MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanocaldococcus sp. FS406-22 chromosome

Total Repeats: 41352

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013887	AGA	3	9	216647	216655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191718
5002	NC_013887	GCT	2	6	216696	216701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289191718
5003	NC_013887	TGA	2	6	216722	216727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191718
5004	NC_013887	AG	3	6	216781	216786	50 %	0 %	50 %	0 %	289191718
5005	NC_013887	GAT	2	6	216795	216800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191718
5006	NC_013887	ACTG	2	8	216816	216823	25 %	25 %	25 %	25 %	289191718
5007	NC_013887	CTA	2	6	216845	216850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289191718
5008	NC_013887	AG	3	6	217060	217065	50 %	0 %	50 %	0 %	289191719
5009	NC_013887	AG	4	8	217072	217079	50 %	0 %	50 %	0 %	289191719
5010	NC_013887	A	6	6	217091	217096	100 %	0 %	0 %	0 %	289191719
5011	NC_013887	GGA	2	6	217205	217210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289191719
5012	NC_013887	TAA	2	6	217270	217275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191719
5013	NC_013887	ATAA	2	8	217335	217342	75 %	25 %	0 %	0 %	289191719
5014	NC_013887	AGG	2	6	217345	217350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289191719
5015	NC_013887	ACA	2	6	217366	217371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289191719
5016	NC_013887	TAA	2	6	217394	217399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191719
5017	NC_013887	TAAA	2	8	217420	217427	75 %	25 %	0 %	0 %	289191719
5018	NC_013887	CTC	2	6	217441	217446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289191719
5019	NC_013887	AGG	2	6	217462	217467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289191719
5020	NC_013887	AGA	2	6	217495	217500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191719
5021	NC_013887	GAAG	2	8	217594	217601	50 %	0 %	50 %	0 %	289191719
5022	NC_013887	AAT	2	6	217648	217653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191719
5023	NC_013887	ATT	2	6	217837	217842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191720
5024	NC_013887	AGA	2	6	217853	217858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191720
5025	NC_013887	ACA	3	9	217879	217887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289191720
5026	NC_013887	TG	3	6	217910	217915	0 %	50 %	50 %	0 %	289191720
5027	NC_013887	TTG	2	6	217918	217923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191720
5028	NC_013887	ATT	2	6	217945	217950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191720
5029	NC_013887	T	6	6	218024	218029	0 %	100 %	0 %	0 %	289191720
5030	NC_013887	AGG	2	6	218083	218088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289191720
5031	NC_013887	TGA	3	9	218120	218128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191720
5032	NC_013887	GAA	2	6	218133	218138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191720
5033	NC_013887	TAAA	2	8	218143	218150	75 %	25 %	0 %	0 %	289191720
5034	NC_013887	A	6	6	218162	218167	100 %	0 %	0 %	0 %	289191720
5035	NC_013887	ATG	2	6	218217	218222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191720
5036	NC_013887	T	6	6	218226	218231	0 %	100 %	0 %	0 %	289191720
5037	NC_013887	AAAAT	2	10	218281	218290	80 %	20 %	0 %	0 %	289191720
5038	NC_013887	AGA	2	6	218309	218314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191720
5039	NC_013887	ATT	2	6	218328	218333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191720
5040	NC_013887	TGA	2	6	218342	218347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191720
5041	NC_013887	AAG	2	6	218351	218356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191720
5042	NC_013887	TTA	2	6	218379	218384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191720
5043	NC_013887	TATTG	2	10	218409	218418	20 %	60 %	20 %	0 %	289191720
5044	NC_013887	TGA	2	6	218453	218458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191720
5045	NC_013887	AGA	2	6	218468	218473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191720
5046	NC_013887	AATT	2	8	218474	218481	50 %	50 %	0 %	0 %	289191720
5047	NC_013887	A	6	6	218507	218512	100 %	0 %	0 %	0 %	289191720
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5049	NC_013887	A	6	6	218523	218528	100 %	0 %	0 %	0 %	289191720
5050	NC_013887	GAA	2	6	218529	218534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191720
5051	NC_013887	T	6	6	218618	218623	0 %	100 %	0 %	0 %	289191720
5052	NC_013887	TAGT	2	8	218673	218680	25 %	50 %	25 %	0 %	289191720
5053	NC_013887	CTT	2	6	218682	218687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289191721
5054	NC_013887	CT	3	6	218690	218695	0 %	50 %	0 %	50 %	289191721
5055	NC_013887	TCA	2	6	218743	218748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289191721
5056	NC_013887	TA	3	6	218754	218759	50 %	50 %	0 %	0 %	289191721
5057	NC_013887	TTA	2	6	218807	218812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191721
5058	NC_013887	CAC	2	6	218882	218887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289191721
5059	NC_013887	ATTA	2	8	218952	218959	50 %	50 %	0 %	0 %	289191721
5060	NC_013887	T	6	6	219033	219038	0 %	100 %	0 %	0 %	289191721
5061	NC_013887	ATC	2	6	219040	219045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289191721
5062	NC_013887	AACAG	2	10	219068	219077	60 %	0 %	20 %	20 %	289191721
5063	NC_013887	CT	3	6	219099	219104	0 %	50 %	0 %	50 %	289191721
5064	NC_013887	TGA	2	6	219129	219134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191721
5065	NC_013887	AT	3	6	219144	219149	50 %	50 %	0 %	0 %	289191721
5066	NC_013887	CAA	2	6	219173	219178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289191721
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5071	NC_013887	AT	3	6	219452	219457	50 %	50 %	0 %	0 %	289191721
5072	NC_013887	CAG	2	6	219482	219487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289191721
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5074	NC_013887	CAT	2	6	219509	219514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289191721
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5085	NC_013887	TCT	2	6	219974	219979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289191722
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5089	NC_013887	TCA	2	6	220123	220128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289191722
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5091	NC_013887	TCC	2	6	220188	220193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289191722
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5100	NC_013887	T	7	7	220511	220517	0 %	100 %	0 %	0 %	289191722
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5106	NC_013887	ATCT	2	8	220698	220705	25 %	50 %	0 %	25 %	289191723
5107	NC_013887	CAG	2	6	220740	220745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289191723
5108	NC_013887	TTA	2	6	220782	220787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191723
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5110	NC_013887	TAAC	2	8	220830	220837	50 %	25 %	0 %	25 %	289191723
5111	NC_013887	CA	3	6	220866	220871	50 %	0 %	0 %	50 %	289191723
5112	NC_013887	TGC	2	6	220918	220923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289191723
5113	NC_013887	AT	3	6	220931	220936	50 %	50 %	0 %	0 %	289191723
5114	NC_013887	TCC	2	6	220990	220995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289191723
5115	NC_013887	TCCT	2	8	221026	221033	0 %	50 %	0 %	50 %	289191723
5116	NC_013887	CT	3	6	221032	221037	0 %	50 %	0 %	50 %	289191723
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