MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methanocella paludicola SANAE chromosome

Total Repeats: 1388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013665	GTCCC	2	10	5111	5120	0 %	20 %	20 %	60 %	282162676
2	NC_013665	CGGCG	2	10	5236	5245	0 %	0 %	60 %	40 %	282162676
3	NC_013665	CCAGG	2	10	5475	5484	20 %	0 %	40 %	40 %	282162677
4	NC_013665	TCATT	2	10	7247	7256	20 %	60 %	0 %	20 %	282162677
5	NC_013665	GCCGC	2	10	7417	7426	0 %	0 %	40 %	60 %	282162678
6	NC_013665	CGACT	2	10	8877	8886	20 %	20 %	20 %	40 %	282162680
7	NC_013665	TTCTG	2	10	9992	10001	0 %	60 %	20 %	20 %	282162683
8	NC_013665	AGGGG	2	10	12294	12303	20 %	0 %	80 %	0 %	282162687
9	NC_013665	CGGCA	2	10	21655	21664	20 %	0 %	40 %	40 %	282162699
10	NC_013665	GGGCT	2	10	27429	27438	0 %	20 %	60 %	20 %	282162706
11	NC_013665	CGTGT	2	10	29587	29596	0 %	40 %	40 %	20 %	282162710
12	NC_013665	GGCGT	2	10	32597	32606	0 %	20 %	60 %	20 %	282162712
13	NC_013665	GGGCG	2	10	33521	33530	0 %	0 %	80 %	20 %	282162712
14	NC_013665	CAGCC	2	10	34822	34831	20 %	0 %	20 %	60 %	282162714
15	NC_013665	CCCCG	2	10	35302	35311	0 %	0 %	20 %	80 %	282162715
16	NC_013665	AAGTG	2	10	35554	35563	40 %	20 %	40 %	0 %	282162715
17	NC_013665	ACGCT	2	10	36419	36428	20 %	20 %	20 %	40 %	282162716
18	NC_013665	AGCGG	2	10	39864	39873	20 %	0 %	60 %	20 %	282162722
19	NC_013665	GTGCC	2	10	40112	40121	0 %	20 %	40 %	40 %	282162722
20	NC_013665	AGTCG	2	10	41292	41301	20 %	20 %	40 %	20 %	282162722
21	NC_013665	ATCTC	2	10	47018	47027	20 %	40 %	0 %	40 %	282162726
22	NC_013665	CGGAC	2	10	48909	48918	20 %	0 %	40 %	40 %	282162727
23	NC_013665	GCCTG	2	10	51301	51310	0 %	20 %	40 %	40 %	282162729
24	NC_013665	CAAGC	2	10	52472	52481	40 %	0 %	20 %	40 %	282162730
25	NC_013665	GATAA	2	10	52953	52962	60 %	20 %	20 %	0 %	282162730
26	NC_013665	ACGTC	2	10	53428	53437	20 %	20 %	20 %	40 %	282162730
27	NC_013665	CTGGA	2	10	64492	64501	20 %	20 %	40 %	20 %	282162741
28	NC_013665	AGCAC	2	10	66867	66876	40 %	0 %	20 %	40 %	282162745
29	NC_013665	GCCTC	2	10	67944	67953	0 %	20 %	20 %	60 %	282162746
30	NC_013665	GGAGC	2	10	70152	70161	20 %	0 %	60 %	20 %	282162749
31	NC_013665	AAGGC	2	10	71949	71958	40 %	0 %	40 %	20 %	282162750
32	NC_013665	GGGGC	2	10	72658	72667	0 %	0 %	80 %	20 %	282162751
33	NC_013665	TCACG	2	10	73855	73864	20 %	20 %	20 %	40 %	282162752
34	NC_013665	TTTAT	2	10	80290	80299	20 %	80 %	0 %	0 %	282162759
35	NC_013665	CAGCG	2	10	84573	84582	20 %	0 %	40 %	40 %	282162763
36	NC_013665	ATTCG	2	10	88894	88903	20 %	40 %	20 %	20 %	282162769
37	NC_013665	GGCCG	2	10	94664	94673	0 %	0 %	60 %	40 %	282162775
38	NC_013665	CCGGC	2	10	95844	95853	0 %	0 %	40 %	60 %	282162776
39	NC_013665	TTCCT	2	10	97070	97079	0 %	60 %	0 %	40 %	282162778
40	NC_013665	AGGGC	2	10	102463	102472	20 %	0 %	60 %	20 %	282162783
