MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Methanobrevibacter ruminantium M1 chromosome

Total Repeats: 6370

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013790	GAGT	2	8	41	48	25 %	25 %	50 %	0 %	288559259
2	NC_013790	AGAA	2	8	106	113	75 %	0 %	25 %	0 %	288559259
3	NC_013790	TGGA	2	8	366	373	25 %	25 %	50 %	0 %	288559259
4	NC_013790	TAGA	2	8	1165	1172	50 %	25 %	25 %	0 %	288559259
5	NC_013790	AAAG	2	8	2515	2522	75 %	0 %	25 %	0 %	288559261
6	NC_013790	GACT	2	8	2605	2612	25 %	25 %	25 %	25 %	288559261
7	NC_013790	GGAT	2	8	2676	2683	25 %	25 %	50 %	0 %	288559261
8	NC_013790	CTTG	2	8	2726	2733	0 %	50 %	25 %	25 %	288559261
9	NC_013790	GTTG	2	8	2759	2766	0 %	50 %	50 %	0 %	288559261
10	NC_013790	TGAT	2	8	3892	3899	25 %	50 %	25 %	0 %	288559261
11	NC_013790	AGAT	2	8	4063	4070	50 %	25 %	25 %	0 %	288559261
12	NC_013790	ATTC	2	8	4194	4201	25 %	50 %	0 %	25 %	288559261
13	NC_013790	GCTA	2	8	4529	4536	25 %	25 %	25 %	25 %	288559261
14	NC_013790	CTGC	2	8	5426	5433	0 %	25 %	25 %	50 %	288559262
15	NC_013790	TAGC	2	8	5483	5490	25 %	25 %	25 %	25 %	288559262
16	NC_013790	TTAA	2	8	5840	5847	50 %	50 %	0 %	0 %	288559262
17	NC_013790	GTCA	2	8	6211	6218	25 %	25 %	25 %	25 %	288559262
18	NC_013790	GTTT	2	8	6435	6442	0 %	75 %	25 %	0 %	288559262
19	NC_013790	TGTT	2	8	6486	6493	0 %	75 %	25 %	0 %	288559262
20	NC_013790	AGTG	2	8	8154	8161	25 %	25 %	50 %	0 %	288559263
21	NC_013790	TTGA	2	8	8566	8573	25 %	50 %	25 %	0 %	288559263
22	NC_013790	CAAT	2	8	8903	8910	50 %	25 %	0 %	25 %	288559264
23	NC_013790	TTTA	2	8	9142	9149	25 %	75 %	0 %	0 %	288559264
24	NC_013790	ATGG	2	8	9184	9191	25 %	25 %	50 %	0 %	288559264
25	NC_013790	ATCT	2	8	9271	9278	25 %	50 %	0 %	25 %	288559264
26	NC_013790	ATAA	2	8	9328	9335	75 %	25 %	0 %	0 %	288559264
27	NC_013790	TTGA	2	8	10364	10371	25 %	50 %	25 %	0 %	288559265
28	NC_013790	GAAT	2	8	10881	10888	50 %	25 %	25 %	0 %	288559266
29	NC_013790	ATTC	2	8	11256	11263	25 %	50 %	0 %	25 %	288559266
30	NC_013790	GACA	2	8	11556	11563	50 %	0 %	25 %	25 %	288559266
31	NC_013790	ATTG	2	8	12256	12263	25 %	50 %	25 %	0 %	288559266
32	NC_013790	ATCT	2	8	12838	12845	25 %	50 %	0 %	25 %	288559267
33	NC_013790	ATTT	2	8	13151	13158	25 %	75 %	0 %	0 %	288559267
34	NC_013790	TTTC	3	12	13475	13486	0 %	75 %	0 %	25 %	288559268
35	NC_013790	AATG	2	8	13670	13677	50 %	25 %	25 %	0 %	288559268
36	NC_013790	TGTT	2	8	14020	14027	0 %	75 %	25 %	0 %	288559268
37	NC_013790	TAAT	2	8	14972	14979	50 %	50 %	0 %	0 %	288559269
38	NC_013790	TAAT	2	8	15621	15628	50 %	50 %	0 %	0 %	288559270
39	NC_013790	TTTA	2	8	15637	15644	25 %	75 %	0 %	0 %	288559270
40	NC_013790	AAGA	2	8	15947	15954	75 %	0 %	25 %	0 %	288559270
