MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanocaldococcus sp. FS406-22 chromosome

Total Repeats: 41352

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013887	AATA	2	8	152248	152255	75 %	25 %	0 %	0 %	289191655
3502	NC_013887	GGA	2	6	152321	152326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289191655
3503	NC_013887	A	6	6	152345	152350	100 %	0 %	0 %	0 %	289191655
3504	NC_013887	A	6	6	152366	152371	100 %	0 %	0 %	0 %	289191655
3505	NC_013887	A	6	6	152375	152380	100 %	0 %	0 %	0 %	289191655
3506	NC_013887	ATG	2	6	152391	152396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191655
3507	NC_013887	GA	4	8	152417	152424	50 %	0 %	50 %	0 %	289191655
3508	NC_013887	AAG	2	6	152461	152466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191655
3509	NC_013887	TAAG	2	8	152472	152479	50 %	25 %	25 %	0 %	289191655
3510	NC_013887	TTGA	2	8	152489	152496	25 %	50 %	25 %	0 %	289191655
3511	NC_013887	TTTAA	2	10	152497	152506	40 %	60 %	0 %	0 %	289191655
3512	NC_013887	AGA	2	6	152572	152577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191656
3513	NC_013887	A	6	6	152586	152591	100 %	0 %	0 %	0 %	289191656
3514	NC_013887	AGG	2	6	152595	152600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289191656
3515	NC_013887	A	6	6	152605	152610	100 %	0 %	0 %	0 %	289191656
3516	NC_013887	TAT	2	6	152669	152674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191656
3517	NC_013887	GTT	2	6	152687	152692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191656
3518	NC_013887	GAAG	2	8	152701	152708	50 %	0 %	50 %	0 %	289191656
3519	NC_013887	TGCA	2	8	152761	152768	25 %	25 %	25 %	25 %	289191656
3520	NC_013887	AG	3	6	152779	152784	50 %	0 %	50 %	0 %	289191656
3521	NC_013887	CAG	2	6	152790	152795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289191656
3522	NC_013887	ATT	2	6	152909	152914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191656
3523	NC_013887	AAT	2	6	152915	152920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191656
3524	NC_013887	GTT	2	6	152924	152929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191656
3525	NC_013887	CAG	2	6	152937	152942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289191656
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3528	NC_013887	AG	3	6	153052	153057	50 %	0 %	50 %	0 %	289191656
3529	NC_013887	GAA	2	6	153099	153104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191656
3530	NC_013887	A	6	6	153121	153126	100 %	0 %	0 %	0 %	289191656
3531	NC_013887	TTGA	2	8	153143	153150	25 %	50 %	25 %	0 %	289191656
3532	NC_013887	GTT	2	6	153215	153220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191656
3533	NC_013887	GCT	2	6	153221	153226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289191656
3534	NC_013887	TGA	2	6	153232	153237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191656
3535	NC_013887	TG	3	6	153261	153266	0 %	50 %	50 %	0 %	289191656
3536	NC_013887	GA	3	6	153361	153366	50 %	0 %	50 %	0 %	289191656
3537	NC_013887	GA	3	6	153376	153381	50 %	0 %	50 %	0 %	289191656
3538	NC_013887	GAG	3	9	153446	153454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289191656
3539	NC_013887	ATATCT	2	12	153455	153466	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	289191656
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3541	NC_013887	A	6	6	153496	153501	100 %	0 %	0 %	0 %	289191656
3542	NC_013887	TTA	2	6	153513	153518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191656
3543	NC_013887	AT	3	6	153554	153559	50 %	50 %	0 %	0 %	289191656
3544	NC_013887	TAGA	2	8	153627	153634	50 %	25 %	25 %	0 %	289191656
3545	NC_013887	A	6	6	153646	153651	100 %	0 %	0 %	0 %	289191656
3546	NC_013887	GA	3	6	153659	153664	50 %	0 %	50 %	0 %	289191656
3547	NC_013887	TAT	2	6	153677	153682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191656
3548	NC_013887	GA	3	6	153699	153704	50 %	0 %	50 %	0 %	289191657
3549	NC_013887	TTCAA	2	10	153710	153719	40 %	40 %	0 %	20 %	289191657
3550	NC_013887	T	6	6	153730	153735	0 %	100 %	0 %	0 %	289191657
3551	NC_013887	T	7	7	153737	153743	0 %	100 %	0 %	0 %	289191657
3552	NC_013887	TCT	2	6	153755	153760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289191657
3553	NC_013887	TC	3	6	153769	153774	0 %	50 %	0 %	50 %	289191657
3554	NC_013887	T	6	6	153857	153862	0 %	100 %	0 %	0 %	289191657
3555	NC_013887	ATG	2	6	153920	153925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191657
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3557	NC_013887	TAT	2	6	154015	154020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191657
3558	NC_013887	TCA	2	6	154028	154033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289191657
3559	NC_013887	CTT	2	6	154039	154044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289191657
3560	NC_013887	ATCT	2	8	154051	154058	25 %	50 %	0 %	25 %	289191657
3561	NC_013887	T	6	6	154102	154107	0 %	100 %	0 %	0 %	289191657
3562	NC_013887	ATA	2	6	154111	154116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191657
3563	NC_013887	GTTACA	2	12	154166	154177	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	289191657
3564	NC_013887	T	6	6	154201	154206	0 %	100 %	0 %	0 %	289191657
3565	NC_013887	GTA	2	6	154207	154212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191657
3566	NC_013887	TTTA	2	8	154213	154220	25 %	75 %	0 %	0 %	289191657
3567	NC_013887	ACA	2	6	154221	154226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289191657
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3572	NC_013887	TGCA	2	8	154470	154477	25 %	25 %	25 %	25 %	289191657
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3575	NC_013887	ATT	2	6	154729	154734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191658
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3578	NC_013887	AATT	2	8	154788	154795	50 %	50 %	0 %	0 %	289191658
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3582	NC_013887	AAAT	2	8	154881	154888	75 %	25 %	0 %	0 %	289191658
3583	NC_013887	CGC	2	6	154923	154928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289191658
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3586	NC_013887	TGGA	2	8	155001	155008	25 %	25 %	50 %	0 %	289191658
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3592	NC_013887	TAA	2	6	155127	155132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191658
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3594	NC_013887	TG	3	6	155145	155150	0 %	50 %	50 %	0 %	289191658
3595	NC_013887	TAA	2	6	155172	155177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191658
3596	NC_013887	GCT	2	6	155218	155223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289191658
3597	NC_013887	ACA	2	6	155224	155229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289191658
3598	NC_013887	ATA	2	6	155314	155319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191658
3599	NC_013887	TGG	2	6	155641	155646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289191659
3600	NC_013887	A	7	7	155688	155694	100 %	0 %	0 %	0 %	289191659
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3605	NC_013887	TTG	2	6	155945	155950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191659
3606	NC_013887	CTG	2	6	155957	155962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289191659
3607	NC_013887	TTCA	2	8	156096	156103	25 %	50 %	0 %	25 %	289191659
3608	NC_013887	CAG	2	6	156104	156109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289191659
3609	NC_013887	TTA	2	6	156172	156177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191659
3610	NC_013887	TTG	2	6	156220	156225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191659
3611	NC_013887	AGT	2	6	156237	156242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191659
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3614	NC_013887	AAACA	2	10	156302	156311	80 %	0 %	0 %	20 %	289191660
3615	NC_013887	TTA	2	6	156319	156324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191660
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3999	NC_013887	AGA	3	9	172082	172090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191674
4000	NC_013887	CCA	2	6	172119	172124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289191674

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