MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanocella paludicola SANAE chromosome

Total Repeats: 39461

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013665	TGA	2	6	622	627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162671
2	NC_013665	GAG	2	6	647	652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	282162671
3	NC_013665	GCC	2	6	794	799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162671
4	NC_013665	AAG	2	6	881	886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	282162671
5	NC_013665	AAG	2	6	1064	1069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	282162671
6	NC_013665	CAT	3	9	1081	1089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162671
7	NC_013665	GAA	2	6	1114	1119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	282162671
8	NC_013665	GCG	2	6	1122	1127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162671
9	NC_013665	CAT	2	6	1186	1191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162671
10	NC_013665	AGC	2	6	1311	1316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162671
11	NC_013665	CGG	2	6	1353	1358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162671
12	NC_013665	GCG	2	6	1373	1378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162671
13	NC_013665	GGT	2	6	1465	1470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	282162671
14	NC_013665	GAG	2	6	1475	1480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	282162671
15	NC_013665	GGT	2	6	1528	1533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	282162671
16	NC_013665	GAT	2	6	1651	1656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162671
17	NC_013665	CAT	2	6	1720	1725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162671
18	NC_013665	GTG	2	6	1736	1741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	282162671
19	NC_013665	CCG	2	6	1788	1793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162671
20	NC_013665	CGA	2	6	1816	1821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162671
21	NC_013665	CAG	2	6	1868	1873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162671
22	NC_013665	GCC	2	6	1990	1995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162672
23	NC_013665	CTT	2	6	1996	2001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162672
24	NC_013665	CCG	2	6	2003	2008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162672
25	NC_013665	GCC	2	6	2086	2091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162672
26	NC_013665	TCT	2	6	2151	2156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162672
27	NC_013665	TCT	2	6	2211	2216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162672
28	NC_013665	CCT	2	6	2235	2240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	282162672
29	NC_013665	AAG	2	6	2358	2363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	282162673
30	NC_013665	GTT	2	6	2471	2476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	282162673
31	NC_013665	GCC	2	6	2516	2521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162673
32	NC_013665	TGC	2	6	2989	2994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162674
33	NC_013665	GGT	2	6	3188	3193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	282162674
34	NC_013665	CGA	2	6	3286	3291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162674
35	NC_013665	ACG	2	6	3298	3303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162674
36	NC_013665	GTG	2	6	3323	3328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	282162674
37	NC_013665	CGC	2	6	3448	3453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162674
38	NC_013665	GCC	2	6	3462	3467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162674
39	NC_013665	ACG	2	6	3823	3828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162675
40	NC_013665	TCG	2	6	3838	3843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162675
41	NC_013665	CGC	2	6	3950	3955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162675
42	NC_013665	GGC	2	6	4034	4039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162676
43	NC_013665	CAG	2	6	4087	4092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162676
44	NC_013665	GAC	2	6	4144	4149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162676
45	NC_013665	CGC	2	6	4359	4364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162676
46	NC_013665	ATG	2	6	4412	4417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162676
47	NC_013665	GCC	2	6	4442	4447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162676
48	NC_013665	GTA	2	6	4549	4554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162676
49	NC_013665	CGT	2	6	4638	4643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162676
50	NC_013665	CGT	2	6	4665	4670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162676
51	NC_013665	TCA	2	6	4905	4910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162676
52	NC_013665	GCG	2	6	4914	4919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162676
53	NC_013665	GTT	2	6	5143	5148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	282162676
54	NC_013665	CCT	2	6	5181	5186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	282162676
55	NC_013665	CCG	2	6	5223	5228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162676
56	NC_013665	GAT	2	6	5257	5262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162676
57	NC_013665	GCG	2	6	5416	5421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162677
58	NC_013665	GCA	2	6	5486	5491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162677
59	NC_013665	CAC	2	6	5560	5565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	282162677
60	NC_013665	CGC	2	6	5687	5692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162677
61	NC_013665	GGC	2	6	5721	5726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162677
62	NC_013665	CGC	2	6	5736	5741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162677
63	NC_013665	GGC	2	6	5778	5783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162677
64	NC_013665	GTC	2	6	5805	5810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162677
65	NC_013665	CGG	3	9	5879	5887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162677
66	NC_013665	CTC	2	6	6000	6005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	282162677
67	NC_013665	GCC	2	6	6033	6038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162677
68	NC_013665	CGG	3	9	6062	6070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162677
69	NC_013665	TCG	2	6	6163	6168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162677
70	NC_013665	ATT	2	6	6253	6258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	282162677
71	NC_013665	GCC	2	6	6322	6327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162677
72	NC_013665	CAG	2	6	6346	6351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162677
73	NC_013665	CTG	2	6	6372	6377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162677
74	NC_013665	ACG	2	6	6395	6400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162677
75	NC_013665	GAT	2	6	6402	6407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162677
76	NC_013665	CAG	2	6	6441	6446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162677
77	NC_013665	GTA	2	6	6453	6458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162677
78	NC_013665	CGA	2	6	6698	6703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162677
79	NC_013665	TCC	2	6	6724	6729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	282162677
80	NC_013665	CCG	2	6	6773	6778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162677
81	NC_013665	TCA	2	6	6839	6844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162677
82	NC_013665	GTT	2	6	6876	6881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	282162677
83	NC_013665	GAA	2	6	6966	6971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	282162677
84	NC_013665	GAG	2	6	7054	7059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	282162677
85	NC_013665	CTT	2	6	7104	7109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162677
86	NC_013665	TCG	2	6	7201	7206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162677
87	NC_013665	CGT	2	6	7478	7483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162678