41	NC_013790	AAGG	2	8	16250	16257	50 %	0 %	50 %	0 %	288559270
42	NC_013790	ATCA	2	8	18285	18292	50 %	25 %	0 %	25 %	288559272
43	NC_013790	AAAT	2	8	18959	18966	75 %	25 %	0 %	0 %	288559272
44	NC_013790	CTTT	2	8	19207	19214	0 %	75 %	0 %	25 %	288559272
45	NC_013790	AAGG	2	8	19305	19312	50 %	0 %	50 %	0 %	288559272
46	NC_013790	TTAT	2	8	19453	19460	25 %	75 %	0 %	0 %	288559272
47	NC_013790	CAAT	2	8	20320	20327	50 %	25 %	0 %	25 %	288559273
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49	NC_013790	ATGG	2	8	20668	20675	25 %	25 %	50 %	0 %	288559273
50	NC_013790	TGTT	2	8	20703	20710	0 %	75 %	25 %	0 %	288559273
51	NC_013790	TCCT	2	8	21206	21213	0 %	50 %	0 %	50 %	288559273
52	NC_013790	CATT	2	8	21291	21298	25 %	50 %	0 %	25 %	288559273
53	NC_013790	GGAT	2	8	21866	21873	25 %	25 %	50 %	0 %	288559273
54	NC_013790	CTAT	2	8	22166	22173	25 %	50 %	0 %	25 %	288559273
55	NC_013790	TGGA	2	8	22966	22973	25 %	25 %	50 %	0 %	288559273
56	NC_013790	TGTC	2	8	23053	23060	0 %	50 %	25 %	25 %	288559273
57	NC_013790	GACA	2	8	23209	23216	50 %	0 %	25 %	25 %	288559273
58	NC_013790	TTGA	2	8	23753	23760	25 %	50 %	25 %	0 %	288559274
59	NC_013790	TCAG	2	8	23903	23910	25 %	25 %	25 %	25 %	288559274
60	NC_013790	ATTT	2	8	24888	24895	25 %	75 %	0 %	0 %	288559275
61	NC_013790	TTAT	2	8	25007	25014	25 %	75 %	0 %	0 %	288559275
62	NC_013790	GTAT	2	8	25163	25170	25 %	50 %	25 %	0 %	288559275
63	NC_013790	ATTT	2	8	25509	25516	25 %	75 %	0 %	0 %	288559276
64	NC_013790	TAGA	2	8	25598	25605	50 %	25 %	25 %	0 %	288559276
65	NC_013790	AAAG	2	8	25667	25674	75 %	0 %	25 %	0 %	288559276
66	NC_013790	AAAG	2	8	25686	25693	75 %	0 %	25 %	0 %	288559276
67	NC_013790	TTTA	2	8	25736	25743	25 %	75 %	0 %	0 %	288559276
68	NC_013790	GATA	2	8	25885	25892	50 %	25 %	25 %	0 %	288559276
69	NC_013790	ATAA	2	8	25993	26000	75 %	25 %	0 %	0 %	288559276
70	NC_013790	TTAT	2	8	26581	26588	25 %	75 %	0 %	0 %	288559277
71	NC_013790	TTAT	2	8	26611	26618	25 %	75 %	0 %	0 %	288559277
72	NC_013790	TAAA	2	8	26733	26740	75 %	25 %	0 %	0 %	288559277
73	NC_013790	AAAT	2	8	27331	27338	75 %	25 %	0 %	0 %	288559277
74	NC_013790	ATAA	2	8	27738	27745	75 %	25 %	0 %	0 %	288559278
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81	NC_013790	TTTA	2	8	28753	28760	25 %	75 %	0 %	0 %	288559278
82	NC_013790	TGTT	2	8	28829	28836	0 %	75 %	25 %	0 %	288559278
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84	NC_013790	GTCT	2	8	29318	29325	0 %	50 %	25 %	25 %	288559278
85	NC_013790	ATTC	2	8	29431	29438	25 %	50 %	0 %	25 %	288559278
86	NC_013790	ATTT	2	8	29694	29701	25 %	75 %	0 %	0 %	288559278
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89	NC_013790	CTTC	2	8	30363	30370	0 %	50 %	0 %	50 %	288559278