41	NC_013665	AGGGA	2	10	102895	102904	40 %	0 %	60 %	0 %	282162783
42	NC_013665	GCCCT	2	10	103575	103584	0 %	20 %	20 %	60 %	282162784
43	NC_013665	CGCCT	2	10	112693	112702	0 %	20 %	20 %	60 %	282162788
44	NC_013665	GCCTT	2	10	113085	113094	0 %	40 %	20 %	40 %	282162788
45	NC_013665	CTGGG	2	10	113875	113884	0 %	20 %	60 %	20 %	282162788
46	NC_013665	GTCGT	2	10	114230	114239	0 %	40 %	40 %	20 %	282162788
47	NC_013665	TGGGC	2	10	116706	116715	0 %	20 %	60 %	20 %	282162790
48	NC_013665	GTCCA	2	10	119549	119558	20 %	20 %	20 %	40 %	282162793
49	NC_013665	CGGGG	2	10	131808	131817	0 %	0 %	80 %	20 %	282162807
50	NC_013665	CTGTC	2	10	132578	132587	0 %	40 %	20 %	40 %	282162807
51	NC_013665	GGCAC	2	10	134898	134907	20 %	0 %	40 %	40 %	282162809
52	NC_013665	GCGCG	2	10	138069	138078	0 %	0 %	60 %	40 %	282162813
53	NC_013665	TCCAG	2	10	138124	138133	20 %	20 %	20 %	40 %	282162813
54	NC_013665	CGTGG	2	10	141194	141203	0 %	20 %	60 %	20 %	282162815
55	NC_013665	GAACG	2	10	145560	145569	40 %	0 %	40 %	20 %	282162818
56	NC_013665	CGGCA	2	10	149863	149872	20 %	0 %	40 %	40 %	282162822
57	NC_013665	GCCGA	2	10	151035	151044	20 %	0 %	40 %	40 %	282162824
58	NC_013665	GGAAG	2	10	159235	159244	40 %	0 %	60 %	0 %	282162833
59	NC_013665	ACCGC	2	10	162482	162491	20 %	0 %	20 %	60 %	282162837
60	NC_013665	GGACC	2	10	162624	162633	20 %	0 %	40 %	40 %	282162837
61	NC_013665	CGGAG	2	10	163239	163248	20 %	0 %	60 %	20 %	282162838
62	NC_013665	CTGTG	2	10	167121	167130	0 %	40 %	40 %	20 %	282162842
63	NC_013665	CCTTT	2	10	168354	168363	0 %	60 %	0 %	40 %	282162844
64	NC_013665	GCCCC	2	10	168407	168416	0 %	0 %	20 %	80 %	282162844
65	NC_013665	CGAGG	2	10	169277	169286	20 %	0 %	60 %	20 %	282162845
66	NC_013665	ATCTC	2	10	171577	171586	20 %	40 %	0 %	40 %	282162848
67	NC_013665	GCCTC	2	10	172471	172480	0 %	20 %	20 %	60 %	282162848
68	NC_013665	GGAAT	2	10	175768	175777	40 %	20 %	40 %	0 %	282162852
69	NC_013665	GCCCG	2	10	184073	184082	0 %	0 %	40 %	60 %	282162859
70	NC_013665	TCGGC	2	10	184827	184836	0 %	20 %	40 %	40 %	282162860
71	NC_013665	CTCGC	2	10	185232	185241	0 %	20 %	20 %	60 %	282162861
72	NC_013665	TCACG	2	10	190496	190505	20 %	20 %	20 %	40 %	282162866
73	NC_013665	AGTAG	2	10	194539	194548	40 %	20 %	40 %	0 %	282162870
74	NC_013665	GGAGC	2	10	195814	195823	20 %	0 %	60 %	20 %	282162870
75	NC_013665	AGCCT	2	10	196122	196131	20 %	20 %	20 %	40 %	282162870
76	NC_013665	GTCGG	2	10	197224	197233	0 %	20 %	60 %	20 %	282162871
77	NC_013665	GGGCC	2	10	206792	206801	0 %	0 %	60 %	40 %	282162881
78	NC_013665	AGGGG	2	10	211540	211549	20 %	0 %	80 %	0 %	282162885
79	NC_013665	CCTGG	2	10	216240	216249	0 %	20 %	40 %	40 %	282162889
80	NC_013665	GACCG	2	10	217451	217460	20 %	0 %	40 %	40 %	282162890
81	NC_013665	GATAA	2	10	219983	219992	60 %	20 %	20 %	0 %	282162890
82	NC_013665	GCCCC	2	10	222045	222054	0 %	0 %	20 %	80 %	282162893
