MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanocella paludicola SANAE chromosome

Total Repeats: 51977

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_013665	CAT	2	6	52763	52768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162730
1003	NC_013665	AGC	2	6	52800	52805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162730
1004	NC_013665	CCGGCG	2	12	52816	52827	0 %	0 %	50 %	50 %	282162730
1005	NC_013665	AAG	2	6	52884	52889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	282162730
1006	NC_013665	GGC	2	6	52905	52910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162730
1007	NC_013665	GCG	2	6	52924	52929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162730
1008	NC_013665	CGA	2	6	52930	52935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162730
1009	NC_013665	GATAA	2	10	52953	52962	60 %	20 %	20 %	0 %	282162730
1010	NC_013665	AAG	2	6	53025	53030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	282162730
1011	NC_013665	CCA	2	6	53092	53097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	282162730
1012	NC_013665	AGG	2	6	53101	53106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	282162730
1013	NC_013665	CGG	2	6	53180	53185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162730
1014	NC_013665	CGG	2	6	53207	53212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162730
1015	NC_013665	GGCCAT	2	12	53231	53242	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	282162730
1016	NC_013665	ATG	2	6	53301	53306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162730
1017	NC_013665	GCG	2	6	53317	53322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162730
1018	NC_013665	AGA	2	6	53344	53349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	282162730
1019	NC_013665	GCC	2	6	53352	53357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162730
1020	NC_013665	ATC	2	6	53400	53405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162730
1021	NC_013665	GCG	2	6	53416	53421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162730
1022	NC_013665	ACGTC	2	10	53428	53437	20 %	20 %	20 %	40 %	282162730
1023	NC_013665	ACA	2	6	53509	53514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	282162730
1024	NC_013665	GC	3	6	53545	53550	0 %	0 %	50 %	50 %	282162730
1025	NC_013665	AAG	3	9	53583	53591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	282162730
1026	NC_013665	GAA	2	6	53603	53608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	282162730
1027	NC_013665	TCG	2	6	53695	53700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162730
1028	NC_013665	GGC	2	6	53807	53812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162731
1029	NC_013665	CAC	2	6	53871	53876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	282162731
1030	NC_013665	GGT	2	6	53878	53883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	282162731
1031	NC_013665	CTG	2	6	53887	53892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162731
1032	NC_013665	TCC	2	6	53916	53921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	282162731
1033	NC_013665	TTC	2	6	53922	53927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162731
1034	NC_013665	TCG	2	6	53943	53948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162731
1035	NC_013665	GTC	2	6	53999	54004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162731
1036	NC_013665	GTC	2	6	54008	54013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162731
1037	NC_013665	GAG	2	6	54168	54173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	282162732
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1040	NC_013665	CGC	2	6	54245	54250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162732
1041	NC_013665	AGC	2	6	54259	54264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162732
1042	NC_013665	GC	3	6	54307	54312	0 %	0 %	50 %	50 %	282162732
1043	NC_013665	GGA	2	6	54329	54334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	282162732
1044	NC_013665	CGG	2	6	54365	54370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162732
1045	NC_013665	CGA	2	6	54371	54376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162732
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1051	NC_013665	ATG	2	6	54804	54809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162733
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1054	NC_013665	GCA	2	6	54859	54864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162733
1055	NC_013665	CAG	2	6	54899	54904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162733
1056	NC_013665	GCC	2	6	54951	54956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162733
1057	NC_013665	TCGT	2	8	54996	55003	0 %	50 %	25 %	25 %	282162733
1058	NC_013665	CTG	2	6	55117	55122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162734
1059	NC_013665	GCT	2	6	55145	55150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162734
1060	NC_013665	TTG	2	6	55157	55162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	282162734
1061	NC_013665	CTT	2	6	55588	55593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162734
1062	NC_013665	TCC	2	6	55622	55627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	282162734
1063	NC_013665	GTGG	2	8	55639	55646	0 %	25 %	75 %	0 %	282162734
1064	NC_013665	TC	3	6	55686	55691	0 %	50 %	0 %	50 %	282162734
1065	NC_013665	ATC	2	6	55694	55699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162734
1066	NC_013665	TCGT	2	8	55763	55770	0 %	50 %	25 %	25 %	282162734
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1071	NC_013665	ACC	2	6	55943	55948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	282162734
1072	NC_013665	CTG	2	6	55993	55998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162734
1073	NC_013665	GCC	2	6	56087	56092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162734
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1082	NC_013665	TGG	2	6	56427	56432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	282162734
1083	NC_013665	CTC	2	6	56509	56514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	282162734
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1087	NC_013665	CTCG	2	8	56583	56590	0 %	25 %	25 %	50 %	282162734
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1091	NC_013665	CGTGGC	2	12	56851	56862	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	282162734
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1095	NC_013665	ATG	2	6	57020	57025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162734
1096	NC_013665	CAG	2	6	57064	57069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162734
1097	NC_013665	GAT	2	6	57073	57078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162734
1098	NC_013665	CAG	2	6	57103	57108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162734
1099	NC_013665	CTT	2	6	57175	57180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162734
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1102	NC_013665	GCC	2	6	57323	57328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162734
1103	NC_013665	CGGG	2	8	57332	57339	0 %	0 %	75 %	25 %	282162734
1104	NC_013665	ATG	2	6	57356	57361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162734
1105	NC_013665	GCC	2	6	57368	57373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162734
1106	NC_013665	AGG	2	6	57390	57395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	282162734
1107	NC_013665	TCC	2	6	57413	57418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	282162734
1108	NC_013665	GAC	2	6	57427	57432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162734
1109	NC_013665	CGA	2	6	57486	57491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162734
1110	NC_013665	GAC	2	6	57553	57558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162734
1111	NC_013665	GAT	2	6	57559	57564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162734
1112	NC_013665	CCCT	2	8	57931	57938	0 %	25 %	0 %	75 %	282162735
1113	NC_013665	TCT	2	6	57971	57976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162735
1114	NC_013665	ATC	2	6	58015	58020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162735
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1116	NC_013665	GGACGT	2	12	58059	58070	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	282162735
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1119	NC_013665	GCG	2	6	58268	58273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162735
1120	NC_013665	GTG	2	6	58279	58284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	282162735
1121	NC_013665	CGA	2	6	58317	58322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162735
1122	NC_013665	GAA	2	6	58392	58397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	282162735
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1124	NC_013665	GCG	2	6	58548	58553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162736
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1375	NC_013665	GGA	2	6	71899	71904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	282162750
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1497	NC_013665	GTC	3	9	78170	78178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162757
1498	NC_013665	CGA	2	6	78235	78240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162757
1499	NC_013665	GAT	2	6	78241	78246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162757
1500	NC_013665	CCA	2	6	78264	78269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	282162757

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