88	NC_013665	CGT	2	6	7508	7513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162678
89	NC_013665	TGA	2	6	7556	7561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162678
90	NC_013665	CCG	2	6	7616	7621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162678
91	NC_013665	CAC	2	6	7632	7637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	282162678
92	NC_013665	CTT	2	6	7641	7646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162678
93	NC_013665	CGT	2	6	7670	7675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162678
94	NC_013665	CCG	3	9	7682	7690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162678
95	NC_013665	ATC	2	6	7714	7719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162678
96	NC_013665	GCT	2	6	7751	7756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162678
97	NC_013665	GTG	2	6	7843	7848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	282162678
98	NC_013665	ACG	2	6	7879	7884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162678
99	NC_013665	GTC	2	6	7914	7919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162678
100	NC_013665	TCC	2	6	7972	7977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	282162678
101	NC_013665	TGC	2	6	8011	8016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162678
102	NC_013665	GAT	2	6	8043	8048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162678
103	NC_013665	CAG	2	6	8082	8087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162678
104	NC_013665	TCG	2	6	8290	8295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162678
105	NC_013665	CTG	2	6	8370	8375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162679
106	NC_013665	CGT	2	6	8415	8420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162679
107	NC_013665	CAG	2	6	8424	8429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162679
108	NC_013665	TCC	2	6	8447	8452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	282162679
109	NC_013665	GAT	2	6	8460	8465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162679
110	NC_013665	GAT	2	6	8517	8522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162679
111	NC_013665	AGC	2	6	8581	8586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162679
112	NC_013665	CTG	3	9	8673	8681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162679
113	NC_013665	GCT	2	6	8696	8701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162679
114	NC_013665	TCC	2	6	8987	8992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	282162681
115	NC_013665	GTG	2	6	9037	9042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	282162681
116	NC_013665	GCG	2	6	9065	9070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162681
117	NC_013665	CTC	2	6	9114	9119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	282162681
118	NC_013665	TCC	2	6	9136	9141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	282162681
119	NC_013665	AAT	2	6	9160	9165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	282162681
120	NC_013665	TGG	2	6	9173	9178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	282162681
121	NC_013665	GCC	2	6	9207	9212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162681
122	NC_013665	GCC	2	6	9295	9300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162681
123	NC_013665	GAT	2	6	9315	9320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162681
124	NC_013665	CGG	2	6	9326	9331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162681
125	NC_013665	GCG	2	6	9379	9384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162681
126	NC_013665	TCA	2	6	9437	9442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162681
127	NC_013665	TGA	2	6	9467	9472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162681
128	NC_013665	TCG	2	6	9511	9516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162681
129	NC_013665	CAC	2	6	9546	9551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	282162681
130	NC_013665	CGC	2	6	9659	9664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162682
131	NC_013665	GGC	2	6	9703	9708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162682
132	NC_013665	CTT	2	6	9828	9833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162682
133	NC_013665	ATG	2	6	9970	9975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162683
134	NC_013665	TCT	2	6	10025	10030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162683
135	NC_013665	CTT	2	6	10041	10046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162683
136	NC_013665	TCA	2	6	10066	10071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162684
137	NC_013665	CGA	2	6	10189	10194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162684
138	NC_013665	GTC	2	6	10322	10327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162684
139	NC_013665	GCC	3	9	10352	10360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162684
140	NC_013665	CGC	2	6	10364	10369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162684
141	NC_013665	CGG	2	6	10501	10506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162684
142	NC_013665	GAA	2	6	10565	10570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	282162684
143	NC_013665	GCC	2	6	10607	10612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162684
144	NC_013665	CTT	2	6	10665	10670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162685
145	NC_013665	CGT	2	6	10706	10711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162685
146	NC_013665	CTG	2	6	10857	10862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162685
147	NC_013665	CTG	2	6	10869	10874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162685
148	NC_013665	GCT	3	9	10877	10885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162685
149	NC_013665	CTC	2	6	10920	10925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	282162685
150	NC_013665	GCC	2	6	10934	10939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162685
151	NC_013665	CGC	2	6	10958	10963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162685
152	NC_013665	TCA	2	6	10964	10969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162685
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154	NC_013665	GCC	2	6	11121	11126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162686
155	NC_013665	GCT	2	6	11159	11164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162686
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159	NC_013665	ACC	2	6	11318	11323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	282162686
160	NC_013665	CTG	2	6	11328	11333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162686
161	NC_013665	CGG	2	6	11337	11342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162686
162	NC_013665	ACG	2	6	11431	11436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162686
163	NC_013665	CAT	2	6	11453	11458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162686
164	NC_013665	ACT	2	6	11461	11466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162686
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169	NC_013665	CTT	2	6	11931	11936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162687
170	NC_013665	TTC	2	6	11944	11949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162687
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246	NC_013665	ATG	2	6	16665	16670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162694
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248	NC_013665	CAT	2	6	16718	16723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162694
249	NC_013665	TAC	2	6	16785	16790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162694
250	NC_013665	CGG	2	6	16809	16814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162694
251	NC_013665	AAC	2	6	16968	16973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	282162694
252	NC_013665	AGT	2	6	17098	17103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162694
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254	NC_013665	CGG	2	6	17161	17166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162695
255	NC_013665	GCG	2	6	17238	17243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162695
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