83	NC_013665	GCTCC	2	10	222825	222834	0 %	20 %	20 %	60 %	282162893
84	NC_013665	GCACG	2	10	224826	224835	20 %	0 %	40 %	40 %	282162896
85	NC_013665	CAGGG	2	10	224925	224934	20 %	0 %	60 %	20 %	282162896
86	NC_013665	GGCGA	2	10	226125	226134	20 %	0 %	60 %	20 %	282162898
87	NC_013665	GACCG	2	10	227719	227728	20 %	0 %	40 %	40 %	282162900
88	NC_013665	TGGGA	2	10	234876	234885	20 %	20 %	60 %	0 %	282162903
89	NC_013665	TTTCC	2	10	239740	239749	0 %	60 %	0 %	40 %	282162908
90	NC_013665	TCAAT	2	10	240904	240913	40 %	40 %	0 %	20 %	282162909
91	NC_013665	CCTTT	2	10	242688	242697	0 %	60 %	0 %	40 %	282162912
92	NC_013665	TTTTA	2	10	246814	246823	20 %	80 %	0 %	0 %	282162914
93	NC_013665	ATTTG	2	10	248201	248210	20 %	60 %	20 %	0 %	282162915
94	NC_013665	AGTAA	2	10	249125	249134	60 %	20 %	20 %	0 %	282162916
95	NC_013665	GTCGA	2	10	250350	250359	20 %	20 %	40 %	20 %	282162917
96	NC_013665	GAAGC	2	10	251094	251103	40 %	0 %	40 %	20 %	282162918
97	NC_013665	CGTCC	2	10	251310	251319	0 %	20 %	20 %	60 %	282162918
98	NC_013665	CAGGG	2	10	252418	252427	20 %	0 %	60 %	20 %	282162919
99	NC_013665	CAGCG	2	10	253668	253677	20 %	0 %	40 %	40 %	282162920
100	NC_013665	AGCCT	2	10	258112	258121	20 %	20 %	20 %	40 %	282162924
101	NC_013665	TGATC	2	10	264769	264778	20 %	40 %	20 %	20 %	282162929
102	NC_013665	TACTT	2	10	265886	265895	20 %	60 %	0 %	20 %	282162930
103	NC_013665	GGATT	2	10	266371	266380	20 %	40 %	40 %	0 %	282162931
104	NC_013665	CAACT	2	10	269678	269687	40 %	20 %	0 %	40 %	282162935
105	NC_013665	AATAC	2	10	270369	270378	60 %	20 %	0 %	20 %	282162935
106	NC_013665	GGCCG	2	10	275850	275859	0 %	0 %	60 %	40 %	282162940
107	NC_013665	CAGCG	2	10	277729	277738	20 %	0 %	40 %	40 %	282162942
108	NC_013665	GCGCA	2	10	279702	279711	20 %	0 %	40 %	40 %	282162944
109	NC_013665	CGTAG	2	10	282336	282345	20 %	20 %	40 %	20 %	282162947
110	NC_013665	TTTAA	2	10	283941	283950	40 %	60 %	0 %	0 %	282162950
111	NC_013665	ACTGT	2	10	284945	284954	20 %	40 %	20 %	20 %	282162951
112	NC_013665	GATGA	2	10	292789	292798	40 %	20 %	40 %	0 %	282162957
113	NC_013665	CTGCC	2	10	294567	294576	0 %	20 %	20 %	60 %	282162958
114	NC_013665	TCTTG	2	10	297735	297744	0 %	60 %	20 %	20 %	282162962
115	NC_013665	GCCGT	2	10	300069	300078	0 %	20 %	40 %	40 %	282162965
116	NC_013665	TTCCT	2	10	303290	303299	0 %	60 %	0 %	40 %	282162969
117	NC_013665	ATATC	2	10	304855	304864	40 %	40 %	0 %	20 %	282162971
118	NC_013665	CGGGG	2	10	308686	308695	0 %	0 %	80 %	20 %	282162977
119	NC_013665	GAGAG	2	10	311904	311913	40 %	0 %	60 %	0 %	282162980
120	NC_013665	GCCCC	2	10	315471	315480	0 %	0 %	20 %	80 %	282162985
121	NC_013665	CCGGC	2	10	315869	315878	0 %	0 %	40 %	60 %	282162985
122	NC_013665	GCGGG	2	10	323415	323424	0 %	0 %	80 %	20 %	282162992
123	NC_013665	ACGGC	2	10	324150	324159	20 %	0 %	40 %	40 %	282162993
