	2	6	3828	3833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289193304
24	NC_013888	TTC	2	6	3904	3909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289193304
25	NC_013888	TCT	2	6	3970	3975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289193304
26	NC_013888	TAT	2	6	5394	5399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289193305
27	NC_013888	TAC	2	6	5438	5443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289193305
28	NC_013888	TAT	2	6	5508	5513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289193305
29	NC_013888	TAT	2	6	5715	5720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289193306
30	NC_013888	TAA	2	6	5813	5818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289193306
31	NC_013888	TAG	2	6	5825	5830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289193306
32	NC_013888	AGG	2	6	5837	5842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289193306
33	NC_013888	ACA	2	6	5900	5905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289193306
34	NC_013888	TTA	2	6	5972	5977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289193306
35	NC_013888	ATG	2	6	6008	6013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289193306
36	NC_013888	TGA	2	6	6024	6029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289193306
37	NC_013888	TGT	2	6	6111	6116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289193306
38	NC_013888	ATT	2	6	6215	6220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289193306
39	NC_013888	ATT	2	6	6233	6238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289193306
40	NC_013888	ATT	2	6	6246	6251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289193306
41	NC_013888	TAT	2	6	6262	6267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289193306
42	NC_013888	GTT	2	6	6298	6303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289193306
43	NC_013888	TAA	2	6	6336	6341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289193306
44	NC_013888	TAA	2	6	6360	6365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289193306
45	NC_013888	GTA	2	6	6367	6372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289193306
46	NC_013888	GAA	2	6	6550	6555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289193306
47	NC_013888	TGT	2	6	6626	6631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289193306
48	NC_013888	GTT	2	6	6727	6732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289193306
49	NC_013888	GAG	2	6	6748	6753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289193306
50	NC_013888	AAG	2	6	6781	6786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289193306
51	NC_013888	TAT	2	6	6836	6841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289193306
52	NC_013888	ACA	2	6	6900	6905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289193306
53	NC_013888	TAA	2	6	7017	7022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289193306
54	NC_013888	AGA	2	6	7073	7078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289193306
55	NC_013888	TGA	2	6	7152	7157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289193306
56	NC_013888	TAC	2	6	7179	7184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289193306
57	NC_013888	AGG	2	6	7227	7232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289193306
58	NC_013888	TAA	2	6	7461	7466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289193306
59	NC_013888	TGT	2	6	7695	7700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289193306
60	NC_013888	AGG	2	6	7718	7723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289193306
61	NC_013888	AAT	2	6	7797	7802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289193306
62	NC_013888	TAG	2	6	7812	7817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289193306
63	NC_013888	AGA	2	6	7854	7859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289193306
64	NC_013888	TGA	2	6	7896	7901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289193306
65	NC_013888	GAA	2	6	7918	7923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289193306
66	NC_013888	TGA	2	6	7986	7991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289193306
67	NC_013888	GTT	2	6	8103	8108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289193307
68	NC_013888	GAA	2	6	8130	8135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289193307
69	NC_013888	ATG	2	6	8150	8155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289193307
70	NC_013888	GTT	2	6	8158	8163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289193307
71	NC_013888	TAA	2	6	8168	8173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289193307
72	NC_013888	GAT	2	6	8209	8214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289193307
73	NC_013888	CTA	2	6	8231	8236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289193307
74	NC_013888	GGA	2	6	8256	8261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289193307
75	NC_013888	GGA	2	6	8277	8282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289193307
76	NC_013888	ATA	2	6	8303	8308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289193307
77	NC_013888	GGA	2	6	8479	8484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289193308
78	NC_013888	ATA	2	6	8526	8531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289193308
79	NC_013888	ATT	2	6	8576	8581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289193308
80	NC_013888	ATA	2	6	8650	8655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289193308
81	NC_013888	AGG	2	6	8712	8717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289193309
82	NC_013888	AGG	2	6	8861	8866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289193309
83	NC_013888	AGG	2	6	8892	8897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289193309
84	NC_013888	ATT	2	6	8910	8915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289193309
85	NC_013888	TGT	2	6	8916	8921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289193309
86	NC_013888	AAG	3	9	8933	8941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289193309
87	NC_013888	GTT	2	6	8969	8974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289193309
88	NC_013888	GAT	2	6	9052	9057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289193309
89	NC_013888	TTG	2	6	9075	9080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289193309
90	NC_013888	ATT	2	6	9224	9229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289193310
91	NC_013888	ATT	2	6	9287	9292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289193310
92	NC_013888	AGA	2	6	9403	9408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289193310
93	NC_013888	AAT	2	6	9479	9484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289193310
94	NC_013888	ATT	2	6	9518	9523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289193310
95	NC_013888	TTG	2	6	9543	9548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289193310
96	NC_013888	AGG	2	6	9611	9616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289193311
97	NC_013888	CAC	2	6	9652	9657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289193311
98	NC_013888	AAG	2	6	9770	9775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289193312
99	NC_013888	AGG	2	6	9855	9860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289193312
100	NC_013888	AGA	2	6	9865	9870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289193312
101	NC_013888	TCA	2	6	9949	9954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289193312
102	NC_013888	GAT	2	6	9967	9972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289193312
103	NC_013888	TAA	2	6	9992	9997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289193312
104	NC_013888	GAA	2	6	10071	10076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289193312
105	NC_013888	TAA	2	6	10124	10129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289193312
106	NC_013888	AAG	2	6	10238	10243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289193312
107	NC_013888	GGA	2	6	10353	10358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289193312
108	NC_013888	ATT	2	6	10481	10486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289193313
109	NC_013888	AAG	2	6	10511	10516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289193313
110	NC_013888	CTA	2	6	10625	10630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289193313
111	NC_013888	ATT	2	6	10710	10715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289193313
112	NC_013888	GGA	2	6	10731	10736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289193313
113	NC_013888	TAA	2	6	10782	10787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289193313
114	NC_013888	AAG	2	6	10923	10928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289193313
115	NC_013888	TAA	2	6	10932	10937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289193313
116	NC_013888	ATC	2	6	11016	11021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289193313
117	NC_013888	AAG	2	6	11069	11074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289193313
118	NC_013888	ATG	2	6	11079	11084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289193313
119	NC_013888	ATT	2	6	11140	11145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289193313
120	NC_013888	TAA	2	6	11191	11196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289193313
121	NC_013888	ATG	2	6	11271	11276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289193313
122	NC_013888	AGT	2	6	11309	11314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289193313
123	NC_013888	GTT	2	6	11432	11437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289193313
124	NC_013888	GTG	2	6	11451	11456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289193313
125	NC_013888	TGA	2	6	11563	11568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289193313
126	NC_013888	TAT	2	6	11630	11635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289193313

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.