90	NC_013790	GCAT	2	8	30686	30693	25 %	25 %	25 %	25 %	288559278
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95	NC_013790	GCAA	2	8	33138	33145	50 %	0 %	25 %	25 %	288559278
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101	NC_013790	TATT	2	8	36222	36229	25 %	75 %	0 %	0 %	288559282
102	NC_013790	ATTG	2	8	36274	36281	25 %	50 %	25 %	0 %	288559282
103	NC_013790	TCTA	2	8	36699	36706	25 %	50 %	0 %	25 %	288559283
104	NC_013790	CTGG	2	8	36912	36919	0 %	25 %	50 %	25 %	288559283
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106	NC_013790	AATG	2	8	38159	38166	50 %	25 %	25 %	0 %	288559284
107	NC_013790	ATTG	2	8	38388	38395	25 %	50 %	25 %	0 %	288559285
108	NC_013790	GTTT	2	8	38855	38862	0 %	75 %	25 %	0 %	288559285
109	NC_013790	AGAA	2	8	38930	38937	75 %	0 %	25 %	0 %	288559285
110	NC_013790	TGAA	2	8	39724	39731	50 %	25 %	25 %	0 %	288559287
111	NC_013790	CAGA	2	8	40116	40123	50 %	0 %	25 %	25 %	288559287
112	NC_013790	CATT	2	8	40211	40218	25 %	50 %	0 %	25 %	288559287
113	NC_013790	TTAA	2	8	40425	40432	50 %	50 %	0 %	0 %	288559287
114	NC_013790	GAAT	2	8	41083	41090	50 %	25 %	25 %	0 %	288559288
115	NC_013790	CCAA	2	8	41184	41191	50 %	0 %	0 %	50 %	288559288
116	NC_013790	CAGA	2	8	41541	41548	50 %	0 %	25 %	25 %	288559288
117	NC_013790	AGGT	2	8	42364	42371	25 %	25 %	50 %	0 %	288559289
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119	NC_013790	AGAT	2	8	42642	42649	50 %	25 %	25 %	0 %	288559289
120	NC_013790	ATCT	2	8	43296	43303	25 %	50 %	0 %	25 %	288559289
121	NC_013790	TTTG	2	8	43500	43507	0 %	75 %	25 %	0 %	288559289
122	NC_013790	ATTA	2	8	43824	43831	50 %	50 %	0 %	0 %	288559289
123	NC_013790	TGAA	2	8	44072	44079	50 %	25 %	25 %	0 %	288559289
124	NC_013790	ATTG	2	8	44367	44374	25 %	50 %	25 %	0 %	288559289
125	NC_013790	CTTG	2	8	44688	44695	0 %	50 %	25 %	25 %	288559289
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127	NC_013790	ATTG	2	8	45744	45751	25 %	50 %	25 %	0 %	288559289
128	NC_013790	TTTG	2	8	46752	46759	0 %	75 %	25 %	0 %	288559290
129	NC_013790	ATTT	2	8	47556	47563	25 %	75 %	0 %	0 %	288559290
130	NC_013790	CAAT	2	8	48245	48252	50 %	25 %	0 %	25 %	288559291
131	NC_013790	CTAT	2	8	48767	48774	25 %	50 %	0 %	25 %	288559291
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134	NC_013790	ATGC	2	8	50208	50215	25 %	25 %	25 %	25 %	288559294
135	NC_013790	CATT	2	8	50519	50526	25 %	50 %	0 %	25 %	288559294
136	NC_013790	TTCC	2	8	51396	51403	0 %	50 %	0 %	50 %	288559294
137	NC_013790	TTTG	2	8	51415	51422	0 %	75 %	25 %	0 %	288559294
138	NC_013790	TGTT	2	8	51501	51508	0 %	75 %	25 %	0 %	288559294
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