124	NC_013665	TGGGG	2	10	327169	327178	0 %	20 %	80 %	0 %	282162995
125	NC_013665	CGGAC	2	10	328836	328845	20 %	0 %	40 %	40 %	282162995
126	NC_013665	CGGCG	2	10	330552	330561	0 %	0 %	60 %	40 %	282162996
127	NC_013665	GCGTC	2	10	331667	331676	0 %	20 %	40 %	40 %	282162996
128	NC_013665	AGATA	2	10	332526	332535	60 %	20 %	20 %	0 %	282162996
129	NC_013665	ATGGC	2	10	333554	333563	20 %	20 %	40 %	20 %	282162997
130	NC_013665	CCTGC	2	10	339176	339185	0 %	20 %	20 %	60 %	282163003
131	NC_013665	CCCGA	2	10	339487	339496	20 %	0 %	20 %	60 %	282163003
132	NC_013665	CAGCG	2	10	340163	340172	20 %	0 %	40 %	40 %	282163005
133	NC_013665	CACGG	2	10	342842	342851	20 %	0 %	40 %	40 %	282163007
134	NC_013665	GTCCT	2	10	343198	343207	0 %	40 %	20 %	40 %	282163008
135	NC_013665	TTATC	2	10	346260	346269	20 %	60 %	0 %	20 %	282163010
136	NC_013665	CGCTT	2	10	348032	348041	0 %	40 %	20 %	40 %	282163012
137	NC_013665	GGAGC	2	10	350232	350241	20 %	0 %	60 %	20 %	282163014
138	NC_013665	GATGG	2	10	351678	351687	20 %	20 %	60 %	0 %	282163016
139	NC_013665	CAGCA	2	10	355066	355075	40 %	0 %	20 %	40 %	282163020
140	NC_013665	GGCAA	2	10	358690	358699	40 %	0 %	40 %	20 %	282163024
141	NC_013665	TTATG	2	10	359619	359628	20 %	60 %	20 %	0 %	282163025
142	NC_013665	GGCCC	2	10	359986	359995	0 %	0 %	40 %	60 %	282163026
143	NC_013665	AGGCA	2	10	361867	361876	40 %	0 %	40 %	20 %	282163027
144	NC_013665	AAGCT	2	10	365671	365680	40 %	20 %	20 %	20 %	282163032
145	NC_013665	CGGGG	2	10	365782	365791	0 %	0 %	80 %	20 %	282163032
146	NC_013665	GCCCC	2	10	366379	366388	0 %	0 %	20 %	80 %	282163033
147	NC_013665	AGCCC	2	10	370272	370281	20 %	0 %	20 %	60 %	282163036
148	NC_013665	GTAAA	2	10	375530	375539	60 %	20 %	20 %	0 %	282163038
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150	NC_013665	CCTCG	2	10	378098	378107	0 %	20 %	20 %	60 %	282163041
151	NC_013665	CCGGA	2	10	379719	379728	20 %	0 %	40 %	40 %	282163043
152	NC_013665	GGCCG	2	10	384152	384161	0 %	0 %	60 %	40 %	282163049
153	NC_013665	GCGAG	2	10	385490	385499	20 %	0 %	60 %	20 %	282163051
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155	NC_013665	ATGGA	2	10	389407	389416	40 %	20 %	40 %	0 %	282163054
156	NC_013665	GCACG	2	10	389502	389511	20 %	0 %	40 %	40 %	282163054
157	NC_013665	CCTGG	2	10	390126	390135	0 %	20 %	40 %	40 %	282163054
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164	NC_013665	GCTCG	2	10	407947	407956	0 %	20 %	40 %	40 %	282163073
165	NC_013665	GGCAG	2	10	409884	409893	20 %	0 %	60 %	20 %	282163076
166	NC_013665	CATCG	2	10	418014	418023	20 %	20 %	20 %	40 %	282163086
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168	NC_013665	GATCT	2	10	421946	421955	20 %	40 %	20 %	20 %	282163090
169	NC_013665	CCGGA	2	10	431766	431775	20 %	0 %	40 %	40 %	282163101
