MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanocaldococcus sp. FS406-22 chromosome

Total Repeats: 41352

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013887	TGT	3	9	22777	22785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191522
502	NC_013887	TTC	2	6	22809	22814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289191522
503	NC_013887	TGC	2	6	22840	22845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289191522
504	NC_013887	GTT	2	6	22847	22852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191522
505	NC_013887	A	6	6	22957	22962	100 %	0 %	0 %	0 %	289191522
506	NC_013887	AAG	2	6	23021	23026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191522
507	NC_013887	AAAAT	2	10	23053	23062	80 %	20 %	0 %	0 %	289191522
508	NC_013887	AAC	2	6	23091	23096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289191523
509	NC_013887	TTGT	2	8	23143	23150	0 %	75 %	25 %	0 %	289191523
510	NC_013887	ATA	2	6	23151	23156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191523
511	NC_013887	AGA	2	6	23210	23215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191523
512	NC_013887	ATA	2	6	23262	23267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191523
513	NC_013887	GTTG	2	8	23276	23283	0 %	50 %	50 %	0 %	289191523
514	NC_013887	TAA	2	6	23347	23352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191523
515	NC_013887	TCC	2	6	23369	23374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289191523
516	NC_013887	AAC	2	6	23519	23524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289191523
517	NC_013887	AT	3	6	23561	23566	50 %	50 %	0 %	0 %	289191523
518	NC_013887	T	7	7	23600	23606	0 %	100 %	0 %	0 %	289191523
519	NC_013887	TGCT	2	8	23698	23705	0 %	50 %	25 %	25 %	289191523
520	NC_013887	CTA	2	6	23710	23715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289191523
521	NC_013887	CAA	2	6	23794	23799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289191523
522	NC_013887	TAA	2	6	23845	23850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191523
523	NC_013887	TGG	2	6	23858	23863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289191523
524	NC_013887	AGA	2	6	23904	23909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191524
525	NC_013887	GAA	2	6	23926	23931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191524
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527	NC_013887	TGT	2	6	24034	24039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191524
528	NC_013887	AG	3	6	24085	24090	50 %	0 %	50 %	0 %	289191524
529	NC_013887	TAGA	2	8	24095	24102	50 %	25 %	25 %	0 %	289191524
530	NC_013887	TAG	2	6	24119	24124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191524
531	NC_013887	A	7	7	24244	24250	100 %	0 %	0 %	0 %	289191524
532	NC_013887	ATT	2	6	24256	24261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191524
533	NC_013887	CAGC	2	8	24268	24275	25 %	0 %	25 %	50 %	289191524
534	NC_013887	TAGT	2	8	24320	24327	25 %	50 %	25 %	0 %	289191524
535	NC_013887	GAG	2	6	24394	24399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289191524
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538	NC_013887	TGT	2	6	24417	24422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191524
539	NC_013887	A	6	6	24481	24486	100 %	0 %	0 %	0 %	289191524
540	NC_013887	ACA	2	6	24488	24493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289191524
541	NC_013887	AAC	2	6	24513	24518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289191524
542	NC_013887	GA	3	6	24550	24555	50 %	0 %	50 %	0 %	289191524
543	NC_013887	AAGA	2	8	24599	24606	75 %	0 %	25 %	0 %	289191525
544	NC_013887	TGA	2	6	24632	24637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191525
545	NC_013887	AG	3	6	24652	24657	50 %	0 %	50 %	0 %	289191525
546	NC_013887	ATT	2	6	24658	24663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191525
547	NC_013887	AAC	2	6	24695	24700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289191525
548	NC_013887	GAT	2	6	24735	24740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191525
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550	NC_013887	GGTATT	2	12	24855	24866	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	289191525
551	NC_013887	GA	3	6	24881	24886	50 %	0 %	50 %	0 %	289191525
552	NC_013887	GGA	2	6	24960	24965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289191525
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554	NC_013887	TTG	2	6	25020	25025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191525
555	NC_013887	AAT	2	6	25169	25174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191525
556	NC_013887	TGA	2	6	25208	25213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191525
557	NC_013887	A	6	6	25229	25234	100 %	0 %	0 %	0 %	289191525
558	NC_013887	AAG	2	6	25287	25292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191525
559	NC_013887	A	6	6	25428	25433	100 %	0 %	0 %	0 %	289191525
560	NC_013887	TTTA	2	8	25516	25523	25 %	75 %	0 %	0 %	289191525
561	NC_013887	A	6	6	25565	25570	100 %	0 %	0 %	0 %	289191525
562	NC_013887	GAT	2	6	25738	25743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191526
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564	NC_013887	ACT	2	6	25783	25788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289191526
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569	NC_013887	AAT	2	6	26010	26015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191526
570	NC_013887	ATG	2	6	26036	26041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191526
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572	NC_013887	GA	3	6	26069	26074	50 %	0 %	50 %	0 %	289191526
573	NC_013887	AG	3	6	26127	26132	50 %	0 %	50 %	0 %	289191526
574	NC_013887	G	6	6	26148	26153	0 %	0 %	100 %	0 %	289191526
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595	NC_013887	GGA	2	6	26775	26780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289191527
596	NC_013887	GA	3	6	26795	26800	50 %	0 %	50 %	0 %	289191527
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599	NC_013887	AAC	2	6	26862	26867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289191527
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613	NC_013887	AGGG	2	8	27415	27422	25 %	0 %	75 %	0 %	289191528
614	NC_013887	GA	3	6	27433	27438	50 %	0 %	50 %	0 %	289191528
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