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171	NC_013665	CATGG	2	10	434447	434456	20 %	20 %	40 %	20 %	282163102
172	NC_013665	CCGCT	2	10	438654	438663	0 %	20 %	20 %	60 %	282163107
173	NC_013665	GCCGC	2	10	439624	439633	0 %	0 %	40 %	60 %	282163108
174	NC_013665	GCCGG	2	10	440571	440580	0 %	0 %	60 %	40 %	282163108
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183	NC_013665	CTGGT	2	10	464152	464161	0 %	40 %	40 %	20 %	282163136
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198	NC_013665	CGCTG	2	10	504976	504985	0 %	20 %	40 %	40 %	282163182
199	NC_013665	GGCAA	2	10	505163	505172	40 %	0 %	40 %	20 %	282163182
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201	NC_013665	CAGAA	2	10	506900	506909	60 %	0 %	20 %	20 %	282163185
202	NC_013665	AGGTG	2	10	507613	507622	20 %	20 %	60 %	0 %	282163185
203	NC_013665	GGCTC	2	10	508606	508615	0 %	20 %	40 %	40 %	282163186
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232	NC_013665	GGAGG	2	10	558089	558098	20 %	0 %	80 %	0 %	282163245
233	NC_013665	AAAAT	2	10	558804	558813	80 %	20 %	0 %	0 %	282163245
234	NC_013665	GCAGA	2	10	560086	560095	40 %	0 %	40 %	20 %	282163248
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241	NC_013665	CACTT	2	10	582275	582284	20 %	40 %	0 %	40 %	282163270
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243	NC_013665	GAAGA	2	10	583411	583420	60 %	0 %	40 %	0 %	282163271
244	NC_013665	CTTGT	2	10	584955	584964	0 %	60 %	20 %	20 %	282163272
245	NC_013665	CTGGG	2	10	585796	585805	0 %	20 %	60 %	20 %	282163273
246	NC_013665	AGCGC	2	10	592600	592609	20 %	0 %	40 %	40 %	282163283
247	NC_013665	GCGGA	2	10	595284	595293	20 %	0 %	60 %	20 %	282163285
248	NC_013665	GGCCA	2	10	599042	599051	20 %	0 %	40 %	40 %	282163288
249	NC_013665	GAGCC	2	10	599765	599774	20 %	0 %	40 %	40 %	282163288
250	NC_013665	GGCCG	2	10	600088	600097	0 %	0 %	60 %	40 %	282163288
251	NC_013665	GGACA	2	10	601854	601863	40 %	0 %	40 %	20 %	282163292
252	NC_013665	TCGGT	2	10	605759	605768	0 %	40 %	40 %	20 %	282163294
253	NC_013665	GCCTG	2	10	609871	609880	0 %	20 %	40 %	40 %	282163298
254	NC_013665	CTCTC	2	10	610050	610059	0 %	40 %	0 %	60 %	282163298
255	NC_013665	TCATC	2	10	610414	610423	20 %	40 %	0 %	40 %	282163298
256	NC_013665	CTGGC	2	10	611748	611757	0 %	20 %	40 %	40 %	282163298
257	NC_013665	TCGTG	2	10	613977	613986	0 %	40 %	40 %	20 %	282163300
258	NC_013665	GCCCT	2	10	615712	615721	0 %	20 %	20 %	60 %	282163301
259	NC_013665	ACGCC	2	10	616586	616595	20 %	0 %	20 %	60 %	282163301
260	NC_013665	TCCTT	2	10	621412	621421	0 %	60 %	0 %	40 %	282163306
261	NC_013665	CCGCC	2	10	622729	622738	0 %	0 %	20 %	80 %	282163308
262	NC_013665	CTGAT	2	10	622794	622803	20 %	40 %	20 %	20 %	282163308
263	NC_013665	GGCCT	2	10	627000	627009	0 %	20 %	40 %	40 %	282163312
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